DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ERCC3 and Ercc3

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_011509096.1 Gene:ERCC3 / 2071 HGNCID:3435 Length:788 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001026814.1 Gene:Ercc3 / 291703 RGDID:1307139 Length:782 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:788 Identity:750/788 - (95%)
Similarity:764/788 - (96%) Gaps:6/788 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MGKRDRADRDKKKSRKRHYEDEEDDEEDAPGNDPQEAVPSAAGKQVDESGTKVDEYGAKDYRLQM 65
            ||||||.|||||||:||.||:||:||:|||||:.|||||||||||||||.||||||||||||.||
  Rat     1 MGKRDRVDRDKKKSKKRQYEEEEEDEDDAPGNESQEAVPSAAGKQVDESSTKVDEYGAKDYRQQM 65

Human    66 PLKDDHTSRPLWVAPDGHIFLEAFSPVYKYAQDFLVAIAEPVCRPTHVHEYKLTAYSLYAAVSVG 130
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 PLKGDHTSRPLWVAPDGHIFLEAFSPVYKYAQDFLVAIAEPVCRPTHVHEYKLTAYSLYAAVSVG 130

Human   131 LQTSDITEYLRKLSKTGVPDGIMQFIKLCTVSYGKVKLVLKHNRYFVESCHPDVIQHLLQDPVIR 195
            ||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
  Rat   131 LQTSDITEYLRKLSKTGVPDGIIQFIKLCTVSYGKVKLVLKHNRYFVESSHPDVIQHLLQDPVIR 195

Human   196 ECRLRNSEGEATELITETFTSKSAHLPLSQISKTAESSGGPSTSRVTDPQGKSDIPMDLFDFYEQ 260
            ||||||:|||||||||||||||||      ||||.|.|||.|||:..|.|.|||||.||||||||
  Rat   196 ECRLRNAEGEATELITETFTSKSA------ISKTVEGSGGASTSQGVDAQAKSDIPKDLFDFYEQ 254

Human   261 MDKDEEEEEETQTVSFEVKQEMIEELQKRCIHLEYPLLAEYDFRNDSVNPDINIDLKPTAVLRPY 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||:|||||||||||||||||
  Rat   255 MDKDEEEEEETQTVSFEVKQEMIEELQKRCICLEYPLLAEYDFRNDSLNPDINIDLKPTAVLRPY 319

Human   326 QEKSLRKMFGNGRARSGVIVLPCGAGKSLVGVTAACTVRKRCLVLGNSAVSVEQWKAQFKMWSTI 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   320 QEKSLRKMFGNGRARSGVIVLPCGAGKSLVGVTAACTVRKRCLVLGNSAVSVEQWKAQFKMWSTI 384

Human   391 DDSQICRFTSDAKDKPIGCSVAISTYSMLGHTTKRSWEAERVMEWLKTQEWGLMILDEVHTIPAK 455
            ||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   385 DDSQICRFTSDAKDKPIGCSIAISTYSMLGHTTKRSWEAERVMEWLKTQEWGLMILDEVHTIPAK 449

Human   456 MFRRVLTIVQAHCKLGLTATLVREDDKIVDLNFLIGPKLYEANWMELQNNGYIAKVQCAEVWCPM 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   450 MFRRVLTIVQAHCKLGLTATLVREDDKIVDLNFLIGPKLYEANWMELQNNGYIAKVQCAEVWCPM 514

Human   521 SPEFYREYVAIKTKKRILLYTMNPNKFRACQFLIKFHERRNDKIIVFADNVFALKEYAIRLNKPY 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   515 SPEFYREYVAIKTKKRILLYTMNPNKFRACQFLIKFHERRNDKIIVFADNVFALKEYAIRLNKPY 579

Human   586 IYGPTSQGERMQILQNFKHNPKINTIFISKVGDTSFDLPEANVLIQISSHGGSRRQEAQRLGRVL 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   580 IYGPTSQGERMQILQNFKHNPKINTIFISKVGDTSFDLPEANVLIQISSHGGSRRQEAQRLGRVL 644

Human   651 RAKKGMVAEEYNAFFYSLVSQDTQEMAYSTKRQRFLVDQGYSFKVITKLAGMEEEDLAFSTKEEQ 715
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||
  Rat   645 RAKKGMVAEEYNAFFYSLVSQDTQEMAYSTKRQRFLVDQGYSFKVITKLAGMEEEELAFSTKEEQ 709

Human   716 QQLLQKVLAATDLDAEEEVVAGEFGSRSSQASRRFGTMSSMSGADDTVYMEYHSSRSKAPSKHVH 780
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||:|||||||||||||||:||.:||||
  Rat   710 QQLLQKVLAATDLDAEEEVVAGEFGSRSGQASRRFGTMSSLSGADDTVYMEYHSSRNKASTKHVH 774

Human   781 PLFKRFRK 788
            ||||||||
  Rat   775 PLFKRFRK 782

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ERCC3XP_011509096.1 rad25 60..785 CDD:273168 695/724 (96%)
Ercc3NP_001026814.1 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1..52 41/50 (82%)
Nuclear localization signal. /evidence=ECO:0000255 6..18 9/11 (82%)
rad25 60..779 CDD:273168 695/724 (96%)
DEVH box 442..445 2/2 (100%)

Return to query results.
Submit another query.