DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment DMD and dmd

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_006724531.1 Gene:DMD / 1756 HGNCID:2928 Length:3703 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001313616.1 Gene:dmd / 83773 ZFINID:ZDB-GENE-010426-1 Length:3609 Species:Danio rerio


Alignment Length:3719 Identity:2145/3719 - (57%)
Similarity:2782/3719 - (74%) Gaps:144/3719 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     3 WWEEVEDCY---------EREDVQKKTFTKWVNAQFSKFGKQHIENLFSDLQDGRRLLDLLEGLT 58
            |.|..||.:         |||||||||||||:|:||:|..:..|::||:||.||||||:|||.|.
Zfish    11 WEEGFEDEFGEIIKTRSDEREDVQKKTFTKWINSQFAKTRRPPIDDLFTDLCDGRRLLELLEVLV 75

Human    59 GQKLPKEKGSTRVHALNNVNKALRVLQNNNVDLVNIGSTDIVDGNHKLTLGLIWNIILHWQVKNV 123
            |.::.||:|.||||:|||||:||::||.|||||||||..|||||||||||||||:||||||||:|
Zfish    76 GHEIVKERGFTRVHSLNNVNRALQILQKNNVDLVNIGGADIVDGNHKLTLGLIWSIILHWQVKDV 140

Human   124 MKNIMAGLQQTNSEKILLSWVRQSTRNYPQVNVINFTTSWSDGLALNALIHSHRPDLFDWNSVVC 188
            ||::||.|||||||||||||||||.:||..|||:||::||:||.|.|||||||||:||.|:.|..
Zfish   141 MKDVMADLQQTNSEKILLSWVRQSLKNYQDVNVVNFSSSWADGFAFNALIHSHRPELFSWSVVEQ 205

Human   189 QQSATQRLEHAFNIARYQLGIEKLLDPEDVDTTYPDKKSILMYITSLFQVLPQQVSIEAIQEVEM 253
            |.:|.:||:|||.:|...|||::|||||||.|.:||||||:||:||||:|||..||:|||||||.
Zfish   206 QDNAIERLDHAFGVAEKSLGIDRLLDPEDVATVHPDKKSIIMYVTSLFKVLPHGVSLEAIQEVET 270

Human   254 LPRPPKVTKEEHFQLHHQMHYSQQITVSLAQGYERTSSP--KPRFKSYAYTQAAYVTTSDPTRSP 316
            ||| ..||||||.....|..||||||||:||...|:.||  ||||||||:||||||.|.:..|..
Zfish   271 LPR-AAVTKEEHVLYQTQQRYSQQITVSVAQSRVRSPSPSYKPRFKSYAFTQAAYVKTPEQQRKF 334

Human   317 FPSQHLE-APEDKSFGSSLMESEVNLDRYQTALEEVLSWLLSAEDTLQAQGEISNDVEVVKDQFH 380
            ..:|..: |.|.:...|.|.:....|:.||:||||||:|||||||.||||..||:.||.||:|||
Zfish   335 LIAQSPDKADELRPSPSPLPQGLNELESYQSALEEVLTWLLSAEDGLQAQPPISSFVEEVKEQFH 399

Human   381 THEGYMMDLTAHQGRVGNILQLGSKLIGTGKLSEDEETEVQEQMNLLNSRWECLRVASMEKQSNL 445
            ||||||::||:|||.||.:|:.||.|:..|:|::|||.||:|||||||||||.|||||||:||.|
Zfish   400 THEGYMVELTSHQGSVGRVLKAGSVLLSGGQLTDDEEREVREQMNLLNSRWEHLRVASMERQSRL 464

Human   446 HRVLMDLQNQKLKELNDWLTKTEERTRKMEEEPLGPDLEDLKRQVQQHKVLQEDLEQEQVRVNSL 510
            |.||||||:|:||:|:|||..||.|.::|..:.|||:|:|:|||:::.|:||||||.||||||||
Zfish   465 HEVLMDLQHQQLKQLSDWLDTTETRIKRMGAQALGPELDDIKRQIEEQKLLQEDLELEQVRVNSL 529

