DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment AGL and Agl

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_000019.2 Gene:AGL / 178 HGNCID:321 Length:1532 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001102034.1 Gene:Agl / 362029 RGDID:1306376 Length:1532 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1532 Identity:1412/1532 - (92%)
Similarity:1478/1532 - (96%) Gaps:0/1532 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MGHSKQIRILLLNEMEKLEKTLFRLEQGYELQFRLGPTLQGKAVTVYTNYPFPGETFNREKFRSL 65
            |.||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
  Rat     1 MEHSKQIRILLLNEMEKLEKTLFRLEQGFELQFRLGPTLQGKAVTVYTNYPFPGEAFNREKFRSL 65

Human    66 DWENPTEREDDSDKYCKLNLQQSGSFQYYFLQGNEKSGGGYIVVDPILRVGADNHVLPLDCVTLQ 130
            |||||||||||||||||::||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 DWENPTEREDDSDKYCKVHLQQSGSFQYYFLQGQEKSGGGYIVVDPILRVGADNHVLPLDCVTLQ 130

Human   131 TFLAKCLGPFDEWESRLRVAKESGYNMIHFTPLQTLGLSRSCYSLANQLELNPDFSRPNRKYTWN 195
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||:|||||||||||||:|||:
  Rat   131 TFLAKCLGPFDEWESRLRVAKESGYNMIHFTPLQALGLSRSCYSLADQLELNPDFSRPNRRYTWD 195

Human   196 DVGQLVEKLKKEWNVICITDVVYNHTAANSKWIQEHPECAYNLVNSPHLKPAWVLDRALWRFSCD 260
            ||||||||||:|||::|||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||..|||
  Rat   196 DVGQLVEKLKREWNILCITDVVYNHTAANSKWIHEHPESAYNLVNSPHLKPAWVLDRALWHLSCD 260

Human   261 VAEGKYKEKGIPALIENDHHMNSIRKIIWEDIFPKLKLWEFFQVDVNKAVEQFRRLLTQENRRVT 325
            ||:|||:|||:|||||||||||.|||||||||||:::|||||||||.||||||||||:|||||||
  Rat   261 VADGKYREKGVPALIENDHHMNCIRKIIWEDIFPRIQLWEFFQVDVQKAVEQFRRLLSQENRRVT 325

Human   326 KSDPNQHLTIIQDPEYRRFGCTVDMNIALTTFIPHDKGPAAIEECCNWFHKRMEELNSEKHRLIN 390
            ||:|.:||.||||||:||.||.|||||||.||||||.||||||||||||.||:||||||||.|.:
  Rat   326 KSEPKEHLKIIQDPEFRRLGCAVDMNIALATFIPHDNGPAAIEECCNWFRKRLEELNSEKHHLTS 390

Human   391 YHQEQAVNCLLGNVFYERLAGHGPKLGPVTRKHPLVTRYFTFPFEEIDFSMEESMIHLPNKACFL 455
            .|||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||:..|.|||::|.|:|||||
  Rat   391 CHQEQAVNCLLGNVFYERLAGHGPKLGPVTRKYPLVTRYFTFPFEEMALSAEESLLHRPDKACFL 455

Human   456 MAHNGWVMGDDPLRNFAEPGSEVYLRRELICWGDSVKLRYGNKPEDCPYLWAHMKKYTEITATYF 520
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|
  Rat   456 MAHNGWVMGDDPLRNFAEPGSNVYLRRELICWGDSVKLRYGNKPEDCPYLWAHMKKYTEITATHF 520

Human   521 QGVRLDNCHSTPLHVAEYMLDAARNLQPNLYVVAELFTGSEDLDNVFVTRLGISSLIREAMSAYN 585
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||
  Rat   521 QGVRLDNCHSTPLHVAEYMLDAARKLQPNLYVVAELFTGSEDLDNIFVTRLGISSLIREAMSAYN 585

Human   586 SHEEGRLVYRYGGEPVGSFVQPCLRPLMPAIAHALFMDITHDNECPIVHRSAYDALPSTTIVSMA 650
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||
  Rat   586 SHEEGRLVYRYGGEPVGSFVQPCLRPLMPAIAHALFMDITHDNECPIVHRSAYDALPSTTVVSMA 650

Human   651 CCASGSTRGYDELVPHQISVVSEERFYTKWNPEALPSNTGEVNFQSGIIAARCAISKLHQELGAK 715
            |||||||||||||||||||||:||||||||||.|.||:||:|:..||||||||||::||||||||
  Rat   651 CCASGSTRGYDELVPHQISVVAEERFYTKWNPGASPSDTGDVSIHSGIIAARCAINRLHQELGAK 715

Human   716 GFIQVYVDQVDEDIVAVTRHSPSIHQSVVAVSRTAFRNPKTSFYSKEVPQMCIPGKIEEVVLEAR 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   716 GFIQVYVDQVDEDIVAVTRHSPSIHQSVVAVSRTAFRNPKTSFYSKEVPQMCIPGKIEEVVLEAR 780

