DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ERBB3 and Erbb3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001973.2 Gene:ERBB3 / 2065 HGNCID:3431 Length:1342 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_058914.2 Gene:Erbb3 / 29496 RGDID:69323 Length:1339 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1342 Identity:1215/1342 - (90%)
Similarity:1269/1342 - (94%) Gaps:3/1342 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MRANDALQVLGLLFSLARGSEVGNSQAVCPGTLNGLSVTGDAENQYQTLYKLYERCEVVMGNLEI 65
            |||...||||..|.|||||||:||||||||||||||||||||:|||||||||||:||||||||||
  Rat     1 MRATGTLQVLCFLLSLARGSEMGNSQAVCPGTLNGLSVTGDADNQYQTLYKLYEKCEVVMGNLEI 65

Human    66 VLTGHNADLSFLQWIREVTGYVLVAMNEFSTLPLPNLRVVRGTQVYDGKFAIFVMLNYNTNSSHA 130
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 VLTGHNADLSFLQWIREVTGYVLVAMNEFSVLPLPNLRVVRGTQVYDGKFAIFVMLNYNTNSSHA 130

Human   131 LRQLRLTQLTEILSGGVYIEKNDKLCHMDTIDWRDIVRDRDAEIVVKDNGRSCPPCHEVCKGRCW 195
            ||||:.||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||:||.:|||||||||||||
  Rat   131 LRQLKFTQLTEILSGGVYIEKNDKLCHMDTIDWRDIVRVRGAEIVVKNNGANCPPCHEVCKGRCW 195

Human   196 GPGSEDCQTLTKTICAPQCNGHCFGPNPNQCCHDECAGGCSGPQDTDCFACRHFNDSGACVPRCP 260
            |||.:|||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
  Rat   196 GPGPDDCQILTKTICAPQCNGRCFGPNPNQCCHDECAGGCSGPQDTDCFACRRFNDSGACVPRCP 260

Human   261 QPLVYNKLTFQLEPNPHTKYQYGGVCVASCPHNFVVDQTSCVRACPPDKMEVDKNGLKMCEPCGG 325
            :||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||:||||||||||
  Rat   261 EPLVYNKLTFQLEPNPHTKYQYGGVCVASCPHNFVVDQTFCVRACPPDKMEVDKHGLKMCEPCGG 325

Human   326 LCPKACEGTGSGSRFQTVDSSNIDGFVNCTKILGNLDFLITGLNGDPWHKIPALDPEKLNVFRTV 390
            ||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
  Rat   326 LCPKACEGTGSGSRYQTVDSSNIDGFVNCTKILGNLDFLITGLNVDPWHKIPALDPEKLNVFRTV 390

Human   391 REITGYLNIQSWPPHMHNFSVFSNLTTIGGRSLYNRGFSLLIMKNLNVTSLGFRSLKEISAGRIY 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|
  Rat   391 REITGYLNIQSWPPHMHNFSVFSNLTTIGGRSLYNRGFSLLIMKNLNVTSLGFRSLKEISAGRVY 455

Human   456 ISANRQLCYHHSLNWTKVLRGPTEERLDIKHNRPRRDCVAEGKVCDPLCSSGGCWGPGPGQCLSC 520
            ||||:|||||||||||::||||:|||||||::||..:|:||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 ISANQQLCYHHSLNWTRLLRGPSEERLDIKYDRPLGECLAEGKVCDPLCSSGGCWGPGPGQCLSC 520

Human   521 RNYSRGGVCVTHCNFLNGEPREFAHEAECFSCHPECQPMEGTATCNGSGSDTCAQCAHFRDGPHC 585
            |||||.||||||||||.||||||.|||:||||||||.|||||:||||||||.||:||||||||||
  Rat   521 RNYSREGVCVTHCNFLQGEPREFVHEAQCFSCHPECLPMEGTSTCNGSGSDACARCAHFRDGPHC 585

Human   586 VSSCPHGVLGAKGPIYKYPDVQNECRPCHENCTQGCKGPELQDCLGQTLVLIGKTHLTMALTVIA 650
            |:|||||:||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||..||:.|.||.:|:||  
  Rat   586 VNSCPHGILGAKGPIYKYPDAQNECRPCHENCTQGCNGPELQDCLGQAEVLMSKPHLVIAVTV-- 648

Human   651 GLVVIFMMLGGTFLYWRGRRIQNKRAMRRYLERGESIEPLDPSEKANKVLARIFKETELRKLKVL 715
            ||.||.|:|||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   649 GLAVILMILGGSFLYWRGRRIQNKRAMRRYLERGESIEPLDPSEKANKVLARIFKETELRKLKVL 713

Human   716 GSGVFGTVHKGVWIPEGESIKIPVCIKVIEDKSGRQSFQAVTDHMLAIGSLDHAHIVRLLGLCPG 780
            |||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||
  Rat   714 GSGVFGTVHKGIWIPEGESIKIPVCIKVIEDKSGRQSFQAVTDHMLAVGSLDHAHIVRLLGLCPG 778