Human   511 THMVVVVDESSGDHATAALEEQLKVLGDRWANICRWTEDRWVLLQDILLKWQRLTEEQCLFSAWL 575
            |||||||||:|||.|||||||:|:.||:|||.||:|||:||:|||.|||.||..:|||.||.:||
Zfish   530 THMVVVVDENSGDGATAALEEKLQNLGERWAAICKWTEERWILLQKILLCWQHFSEEQLLFDSWL 594

Human   576 SEKEDAVNKIHTTGFKDQNEMLSSLQKLAVLKADLEKKKQSMGKLYSLKQDLLSTLKNKSVTQKT 640
            ::||:.|..|.::|..|.||:.::|:|||:||||||.|:|:|.||.||.||||:.:|:|....|.
Zfish   595 TQKEELVQSIQSSGTNDPNEVAANLRKLAILKADLELKRQTMDKLCSLVQDLLTNIKSKEAAGKL 659

Human   641 EAWLDNFARCWDNLVQKLEKSTAQISQAVTTTQPSLTQTTVMETVTTVTTREQILVKHAQEELPP 705
            ||.|:.||:.||.|||.|:.::.:||..|||:|..:|.|| |.|||.|||.::.:|||.:|.:..
Zfish   660 EAKLERFAQRWDKLVQALQLTSTKISTIVTTSQSEITHTT-MATVTKVTTNQKKMVKHTKEGMST 723

Human   706 PPPQKKRQITVDSEIRKRLDVDITELHSWITRSEAVLQSPEFAIFRKEGNFSDLKEKVNAIEREK 770
            |||||||||.||||:|||.|||.||:||::||||||||:|||:|.||||:.:||.|||.||:|||
Zfish   724 PPPQKKRQIVVDSELRKRFDVDFTEIHSFMTRSEAVLQNPEFSISRKEGSVADLYEKVLAIDREK 788

Human   771 AEKFRKLQDASRSAQALVEQMVNEGVNADSIKQASEQLNSRWIEFCQLLSERLNWLEYQNNIIAF 835
            .|||||||:|:|||||||:|:.::|.|::.|:||::||.:||::||.||:|||.||.||..::||
Zfish   789 PEKFRKLQEATRSAQALVDQLTSDGQNSEDIQQAAQQLRARWVDFCALLAERLAWLAYQTKVLAF 853

Human   836 YNQLQQLEQMTTTAENWLKIQPTTPSEPTAIKSQLKICKDEVNRLSDLQPQIERLKIQSIALKEK 900
            ||..|||||...|||||||:|.....||..::.||:.|:||::|||.||||:.:|..|...|::|
Zfish   854 YNLFQQLEQAAATAENWLKVQSPPACEPEPLRIQLERCRDEISRLSALQPQVAKLHEQLEELRQK 918

Human   901 GQGPMFLDADFVAFTNHFKQVFSDVQAREKELQTIFDTLPPMRYQETMSAIRTWVQQSETKLSIP 965
            .:.|:..|||..||..|:.||..|::|||::|..:..:|||.||::.|:|:..|:||.|.||:||
Zfish   919 EETPVLFDADISAFQEHYHQVLEDLRARERQLVLVQSSLPPARYKDVMAALLAWLQQCENKLAIP 983

Human   966 QLSVTDYEIMEQRLGELQALQSSLQEQQSGLYYLSTTVKEMSKKAPSEISRKYQSEFEEIEGRWK 1030
            ..:||:|.:|||||.:::|:|:|.:|.|..:..|:...:::.:|||.||.:||::|.:.:..||:
Zfish   984 STAVTEYPVMEQRLKDIKAIQASQKEHQGDVDDLNKMAEQVFQKAPPEICQKYRTELDNVMVRWR 1048

Human  1031 KLSSQLVEHCQKLEEQMNKLRKIQNHIQTLKKWMAEVDVFLKEEWPALGDSEILKKQLKQCRLLV 1095
            ::|.||.|:.|||::.|.||::.||..:||:||||||||||.||||||||:|.|:|||:||..||
Zfish  1049 RISEQLEENIQKLQDHMTKLQQFQNDTKTLQKWMAEVDVFLNEEWPALGDAEALEKQLEQCTALV 1113

Human  1096 SDIQTIQPSLNSVNEGGQKIKNEAEPEFASRLETELKELNTQWDHMCQQVYARKEALKGGLEKTV 1160
            :||.|:|||||.:||.|..:|.|||..||.:::..|.|||.||:.:|:|.||:|.||||||:.||
Zfish  1114 NDIHTVQPSLNGINEVGLALKREAETPFAIKIQKMLDELNAQWELICKQAYAKKSALKGGLDMTV 1178

