DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment AGL and agla

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_000019.2 Gene:AGL / 178 HGNCID:321 Length:1532 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_005163674.1 Gene:agla / 567798 ZFINID:ZDB-GENE-071004-6 Length:1533 Species:Danio rerio


Alignment Length:1532 Identity:1146/1532 - (74%)
Similarity:1337/1532 - (87%) Gaps:4/1532 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     4 SKQIRILLLNEMEKLEKTLFRLEQGYELQFRLGPTLQGKAVTVYTNYPFPGETFNREKFRSLDWE 68
            :||.|:::||:||||::|||||:||:|||||||||||||.|.||||||..||.|:|:||.:|||.
Zfish     3 AKQTRVMVLNDMEKLDRTLFRLDQGFELQFRLGPTLQGKHVRVYTNYPTEGERFDRQKFHALDWI 67

Human    69 NPTEREDDSDKYCKLNLQQSGSFQYYFLQ-GNEKSGGGYIVVDPILRVGADNHVLPLDCVTLQTF 132
            |||.|||||||:|.|:|:.|||:||||.. |:||||||||||||:||||||||||||||:|:||:
Zfish    68 NPTAREDDSDKFCTLDLKISGSYQYYFGHGGDEKSGGGYIVVDPVLRVGADNHVLPLDCITIQTY 132

Human   133 LAKCLGPFDEWESRLRVAKESGYNMIHFTPLQTLGLSRSCYSLANQLELNPDFSRPNRKYTWNDV 197
            |:|||||.|||..|||||||:||||||||||||||.||||||||:|||||||||...:.|||.|.
Zfish   133 LSKCLGPLDEWSDRLRVAKEAGYNMIHFTPLQTLGESRSCYSLADQLELNPDFSPSGQTYTWTDA 197

Human   198 GQLVEKLKKEWNVICITDVVYNHTAANSKWIQEHPECAYNLVNSPHLKPAWVLDRALWRFSCDVA 262
            |.||||||.|||::|||||||||||:|||||::||||.||||||||||||||||||||..:|.:|
Zfish   198 GNLVEKLKNEWNMLCITDVVYNHTASNSKWIKKHPECGYNLVNSPHLKPAWVLDRALWHVTCAIA 262

Human   263 EGKYKEKGIPALIENDHHMNSIRKIIWEDIFPKLKLWEFFQVDVNKAVEQFRRLLTQENRR--VT 325
            :|||:::|:||||::..|:::||.::|:::|||:||||||||.:...|||||.|| |...:  .:
Zfish   263 DGKYEDRGLPALIQDHPHLHAIRGVLWQEVFPKIKLWEFFQVKIEALVEQFRALL-QSGAKPDSS 326

Human   326 KSDPNQHLTIIQDPEYRRFGCTVDMNIALTTFIPHDKGPAAIEECCNWFHKRMEELNSEKHRLIN 390
            |:|..:.|.|||||:|||||.|||||.||..|:|:...|.|||:||||..:::||||.|:...:.
Zfish   327 KTDGKKQLKIIQDPQYRRFGNTVDMNTALELFVPNGNSPGAIEDCCNWLRRKLEELNGEQFHEVK 391

Human   391 YHQEQAVNCLLGNVFYERLAGHGPKLGPVTRKHPLVTRYFTFPFEEIDFSMEESMIHLPNKACFL 455
            :|||||.||:.|.|.|||||.|||||||:|||||||||||||||||.....:..:|:.|.|:|..
Zfish   392 HHQEQATNCIDGTVSYERLADHGPKLGPITRKHPLVTRYFTFPFEETTLEQDLELINQPEKSCHF 456

Human   456 MAHNGWVMGDDPLRNFAEPGSEVYLRRELICWGDSVKLRYGNKPEDCPYLWAHMKKYTEITATYF 520
            :||||||||||||||||||||.||:||||||||||||||||:.|||||||||||:|||||||.:|
Zfish   457 LAHNGWVMGDDPLRNFAEPGSNVYIRRELICWGDSVKLRYGSGPEDCPYLWAHMQKYTEITAKHF 521

