Protein Alignment ABCA1 and CG1494

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_005493.2
• Gene: ABCA1 / 19
• HGNCID: 29
• Length: 2261
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: NP_608444.2
• Gene: CG1494 / 33102
• FlyBaseID: FBgn0031169
• Length: 1695
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 1995
• Identity: 413/1995 - (20%)
• Similarity: 777/1995 - (38%)
• Gaps: 490/1995 - (24%)

Human   405 ELAVFHDLEGMWEELSPKIWT--------FMENSQEMDLVRMLLDSRDNDHFWEQQLDGLDWTAQ 461
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  Fly    19 KLQLANPLELLVILLVPPLFTLVAVLMRFFIPVNHRSDTV---YDPIDLDRSWMQMVEKLE---- 76

Human   462 DIVAFLAKHPEDVQSSNGSVYT------WR-EAFNETNQAIRTISRFMECVNLNKLEPIATEVWL 519
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  Fly    77 -----KARQVADTYNVKGNPFTPHLVIGWAPKRYGIFQAMMRRVQK--------QIEPM-TSVGF 127

Human   520 --INKSMELLDERKFWAGIVFTG-------------------ITP---GSIELPHHVKYKIRMDI 560
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  Fly   128 EDCEEMRESVIENGLFAGLCFDGSPFVEDQVFEEDTLESYSNIQPMLNYTILLPS----ELRMLD 188

Human   561 DNVERTNKIKDGYW------DPGPRA-----DPFED--MRYVWGGFAYLQDVVEQAIIRVLTGTE 612
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  Fly   189 GDFRMAN------WMTLYNDDPNTFVLTRLNQPYEGGFVGYVREGFIRLQKSVSESFL-VLTSHK 246

Human   613 KKTGVYMQQMPYPCYVDDIFLRVMSRSMPLFMTLAWIYSVAVIIKGIVYEKEARLKETMRIMGLD 677
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  Fly   247 SLPTIQIRRFPITGREQDPLMGNLNYGMPFIIIIGFLFPAQLFVWQVVSEKQSQVRQFLINMNIG 311

Human   678 NSILWFSWFISSLIPLLVSAGLLVVILKL-----GNLLPYSDPSVVFVFLSVFAVVTILQCFLIS 737
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  Fly   312 NLIHFVSWYLKGLIYEMISSLIIAALLKIRWDQDHGVLTQTPWYILILVLFCYNCAAVAFAIMVA 376

Human   738 TLFSRANLAAACGGIIYFTLYLP-YVLC------VAWQDYVGFTL-KIFASLLSPVAFGFGCEYF 794
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  Fly   377 AFFRNALNAVRVLTILWIMSYVPTFILSNNLEGNIHALRYVSYALPNVVATLVIE---------F 432

Human   795 ALFEEQGIGVQW-DNLFESPVEEDGFNLTTSVSMMLF--DTFLYGVMTWYIEAVFPGQYG---IP 853
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  Fly   433 LIERESIVHITWEDSGYR--LNYDGGHITVTASSWIFMLNALVYCAIGLYVDMWRGGDRSGKKMK 495

Human   854 RPWYFPCTKSYWFGEESDEKSHPGS----NQKRISEICMEEEPTHLKLGVSIQNLVKVYRDGMKV 914
            :|......:...:.|..|..:|.|.    |..:|.|:    ||:|.:..:.|:.|.|.:....:.
  Fly   496 KPNTNASVQEDPYHERGDSFTHQGQAIGVNSTKIYEV----EPSHRRFKLKIKKLCKRFATNDRP 556

Human   915 AVDGLALNFYEGQITSFLGHNGAGKTTTMSILTGLFPPTSGTAYILGKDIRSEMSTIRQNLGVCP 979
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  Fly   557 ALNLFSWNVYENEVTVLMGHNGCGKSTLLKILAGLVEPSRGTVMISSHNIQTERKAASMELGIAF 621

Human   980 QHNVLFDMLTVEEHIWFYARLKGLSEKHVKAEMEQMA---LDV----GLPSSKLKSKTSQLSGGM 1037
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  Fly   622 GHDMLLTGFTVIDYLRFICRVKGL---HNNIEIDGQSNYFLNVLQIGGLKTKRIRTLT------- 676

