DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment JAG1 and Jag1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_000205.1 Gene:JAG1 / 182 HGNCID:6188 Length:1218 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_062020.2 Gene:Jag1 / 29146 RGDID:2937 Length:1219 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1219 Identity:1176/1219 - (96%)
Similarity:1193/1219 - (97%) Gaps:1/1219 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MRSPRTRGRSGRPLSLLLALLCALRAKVCGASGQFELEILSMQNVNGELQNGNCCGGARNPGDRK 65
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MRSPRTRGRPGRPLSLLLALLCALRAKVCGASGQFELEILSMQNVNGELQNGNCCGGARNPGDRK 65

Human    66 CTRDECDTYFKVCLKEYQSRVTAGGPCSFGSGSTPVIGGNTFNLKASRGNDRNRIVLPFSFAWPR 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 CTRDECDTYFKVCLKEYQSRVTAGGPCSFGSGSTPVIGGNTFNLKASRGNDRNRIVLPFSFAWPR 130

Human   131 SYTLLVEAWDSSNDTVQPDSIIEKASHSGMINPSRQWQTLKQNTGVAHFEYQIRVTCDDYYYGFG 195
            |||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||:|||||
  Rat   131 SYTLLVEAWDSSNDTIQPDSIIEKASHSGMINPSRQWQTLKQNTGIAHFEYQIRVTCDDHYYGFG 195

Human   196 CNKFCRPRDDFFGHYACDQNGNKTCMEGWMGPECNRAICRQGCSPKHGSCKLPGDCRCQYGWQGL 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 CNKFCRPRDDFFGHYACDQNGNKTCMEGWMGPECNKAICRQGCSPKHGSCKLPGDCRCQYGWQGL 260

Human   261 YCDKCIPHPGCVHGICNEPWQCLCETNWGGQLCDKDLNYCGTHQPCLNGGTCSNTGPDKYQCSCP 325
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
  Rat   261 YCDKCIPHPGCVHGTCNEPWQCLCETNWGGQLCDKDLNYCGTHQPCLNRGTCSNTGPDKYQCSCP 325

Human   326 EGYSGPNCEIAEHACLSDPCHNRGSCKETSLGFECECSPGWTGPTCSTNIDDCSPNNCSHGGTCQ 390
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 EGYSGPNCEIAEHACLSDPCHNRGSCKETSSGFECECSPGWTGPTCSTNIDDCSPNNCSHGGTCQ 390

Human   391 DLVNGFKCVCPPQWTGKTCQLDANECEAKPCVNAKSCKNLIASYYCDCLPGWMGQNCDININDCL 455
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 DLVNGFKCVCPPQWTGKTCQLDANECEAKPCVNARSCKNLIASYYCDCLPGWMGQNCDININDCL 455

Human   456 GQCQNDASCRDLVNGYRCICPPGYAGDHCERDIDECASNPCLNGGHCQNEINRFQCLCPTGFSGN 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 GQCQNDASCRDLVNGYRCICPPGYAGDHCERDIDECASNPCLNGGHCQNEINRFQCLCPTGFSGN 520

Human   521 LCQLDIDYCEPNPCQNGAQCYNRASDYFCKCPEDYEGKNCSHLKDHCRTTPCEVIDSCTVAMASN 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   521 LCQLDIDYCEPNPCQNGAQCYNRASDYFCKCPEDYEGKNCSHLKDHCRTTPCEVIDSCTVAMASN 585

Human   586 DTPEGVRYISSNVCGPHGKCKSQSGGKFTCDCNKGFTGTYCHENINDCESNPCRNGGTCIDGVNS 650
            ||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||
  Rat   586 DTPEGVRYISSNVCGPHGKCKSESGGKFTCDCNKGFTGTYCHENINDCEGNPCTNGGTCIDGVNS 650

Human   651 YKCICSDGWEGAYCETNINDCSQNPCHNGGTCRDLVNDFYCDCKNGWKGKTCHSRDSQCDEATCN 715
            ||||||||||||:||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   651 YKCICSDGWEGAHCENNINDCSQNPCHYGGTCRDLVNDFYCDCKNGWKGKTCHSRDSQCDEATCN 715

Human   716 NGGTCYDEGDAFKCMCPGGWEGTTCNIARNSSCLPNPCHNGGTCVVNGESFTCVCKEGWEGPICA 780
            ||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||.
  Rat   716 NGGTCYDEVDTFKCMCPGGWEGTTCNIARNSSCLPNPCHNGGTCVVNGDSFTCVCKEGWEGPICT 780

Human   781 QNTNDCSPHPCYNSGTCVDGDNWYRCECAPGFAGPDCRININECQSSPCAFGATCVDEINGYRCV 845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|:
  Rat   781 QNTNDCSPHPCYNSGTCVDGDNWYRCECAPGFAGPDCRININECQSSPCAFGATCVDEINGYQCI 845

