DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment AGL and agl-1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_000019.2 Gene:AGL / 178 HGNCID:321 Length:1532 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_496984.1 Gene:agl-1 / 175091 WormBaseID:WBGene00011050 Length:1467 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:1550 Identity:673/1550 - (43%)
Similarity:939/1550 - (60%) Gaps:106/1550 - (6%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MGHSKQIRILLLNEMEKLEKTLFRLEQGYELQFRLGPTLQGKAVTVYTNYPFPGETFNREKFRSL 65
            ||..|:|||::|.:.|.||..:.::|:|:.::|:.|.:|.||.|.|:|:. .||        .||
 Worm     1 MGEEKEIRIIVLEDGEHLESVIRKIEKGWIVRFKRGSSLLGKKVKVFTSI-CPG--------NSL 56

Human    66 DWENPTEREDDSDKYCKLNLQQSGSFQYYF-LQGNEKSGGGYIVVDPILRVGADNHVLPLDCVTL 129
            :|   :|.:|....||::..:::|||:|:| ::.:|:.|.||.:|.|.|::  :...||||.:..
 Worm    57 EW---SEGKDHLAVYCQVECKEAGSFRYWFKIEDSEERGSGYFLVMPELKI--NGKCLPLDGIAC 116

Human   130 QTFLAKCLGPFDEWESRLRVAKESGYNMIHFTPLQTLGLSRSCYSLANQLELNPDFSRPNRKYTW 194
            ||:|.|.|||..||:.||.||.::||||||.||:..||:|.|.|||::...|.......::|:.:
 Worm   117 QTYLTKLLGPLSEWKERLEVAHQTGYNMIHLTPIHELGISNSSYSLSDHHSLIKTIQSQDQKFGF 181

Human   195 NDVGQLVEKLKKEWNVICITDVVYNHTAANSKWIQEHPECAYNLVNSPHLKPAWVLDRALWRFSC 259
            .||..||..|::.||::.:.|||:||.|.|:.|:.||||.|||.:|||||:||:|:||....|..
 Worm   182 EDVQALVGDLERSWNILTVQDVVWNHAAKNATWLLEHPESAYNCLNSPHLRPAYVIDRVYHEFGK 246

Human   260 DVAEGKYKEKGIPALIENDHHMNSIRKIIWEDIFPKLKLWEFFQVDVNKAVEQFRRLLTQENRRV 324
            .:.||.::.:|:|.:::|.||:|:|..::..::.||..|.||:|||:...|..|...:.|.:...
 Worm   247 QIGEGVWEHRGVPPVVDNIHHVNAIEYLLRAEVLPKADLHEFYQVDLKAMVNLFEVFIKQSSGPT 311

Human   325 TKSDPNQHLTIIQDPEYRRFGCTVDMNIALTTFIPHDKGPA-----AIEECCNWFHKRMEELNSE 384
            |.....:.:.|.||.|.||||.|||...:...|..| :|.|     .:|:|...|.:.:...|.|
 Worm   312 TNPLDGEDVEIEQDLECRRFGNTVDFERSARIFNRH-RGDAKSEEERVEKCVRSFEEALNNKNLE 375

Human   385 KHRLINYHQEQ------AVNCLLGNVFYERLAGHGPKLGPVTRKHPLVTRYFTFPFEEIDFSMEE 443
            ..|      |.      .:..::|.:.|||:|.:|||.|.|:.::||.|.||.....::.:..||
 Worm   376 AAR------ESWEVILAGLAAVMGGITYERIADNGPKKGLVSPENPLTTDYFLHLEADLGWKSEE 434

Human   444 SMIHLPNKACFLMAHNGWVMGDDPLRNFAEPGSEVYLRRELICWGDSVKLRYGNKPEDCPYLWAH 508
            ...:.|.|:.||||.|||||..||::|||...|:|||||||:||||||||.||||..|.|:||.:
 Worm   435 KFAYDPEKSKFLMAFNGWVMSSDPMKNFALKESQVYLRRELVCWGDSVKLNYGNKEADSPFLWQY 499

