DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CEP112 and Cep112

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001340058.1 Gene:CEP112 / 201134 HGNCID:28514 Length:956 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_038941574.1 Gene:Cep112 / 287776 RGDID:1564168 Length:1032 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:982 Identity:818/982 - (83%)
Similarity:890/982 - (90%) Gaps:28/982 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MEVGSEEEKWEKLDAEFDHFVVDMKPFVLKLPHRTERQRCALWIRKLCEPSGTGAGIMGRKNRNL 65
            ||:|||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||:||||||||
  Rat    53 MEMGSEEEKWEKLDAEFDHFVVDMKPFVLKLPHRSERQRCALWIRKLCEPSGTGAGLMGRKNRNL 117

Human    66 YAKLLLHMLKRGALEGPFTHRPEPGTLKILPSYMSIYFDEPNPARAKGSSPEGLPAWVLGELETS 130
            |||||||||:||.|||||||||||||||:|||||||||||||.|::|.||||.||.||:||||..
  Rat   118 YAKLLLHMLRRGVLEGPFTHRPEPGTLKVLPSYMSIYFDEPNSAQSKDSSPEKLPDWVMGELEPG 182

Human   131 EHKLNESWKLSSGEDNTLVQSPTDVYSREQYTGKLRVRSHSLSPTHREDGQNITPKIC------- 188
            |.:|::||:||.||:|.|:.|.:|.: |||||||||:||||:|||.|||.|:||.|||       
  Rat   183 ERRLSDSWQLSCGEENALLLSASDAH-REQYTGKLRMRSHSVSPTDREDRQHITSKICCMNENEF 246

Human   189 -------------------EVYSKKSPVSLDDSDIEARLNSWNLGIENPRYLRQKPIPVSLQMTP 234
                               |::.||||:||||||||.|||||||||||||||||||:|||| |||
  Rat   247 KNKELLGHQHKTFLLTNFKEIHPKKSPISLDDSDIEVRLNSWNLGIENPRYLRQKPLPVSL-MTP 310

Human   235 KFSLRKSSSFHDDHFLSRIREKELDMKTKMMEAKFHEEKLKLQQKHDADVQKILERKNNEIEELK 299
            |.|||.||:.||||||||:.|||||||||||||||.|||||||:||||:|||||||||||:||||
  Rat   311 KVSLRNSSNLHDDHFLSRMHEKELDMKTKMMEAKFSEEKLKLQKKHDAEVQKILERKNNELEELK 375

Human   300 TLYRSKQHETEETIRKLEKKVQTLIRDCQVIRETKEDQIAELKKICEQSTESLNNDWEKKLHNAV 364
            .||:.||.|||||:||||||||.|||||||||||||:||.||||||||||||||||||||||:||
  Rat   376 ILYKKKQTETEETVRKLEKKVQILIRDCQVIRETKENQITELKKICEQSTESLNNDWEKKLHSAV 440

Human   365 AEMEQEKFDLQKQHTENIQELLEDTNVRLNKMESEYMAQTQSTNHMIKELEARVQQLTGEAENSN 429
            ||||:|||:|||.|||.||||||||||||:|||.:||.||||||||||:||.|||||.|||||||
  Rat   441 AEMEKEKFELQKHHTETIQELLEDTNVRLSKMEGDYMVQTQSTNHMIKDLEGRVQQLMGEAENSN 505

Human   430 LQRQKLIQEKAELERCYQITCSELQEVKARRNTLHKEKDHLVNDYEQNMKLLQTKYDADINLLKQ 494
            ||||||.|||.|||||||||||||||:|.|:|.||.||:|||||||||:|||:||||:|||:|:|
  Rat   506 LQRQKLTQEKLELERCYQITCSELQELKTRQNLLHTEKEHLVNDYEQNVKLLKTKYDSDINILRQ 570

Human   495 EHALSASKASSMIEELEQNVCQLKQQLQESELQRKQQLRDQENKFQMEKSHLKHIYEKKAHDLQS 559
            |||||.||.|.:|||||||:.|||||:||||||||||::|||:||.|||:|||:|||:|.|:|:|
  Rat   571 EHALSTSKTSVVIEELEQNIRQLKQQVQESELQRKQQVKDQEDKFHMEKNHLKYIYEEKVHELKS 635

Human   560 ELDKGKEDTQKKIHKFEEALKEKEEQLTRVTEVQRLQAQQADAALEEFKRQVELNSEKVYAEMKE 624
            ||||.|||.|:||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||:.|||||::|||
  Rat   636 ELDKEKEDAQRKIHKFEEALKEKEEQLGRVTEVQRLQAQQADAALEEFKRQVEVTSEKVYSDMKE 700

Human   625 QMEKVEADLTRSKSLREKQSKEFLWQLEDIRQRYEQQIVELKLEHEQEKTHLLQQHNAEKDSLVR 689
            |||||||||:|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   701 QMEKVEADLSRSKSLREKQSKEFLWQLEDARQRYEQQIVELKLEHEQEKTHLLQQHNAEKDSLVR 765

Human   690 DHEREIENLEKQLRAANMEHENQIQEFKKRDAQVIADMEAQVHKLREELINVNSQRKQQLVELGL 754
            |||||:||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
  Rat   766 DHEREVENLENQLRAANMEHENQIQESKKRDAQVIADMEAQVHKLREELINVNSHRKQQLVELGL 830

Human   755 LREEEKQRATREHEIVVNKLKAESEKMKIELKKTHAAETEMTLEKANSKLKQIEKEYTQKLAKSS 819
            |||||||||.|:||..|.|||||||::|:|||||||||||||||||||:||||||||||||||||
  Rat   831 LREEEKQRAARDHETAVKKLKAESERVKMELKKTHAAETEMTLEKANSRLKQIEKEYTQKLAKSS 895

Human   820 QIIAELQTTISSLKEENSQQQLAAERRLQDVRQKFEDEKKQLIRDNDQAIKVLQDELENRSNQVR 884
            ||||||||||||||||:|:||||||||||||.|||||||:|||||||||||.||||||.||||||
  Rat   896 QIIAELQTTISSLKEESSRQQLAAERRLQDVIQKFEDEKQQLIRDNDQAIKALQDELETRSNQVR 960

Human   885 CAEKKLQHKELESQEQITYIRQEYETKLKGLMPASLRQELEDTISSLKSQVNFLQKRASILQEEL 949
            .|||||||||||:|||:.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   961 SAEKKLQHKELEAQEQMMYIRQEYETKFKGLMPASLRQELEDTISSLKSQVNFLQKRASILQEEL 1025

Human   950 TTYQGRR 956
            ||||.||
  Rat  1026 TTYQSRR 1032

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CEP112NP_001340058.1 DUF4485 13..98 CDD:464345 79/84 (94%)
Smc 302..>934 CDD:440809 548/631 (87%)
Cep112XP_038941574.1 DUF4485 65..150 CDD:464345 79/84 (94%)
SMC_prok_B <323..1014 CDD:274008 600/690 (87%)
Smc 635..>969 CDD:440809 303/333 (91%)

Return to query results.
Submit another query.