Human   846 CPPGHSGAKCQEVSGRPCITMGSVIPDGAKWDDDCNTCQCLNGRIACSKVWCGPRPCLLHKGHSE 910
            ||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||:||||||||||||.|||||.|
  Rat   846 CPPGHSGAKCHEVSGRSCITMGRVILDGAKWDDDCNTCQCLNGRVACSKVWCGPRPCQLHKGHGE 910

Human   911 CPSGQSCIPILDDQCFVHPCTGVGECRSSSLQPVKTKCTSDSYYQDNCANITFTFNKEMMSPGLT 975
            ||:||||||:|||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   911 CPNGQSCIPVLDDQCFVRPCTGAGECRSSSLQPVKTKCTSDSYYQDNCANITFTFNKEMMSPGLT 975

Human   976 TEHICSELRNLNILKNVSAEYSIYIACEPSPSANNEIHVAISAEDIRDDGNPIKEITDKIIDLVS 1040
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||:||||||||||||
  Rat   976 TEHICSELRNLNILKNVSAEYSIYIACEPSLSANNEIHVAISAEDIRDDGNPVKEITDKIIDLVS 1040

Human  1041 KRDGNSSLIAAVAEVRVQRRPLKNRTDFLVPLLSSVLTVAWICCLVTAFYWCLRK-RRKPGSHTH 1104
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||:|| ||||.||||
  Rat  1041 KRDGNSSLIAAVAEVRVQRRPLKNRTDFLVPLLSSVLTVAWVCCLVTAFYWCVRKRRRKPSSHTH 1105

Human  1105 SASEDNTTNNVREQLNQIKNPIEKHGANTVPIKDYENKNSKMSKIRTHNSEVEEDDMDKHQQKAR 1169
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
  Rat  1106 SAPEDNTTNNVREQLNQIKNPIEKHGANTVPIKDYENKNSKMSKIRTHNSEVEEDDMDKHQQKVR 1170

Human  1170 FAKQPAYTLVDREEKPPNGTPTKHPNWTNKQDNRDLESAQSLNRMEYIV 1218
            |||||.|||||||||.|:|||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1171 FAKQPVYTLVDREEKAPSGTPTKHPNWTNKQDNRDLESAQSLNRMEYIV 1219

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
JAG1NP_000205.1 MNNL 32..185 CDD:462222 150/152 (99%)
DSL 167..229 CDD:128366 59/61 (97%)
Important for interaction with NOTCH1. /evidence=ECO:0000269|PubMed:18660822 199..207 7/7 (100%)
EGF_CA 296..334 CDD:238011 36/37 (97%)
EGF 340..370 CDD:394967 28/29 (97%)
EGF_CA 374..410 CDD:238011 35/35 (100%)
EGF_CA 412..447 CDD:238011 33/34 (97%)
EGF_CA 450..485 CDD:238011 34/34 (100%)
EGF_CA 487..523 CDD:238011 35/35 (100%)
EGF_CA 525..560 CDD:238011 34/34 (100%)
EGF_CA 629..665 CDD:238011 32/35 (91%)
EGF_CA 667..702 CDD:238011 33/34 (97%)
EGF 748..777 CDD:394967 27/28 (96%)
EGF_CA 782..817 CDD:238011 34/34 (100%)
EGF_CA 820..856 CDD:238011 33/35 (94%)
VWC_out 863..930 CDD:214565 58/66 (88%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1152..1218 61/65 (94%)
Jag1NP_062020.2 MNNL 32..185 CDD:462222 150/152 (99%)
DSL 167..229 CDD:128366 59/61 (97%)
Important for interaction with NOTCH1. /evidence=ECO:0000250 199..207 7/7 (100%)
EGF_CA 296..334 CDD:238011 36/37 (97%)
EGF 340..370 CDD:394967 28/29 (97%)
EGF_CA 374..410 CDD:238011 35/35 (100%)
EGF_CA 412..447 CDD:238011 33/34 (97%)
EGF_CA 450..485 CDD:238011 34/34 (100%)
EGF_CA 487..523 CDD:238011 35/35 (100%)
EGF_CA 525..560 CDD:238011 34/34 (100%)
EGF_CA 629..665 CDD:238011 32/35 (91%)
EGF_CA 667..702 CDD:238011 33/34 (97%)
EGF_CA <714..740 CDD:238011 23/25 (92%)
EGF 748..777 CDD:394967 27/28 (96%)
EGF_CA 782..817 CDD:238011 34/34 (100%)
EGF_CA 820..855 CDD:238011 32/34 (94%)
VWC_out 863..930 CDD:214565 58/66 (88%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1182..1219 34/36 (94%)

Return to query results.
Submit another query.