Human   781 TIERNTKPYRKDENSINGTPDITVEIREHIQLNESKIVKQAGVATKGPNEYIQEIEFENLSPGSV 845
            ||||||||||||||||||.|::|||:||.|||:||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   781 TIERNTKPYRKDENSINGMPNMTVELRERIQLHESKIVKQAGVATKGPNEYIQEIEFENLSPGSV 845

Human   846 IIFRVSLDPHAQVAVGILRNHLTQFSPHFKSGSLAVDNADPILKIPFASLASRLTLAELNQILYR 910
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||:||||||||||:||:||||||||:|||
  Rat   846 IIFRVSLDPHAQVAVGILRNHLTQFSSHFKSGSLAVDNSDPILKIPFASIASKLTLAELNQVLYR 910

Human   911 CESEEKEDGGGCYDIPNWSALKYAGLQGLMSVLAEIRPKNDLGHPFCNNLRSGDWMIDYVSNRLI 975
            |||||:|||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||
  Rat   911 CESEEQEDGGGCYDIPNWSSLKYAGLQGLMSVLAEIRPKNDLGHPFCENLRSGDWMIDYVSGRLI 975

Human   976 SRSGTIAEVGKWLQAMFFYLKQIPRYLIPCYFDAILIGAYTTLLDTAWKQMSSFVQNGSTFVKHL 1040
            ||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
  Rat   976 SRSGSIAEVGKWLQAMFFYLKQIPRYLIPCYFDAILIGAYTTLLDVAWKQMSSFVQNGSTFVKHL 1040

Human  1041 SLGSVQLCGVGKFPSLPILSPALMDVPYRLNEITKEKEQCCVSLAAGLPHFSSGIFRCWGRDTFI 1105
            ||||||:|||||.|.||:|||:|:|||.|||||||||||||.||||||||||||:||||||||||
  Rat  1041 SLGSVQMCGVGKCPCLPLLSPSLLDVPCRLNEITKEKEQCCASLAAGLPHFSSGLFRCWGRDTFI 1105

Human  1106 ALRGILLITGRYVEARNIILAFAGTLRHGLIPNLLGEGIYARYNCRDAVWWWLQCIQDYCKMVPN 1170
            ||||:||:||||:||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1106 ALRGMLLVTGRYLEARNIILAFACTLRHGLIPNLLGEGTYARYNCRDAVWWWLQCIQDYCKMVPN 1170

Human  1171 GLDILKCPVSRMYPTDDSAPLPAGTLDQPLFEVIQEAMQKHMQGIQFRERNAGPQIDRNMKDEGF 1235
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||
  Rat  1171 GLDILKCPVSRMYPTDDSAPLPAGTLDQPLFEVIQEAMQRHMQGIQFRERNAGPQIDRNMKDEGF 1235

Human  1236 NITAGVDEETGFVYGGNRFNCGTWMDKMGESDRARNRGIPATPRDGSAVEIVGLSKSAVRWLLEL 1300
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
  Rat  1236 NITVGVDEETGFVYGGNRFNCGTWMDKMGESDRARNRGIPATPRDGSAVEIVGLCKSAVRWLLEL 1300

Human  1301 SKKNIFPYHEVTVKRHGKAIKVSYDEWNRKIQDNFEKLFHVSEDPSDLNEKHPNLVHKRGIYKDS 1365
            |||||||||||.|:||||.:.|||||||||||::|||||||||||||.|||||||||||||||||
  Rat  1301 SKKNIFPYHEVRVRRHGKVVAVSYDEWNRKIQNSFEKLFHVSEDPSDPNEKHPNLVHKRGIYKDS 1365

Human  1366 YGASSPWCDYQLRPNFTIAMVVAPELFTTEKAWKALEIAEKKLLGPLGMKTLDPDDMVYCGIYDN 1430
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||:|||
  Rat  1366 YGASSPWCDYQLRPNFTIAMVVAPELFTAEKAWKALEIAEGKLLGPLGMKTLDPDDMVYCGVYDN 1430

Human  1431 ALDNDNYNLAKGFNYHQGPEWLWPIGYFLRAKLYFSRLMGPETTAKTIVLVKNVLSRHYVHLERS 1495
            ||||||||||:|||||||||||||||||||||||||::|||||.|||:.||||||||||||||||
  Rat  1431 ALDNDNYNLARGFNYHQGPEWLWPIGYFLRAKLYFSKMMGPETAAKTVFLVKNVLSRHYVHLERS 1495

Human  1496 PWKGLPELTNENAQYCPFSCETQAWSIATILETLYDL 1532
            ||||||||||||.|||||||||||||:|.:|||||||
  Rat  1496 PWKGLPELTNENGQYCPFSCETQAWSMAAVLETLYDL 1532

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
AGLNP_000019.2 glyc_debranch 22..1532 CDD:273673 1390/1509 (92%)
AglNP_001102034.1 glyc_debranch 22..1532 CDD:273673 1390/1509 (92%)

Return to query results.
Submit another query.