DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ERBB4 and Erbb4

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_016859066.1 Gene:ERBB4 / 2066 HGNCID:3432 Length:1349 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_067719.2 Gene:Erbb4 / 59323 RGDID:620486 Length:1308 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1349 Identity:1268/1349 - (93%)
Similarity:1290/1349 - (95%) Gaps:41/1349 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MKPATGLWVWVSLLVAAGTVQPSDSQSVCAGTENKLSSLSDLEQQYRALRKYYENCEVVMGNLEI 65
            ||.|||||||.||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MKLATGLWVWGSLLVAARTVQPSASQSVCAGTENKLSSLSDLEQQYRALRKYYENCEVVMGNLEI 65

Human    66 TSIEHNRDLSFLRSVREVTGYVLVALNQFRYLPLENLRIIRGTKLYEDRYALAIFLNYRKDGNFG 130
            ||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 TSIEHNRDLSFLRSIREVTGYVLVALNQFRYLPLENLRIIRGTKLYEDRYALAIFLNYRKDGNFG 130

Human   131 LQELGLKNLTEILNGGVYVDQNKFLCYADTIHWQDIVRNPWPSNLTLVSTNGSSGCLAHQDTEKN 195
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||.|||||         
  Rat   131 LQELGLKNLTEILNGGVYVDQNKFLCYADTIHWQDIVRNPWPSNMTLVSTIGSSGC--------- 186

Human   196 NPQLLQSLQPFSLITPGGRCHKSCTGRCWGPTENHCQTLTRTVCAEQCDGRCYGPYVSDCCHREC 260
                             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   187 -----------------GRCHKSCTGRCWGPTENHCQTLTRTVCAEQCDGRCYGPYVSDCCHREC 234

Human   261 AGGCSGPKDTDCFACMNFNDSGACVTQCPQTFVYNPTTFQLEHNFNAKYTYGAFCVKKCPHNFVV 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   235 AGGCSGPKDTDCFACMNFNDSGACVTQCPQTFVYNPTTFQLEHNFNAKYTYGAFCVKKCPHNFVV 299

Human   326 DSSSCVRACPSSKMEVEENGIKMCKPCTDICPKACDGIGTGSLMSAQTVDSSNIDKFINCTKING 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   300 DSSSCVRACPSSKMEVEENGIKMCKPCTDICPKACDGIGTGSLMSAQTVDSSNIDKFINCTKING 364

Human   391 NLIFLVTGIHGDPYNAIEAIDPEKLNVFRTVREITGFLNIQSWPPNMTDFSVFSNLVTIGGRVLY 455
            |||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   365 NLIFLVTGIHGDPYNAIDAIDPEKLNVFRTVREITGFLNIQSWPPNMTDFSVFSNLVTIGGRVLY 429

Human   456 SGLSLLILKQQGITSLQFQSLKEISAGNIYITDNSNLCYYHTINWTTLFSTINQRIVIRDNRKAE 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||:||
  Rat   430 SGLSLLILKQQGITSLQFQSLKEISAGNIYITDNSNLCYYHTINWTTLFSTVNQRIVIRDNRRAE 494

Human   521 NCTAEGMVCNHLCSSDGCWGPGPDQCLSCRRFSRGRICIESCNLYDGEFREFENGSICVECDPQC 585
            ||||||||||||||:||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||.||
  Rat   495 NCTAEGMVCNHLCSNDGCWGPGPDQCLSCRRFSRGKICIESCNLYDGEFREFENGSICVECDSQC 559

Human   586 EKMEDGLLTCHGPGPDNCTKCSHFKDGPNCVEKCPDGLQGANSFIFKYADPDRECHPCHPNCTQG 650
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
  Rat   560 EKMEDGLLTCHGPGPDNCTKCSHFKDGPNCVEKCPDGLQGANSFIFKYADQDRECHPCHPNCTQG 624

Human   651 CIGSSIEDCIGLMDRCNGPTSHDCIYYPWTGHSTLPQHARTPLIAAGVIGGLFILVIVGLTFAVY 715
                           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:.||||||
  Rat   625 ---------------CNGPTSHDCIYYPWTGHSTLPQHARTPLIAAGVIGGLFILVIMALTFAVY 674

Human   716 VRRKSIKKKRALRRFLETELVEPLTPSGTAPNQAQLRILKETELKRVKVLGSGAFGTVYKGIWVP 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   675 VRRKSIKKKRALRRFLETELVEPLTPSGTAPNQAQLRILKETELKRVKVLGSGAFGTVYKGIWVP 739

