DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment FANCD2 and Fancd2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_149075.2 Gene:FANCD2 / 2177 HGNCID:3585 Length:1471 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001028416.2 Gene:Fancd2 / 211651 MGIID:2448480 Length:1450 Species:Mus musculus


Alignment Length:1430 Identity:1074/1430 - (75%)
Similarity:1215/1430 - (84%) Gaps:6/1430 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MVSKRRLSKSEDKESLTEDASKTRKQPLSKKTKKSHIANEVEENDSIFVKLLKISGIILKTGESQ 65
            |:||||...|||||:||||||||  .||||..||||.::|||||.|:||||||.||:.|||||:|
Mouse     1 MISKRRRLDSEDKENLTEDASKT--MPLSKLAKKSHNSHEVEENGSVFVKLLKASGLTLKTGENQ 63

Human    66 NQLAVDQIAFQKKLFQTLRRHPSYPKIIEEFVSGLESYIEDEDSFRNCLLSCERLQDEEASMGAS 130
            |||.|||:.||:||||.||:||:|||:|||||:|||||.||.:|.||||||||||||||||||..
Mouse    64 NQLGVDQVIFQRKLFQALRKHPAYPKVIEEFVNGLESYTEDSESLRNCLLSCERLQDEEASMGTF 128

Human   131 YSKSLIKLLLGIDILQPAIIKTLFEKLPEYFFENKNSDEINIPRLIVSQLKWLDRVVDGKDLTTK 195
            |||||||||||||||||||||.||||:|::.||::|.|.||:.|||::|||||||:|||||||.:
Mouse   129 YSKSLIKLLLGIDILQPAIIKMLFEKVPQFLFESENRDGINMARLIINQLKWLDRIVDGKDLTAQ 193

Human   196 IMQLISIAPENLQHDIITSLPEILGDSQHADVGKELSDLLIENTSLTVPILDVLSSLRLDPNFLL 260
            :|||||:||.|||||.||||||||||||||:|||||.:||::|||||||||||.||||||||||.
Mouse   194 MMQLISVAPVNLQHDFITSLPEILGDSQHANVGKELGELLVQNTSLTVPILDVFSSLRLDPNFLS 258

Human   261 KVRQLVMDKLSSIRLEDLPVIIKFILHSVTAMDTLEVISELREKLDLQHCVLPSRLQASQVKLKS 325
            |:|||||.||||:||||.|||:||:|||||...:||||:||||.|::|..:||||:||||.||||
Mouse   259 KIRQLVMGKLSSVRLEDFPVIVKFLLHSVTDTTSLEVIAELRENLNVQQFILPSRIQASQSKLKS 323

Human   326 KGRASSSGNQESSGQSCIILLFDVIKSAIRYEKTISEAWIKAIENTASVSEHKVFDLVMLFIIYS 390
            ||.||||||||:|.:.||:|:||||||||||||||||||.||||...|.:|||..|:|||.||||
Mouse   324 KGLASSSGNQENSDKDCIVLVFDVIKSAIRYEKTISEAWFKAIERIESAAEHKALDVVMLLIIYS 388

Human   391 TNTQTKKYIDRVLRNKIRSGCIQEQLLQSTFSVHYLVLKDMCSSILSLAQSLLHSLDQSIISFGS 455
            |:|||||.::::|||||:|.|||||||.|.||.|||||||:|.|||.|||:|.||.||.||.|||
Mouse   389 TSTQTKKGVEKLLRNKIQSDCIQEQLLDSAFSTHYLVLKDICPSILLLAQTLFHSQDQRIILFGS 453

Human   456 LLYKYAFKFFDTYCQQEVVGALVTHICSGNEAEVDTALDVLLELVVLNPSAMMMNAVFVKGILDY 520
            |||||||||||||||||||||||||:|||.||||||||||||||:|||.|||.:||.||||||||
Mouse   454 LLYKYAFKFFDTYCQQEVVGALVTHVCSGTEAEVDTALDVLLELIVLNASAMRLNAAFVKGILDY 518

Human   521 LDNISPQQIRKLFYVLSTLAFSKQNEASSHIQDDMHLVIRKQLSSTVFKYKLIGIIGAVTMAGIM 585
            |:|:|||||||:|.:|||||||:|...|:||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   519 LENMSPQQIRKIFCILSTLAFSQQPGTSNHIQDDMHLVIRKQLSSTVFKYKLIGIIGAVTMAGIM 583

Human   586 AADRSESPSLTQERANLSDEQCTQVTSLLQLVHSCSEQSPQASALYYDEFANLIQHEKLDPKALE 650
            |.|||...:.:|..||:|.||.|||||||||||||:|.||.||:|||||||||||..||.||.||
Mouse   584 AEDRSVPSNSSQRSANVSSEQRTQVTSLLQLVHSCTEHSPWASSLYYDEFANLIQERKLAPKTLE 648

Human   651 WVGHTICNDFQDAFVVDSCVVPEGDFPFPVKALYGLEEYDTQDGIAINLLPLLFSQDFAKDGGPV 715
            |||.||.||||||||||.|..||||||||||||||||||.|||||.||||| ||.|:.|||....
Mouse   649 WVGQTIFNDFQDAFVVDFCAAPEGDFPFPVKALYGLEEYSTQDGIVINLLP-LFYQECAKDASRA 712

