DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ERBB4 and erbb4

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_016859066.1 Gene:ERBB4 / 2066 HGNCID:3432 Length:1349 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_031748752.1 Gene:erbb4 / 100493234 XenbaseID:XB-GENE-877077 Length:1300 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:1342 Identity:1083/1342 - (80%)
Similarity:1175/1342 - (87%) Gaps:55/1342 - (4%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     9 VWVSLLVAAGTVQPSDSQSVCAGTENKLSSLSDLEQQYRALRKYYENCEVVMGNLEITSIEHNRD 73
            ||:|:|.|.||:|.:..|||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||..|:
 Frog    13 VWLSVLWALGTLQAACGQSVCAGTENKLSSLSDLEQQYKALRKYYENCEVVMGNLEITSIEPGRN 77

Human    74 LSFLRSVREVTGYVLVALNQFRYLPLENLRIIRGTKLYEDRYALAIFLNYRKDGNFGLQELGLKN 138
            ||||||:||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||:||:||||:|
 Frog    78 LSFLRSIREVTGYVLVALNQFDYLPLENLRIIRGIKLYEDRYALAIFLNYRKDGNYGLRELGLRN 142

Human   139 LTEILNGGVYVDQNKFLCYADTIHWQDIVRNPWPSNLTLVSTNGSSGCLAHQDTEKNNPQLLQSL 203
            ||||||||||:.||||||||||||||||||.|   |.|||..:.::.|                 
 Frog   143 LTEILNGGVYLGQNKFLCYADTIHWQDIVRTP---NATLVPMSSNAEC----------------- 187

Human   204 QPFSLITPGGRCHKSCTGRCWGPTENHCQTLTRTVCAEQCDGRCYGPYVSDCCHRECAGGCSGPK 268
                     |||.|||.||||||::.|||.||:|||||||||||||.||||||||||||||:|||
 Frog   188 ---------GRCPKSCMGRCWGPSDQHCQRLTKTVCAEQCDGRCYGSYVSDCCHRECAGGCTGPK 243

Human   269 DTDCFACMNFNDSGACVTQCPQTFVYNPTTFQLEHNFNAKYTYGAFCVKKCPHNFVVDSSSCVRA 333
            |||||:||.|||||:|||||||..:||||.||||.|..||||||||||.|||||||||.||||||
 Frog   244 DTDCFSCMKFNDSGSCVTQCPQPNIYNPTAFQLEQNPKAKYTYGAFCVNKCPHNFVVDDSSCVRA 308

Human   334 CPSSKMEVEENGIKMCKPCTDICPKACDGIGTGSLMSAQTVDSSNIDKFINCTKINGNLIFLVTG 398
            |||:|||||||||||||||..||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
 Frog   309 CPSNKMEVEENGIKMCKPCAGICPKVCDGIGTGSLQSAQTVDSSNIDKFINCTKINGNLHFLVTG 373

Human   399 IHGDPYNAIEAIDPEKLNVFRTVREITGFLNIQSWPPNMTDFSVFSNLVTIGGRVLYSGLSLLIL 463
            |.||||:.|.|::|:|||:|.|||||||||||||||.||||.|||||||.|||||||||:|||||
 Frog   374 IDGDPYHNIAALEPQKLNIFFTVREITGFLNIQSWPRNMTDLSVFSNLVNIGGRVLYSGISLLIL 438

Human   464 KQQGITSLQFQSLKEISAGNIYITDNSNLCYYHTINWTTLFSTINQRIVIRDNRKAENCTAEGMV 528
            |||.:.||||||||||||||:|||||.|||||||:|||:||.|.|||..||:|:|.|||||||||
 Frog   439 KQQSLNSLQFQSLKEISAGNVYITDNRNLCYYHTVNWTSLFRTSNQRTTIRENKKPENCTAEGMV 503

Human   529 CNHLCSSDGCWGPGPDQCLSCRRFSRGRICIESCNLYDGEFREFENGSICVECDPQCEKMEDGLL 593
            |:.|||:.||||||.:||||||.||||:.|:.|||||.||.|||.|||:||.||.|||||||.::
 Frog   504 CDPLCSNAGCWGPGANQCLSCRYFSRGKSCVRSCNLYKGESREFVNGSVCVMCDSQCEKMEDSIV 568

Human   594 TCHGPGPDNCTKCSHFKDGPNCVEKCPDGLQGANSFIFKYADPDRECHPCHPNCTQGCIGSSIED 658
            ||:|||||:|||||:||||||||||||:||||||||||||||.|:||||||||||.||.|..::|
 Frog   569 TCYGPGPDHCTKCSNFKDGPNCVEKCPEGLQGANSFIFKYADEDKECHPCHPNCTDGCRGPRLKD 633

Human   659 CIGLMDRCNGPTSHDCIYYPWTGHSTLPQHARTPLIAAGVIGGLFILVIVGLTFAVYVRRKSIKK 723
            |||::|                         |||||||.|||||||:||:.||||||:|||||||
 Frog   634 CIGIID-------------------------RTPLIAASVIGGLFIIVIMALTFAVYIRRKSIKK 673