Human  1038 QRKL---SVALAFVGGSKVVILDEPTAGVDPYSRRGIWELLLKYRQGRTIILSTHHMDEADVLGD 1099
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  Fly   677 DRDLCLVSICCAFVGNSPIILIDDVHSDLDKRTQSLVWNLINEEKSKRTIILVSNSPALAENIAD 741

Human  1100 RIAIISHGKLCCVGSSLFLKNQLGTGYYLTLVKKDVESSLSSCRNSSSTVSYLKKEDSVSQSSSD 1164
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  Fly   742 RMAIMSNGELKCTGTKPFLKNMYGHGYRLTCVK-------------------------------- 774

Human  1165 AGLGSDHESDTLTIDVSAISNLIRKHVSEARLVEDIGHELTYVLPYEAAKEGAFVELFHEIDDRL 1229
               |.:::.|.|       ..::..::....:..|||:::|:||  |...|..|..|..::::.:
  Fly   775 ---GKNYKRDEL-------FGMMNSYMPNMSIERDIGYKVTFVL--ENKFEDQFPMLIDDLEENM 827

Human  1230 SDLGISSYGISETTLEEIFLKVAEESGVDAETSDGTLPARRNRRAFGDK-QSCLRPFTEDDAADP 1293
            ..||:.|:.|.:|::|||||:.    |.:.....|...:..|.:...:: .|.|        |:.
  Fly   828 QQLGVVSFRIRDTSMEEIFLRF----GCEDNDQSGAFQSHENAQVLLEEYYSTL--------AEA 880

Human  1294 NDSDIDPESRETDLLSGMDGKGSYQVKGWKLTQQQFVALLWKRLLIARRSRKGFFAQIVLPAVFV 1358
            |:     :.|.|               ||||......|:::||.:.|.|.      .|||....:
  Fly   881 NE-----KGRRT---------------GWKLFFLHGRAVIYKRWIAAHRH------WIVLIFEVL 919

Human  1359 CIALV----FSLIVPPFGKYPSLELQPWMYNEQYTFVSNDAPEDTGTLELLNALTKDPGFGTRCM 1419
            .:|||    ||.|. .:||  :.||:|..:|                |..|:.:
  Fly   920 AMALVAVCTFSSIF-IYGK--NYELEPLTFN----------------LSQLHTV----------- 954

Human  1420 EGNPIPDTPCQAGEEEWTTAPVPQTIMDLFQNGNWTMQNPSPACQCSSDKIKKMLPVCPPGAGGL 1484
                                   ...::||.               ..:.:|.|
  Fly   955 -----------------------DAFVELFS---------------EEEDVKDM----------- 970

Human  1485 PPPQRKQNTADILQDLTGRNISDYLVKTYVQIIAKSLKNKIWVNEFRYGGFSLGVSNTQALPPSQ 1549
                 .....::|          |....:|..:.|:          |:..::|...|
  Fly   971 -----HAYYTELL----------YWYDAHVATLTKN----------RHNAYALLTQN-------- 1002

Human  1550 EVNDAIKQMKKHLKLAKDSSADRFLNSLGRFMTGLDTKNNVKVWFNNKGWHAISSFLNVINNAIL 1614
                   |...|            :||...|....|.| .|..||||...|:....|||::||:.
  Fly  1003 -------QFTAH------------VNSRYIFGATFDQK-IVTAWFNNIPLHSAPYALNVVHNAVA 1047

Human  1615 R--------ANLQKGENPSHYGITAF---NHPLNLTKQQLSEVALMTTSVDVLVSICVIFAMSFV 1668
            |        .::.....|....|..|   :|               |....:...||  |.::|:
  Fly  1048 RHLFDEEATIDVTLAPLPFRTAINTFPPSSH---------------TFGGCLAFGIC--FVLTFI 1095

Human  1669 PASFVVFLIQERVSKAKHLQFISGVKPVIYWLSNFVWDMCNYVVPATLVIIIFICFQQKS----- 1728
            ..:|.:::|.||.|..|..||::||:...||....::|:...::....|:::...::..:
  Fly  1096 WPAFAIYMITERGSLLKKQQFLAGVRVCSYWTFTVLYDLLFLLIFCACVVVMVALYENPNHDVML 1160