Human   781 EGETVKIPVAIKILNETTGPKANVEFMDEALIMASMDHPHLVRLLGVCLSPTIQLVTQLMPHGCL 845
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   740 EGETVKIPVAIKILNETTGPKANVEFMDEALIMASVDHPHLVRLLGVCLSPTIQLVTQLMPHGCL 804

Human   846 LEYVHEHKDNIGSQLLLNWCVQIAKGMMYLEERRLVHRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLE 910
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   805 LEYVHEHKDNIGSQLLLNWCVQIAKGMMYLEERRLVHRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLE 869

Human   911 GDEKEYNADGGKMPIKWMALECIHYRKFTHQSDVWSYGVTIWELMTFGGKPYDGIPTREIPDLLE 975
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   870 GDEKEYNADGGKMPIKWMALECIHYRKFTHQSDVWSYGVTIWELMTFGGKPYDGIPTREIPDLLE 934

Human   976 KGERLPQPPICTIDVYMVMVKCWMIDADSRPKFKELAAEFSRMARDPQRYLVIQGDDRMKLPSPN 1040
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   935 KGERLPQPPICTIDVYMVMVKCWMIDADSRPKFKELAAEFSRMARDPQRYLVIQGDDRMKLPSPN 999

Human  1041 DSKFFQNLLDEEDLEDMMDAEEYLVPQAFNIPPPIYTSRARIDSNRSEIGHSPPPAYTPMSGNQF 1105
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
  Rat  1000 DSKFFQNLLDEEDLEDMMDAEEYLVPQAFNIPPPIYTSRTRIDSNRSEIGHSPPPAYTPMSGNQF 1064

Human  1106 VYRDGGFAAEQGVSVPYRAPTSTIPEAPVAQGATAEIFDDSCCNGTLRKPVAPHVQEDSSTQRYS 1170
            ||:|||||.:||:.:||||.||||||||||||||||:||||||||||||||.|||||||||||||
  Rat  1065 VYQDGGFATQQGMPMPYRATTSTIPEAPVAQGATAEMFDDSCCNGTLRKPVVPHVQEDSSTQRYS 1129

Human  1171 ADPTVFAPERSPRGELDEEGYMTPMRDKPKQEYLNPVEENPFVSRRKNGDLQALDNPEYHNASNG 1235
            ||||||||||:||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||:||:|
  Rat  1130 ADPTVFAPERNPRAELDEEGYMTPMHDKPKQEYLNPVEENPFVSRRKNGDLQALDNPEYHSASSG 1194

Human  1236 PPKAEDEYVNEPLYLNTFANTLGKAEYLKNNILSMPEKAKKAFDNPDYWNHSLPPRSTLQHPDYL 1300
            ||||||||||||||||||.|.||.|||:||::||:||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1195 PPKAEDEYVNEPLYLNTFTNALGNAEYMKNSLLSVPEKAKKAFDNPDYWNHSLPPRSTLQHPDYL 1259

Human  1301 QEYSTKYFYKQNGRIRPIVAENPEYLSEFSLKPGTVLPPPPYRHRNTVV 1349
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||
  Rat  1260 QEYSTKYFYKQNGRIRPIVAENPEYLSEFSLKPGTMLPPPPYRHRNTVV 1308

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ERBB4XP_016859066.1 Recep_L_domain 55..167 CDD:460032 110/111 (99%)
Furin-like 215..358 CDD:395614 142/142 (100%)
Recep_L_domain 384..504 CDD:460032 118/119 (99%)
GF_recep_IV 528..660 CDD:464344 119/131 (91%)
TM_ErbB4 683..726 CDD:213053 40/42 (95%)
PTKc_HER4 751..1053 CDD:173655 300/301 (100%)
Erbb4NP_067719.2 Recep_L_domain 55..167 CDD:460032 110/111 (99%)
Furin-like 186..332 CDD:395614 145/171 (85%)
Recep_L_domain 358..478 CDD:460032 118/119 (99%)
GF_recep_IV 502..634 CDD:464344 127/146 (87%)
TM_ErbB4 642..685 CDD:213053 40/42 (95%)
Nuclear localization signal. /evidence=ECO:0000250 676..684 7/7 (100%)
PTKc_HER4 710..1012 CDD:173655 300/301 (100%)
PPxy motif 1 1032..1035 2/2 (100%)
PPxY motif 2 1298..1301 2/2 (100%)
PDZ-binding 1306..1308 1/1 (100%)

Return to query results.
Submit another query.