Human   781 SSLQLVTQYLPLGSLLDHVRQHRGALGPQLLLNWGVQIAKGMYYLEEHGMVHRNLAARNVLLKSP 845
            |||||||||||||||||||:|||..|||||||||||||||||||||||.||||:||.|||:||||
  Rat   779 SSLQLVTQYLPLGSLLDHVKQHRETLGPQLLLNWGVQIAKGMYYLEEHSMVHRDLALRNVMLKSP 843

Human   846 SQVQVADFGVADLLPPDDKQLLYSEAKTPIKWMALESIHFGKYTHQSDVWSYGVTVWELMTFGAE 910
            ||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   844 SQVQVADFGVADLLPPDDKQLLHSEAKTPIKWMALESIHFGKYTHQSDVWSYGVTVWELMTFGAE 908

Human   911 PYAGLRLAEVPDLLEKGERLAQPQICTIDVYMVMVKCWMIDENIRPTFKELANEFTRMARDPPRY 975
            |||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   909 PYAGLRLAEIPDLLEKGERLAQPQICTIDVYMVMVKCWMIDENIRPTFKELANEFTRMARDPPRY 973

Human   976 LVIKRESGPGIAPGPEPHGLTNKKLEEVELEPELDLDLDLEAEEDNLATTTLGSALSLPVGTLNR 1040
            |||||.||||..|..||..||.|:|:|.||||||||||||||||:.|| |:||||||||.|||.|
  Rat   974 LVIKRASGPGTPPAAEPSVLTTKELQEAELEPELDLDLDLEAEEEGLA-TSLGSALSLPTGTLTR 1037

Human  1041 PRGSQSLLSPSSGYMPMNQGNLGESCQESAVSGSSERCPRPVSLHPMPRGCLASESSEGHVTGSE 1105
            |||||||||||||||||||.:|||:|.:|||.|..|:..||:||||:|||..|||||||||||||
  Rat  1038 PRGSQSLLSPSSGYMPMNQSSLGEACLDSAVLGGREQFSRPISLHPIPRGRPASESSEGHVTGSE 1102

Human  1106 AELQEKVSMCRSRSRSRSPRPRGDSAYHSQRHSLLTPVTPLSPPGLEEEDVNGYVMPDTHLKGTP 1170
            ||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||:|..
  Rat  1103 AELQEKVSVCRSRSRSRSPRPRGDSAYHSQRHSLLTPVTPLSPPGLEEEDGNGYVMPDTHLRGAS 1167

Human  1171 SSREGTLSSVGLSSVLGTEEEDEDEEYEYMNRRRRHSPPHPPRPSSLEELGYEYMDVGSDLSASL 1235
            ||||||||||||||||||||||||||||||||:||.|||.||||.||||||||||||||||||||
  Rat  1168 SSREGTLSSVGLSSVLGTEEEDEDEEYEYMNRKRRGSPPRPPRPGSLEELGYEYMDVGSDLSASL 1232

Human  1236 GSTQSCPLHPVPIMPTAGTTPDEDYEYMNRQRDGGGPGGDYAAMGACPASEQGYEEMRAFQGPGH 1300
            ||||||||||:.|:|:||||||||||||||:|..||.||||||||||||:|||||||||||||||
  Rat  1233 GSTQSCPLHPMAIVPSAGTTPDEDYEYMNRRRGAGGAGGDYAAMGACPAAEQGYEEMRAFQGPGH 1297

Human  1301 QAPHVHYARLKTLRSLEATDSAFDNPDYWHSRLFPKANAQRT 1342
            .||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1298 HAPHVRYARLKTLRSLEATDSAFDNPDYWHSRLFPKANAQRT 1339

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ERBB3NP_001973.2 Recep_L_domain 56..167 CDD:460032 107/110 (97%)
Furin-like 183..329 CDD:395614 137/145 (94%)
Recep_L_domain 353..474 CDD:460032 116/120 (97%)
GF_recep_IV 499..630 CDD:464344 118/130 (91%)
TM_ErbB3 638..676 CDD:213056 26/37 (70%)
PTK_HER3 701..979 CDD:173656 266/277 (96%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 980..999 10/18 (56%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1033..1152 100/118 (85%)
Erbb3NP_058914.2 Recep_L_domain 56..167 CDD:460032 107/110 (97%)
Furin-like 182..329 CDD:395614 137/146 (94%)
Recep_L_domain 353..474 CDD:460032 116/120 (97%)
GF_recep_IV 499..630 CDD:464344 118/130 (91%)
TM_ErbB3 638..674 CDD:213056 26/37 (70%)
Protein Kinases, catalytic domain 699..977 CDD:473864 266/277 (96%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1023..1052 25/28 (89%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1078..1215 123/136 (90%)

Return to query results.
Submit another query.