Human  1161 SLQKDLSEMHEWMTQAEEEYLERDFEYKTPDELQKAVEEMKRAKEEAQQKEAKVKLLTESVNSVI 1225
            ||:|::.||.||:||||||||||||:||||:||.|||||:|||:||..|||.||||||:.|.:.|
Zfish  1179 SLRKEMQEMQEWITQAEEEYLERDFQYKTPEELHKAVEELKRAQEEVHQKETKVKLLTDKVTNFI 1243

Human  1226 AQAPPVAQEALKKELETLTTNYQWLCTRLNGKCKTLEEVWACWHELLSYLEKANKWLNEVEFKLK 1290
            ::|||.|.:|||.||:.||:|||.||:||:|||||||||||||.|||||||..|.|::.:|.||.
Zfish  1244 SKAPPAAHDALKAELDVLTSNYQRLCSRLDGKCKTLEEVWACWCELLSYLELENAWMDLLEKKLD 1308

Human  1291 TTENIPGGAEEISEVLDSLENLMR-HSEDNPNQIRILAQTLTDGGVMDELINEELETFNSRWREL 1354
            .||.:.||.|||.|.|.||:.::| |.|.|.||||.|||||.||.|:||||::::|.:|:||.||
Zfish  1309 ETEGLQGGIEEIEEALTSLDTMIREHPEYNRNQIRELAQTLMDGRVLDELIHKKVEDYNTRWDEL 1373

Human  1355 HEEAVRRQKLLEQSIQSAQETEKSLHLIQESLTFIDKQLAAYIADKVDAAQMPQEAQKIQSDLTS 1419
            .:.|.:|::.||:|:..|||.:|:|.|||:||...|:.|.|||||.:||||:||||||||::|..
Zfish  1374 MQRASQRRQQLEKSLHWAQENDKTLRLIQDSLNTTDRHLTAYIADGIDAAQIPQEAQKIQTELNG 1438

Human  1420 HEISLEEMKKHNQGKEAAQRVLSQIDVAQKKLQDVSMKFRLFQKPANFEQRLQESKMILDEVKMH 1484
            ||::|::|||.....:|:::|:.:||....||..|..|||||||||||:|||:|.:.:|:|||:.
Zfish  1439 HEVTLDDMKKKAMEVDASEKVIGEIDATLDKLLQVKGKFRLFQKPANFDQRLRECERVLEEVKVK 1503

Human  1485 LPALETKSVEQEVVQSQLNHCVNLYKSLSEVKSEVEMVIKTGRQIVQKKQTENPKELDERVTALK 1549
            |..|..:|||||||||||..|:..||:|||||||||.|||||||||||:|||.|||||:|:||||
Zfish  1504 LGVLSIRSVEQEVVQSQLEQCMKFYKNLSEVKSEVETVIKTGRQIVQKQQTEQPKELDDRLTALK 1568

Human  1550 LHYNELGAKVTERKQQLEKCLKLSRKMRKEMNVLTEWLAATDMELTKRSAVEGMPSNLDSEVAWG 1614
            |.||:||::|||.||:|||.|||.||.|||:|.||||||.||.|||:||:||||||:||:|:||.
Zfish  1569 LAYNDLGSQVTEGKQELEKILKLLRKFRKEVNSLTEWLATTDGELTRRSSVEGMPSDLDAELAWA 1633

Human  1615 KATQKEIEKQKVHLKSITEVGEALKTVLGKKETLVEDKLSLLNSNWIAVTSRAEEWLNLLLEYQK 1679
            ||.|::.|..|..||.:.|:...||.:|..:|.|::||:||||.||||||||:|:||.|||:||.
Zfish  1634 KAAQEDTEHHKPQLKLVRELAGTLKGLLHSQENLIDDKVSLLNCNWIAVTSRSEQWLKLLLDYQN 1698

