DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ERCC3 and Ercc3

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_011509096.1 Gene:ERCC3 / 2071 HGNCID:3435 Length:788 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_598419.1 Gene:Ercc3 / 13872 MGIID:95414 Length:783 Species:Mus musculus


Alignment Length:789 Identity:750/789 - (95%)
Similarity:763/789 - (96%) Gaps:7/789 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MGKRDRADRDKKKSRKRHYEDEEDDEEDAPGNDPQEAVPSAAGKQVDESGTKVDEYGAKDYRLQM 65
            ||||||.|||||||:||.||:||:||:|.|||:.|||||||||||||||.||||||||||||.||
Mouse     1 MGKRDRVDRDKKKSKKRQYEEEEEDEDDIPGNESQEAVPSAAGKQVDESSTKVDEYGAKDYRQQM 65

Human    66 PLKDDHTSRPLWVAPDGHIFLEAFSPVYKYAQDFLVAIAEPVCRPTHVHEYKLTAYSLYAAVSVG 130
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse    66 PLKGDHTSRPLWVAPDGHIFLEAFSPVYKYAQDFLVAIAEPVCRPTHVHEYKLTAYSLYAAVSVG 130

Human   131 LQTSDITEYLRKLSKTGVPDGIMQFIKLCTVSYGKVKLVLKHNRYFVESCHPDVIQHLLQDPVIR 195
            ||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Mouse   131 LQTSDITEYLRKLSKTGVPDGIIQFIKLCTVSYGKVKLVLKHNRYFVESSHPDVIQHLLQDPVIR 195

Human   196 ECRLRNSEGEATELITETFTSKSAHLPLSQISKT-AESSGGPSTSRVTDPQGKSDIPMDLFDFYE 259
            ||||||:|||||||||||||||||      |||| ||.|||||||:..|.|..||||.|||||||
Mouse   196 ECRLRNAEGEATELITETFTSKSA------ISKTAAEGSGGPSTSQGVDAQATSDIPKDLFDFYE 254

Human   260 QMDKDEEEEEETQTVSFEVKQEMIEELQKRCIHLEYPLLAEYDFRNDSVNPDINIDLKPTAVLRP 324
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||::||||||||||||||||
Mouse   255 QMDKDEEEEEETQTVSFEVKQEMIEELQKRCICLEYPLLAEYDFRNDTLNPDINIDLKPTAVLRP 319

Human   325 YQEKSLRKMFGNGRARSGVIVLPCGAGKSLVGVTAACTVRKRCLVLGNSAVSVEQWKAQFKMWST 389
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   320 YQEKSLRKMFGNGRARSGVIVLPCGAGKSLVGVTAACTVRKRCLVLGNSAVSVEQWKAQFKMWST 384

Human   390 IDDSQICRFTSDAKDKPIGCSVAISTYSMLGHTTKRSWEAERVMEWLKTQEWGLMILDEVHTIPA 454
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   385 IDDSQICRFTSDAKDKPIGCSVAISTYSMLGHTTKRSWEAERVMEWLKTQEWGLMILDEVHTIPA 449

Human   455 KMFRRVLTIVQAHCKLGLTATLVREDDKIVDLNFLIGPKLYEANWMELQNNGYIAKVQCAEVWCP 519
            :||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   450 RMFRRVLTIVQAHCKLGLTATLVREDDKIVDLNFLIGPKLYEANWMELQNNGYIAKVQCAEVWCP 514

Human   520 MSPEFYREYVAIKTKKRILLYTMNPNKFRACQFLIKFHERRNDKIIVFADNVFALKEYAIRLNKP 584
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   515 MSPEFYREYVAIKTKKRILLYTMNPNKFRACQFLIKFHERRNDKIIVFADNVFALKEYAIRLNKP 579

Human   585 YIYGPTSQGERMQILQNFKHNPKINTIFISKVGDTSFDLPEANVLIQISSHGGSRRQEAQRLGRV 649
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   580 YIYGPTSQGERMQILQNFKHNPKINTIFISKVGDTSFDLPEANVLIQISSHGGSRRQEAQRLGRV 644

Human   650 LRAKKGMVAEEYNAFFYSLVSQDTQEMAYSTKRQRFLVDQGYSFKVITKLAGMEEEDLAFSTKEE 714
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||
Mouse   645 LRAKKGMVAEEYNAFFYSLVSQDTQEMAYSTKRQRFLVDQGYSFKVITKLAGMEEEELAFSTKEE 709

Human   715 QQQLLQKVLAATDLDAEEEVVAGEFGSRSSQASRRFGTMSSMSGADDTVYMEYHSSRSKAPSKHV 779
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||:||||||||||||||||||.||||
Mouse   710 QQQLLQKVLAATDLDAEEEVVAGEFGSRSGQASRRCGTMSSLSGADDTVYMEYHSSRSKASSKHV 774

Human   780 HPLFKRFRK 788
            |||||||||
Mouse   775 HPLFKRFRK 783

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ERCC3XP_011509096.1 rad25 60..785 CDD:273168 696/725 (96%)
Ercc3NP_598419.1 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1..52 40/50 (80%)
Nuclear localization signal. /evidence=ECO:0000255 6..18 9/11 (82%)
rad25 60..780 CDD:273168 696/725 (96%)
DEVH box 442..445 2/2 (100%)

Return to query results.
Submit another query.