DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment AGL and agl

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_000019.2 Gene:AGL / 178 HGNCID:321 Length:1532 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_031756872.1 Gene:agl / 780065 XenbaseID:XB-GENE-1001429 Length:1532 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:1533 Identity:1195/1533 - (77%)
Similarity:1369/1533 - (89%) Gaps:2/1533 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MGHSKQIRILLLNEMEKLEKTLFRLEQGYELQFRLGPTLQGKAVTVYTNYPFPGETFNREKFRSL 65
            |.||||:|:|.||:||||:|.|||||||:|||||||||||||.||||:|||.||..::|:.|..|
 Frog     1 MEHSKQVRVLQLNDMEKLDKRLFRLEQGFELQFRLGPTLQGKDVTVYSNYPPPGAVYDRQTFHPL 65

Human    66 DWENPTEREDDSDKYCKLNLQQSGSFQYYFLQGNEKSGGGYIVVDPILRVGADNHVLPLDCVTLQ 130
            .|.|||.||:||||:|||:|:.:|||||:||||::|:|.|||||||:|||||||..|||||:|||
 Frog    66 QWHNPTGREEDSDKFCKLDLKIAGSFQYHFLQGDQKNGEGYIVVDPVLRVGADNRALPLDCITLQ 130

Human   131 TFLAKCLGPFDEWESRLRVAKESGYNMIHFTPLQTLGLSRSCYSLANQLELNPDFSRPNRKYTWN 195
            |:|:|||||.||||.||:||||:||||||||||||||.||||||||:||:||||||||.:.|.|:
 Frog   131 TYLSKCLGPLDEWEDRLKVAKEAGYNMIHFTPLQTLGESRSCYSLADQLQLNPDFSRPGKVYGWD 195

Human   196 DVGQLVEKLKKEWNVICITDVVYNHTAANSKWIQEHPECAYNLVNSPHLKPAWVLDRALWRFSCD 260
            |||:||||::||||::.|||||||||||||||||:||||.|||||||||||||:||||||..:||
 Frog   196 DVGKLVEKMRKEWNMLSITDVVYNHTAANSKWIQQHPECGYNLVNSPHLKPAWLLDRALWHLTCD 260

Human   261 VAEGKYKEKGIPALIENDHHMNSIRKIIWEDIFPKLKLWEFFQVDVNKAVEQFRRLLTQ-ENRRV 324
            .|||||..||:||||:.|..:||||.|:||:|:|::|||||:||:|:|||:|||.|||. ..::.
 Frog   261 AAEGKYAAKGLPALIKTDQQLNSIRGIVWEEIYPRIKLWEFYQVEVDKAVKQFRALLTSGAQKKG 325

Human   325 TKSDPNQHLTIIQDPEYRRFGCTVDMNIALTTFIPHDKGPAAIEECCNWFHKRMEELNSEKHRLI 389
            .|||| :||.|||||||:||||:|||:.||.|||||..||:||||||.||.||:||||:||||.:
 Frog   326 NKSDP-KHLMIIQDPEYKRFGCSVDMDTALNTFIPHSNGPSAIEECCTWFRKRLEELNAEKHRQM 389

Human   390 NYHQEQAVNCLLGNVFYERLAGHGPKLGPVTRKHPLVTRYFTFPFEEIDFSMEESMIHLPNKACF 454
            |:|.||||||:||.:.||||||.||||||:|:|.|:|||||||||:::..|.||||:|.|:|||:
 Frog   390 NFHHEQAVNCILGTMTYERLAGQGPKLGPITKKDPIVTRYFTFPFKDMSLSEEESMMHQPDKACY 454

Human   455 LMAHNGWVMGDDPLRNFAEPGSEVYLRRELICWGDSVKLRYGNKPEDCPYLWAHMKKYTEITATY 519
            .:||||||||||||||||.|.|.||:||||||||||||||||:||.||||||.||||||||||.:
 Frog   455 FLAHNGWVMGDDPLRNFAGPDSNVYVRRELICWGDSVKLRYGDKPSDCPYLWEHMKKYTEITAKH 519

Human   520 FQGVRLDNCHSTPLHVAEYMLDAARNLQPNLYVVAELFTGSEDLDNVFVTRLGISSLIREAMSAY 584
            |.|||||||||||:|||||:||.||.::|:||||||||||||:|||||||||||:||||||||||
 Frog   520 FHGVRLDNCHSTPIHVAEYLLDVARKVRPDLYVVAELFTGSEELDNVFVTRLGINSLIREAMSAY 584

Human   585 NSHEEGRLVYRYGGEPVGSFVQPCLRPLMPAIAHALFMDITHDNECPIVHRSAYDALPSTTIVSM 649
            |||||||||||:|||||||||||.||||:|:||||||||:|||||.||.||||||:|||:.||||
 Frog   585 NSHEEGRLVYRFGGEPVGSFVQPSLRPLVPSIAHALFMDVTHDNESPITHRSAYDSLPSSAIVSM 649

Human   650 ACCASGSTRGYDELVPHQISVVSEERFYTKWNPEALPSNTGEVNFQSGIIAARCAISKLHQELGA 714
            ||||:||||||||||||||||||||||||||||:.......:||.||||||.:.|::||||||.|
 Frog   650 ACCATGSTRGYDELVPHQISVVSEERFYTKWNPKMAAPIPRDVNGQSGIIAGKRALNKLHQELAA 714

Human   715 KGFIQVYVDQVDEDIVAVTRHSPSIHQSVVAVSRTAFRNPKTSFYSKEVPQMCIPGKIEEVVLEA 779
            :||:|||||||||||||||||.|..|||||||||||||:||.|||||||||||||||||||:|||
 Frog   715 RGFLQVYVDQVDEDIVAVTRHCPHTHQSVVAVSRTAFRDPKNSFYSKEVPQMCIPGKIEEVILEA 779

