Protein Alignment ERCC3 and ercc3

DIOPT Version :10

• Sequence 1: XP_011509096.1
• Gene: ERCC3 / 2071
• HGNCID: 3435
• Length: 788
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: NP_963876.1
• Gene: ercc3 / 324323
• ZFINID: ZDB-GENE-030131-3043
• Length: 782
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 791
• Identity: 693/791 - (87%)
• Similarity: 740/791 - (93%)
• Gaps: 12/791 - (1%)

Human     1 MGKRDRADRDKKKSRKRHYEDEEDDEEDAPGNDPQEAVPSAAGKQVDESGTKVDEYGAKDYRLQM 65
            ||::|::||: |||:||:|||||:||| ..|.:.|||||:|||||||||.||:||||||||||||
Zfish     1 MGRKDKSDRE-KKSKKRYYEDEEEDEE-VIGGESQEAVPAAAGKQVDESSTKLDEYGAKDYRLQM 63

Human    66 PLKDDHTSRPLWVAPDGHIFLEAFSPVYKYAQDFLVAIAEPVCRPTHVHEYKLTAYSLYAAVSVG 130
            .||:||:|||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||.|||||||||||||||||
Zfish    64 LLKNDHSSRPLWVAPDGHIFLEAFSPVYKYAQDFLVAISEPVCRPTHAHEYKLTAYSLYAAVSVG 128

Human   131 LQTSDITEYLRKLSKTGVPDGIMQFIKLCTVSYGKVKLVLKHNRYFVESCHPDVIQHLLQDPVIR 195
            ||||||.|||:|||||.|||||:||||||||||||||||||||||||||..|||||.||||.|||
Zfish   129 LQTSDIIEYLQKLSKTSVPDGIVQFIKLCTVSYGKVKLVLKHNRYFVESAFPDVIQRLLQDTVIR 193

Human   196 ECRLRNSEGEATELITETFTSKSAHLPLSQISKTAESSGGPSTSRVTDPQ-GKSDIPMDLFDFYE 259
            :||||::|||.|||||||.:||||      |||:.:.:||||:|:..|.| ..:.:|.|:|.:||
Zfish   194 DCRLRSAEGEETELITETISSKSA------ISKSQQDNGGPSSSQPADGQRSGTQVPEDIFSYYE 252

Human   260 QMDKDEEEEEETQTVSFEVKQEMIEELQKRCIHLEYPLLAEYDFRNDSVNPDINIDLKPTAVLRP 324
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Zfish   253 QMDKEEEEEEETQTVSFEIRQEMIEELQKRCIQLEYPLLAEYDFRNDTVNPDINMDLKPTAVLRP 317

Human   325 YQEKSLRKMFGNGRARSGVIVLPCGAGKSLVGVTAACTVRKRCLVLGNSAVSVEQWKAQFKMWST 389
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Zfish   318 YQEKSLRKMFGNGRARSGVIVLPCGAGKSLVGVTAACTVRKRCLVLGNSSVSVEQWKAQFKMWST 382

Human   390 IDDSQICRFTSDAKDKPIGCSVAISTYSMLGHTTKRSWEAERVMEWLKTQEWGLMILDEVHTIPA 454
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Zfish   383 IDDSQICRFTSDAKDKPIGCSVAISTYSMLGHTTKRSWEAERVMEWMKSQEWGLIILDEVHTIPA 447

Human   455 KMFRRVLTIVQAHCKLGLTATLVREDDKIVDLNFLIGPKLYEANWMELQNNGYIAKVQCAEVWCP 519
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Zfish   448 KMFRRVLTIVQAHCKLGLTATLVREDDKIVDLNFLIGPKLYEANWMELQNNGYIAKVQCAEVWCP 512

Human   520 MSPEFYREYVAIKTKKRILLYTMNPNKFRACQFLIKFHERRNDKIIVFADNVFALKEYAIRLNKP 584
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Zfish   513 MSPEFYREYVAIKTKKRILLYTMNPNKFRACQFLIRFHERRNDKIIVFADNVFALKEYAIRLNKP 577

Human   585 YIYGPTSQGERMQILQNFKHNPKINTIFISKVGDTSFDLPEANVLIQISSHGGSRRQEAQRLGRV 649
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Zfish   578 YIYGPTSQGERMQILQNFKHNPKINTIFISKVGDTSFDLPEANVLIQISSHGGSRRQEAQRLGRV 642

Human   650 LRAKKGMVAEEYNAFFYSLVSQDTQEMAYSTKRQRFLVDQGYSFKVITKLAGMEEEDLAFSTKEE 714
            ||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||::|
Zfish   643 LRAKKGMVAEEYNAYFYSLVSQDTQEMAYSTKRQRFLVDQGYSFKVITKLAGMEEEDLMFSTRDE 707

Human   715 QQQLLQKVLAATDLDAEEEVVAGEFGSRSSQASRRFGTMSSMSGADDTVYMEYHSSR-SKAP-SK 777
            |||||||||||:|||||||||.||.|.: .|.|||.|||||||||||.:||||...| |||. .|
Zfish   708 QQQLLQKVLAASDLDAEEEVVMGEVGGK-PQFSRRAGTMSSMSGADDALYMEYQMPRGSKASVGK 771

Human   778 HVHPLFKRFRK 788
            ::|||||||||
Zfish   772 NIHPLFKRFRK 782

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
ERCC3	XP_011509096.1	rad25	60..785	CDD:273168	647/727 (89%)
ercc3	NP_963876.1	Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1..47		31/47 (66%)
		Nuclear localization signal. /evidence=ECO:0000255	6..17		6/11 (55%)
		rad25	58..779	CDD:273168	647/727 (89%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	211..242		15/36 (42%)
		DEVH box	440..443		2/2 (100%)