Human  1680 HMETFDQNVDHITKWIIQADTLLDESEKKKPQQKEDVLKRLKAELNDIRPKVDSTRDQAANLMAN 1744
            .|:|.:||:..|..|:.:|:..|||.:.:  ...|.|:|.|:.||.:::.||::.:..|.:|:.|
Zfish  1699 QMKTLEQNISQINTWMDRAEEKLDEMDSQ--GCIEHVIKGLRMELEEMKGKVEAVQVLAEDLIKN 1761

Human  1745 RGDHCRKLVEPQISELNHRFAAISHRIKTGKASIPLKELEQFNSDIQKLLEPLEAEIQQGVNLKE 1809
            .|:||:..|:|::.:||.||..::.||..|:||  .:||::::......|:.|:.||:.|.:|||
Zfish  1762 TGEHCKAQVKPKLEQLNQRFDIVARRILMGQAS--SQELDEYHRQANIWLQVLDEEIKLGESLKE 1824

Human  1810 EDFNKDMNEDNEGTVKELLQRGDNLQQRITDERKREEIKIKQQLLQTKHNALKDLRSQRRKKALE 1874
            |||.:|...|.| .:.||..:|:||.:|.....|||.::.|..||..:::.||:||:.|:||||.
Zfish  1825 EDFLEDATIDEE-ALNELFLKGENLLKRTPGGEKREAVREKHNLLHDRYDTLKNLRALRKKKALA 1888

Human  1875 ISHQWYQYKRQADDLLKCLDDIEKKLASLPEPRDERKIKEIDRELQKKKEELNAVRRQAEGLSED 1939
            ::.||||:.:::||:::.||.|||.:..||:|.:|.::|.:..|:.:::.:|..:|.....|||.
Zfish  1889 LASQWYQFCKKSDDMMQWLDRIEKSIRELPDPPEEPRVKAVGYEIDQQRPKLEDLRGLGRVLSEG 1953

Human  1940 GAAMAVEPTQIQLSKRWREIESKFAQFRRLNFAQIHTVREETMMVMTEDMPLEISYVPSTYLTEI 2004
            ||:..|||..:.::|||.|::..|.:.|                                :.:|:
Zfish  1954 GASRMVEPRLLPINKRWTELDVNFTRVR--------------------------------HKSEL 1986

Human  2005 THVSQALLEVEQLLNAPDLCAKDFEDLFKQEESLKNIKDSLQQSSGRIDIIHSKKTAALQSATPV 2069
            ..:.|.:.|.|.|||:|:..:..|.:|.:||:.||.:|.:|.:..|.:     .:.....::.|.
Zfish  1987 QFLLQCISENEALLNSPERWSTAFINLPQQEKCLKEVKVNLDKLEGPV-----AEAVGRGASQPE 2046

Human  2070 ERVKLQEALSQLDFQWEKVNKMYKDRQGRFDRSVEKWRRFHYDIKIFNQWLTEAEQFLRK-TQIP 2133
            |.:.:|    .|...||.:..:|:||..|    :||.::|:.::|:.:.|||:||:.:.| .|.|
Zfish  2047 EGLLVQ----LLRTNWENLKMLYQDRLKR----LEKAKKFNEELKMLDNWLTDAERTIMKYEQDP 2103

Human  2134 -ENWEHAKYKWYLKELQDGIGQRQTVVRTLNATGEEIIQQSSKTDASILQEKLGSLNLRWQEVCK 2197
             .|.:|      |||||.|:.:::..|:.|||.|.::..|.||.|...::::|.|:|.||.:|..
Zfish  2104 INNRDH------LKELQAGLEKQEAAVKGLNALGTDLSPQCSKDDRDHIKQQLASINSRWAKVSN 2162

Human  2198 QLSDRKKRLEEQKNILSEFQRDLNEFVLWLEEADNIASIPLEPGKEQQLKEKLEQVKLLVEELPL 2262
            ||::.|:|....|.:|:|...|:.||..||::|:.:|::|:|.|:::||...||:||..|.|||.
Zfish  2163 QLTEIKRRSAGAKMLLAELNEDMGEFQSWLDDAEAVAALPVEAGRKEQLSATLEKVKARVVELPS 2227

Human  2263 RQGILKQLNETGGPVLVSAPISPEEQDK-LENKLKQTNLQWIKVSRALPEKQGEIEAQIKDLGQL 2326
            |:..|.|:|..|..:       |.::.| ||.:||..|::|.|||..|||||.:||..::||.. 
Zfish  2228 RKQALHQINSKGSSL-------PADKVKPLEKQLKVINMRWAKVSTDLPEKQRQIEDLLRDLSL- 2284