Human   509 MKKYTEITATYFQGVRLDNCHSTPLHVAEYMLDAARNLQPNLYVVAELFTGSEDLDNVFVTRLGI 573
            ||:||:..|..|.|:|:||.|.||:||||.:|..||.::|::||.||||||||..||:||.||||
 Worm   500 MKEYTQQAARIFHGLRIDNAHGTPIHVAEKLLKTAREVRPDIYVFAELFTGSEHADNMFVNRLGI 564

Human   574 SSLIREAMSAYNSHEEGRLVYRYGGEPVGSFVQPCLRPLMPAIAHALFMDITHDNECPIVHRSAY 638
            |||||||.||::|||:|||||||||:.||:|.|...|....:|||.||:|.:|||..||..||.:
 Worm   565 SSLIREAQSAHDSHEQGRLVYRYGGDCVGAFKQKSARLAPKSIAHGLFLDQSHDNPSPIHTRSPF 629

Human   639 DALPSTTIVSMACCASGSTRGYDELVPHQISVVSEERFYTKW-NPEALPSNTGEVNFQSGIIAAR 702
            |.||:..:::||.||.||.||||||:...|.||||:|.|..| .|:       :|:...|||..|
 Worm   630 DILPTAAMLTMASCAVGSNRGYDELIRDHIHVVSEKRPYASWCRPD-------QVSRSQGIIEGR 687

Human   703 CAISKLHQELGAKGFIQVYVDQVDEDIVAVTRHSPSIHQSVVAVSRTAFRNPKTSFYS--KEVPQ 765
            ..::|||..|...|:.||:|||::.|||.:|||:|..|::||.||.|:|......:..  |.:| 
 Worm   688 NLLNKLHTWLAEHGYSQVFVDQMNSDIVGITRHNPRTHETVVVVSHTSFSKNYIDWPGGLKHIP- 751

Human   766 MCIPGKIEEVVLEARTIERNTKPYRKDENSINGTPDITVEIREHIQLNESKIVKQAGVATKGPNE 830
              |.|.:|.|:.|.:..:...:...:|.:.:.|..:..:||||::.|:.       |...|..:.
 Worm   752 --IGGVLENVIFEMKLKKVQEEWGTEDPDVLIGLKNYEMEIRENVNLDN-------GTMFKVHDG 807

Human   831 YIQEIEFENLSPGSVIIFRVSLDPHAQVAVGILRNHLTQFSPHFKSGSLAVDNADPILKIPFASL 895
            |   ||..|...|||:.|::.....|..|..::.|.:|.....|.|.                  
 Worm   808 Y---IELTNFPTGSVVGFKIRPSDEATKAFNMIHNSITPEQSEFDSA------------------ 851

Human   896 ASRLTLAELNQILYRCESEEK---EDGGGCYDIPNWSALKYAGLQGLMSVLAEIRPKNDLGHPFC 957
            .||||......:|:.||||:.   :.||  ||:||:....|.|||||:.||.:||..||||||.|
 Worm   852 LSRLTYQSFPNLLFHCESEDYATIQQGG--YDVPNFGKFVYCGLQGLVPVLEKIRDDNDLGHPLC 914

Human   958 NNLRSGDWMIDYVSNRLISRSGTIAEVGKWLQAMFFYLKQIPRYLIPCYFDAILIGAYTTLLDTA 1022
            .|||.|.|:.||:..|| ::...:.||.:.::..|..|..:|.||.||||:.::...|..:...|
 Worm   915 QNLRDGTWICDYIVGRL-AKFEKLGEVSEAIRKFFAPLDHVPYYLRPCYFELLVSYIYGKIRKEA 978