Human   780 RTIERNTKPYRKDENSINGTPDITVEIREHIQLNESKIVKQAGVATKGPNEYIQEIEFENLSPGS 844
            ||:||..:||.:||..|||.|..||||||||||.|||||||||:.||||||::|||:||||:|||
 Frog   780 RTVERKAEPYSQDEKFINGLPQYTVEIREHIQLKESKIVKQAGITTKGPNEFVQEIDFENLTPGS 844

Human   845 VIIFRVSLDPHAQVAVGILRNHLTQFSPHFKSGSLAVDNADPILKIPFASLASRLTLAELNQILY 909
            ||||||||||.||.:|||||:||.||:|||.||||..|.|.||||:||||:|::|:||:|||:||
 Frog   845 VIIFRVSLDPKAQESVGILRSHLIQFTPHFTSGSLPDDQAHPILKVPFASIAAKLSLADLNQVLY 909

Human   910 RCESEEKEDGGGCYDIPNWSALKYAGLQGLMSVLAEIRPKNDLGHPFCNNLRSGDWMIDYVSNRL 974
            ||:|||:|||||||:||||:.|||||||||:||:.:||||||||||||:|||.||||||||||||
 Frog   910 RCDSEEQEDGGGCYNIPNWTPLKYAGLQGLISVMVDIRPKNDLGHPFCDNLRCGDWMIDYVSNRL 974

Human   975 ISRSGTIAEVGKWLQAMFFYLKQIPRYLIPCYFDAILIGAYTTLLDTAWKQMSSFVQNGSTFVKH 1039
            |:|.|..||||||.||||.||||||||||||||||||:||||||||.||||||||||||||.:||
 Frog   975 IARGGPCAEVGKWFQAMFSYLKQIPRYLIPCYFDAILVGAYTTLLDAAWKQMSSFVQNGSTLIKH 1039

Human  1040 LSLGSVQLCGVGKFPSLPILSPALMDVPYRLNEITKEKEQCCVSLAAGLPHFSSGIFRCWGRDTF 1104
            |:|||||:||||:||:||:|||:|.|||||||.||:||||||.||||||||||||||||||||||
 Frog  1040 LALGSVQMCGVGRFPALPVLSPSLQDVPYRLNSITQEKEQCCPSLAAGLPHFSSGIFRCWGRDTF 1104

Human  1105 IALRGILLITGRYVEARNIILAFAGTLRHGLIPNLLGEGIYARYNCRDAVWWWLQCIQDYCKMVP 1169
            |:|||:|||||.|:|||||||||||||||||||||||:|.|||||||||||||||||||||..||
 Frog  1105 ISLRGLLLITGSYLEARNIILAFAGTLRHGLIPNLLGQGTYARYNCRDAVWWWLQCIQDYCITVP 1169

Human  1170 NGLDILKCPVSRMYPTDDSAPLPAGTLDQPLFEVIQEAMQKHMQGIQFRERNAGPQIDRNMKDEG 1234
            ||..||:||||||||||||...|||.:||||:||||||:|:|..||.||||||||||||||:|||
 Frog  1170 NGSAILQCPVSRMYPTDDSPTQPAGQVDQPLYEVIQEALQRHALGINFRERNAGPQIDRNMRDEG 1234

Human  1235 FNITAGVDEETGFVYGGNRFNCGTWMDKMGESDRARNRGIPATPRDGSAVEIVGLSKSAVRWLLE 1299
            |||.||||.|||||:||||.||||||||||||:|||::|||||||||||||||||.||.||||.:
 Frog  1235 FNIVAGVDLETGFVFGGNRLNCGTWMDKMGESERARSKGIPATPRDGSAVEIVGLCKSTVRWLQD 1299

Human  1300 LSKKNIFPYHEVTVKRHGKAIKVSYDEWNRKIQDNFEKLFHVSEDPSDLNEKHPNLVHKRGIYKD 1364
            ||:|.::||..|||.|.|:.:.:::.|||::|||||||.|.|||:.||.||:.|:||||||||||
 Frog  1300 LSEKKLYPYKGVTVLRDGREVTLTFSEWNQRIQDNFEKKFFVSENISDPNEQRPDLVHKRGIYKD 1364

Human  1365 SYGASSPWCDYQLRPNFTIAMVVAPELFTTEKAWKALEIAEKKLLGPLGMKTLDPDDMVYCGIYD 1429
            |:|||||||||||||||.:||||||||||.:.|||||||.||||:|||||||||||||||||:||
 Frog  1365 SFGASSPWCDYQLRPNFPVAMVVAPELFTPKNAWKALEITEKKLMGPLGMKTLDPDDMVYCGVYD 1429

Human  1430 NALDNDNYNLAKGFNYHQGPEWLWPIGYFLRAKLYFSRLMGPETTAKTIVLVKNVLSRHYVHLER 1494
            ||||||||||:|||||||||||:|||||||||||:|::||..|:..||:|||||||||||.||||
 Frog  1430 NALDNDNYNLSKGFNYHQGPEWMWPIGYFLRAKLHFAKLMDRESYQKTVVLVKNVLSRHYTHLER 1494

Human  1495 SPWKGLPELTNENAQYCPFSCETQAWSIATILETLYDL 1532
            |.|||||||||||.||||||||||||||:.|||.||||
 Frog  1495 SSWKGLPELTNENGQYCPFSCETQAWSISVILEVLYDL 1532

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
AGLNP_000019.2 glyc_debranch 22..1532 CDD:273673 1179/1510 (78%)
aglXP_031756872.1 GDE_C 22..1532 CDD:481207 1179/1510 (78%)

Return to query results.
Submit another query.