Human  2327 EKKLEDLEEQLNHLLLWLSPIRNQLEIYNQPNQEGP---FDVKETEIAVQAKQPDVEEILSKGQH 2388
                  .:|||:.|.:|.|..:.|||  ..|....|   .||||       |:|.||.:|:    
Zfish  2285 ------YQEQLSKLSIWASNTKTQLE--QSPTAVDPKIEDDVKE-------KKPAVETLLA---- 2330

Human  2389 LYKEKPATQPVKRKLEDLSSEWKAVNRLLQELRAKQPDLAPGLTTIGASPTQTVTLVTQPVVTKE 2453
              ||:|..||.|.:.:.||::|.::..||::.:.|....|..||...|...              
Zfish  2331 --KERPPCQPEKGQYDGLSADWTSIQVLLKDWKDKCQLAAVTLTGSAAGDA-------------- 2379

Human  2454 TAISKLEMPSSLMLEVPALADFNRAWTELTDWLSLLDQVIKSQRVMVGDLEDINEMIIKQKATMQ 2518
                             ||..||::||||.|||:|||.::::||||||||::||||.:|.|:.:|
Zfish  2380 -----------------ALDKFNKSWTELDDWLALLDHMVQTQRVMVGDLDEINEMTVKLKSALQ 2427

Human  2519 DLEQRRPQLEELITAAQNLKNKTSNQEARTIITDRIERIQNQWDEVQEHLQNRRQQLNEMLKDST 2583
            |:|||.|||.:.|||||||||||:|.|.|..||||||::|..|::....|..|...|..|.|||:
Zfish  2428 DMEQRCPQLNKQITAAQNLKNKTNNPETRATITDRIEKLQAHWEDSHAKLTARVLTLQNMYKDSS 2492

Human  2584 QWLEAKEEAEQVLGQARAKLESWKEGPYTVDAIQKKITETKQLAKDLRQWQTNVDVANDLALKLL 2648
            .||||::..|.::.:|..||||||:..::|:.::.:..:.|||:|||:||||.::|.|:||.|||
Zfish  2493 DWLEARKRVEPLIKKANEKLESWKKVSHSVEDLKGQNADVKQLSKDLQQWQTQMNVTNELANKLL 2557

Human  2649 RDYSADDTRKVHMITENINASWRSIHKRVSEREAALEETHRLLQQFPLDLEKFLAWLTEAETTAN 2713
            ..|:.|||.||..:||::|.:|.:|.||..::||.||...|.||.:.|||||||.||||||||||
Zfish  2558 TLYADDDTSKVKQMTESMNLAWANIKKRAGDKEADLEAGLRQLQHYYLDLEKFLNWLTEAETTAN 2622

Human  2714 VLQDATRKERLLEDSKGVKELMKQWQDLQGEIEAHTDVYHNLDENSQKILRSLEGSDDAVLLQRR 2778
            ||||||.||.|||:...|:.|::||||||.||:||.:.||:||||..:|:.||||:|:||:||:|
Zfish  2623 VLQDATFKEGLLENPATVRHLLEQWQDLQAEIDAHRETYHSLDENGHRIVSSLEGTDNAVVLQKR 2687

Human  2779 LDNMNFKWSELRKKSLNIRSHLEASSDQWKRLHLSLQELLVWLQLKDDELSRQAPIGGDFPAVQK 2843
            ||:|..:|.||..|.::||.:|:|..||||.||:||||||.|||||.:||.:|.|:|||.|.|.:
Zfish  2688 LDDMGQRWHELCNKVMSIRPYLDAGVDQWKHLHMSLQELLNWLQLKREELEKQKPVGGDVPTVHQ 2752

Human  2844 QNDVHRAFKRELKTKEPVIMSTLETVRIFLTEQPLEGLEKLYQEP--RELPPEERAQNVTRLLRK 2906
            |...|:||:|||..|||||..||:..:.||.|.|.|||:   |.|  :::.||||.|||.|:|||
Zfish  2753 QLLTHKAFRRELGAKEPVINGTLDNAKTFLAEMPREGLK---QRPGQKDVSPEERVQNVGRILRK 2814