Human   716 TSQESGQKLVSPLCLAPYFRLLRLCVERQHNGNLEEIDGLLDCPIFLTDLEPGEKLESMSAKERS 780
            |||||.|:.:|.||||.:||||||||.|||:|||:|||||||||:||.||||||||||||||:||
Mouse   713 TSQESSQRSMSSLCLASHFRLLRLCVARQHDGNLDEIDGLLDCPLFLPDLEPGEKLESMSAKDRS 777

Human   781 FMCSLIFLTLNWFREIVNAFCQETSPEMKGKVLTRLKHIVELQIILEKYLAVTPDYVPPLGNFDV 845
            .||||.|||.|||||:||||||:||||||||||:|||.:||||.||||||||.||||||..:.|:
Mouse   778 LMCSLTFLTFNWFREVVNAFCQQTSPEMKGKVLSRLKDLVELQGILEKYLAVIPDYVPPFASVDL 842

Human   846 ETLDITPHTVTAISAKIRKKGKI-ERKQKTDGSKTSSSDTLSEEKNSECDPTPSHRGQLNKEFTG 909
            :|||:.|.:.:|::||.|.|||. .:|||.|.:|.|.||||..|..||||..||.|..::||.||
Mouse   843 DTLDMMPRSSSAVAAKNRNKGKTGGKKQKADSNKASCSDTLLTEDTSECDMAPSGRSHVDKESTG 907

Human   910 KEEKTSLLLHNSHAFFRELDIEVFSILHCGLVTKFILDTEMHTEATEVVQLGPPELLFLLEDLSQ 974
            ||.||.:.|.|..|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Mouse   908 KEGKTFVSLQNYRAFFRELDIEVFSILHSGLVTKFILDTEMHTEATEVVQLGPAELLFLLEDLSQ 972

Human   975 KLESMLTPPIARRVPFLKNKGSRNIGFSHLQQRSAQEIVHCVFQLLTPMCNHLENIHNYFQCLAA 1039
            |||:|||.|.|:|:...||||.:|||||||.|||.|:|||||.|||||||||||||||:||||.|
Mouse   973 KLENMLTAPFAKRICCFKNKGRQNIGFSHLHQRSVQDIVHCVVQLLTPMCNHLENIHNFFQCLGA 1037

Human  1040 ENHGVVDGPGVKVQEYHIMSSCYQRLLQIFHGLFAWSGFSQPENQNLLYSALHVLSSRLKQGEHS 1104
            |:....|......||.|.|:.|||:|||:.|.||||.||:......||:|||.|||:||||.|..
Mouse  1038 EHLSADDKARATAQEQHTMACCYQKLLQVLHALFAWKGFTHQSKHRLLHSALEVLSNRLKQMEQD 1102

Human  1105 QPLEELLSQSVHYLQNFHQSIPSFQCALYLIRLLMVILEKSTASAQNKEKIASLARQFLCRVWPS 1169
            ||||||:|||..||||||.|:|||||.|||:||||.:||||....|.|||:||||:|.|||.||.
Mouse  1103 QPLEELVSQSFSYLQNFHHSVPSFQCGLYLLRLLMALLEKSAVPNQKKEKLASLAKQLLCRAWPH 1167

Human  1170 GDKEKSNISNDQLHALLCIYLEHTESILKAIEEIAGVGVPELINSPKDASSSTFPTLTRHTFVVF 1234
            |:|||:...||.||.:|.||||||:::|||||||.|||||||:::||||:|||||||||||||:|
Mouse  1168 GEKEKNPTFNDHLHDVLYIYLEHTDNVLKAIEEITGVGVPELVSAPKDAASSTFPTLTRHTFVIF 1232

Human  1235 FRVMMAELEKTVKKIEPGTAADSQQIHEEKLLYWNMAVRDFSILINLIKVFDSHPVLHVCLKYGR 1299
            |||||||||||||.::.||||||||:||||||||||||||||||:||:|||||:|||||||||||
Mouse  1233 FRVMMAELEKTVKGLQAGTAADSQQVHEEKLLYWNMAVRDFSILLNLMKVFDSYPVLHVCLKYGR 1297

Human  1300 LFVEAFLKQCMPLLDFSFRKHREDVLSLLETFQLDTRLLHHLCGHSKIHQDTRLTQHVPLLKKTL 1364
            .||||||||||||||||||||||||||||:|.||:|||||||||||||.||||||:|||||||:|
Mouse  1298 RFVEAFLKQCMPLLDFSFRKHREDVLSLLQTLQLNTRLLHHLCGHSKIRQDTRLTKHVPLLKKSL 1362

Human  1365 ELLVCRVKAMLTLNNCREAFWLGNLKNRDLQGEEIKSQ--NSQESTADESEDDMSSQASKSKATE 1427
            |||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||  :|.||.|::|||.::|..|:::|||
Mouse  1363 ELLVCRVKAMLVLNNCREAFWLGTLKNRDLQGEEIISQDPSSSESNAEDSEDGVTSHVSRNRATE 1427

Human  1428  1427
            Mouse  1428  1427

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
FANCD2NP_149075.2 Interaction with FANCE 1..291 222/289 (77%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1..37 25/35 (71%)
FancD2 35..1415 CDD:464225 1044/1382 (76%)
Interaction with BRCA2 248..359 82/110 (75%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 868..906 18/38 (47%)
Fancd2NP_001028416.2 Interaction with FANCE. /evidence=ECO:0000250 1..289 222/289 (77%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1..37 26/37 (70%)
FancD2 33..1415 CDD:464225 1044/1382 (76%)
Interaction with BRCA2. /evidence=ECO:0000250 246..357 82/110 (75%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 853..879 12/25 (48%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1398..1450 14/30 (47%)

Return to query results.
Submit another query.