Human   724 KRALRRFLETELVEPLTPSGTAPNQAQLRILKETELKRVKVLGSGAFGTVYKGIWVPEGETVKIP 788
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|:||||||||||||||||||||||||
 Frog   674 KRALRRFLETELVEPLTPSGTAPNQAQLRILKETELKRIKILGSGAFGTVYKGIWVPEGETVKIP 738

Human   789 VAIKILNETTGPKANVEFMDEALIMASMDHPHLVRLLGVCLSPTIQLVTQLMPHGCLLEYVHEHK 853
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||:||||||
 Frog   739 VAIKILNETTGPKANAEFMDEALIMASMDHPHLVRLLGVSLSPTIQLVTQLMPHGCLLDYVHEHK 803

Human   854 DNIGSQLLLNWCVQIAKGMMYLEERRLVHRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLEGDEKEYNA 918
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   804 DNIGSQLLLNWCVQIAKGMMYLEERRLVHRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLEGDEKEYNA 868

Human   919 DGGKMPIKWMALECIHYRKFTHQSDVWSYGVTIWELMTFGGKPYDGIPTREIPDLLEKGERLPQP 983
            ||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   869 DGGKMPIKWMALECIHYRKFTHQSDVWSYGVTVWELMTFGGKPYDGIPTREIPDLLEKGERLPQP 933

Human   984 PICTIDVYMVMVKCWMIDADSRPKFKELAAEFSRMARDPQRYLVIQGDDRMKLPSPNDSKFFQNL 1048
            |:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   934 PVCTIDVYMVMVKCWMIDADSRPKFKELAAEFSRMARDPQRYLVIQGDDRMKLPSPNDSKFFQNL 998

Human  1049 LDEEDLEDMMDAEEYLVPQAFNIPPPIYTSRARIDSNRSEIGHSPPPAYTPMSGNQFVYRDGGFA 1113
            ||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||:.
 Frog   999 LDEEDLGDMMDAEEYLVPQAFNIPPPIYTSRTRIDSNRSEIGHSPPPAYTPMSGNQFVYRDGGYT 1063

Human  1114 AEQGVSVPYRAPTSTIPEAPVAQGATAEIFDDSCCNGTL-RKPVAPHVQEDSSTQRYSADPTVFA 1177
            .::.|::|:|.....|.|...|||||||:|||.|||||| ::.|:..:.|:||.||||||||.|.
 Frog  1064 TQEAVNLPFRPTACPITELSTAQGATAEVFDDVCCNGTLCKQVVSERIPEESSLQRYSADPTAFV 1128

Human  1178 PERSPRGELDEEGYMTPMRDKPKQEYLNPVEENPFVSRRKNGDLQALDNPEYHNASNGPPKAEDE 1242
            |||:|||.:.|:||||||::|||.:||||||||||||||||||:||::.|||:|..:...|:|||
 Frog  1129 PERNPRGVVGEDGYMTPMKEKPKSDYLNPVEENPFVSRRKNGDVQAVEKPEYNNGPSTQSKSEDE 1193

Human  1243 YVNEPLYLNTFANTLGKAEYLKNNILSMPEKAKKAFDNPDYWNHSLPPRSTLQHPDYLQEYSTKY 1307
            ||.|.||||:||.....|||||||.|::|||:|||||||:|||||||||||:.|||||.||||||
 Frog  1194 YVKERLYLNSFAKPKENAEYLKNNGLTVPEKSKKAFDNPEYWNHSLPPRSTIHHPDYLHEYSTKY 1258

Human  1308 FYKQNGRIRPIVAENPEYLSEFSLKPGTVLPPPPYRHRNTVV 1349
            ||||||||||:||||||||:||:|||||||||||||||||||
 Frog  1259 FYKQNGRIRPVVAENPEYLTEFTLKPGTVLPPPPYRHRNTVV 1300

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ERBB4XP_016859066.1 Recep_L_domain 55..167 CDD:460032 100/111 (90%)
Furin-like 215..358 CDD:395614 118/142 (83%)
Recep_L_domain 384..504 CDD:460032 98/119 (82%)
GF_recep_IV 528..660 CDD:464344 99/131 (76%)
TM_ErbB4 683..726 CDD:213053 30/42 (71%)
PTKc_HER4 751..1053 CDD:173655 294/301 (98%)
erbb4XP_031748752.1 Recep_L_domain 59..171 CDD:460032 100/111 (90%)
Furin-like 184..333 CDD:395614 121/174 (70%)
Recep_L_domain 359..479 CDD:460032 98/119 (82%)
GF_recep_IV 503..635 CDD:464344 99/131 (76%)
TM_ErbB4 633..676 CDD:213053 35/67 (52%)
PTKc_HER4 701..1003 CDD:173655 294/301 (98%)

Return to query results.
Submit another query.