Human  2907 QAEEVNTEWEKLNLHSADWQRKIDETLERLRELQEATDELDLKLRQAEVIKGSWQPVGDLLIDSL 2971
            :.|:|...|:.|...|.|||::::..||||.|||:|.|:||.||||||.:|.||:|||:||:|.|
Zfish  2815 EVEDVTVRWKNLGAASVDWQQQLELALERLMELQDAQDQLDYKLRQAESVKNSWKPVGELLVDDL 2879

Human  2972 QDHLEKVKALRGEIAPLKENVSHVNDLARQLTTLGIQLSPYNLSTLEDLNTRWKLLQVAVEDRVR 3036
            |:|:::|||.:.||||:::||:|||.||.......|||||.|||.::|||.||:|||:::|:.:.
Zfish  2880 QNHIDRVKAFQEEIAPIQDNVNHVNQLASTFRPSDIQLSPDNLSRIDDLNMRWRLLQISIEEHLS 2944

Human  3037 QLHEAHRDFGPASQHFLSTSVQGPWERAISPNKVPYYINHETQTTCWDHPKMTELYQSLADLNNV 3101
            ||..|.:|.|| ||:||..||:.|.||:||||.|||||||:|||||||||||.||||||||||||
Zfish  2945 QLTTAFKDLGP-SQNFLHASVESPLERSISPNNVPYYINHQTQTTCWDHPKMAELYQSLADLNNV 3008

Human  3102 RFSAYRTAMKLRRLQKALCLDLLSLSAACDALDQHNLKQNDQPMDILQIINCLTTIYDRLEQEHN 3166
            |||||||||||||:||||||||||:.|||:|.:|||||||:|.|||:|:|||||:|||||||:|:
Zfish  3009 RFSAYRTAMKLRRMQKALCLDLLSMPAACEAFEQHNLKQNEQFMDIVQVINCLTSIYDRLEQQHS 3073

Human  3167 NLVNVPLCVDMCLNWLLNVYDTGRTGRIRVLSFKTGIISLCKAHLEDKYRYLFKQVASSTGFCDQ 3231
            :|||||||||||||||||||||||.|:||.||||||||||||||||||||:||::|||:||||||
Zfish  3074 SLVNVPLCVDMCLNWLLNVYDTGRAGKIRTLSFKTGIISLCKAHLEDKYRFLFREVASATGFCDQ 3138

Human  3232 RRLGLLLHDSIQIPRQLGEVASFGGSNIEPSVRSCFQFANNKPEIEAALFLDWMRLEPQSMVWLP 3296
            |||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||:||::||||||||||||||||
Zfish  3139 RRLGLLLHDAIQIPRQLGEVASFGGSNIEPSVRSCFQFANNKPELEASVFLDWMRLEPQSMVWLP 3203

Human  3297 VLHRVAAAETAKHQAKCNICKECPIIGFRYRSLKHFNYDICQSCFFSGRVAKGHKMHYPMVEYCT 3361
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Zfish  3204 VLHRVAAAETAKHQAKCNICKECPIIGFRYRSLKHFNYDICQSCFFSGRVAKGHKMQYPMVEYCT 3268

Human  3362 PTTSGEDVRDFAKVLKNKFRTKRYFAKHPRMGYLPVQTVLEGDNMETPVTLINFWPVDSAPASSP 3426
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||..|||||
Zfish  3269 PTTSGEDVRDFAKVLKNKFRTKRYFAKHPRMGYLPVQTILEGDNMETPVTLINFWPVDHPPASSP 3333

Human  3427 QLSHDDTHSRIEHYASRLAEMENSNGSYLNDSISPNESIDDEHLLIQHYCQSLNQDSPLSQPRSP 3491
            |||||||||||||||||||||||.||||:||::|||||:||||||||||||||||.||||||:||
Zfish  3334 QLSHDDTHSRIEHYASRLAEMENRNGSYVNDNVSPNESMDDEHLLIQHYCQSLNQGSPLSQPQSP 3398

Human  3492 AQILISLESEERGELERILADLEEENRNLQAEYDRLKQQHEHKGLSPLPSPPEMMPTSPQSPRDA 3556
            ||||||:|:||:|||||:|.|||:|||.|||||||||:.|:|||||||||||:|:|.||||||||
Zfish  3399 AQILISMETEEKGELERVLNDLEQENRKLQAEYDRLKKAHDHKGLSPLPSPPQMLPVSPQSPRDA 3463