Human   521 QGVRLDNCHSTPLHVAEYMLDAARNLQPNLYVVAELFTGSEDLDNVFVTRLGISSLIREAMSAYN 585
            .||||||||||||||||.||.|||:::|||||:||||||||.:|||||.||||:|||||||||.:
Zfish   522 VGVRLDNCHSTPLHVAEAMLAAARSVRPNLYVIAELFTGSELIDNVFVNRLGITSLIREAMSAGD 586

Human   586 SHEEGRLVYRYGGEPVGSFVQPCLRPLMPAIAHALFMDITHDNECPIVHRSAYDALPSTTIVSMA 650
            |||||||||||||||||:|:||.||||:|:||||:|:|:||||||||..||.||:|||:.|||||
Zfish   587 SHEEGRLVYRYGGEPVGAFLQPSLRPLVPSIAHAMFLDVTHDNECPIQIRSVYDSLPSSAIVSMA 651

Human   651 CCASGSTRGYDELVPHQISVVSEERFYTKWNPEALPSNTGEVNFQSGIIAARCAISKLHQELGAK 715
            |||:||||||||||||||||||||||||||:.:|.||:..|||.|:||||.:.|:::|||||.||
Zfish   652 CCATGSTRGYDELVPHQISVVSEERFYTKWSSQAKPSSPNEVNLQTGIIAGKLALNRLHQELAAK 716

Human   716 GFIQVYVDQVDEDIVAVTRHSPSIHQSVVAVSRTAFRNPKTSFYSKEVPQMCIPGKIEEVVLEAR 780
            ||.||:||||||||||||||.||.|||||||.||||:|||...|:.|||.|||||||||||||||
Zfish   717 GFSQVFVDQVDEDIVAVTRHCPSTHQSVVAVCRTAFKNPKHHRYTDEVPPMCIPGKIEEVVLEAR 781

Human   781 TIERNTKPYRKDENSINGTPDITVEIREHIQLNESKIVKQAGVATKGPNEYIQEIEFENLSPGSV 845
            |:||.|..|:|||.||||.|:.||||:|||||.:||:|:||||.::|.:||:|||.||.|:||||
Zfish   782 TVERQTGTYKKDERSINGMPEYTVEIKEHIQLADSKVVRQAGVTSRGRSEYVQEIVFEKLTPGSV 846

Human   846 IIFRVSLDPHAQVAVGILRNHLTQFSPHFKSGSLAVDNADPILKIPFASLASRLTLAELNQILYR 910
            |.|||||||.:|..||:|||||.||:|.:|:||:...|...|||.|...:.|:||||::|.:|:|
Zfish   847 IAFRVSLDPKSQELVGVLRNHLIQFNPLYKAGSVPDSNTPDILKSPLTQIMSKLTLADMNLLLFR 911

Human   911 CESEEKEDGGGCYDIPNWSALKYAGLQGLMSVLAEIRPKNDLGHPFCNNLRSGDWMIDYVSNRLI 975
            |:|||||||||||:||.|:.|||.|||||:||:||||||||||||||:|||.||||||||||||:
Zfish   912 CDSEEKEDGGGCYNIPGWTPLKYGGLQGLLSVMAEIRPKNDLGHPFCDNLRQGDWMIDYVSNRLV 976

Human   976 SRSGTIAEVGKWLQAMFFYLKQIPRYLIPCYFDAILIGAYTTLLDTAWKQMSSFVQNGSTFVKHL 1040
            ||.|.:||||:|.||||.|||.||||||||||||||:||:||.||..::|||||||:||:|||.|
Zfish   977 SRGGPLAEVGQWFQAMFAYLKHIPRYLIPCYFDAILVGAFTTALDATFRQMSSFVQDGSSFVKLL 1041