Human  1023 WKQMSSFVQNGSTFVKHLSLGSVQLCGVGKFPSLPILSPALMDVPYRLNEITKEKEQCCVSLAAG 1087
            .|:|:..:.:.|..|:||::.::...|.       |....|..:|..|    :.::|...|||||
 Worm   979 LKRMAPQISSSSALVRHLAISTLSFLGY-------IPGAGLAPIPTSL----QIEDQYPSSLAAG 1032

Human  1088 LPHFSSGIFRCWGRDTFIALRGILLITGRYVEARNIILAFAGTLRHGLIPNLLGEGIYARYNCRD 1152
            |.||:.||:|.|||||||||.|.||.|||:.|||.|||:|||.:|||||||||.|||.|||||||
 Worm  1033 LSHFAVGIWRNWGRDTFIALPGCLLSTGRFQEARQIILSFAGAIRHGLIPNLLAEGIGARYNCRD 1097

Human  1153 AVWWWLQCIQDYCKMVPNGLDILKCPVSRMYPTDDSAPLPAGTLDQPLFEVIQEAMQKHMQGIQF 1217
            |.|:||..|..|.:..|||:.||:.||.|:||.|||. ...|.:.|.|.|.|.||:.||..||.:
 Worm  1098 ATWFWLVSIVKYVESAPNGVGILEDPVRRIYPNDDSV-YGEGEVQQMLIETIYEALDKHFAGIDY 1161

Human  1218 RERNAGPQIDRNMKDEGFNITAGVDEETGFVYGGNRFNCGTWMDKMGESDRARNRGIPATPRDGS 1282
            |||:||||||..|:||||.:||||...|||:|||||:||||||||||.|:||.|:|.|||||||:
 Worm  1162 RERSAGPQIDEQMRDEGFQVTAGVSRTTGFIYGGNRWNCGTWMDKMGSSERAGNKGEPATPRDGA 1226

Human  1283 AVEIVGLSKSAVRWLLELSKKNIFPYHEVTVKRHGKAIKVSYDEWNRKIQDNFEKLFHVSEDPSD 1347
            |||:.||:..|::.|....::.:       ::|.|.:.:.::..|.:||::||||.|.|.:|   
 Worm  1227 AVELQGLAYRALKSLKNWKEQGV-------IQRSGVSDEWTWGFWAQKIRENFEKEFFVDKD--- 1281

Human  1348 LNEKHPNLVHKRGIYKDSYGASSPWCDYQLRPNFTIAMVVAPELFTTEKAWKALEIAEKKLLGPL 1412
               .:...|::|.|.|||.|::..:.|:|||.||.||:.|||:|...:||||||:.|| .|||||
 Worm  1282 ---SYAEFVNRREIIKDSVGSTLGFTDFQLRCNFGIALAVAPDLMDPKKAWKALDSAE-VLLGPL 1342

Human  1413 GMKTLDPDDMVYCGIYDNALDNDNYNLAKGFNYHQGPEWLWPIGYFLRAKLYFSRLMGPETTAKT 1477
            |||||||.|..|.|.|:|..|..:...|||:|||||||||:..||:|:|:|....::|.......
 Worm  1343 GMKTLDPTDWAYNGYYNNDDDGTDKKTAKGWNYHQGPEWLFVAGYYLQARLRIGDILGGSEKQYA 1407

Human  1478 IVLVKNVLSRHYVHLERSPWKGLPELTNENAQYCPFSCETQAWSIATILETLYDL 1532
            |..|:..|...|.|:..|||:.||||||.:.:||..||..||||:..::|....|
 Worm  1408 IRQVQERLGNAYKHIISSPWRSLPELTNADGEYCMQSCAAQAWSVGCLIEACVKL 1462

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
AGLNP_000019.2 glyc_debranch 22..1532 CDD:273673 662/1527 (43%)
agl-1NP_496984.1 glyc_debranch 22..1462 CDD:273673 662/1527 (43%)

Return to query results.
Submit another query.