DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment EPHA4 and epha4

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_004429.1 Gene:EPHA4 / 2043 HGNCID:3388 Length:986 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_012825631.1 Gene:epha4 / 100216124 XenbaseID:XB-GENE-1015803 Length:986 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:987 Identity:883/987 - (89%)
Similarity:939/987 - (95%) Gaps:2/987 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MAGIFYFALFSCLFGICDAVTGSRVYPANEVTLLDSRSVQGELGWIASPLEGGWEEVSIMDEKNT 65
            ||||.:..||..|||:|.||||||:|||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog     1 MAGIVHGILFCGLFGLCWAVTGSRIYPASEVTLLDSRSVQGELGWIASPLEGGWEEVSIMDEKNT 65

Human    66 PIRTYQVCNVMEPSQNNWLRTDWITREGAQRVYIEIKFTLRDCNSLPGVMGTCKETFNLYYYESD 130
            ||||||||||||.|||||||||||.|.||||||:||||||||||||||||||||||||||||||:
 Frog    66 PIRTYQVCNVMESSQNNWLRTDWIPRSGAQRVYVEIKFTLRDCNSLPGVMGTCKETFNLYYYESN 130

Human   131 NDKERFIRENQFVKIDTIAADESFTQVDIGDRIMKLNTEIRDVGPLSKKGFYLAFQDVGACIALV 195
            |||||||||.|:|||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||
 Frog   131 NDKERFIRETQYVKIDTIAADESFTQVDIGDRIMKLNTEVRDVGPLSKKGFYLAFQDVGACIALV 195

Human   196 SVRVFYKKCPLTVRNLAQFPDTITGADTSSLVEVRGSCVNNSEEKDVPKMYCGADGEWLVPIGNC 260
            |||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||
 Frog   196 SVRVFYKKCPLTVRNLAQFPDTITGSDTSSLVEVRGSCVDNSEEKDVPKMYCGADGEWLVPIGNC 260

Human   261 LCNAGHEERSGECQACKIGYYKALSTDATCAKCPPHSYSVWEGATSCTCDRGFFRADNDAASMPC 325
            |||||.|||:|.|||||:||||||||||.|:|||||||::.||:||||||||:||||.|.|||||
 Frog   261 LCNAGFEERNGGCQACKVGYYKALSTDAACSKCPPHSYALREGSTSCTCDRGYFRADTDPASMPC 325

Human   326 TRPPSAPLNLISNVNETSVNLEWSSPQNTGGRQDISYNVVCKKCGAGDPSKCRPCGSGVHYTPQQ 390
            |||||||.||||||||||||||||.|||:|||.|::||:|||:||: |.::||||||||||:|||
 Frog   326 TRPPSAPQNLISNVNETSVNLEWSPPQNSGGRPDVTYNLVCKRCGS-DLTRCRPCGSGVHYSPQQ 389

Human   391 NGLKTTKVSITDLLAHTNYTFEIWAVNGVSKYNPNPDQSVSVTVTTNQAAPSSIALVQAKEVTRY 455
            |||||||||||||.||||||||:||:|||||.||..||:|||||||||||||::..:|.||:||:
 Frog   390 NGLKTTKVSITDLQAHTNYTFEVWAINGVSKQNPGQDQAVSVTVTTNQAAPSTVTQIQPKEITRH 454

Human   456 SVALAWLEPDRPNGVILEYEVKYYEKDQNERSYRIVRTAARNTDIKGLNPLTSYVFHVRARTAAG 520
            ||:|.|.||:|.||||||||||||||||||||||||:||:|:.|||||||||:||||||||||||
 Frog   455 SVSLTWPEPERANGVILEYEVKYYEKDQNERSYRIVKTASRSADIKGLNPLTAYVFHVRARTAAG 519

Human   521 YGDFSEPLEVTTNTVPSRIIGDGANSTVLLVSVSGSVVLVVILIAAFVISRRRSKYSKAKQEADE 585
            ||:||.|.|.|||||||.:||:||:.|||||||:||:||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   520 YGEFSGPFEFTTNTVPSPMIGEGASPTVLLVSVAGSIVLVVILIAAFVISRRRSKYSKAKQEADE 584

Human   586 EKHLNQGVRTYVDPFTYEDPNQAVREFAKEIDASCIKIEKVIGVGEFGEVCSGRLKVPGKREICV 650
            ||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
 Frog   585 EKHLNQGVKTYVDPFTYEDPNQAVREFAKEIDASCIKIEKVIGVGEFGEVCSGRLKVPGKREIYV 649

Human   651 AIKTLKAGYTDKQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTKCKPVMIITEYMENGSLDAFLRKND 715
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   650 AIKTLKAGYTDKQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTKCKPVMIITEYMENGSLDAFLRKND 714

Human   716 GRFTVIQLVGMLRGIGSGMKYLSDMSYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGMSRVLEDDPEAAYT 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   715 GRFTVIQLVGMLRGIGSGMKYLSDMSYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGMSRVLEDDPEAAYT 779

Human   781 TRGGKIPIRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDMSNQDVIKAIEEGYRLPP 845
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   780 TRGGKIPIRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDMSNQDVIKAIEEGYRLPP 844

Human   846 PMDCPIALHQLMLDCWQKERSDRPKFGQIVNMLDKLIRNPNSLKRTGTE-SSRPNTALLDPSSPE 909
            ||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||.: |||.|||||||||||
 Frog   845 PMDCPIALHQLMLDCWQKERSDRPKFGQIVSMLDKLIRNPNSLKRTGLDNSSRTNTALLDPSSPE 909

Human   910 FSAVVSVGDWLQAIKMDRYKDNFTAAGYTTLEAVVHVNQEDLARIGITAITHQNKILSSVQAMRT 974
            :|.|.||.||||||||:||||||||||||:|||||||||:||.||||::.:||||||||||.|||
 Frog   910 WSQVASVLDWLQAIKMERYKDNFTAAGYTSLEAVVHVNQDDLTRIGISSPSHQNKILSSVQGMRT 974

Human   975 QMQQMHGRMVPV 986
            |||||.||||||
 Frog   975 QMQQMQGRMVPV 986

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
EPHA4NP_004429.1 EphR_LBD_A4 30..203 CDD:198450 164/172 (95%)
FN3 329..436 CDD:238020 85/106 (80%)
FN3 441..532 CDD:238020 68/90 (76%)
EphA2_TM 562..618 CDD:464211 54/55 (98%)
PTKc_EphR_A 616..882 CDD:270651 263/265 (99%)
SAM_EPH-A4 911..981 CDD:188944 57/69 (83%)
PDZ-binding. /evidence=ECO:0000255 984..986 1/1 (100%)
epha4XP_012825631.1 EphR_LBD_A4 30..203 CDD:198450 164/172 (95%)
FN3 329..435 CDD:238020 85/106 (80%)
FN3 440..531 CDD:238020 68/90 (76%)
EphA2_TM 550..617 CDD:464211 63/66 (95%)
PTKc_EphR_A 615..881 CDD:270651 263/265 (99%)
SAM_EPH-A4 911..981 CDD:188944 57/69 (83%)

Return to query results.
Submit another query.