Human  1041 SLGSVQLCGVGKFPSLPILSPALMDVPYRLNEITKEKEQCCVSLAAGLPHFSSGIFRCWGRDTFI 1105
            :|||||:||||:||:||.|||||.|||||:|||||||||||||:||||||||:||||||||||||
Zfish  1042 ALGSVQMCGVGRFPALPPLSPALSDVPYRVNEITKEKEQCCVSMAAGLPHFSAGIFRCWGRDTFI 1106

Human  1106 ALRGILLITGRYVEARNIILAFAGTLRHGLIPNLLGEGIYARYNCRDAVWWWLQCIQDYCKMVPN 1170
            ||||:||:|||::|||||||||||||||||||||||||:.||:|||||||||||||||||.||||
Zfish  1107 ALRGLLLVTGRHLEARNIILAFAGTLRHGLIPNLLGEGVGARFNCRDAVWWWLQCIQDYCTMVPN 1171

Human  1171 GLDILKCPVSRMYPTDDSAPLPAGTLDQPLFEVIQEAMQKHMQGIQFRERNAGPQIDRNMKDEGF 1235
            |.|||:||||||||||||.||.|||:||.|:|||.|||::|:|||:|||.||||||||||:||||
Zfish  1172 GTDILQCPVSRMYPTDDSKPLTAGTVDQLLYEVIHEAMERHIQGIEFRESNAGPQIDRNMRDEGF 1236

Human  1236 NITAGVDEETGFVYGGNRFNCGTWMDKMGESDRARNRGIPATPRDGSAVEIVGLSKSAVRWLLEL 1300
            ||.|.|:.:||||||||||||||||||||||:||||:|||||||||||||||||.||.:|||:||
Zfish  1237 NIEAKVNPDTGFVYGGNRFNCGTWMDKMGESERARNKGIPATPRDGSAVEIVGLCKSTLRWLVEL 1301

Human  1301 SKKNIFPYHEVTVKRHGKAIKVSYDEWNRKIQDNFEKLFHVSEDPSDLNEKHPNLVHKRGIYKDS 1365
            .||.:|||:.|.::|.||.:.|:||||..|||.||||:|:||.||:|.|||||.|||||||||||
Zfish  1302 HKKGLFPYNTVKIQRDGKQLSVAYDEWEMKIQKNFEKMFYVSHDPNDPNEKHPELVHKRGIYKDS 1366

Human  1366 YGASSPWCDYQLRPNFTIAMVVAPELFTTEKAWKALEIAEKKLLGPLGMKTLDPDDMVYCGIYDN 1430
            ||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.:||:||||||||||||||||||||:|||
Zfish  1367 YGASSPWCDYQLRPNFTIAMVVAPELFTVEHAWKALNMAEEKLLGPLGMKTLDPDDMVYCGVYDN 1431

Human  1431 ALDNDNYNLAKGFNYHQGPEWLWPIGYFLRAKLYFSRLMGPETTAKTIVLVKNVLSRHYVHLERS 1495
            :|||||||||||||||||||||||||||||||::|::.||.:|..||:.|||||||||.||:|||
Zfish  1432 SLDNDNYNLAKGFNYHQGPEWLWPIGYFLRAKIFFAKKMGKDTYDKTVYLVKNVLSRHNVHMERS 1496

Human  1496 PWKGLPELTNENAQYCPFSCETQAWSIATILETLYDL 1532
            .|||||||||||.|||.|||||||||:|.:||.|:||
Zfish  1497 SWKGLPELTNENGQYCSFSCETQAWSLAAVLEVLHDL 1533

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
AGLNP_000019.2 glyc_debranch 22..1532 CDD:273673 1134/1512 (75%)
aglaXP_005163674.1 GDE_C 21..1533 CDD:481207 1134/1512 (75%)

Return to query results.
Submit another query.