Human  3557 ELIAEAKLLRQHKGRLEARMQILEDHNKQLESQLHRLRQLLEQPQAEAKVNGTTVSSPSTSLQRS 3621
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|:|||||.:|||||:..||
Zfish  3464 ELIAEAKLLRQHKGRLEARMQILEDHNKQLESQLTRLRQLLEQPQTESKVNGTALSSPSTASPRS 3528

Human  3622 DSSQPMLLRVVGSQTSDSMGEEDLLSPPQDTSTGLEEVMEQLNNSFPSSRGHNVGSLFHMADDLG 3686
            |:|... |||..|||:::||:::|.||.||.|||||:|:||||||||.|:|.||||||||.|::|
Zfish  3529 DTSLAS-LRVAASQTTETMGDDELSSPTQDASTGLEDVIEQLNNSFPHSQGPNVGSLFHMVDNIG 3592

Human  3687 RAMESLVSVMTDEE 3700
            .||||||.|:|:|:
Zfish  3593 HAMESLVHVITEEQ 3606

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
DMDXP_006724531.1 CH_DMD_rpt1 11..121 CDD:409080 79/118 (67%)
CH_DMD_rpt2 136..246 CDD:409082 73/109 (67%)
SPEC 341..558 CDD:238103 150/216 (69%)
SPEC 560..827 CDD:413338 154/266 (58%)
235kDa-fam <763..>1938 CDD:130673 622/1175 (53%)
SPEC 1049..1263 CDD:238103 139/213 (65%)
SPEC 1878..2102 CDD:413338 60/223 (27%)
SPEC 2105..2320 CDD:238103 84/217 (39%)
SPEC 2321..2579 CDD:413338 99/260 (38%)
SPEC 2472..2688 CDD:238103 111/215 (52%)
SPEC 2690..2933 CDD:238103 138/244 (57%)
Spectrin 2934..3040 CDD:395348 61/105 (58%)
WW 3059..3088 CDD:238122 23/28 (82%)
EFh_DMD 3125..3286 CDD:320004 136/160 (85%)
EF-hand-like motif 3125..3164 CDD:320004 28/38 (74%)
EF-hand-like motif 3171..3205 CDD:320004 30/33 (91%)
EF-hand-like motif 3211..3247 CDD:320004 30/35 (86%)
EF-hand-like motif 3260..3286 CDD:320004 22/25 (88%)
ZZ_dystrophin 3311..3359 CDD:239074 46/47 (98%)
dmdNP_001313616.1 CH_DMD_rpt1 28..138 CDD:409080 79/109 (72%)
CH_DMD_rpt2 153..263 CDD:409082 73/109 (67%)
SPEC 359..577 CDD:238103 150/217 (69%)
SPEC 580..844 CDD:238103 153/264 (58%)
SPEC 741..950 CDD:238103 118/208 (57%)
SPEC 856..1063 CDD:238103 91/206 (44%)
SPEC 1067..1281 CDD:238103 139/213 (65%)
SPEC 1180..1388 CDD:238103 129/207 (62%)
SPEC 1486..1586 CDD:197544 68/99 (69%)
SPEC 1591..1788 CDD:238103 96/198 (48%)
SPEC 1823..1973 CDD:413338 59/150 (39%)
SPEC 2074..2279 CDD:238103 84/217 (39%)
SPEC 2381..2595 CDD:238103 110/213 (52%)
SPEC 2599..2841 CDD:238103 138/244 (57%)
SPEC 2843..>2962 CDD:413338 68/119 (57%)
WW <2973..2995 CDD:238122 19/21 (90%)
EFh_DMD 3032..3193 CDD:320004 136/160 (85%)
EF-hand-like motif 3032..3071 CDD:320004 28/38 (74%)
EF-hand-like motif 3078..3112 CDD:320004 30/33 (91%)
EF-hand-like motif 3118..3154 CDD:320004 30/35 (86%)
EF-hand-like motif 3167..3193 CDD:320004 22/25 (88%)
ZZ_dystrophin 3218..3266 CDD:239074 46/47 (98%)

Return to query results.
Submit another query.