Human  1729 --YVSSTNLPVLALLLLLYGWSITPLMYPASFVFKIPSTAYVVLTSVNLFIGINGSVATFVLELF 1791
              |:|.|        |:|.|:.:..|.|..:.:.:.|...::.|..:|       |:.......|
  Fly  1161 YGYISVT--------LMLGGFWVILLAYLMASLCRNPCYGFLWLCGIN-------SIGLVCFSQF 1210

Human  1792 ------------TDNKLNNINDILKSVFLI--FPHFCLGRGL----IDMVKNQAMADALERFGEN 1838
                        |...:..:..::..:|:|  |...|:...:    :::.|..::.:...:....
  Fly  1211 YRTHPESMLLEPTFMAMYTVATVICKLFMIYEFKLICMDPVVNFTSVEVFKCNSIPNCCIKSNYG 1275

Human  1839 RFVSPLSWDLVGRNLFAMAVEGVVFFLITVLIQYRFFIRPRP-----VNAKLSPLNDEDEDVRRE 1898
            .|.:.:..||            |:..|:.:::....|:....     .:.:|....:|..|..:|
  Fly  1276 TFTAGIYHDL------------VILTLLDIILLACLFVSEYHSILGFADCRLDTRTNESPDSNQE 1328

Human  1899 RQRILDGGGQNDILEI--KELTKIYRRKRKPAVDRICVGI-----------------PPGECFGL 1944
             .|...|...||...:  ||.|.....:.:.....:.:||                 ...||..:
  Fly  1329 -SRAFPGILSNDTAALVDKEHTSRLNEEERSKYAAVGIGIVSKYRRNRVLRDLDFTLAKSECLSI 1392

Human  1945 LGVNGAGKSSTFKMLTGDTTVTRGDAFLNKNSILSNIHEV--HQNMGYCPQFDAITELLTGREHV 2007
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  Fly  1393 TGANNSGKTTLLKVVVNETKMNAGQLWIHDYSV--NTHRVQCYRMVGYCPQKDSLPSEFTPRELL 1455

Human  2008 EFFALLRGVPEKEVGKVGEWAIRKLGLVKYGEKYAGNYSGGNKRKLSTAMALIGGPPVVFLDEPT 2072
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  Fly  1456 YIHAMLQGHRHRIGRELSEALLRLVGLTPCWNRSVRMCTTGQIRRLYFAYAVLGSPDLICVDGVP 1520

Human  2073 TGMDPKARRFLWNCALSVVKEGRSVVLTSHSMEECEALCTRMAIMVNGRFRCLGSVQHLKNRFGD 2137
            .|:||..:|.:.....::...|.|.:.|..:..:.|.|..|..:::.|:...:..:......:..
  Fly  1521 AGLDPTGKRIILMMTSTMQAMGSSFLYTMLTGLDAERLSLRTPLLLEGQLWMIRPMDTETENYKS 1585

Human  2138 GYTIVVRIAGS-NPDL------------------KPVQDFFGLAFPGSVLKEKHRNMLQYQLPSS 2183
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  Fly  1586 GYQLEVRFKRKVNPNVSMSRATWNLINHFPMSPNKKFSAFMEIKFPDAVLTIERDDSMVFVLPLG 1650

Human  2184 LSSLARIFSILSQSKKRLHIEDYSVSQTTLDQVFVNFAKDQSDDD 2228
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  Fly  1651 TTTFSEIFLTLRKDAFEMNIEDYFITRNML-VGFQIFTYDQHQDN 1694

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
ABCA1	NP_005493.2	rim_protein	6..2236	CDD:130324	413/1995 (21%)
		Annulus domain 1. /evidence=ECO:0000305|PubMed:35974019	69..80
		Annulus domain 2. /evidence=ECO:0000305|PubMed:35974019	368..379
		Gateway domain. /evidence=ECO:0000305|PubMed:35974019	564..594		9/42 (21%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1283..1312		4/28 (14%)
CG1494	NP_608444.2	rim_protein	<223..1689	CDD:130324	366/1753 (21%)
		ABC_subfamily_A	541..761	CDD:213230	71/229 (31%)