DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment GLIS3 and Glis3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001035878.1 Gene:GLIS3 / 169792 HGNCID:28510 Length:930 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_780668.3 Gene:Glis3 / 226075 MGIID:2444289 Length:935 Species:Mus musculus


Alignment Length:937 Identity:785/937 - (83%)
Similarity:831/937 - (88%) Gaps:9/937 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MNGRSCSMSLHRTSGTPQGPRMVSGHHIPAIRAHSGTPGPSPCGSTSSPTMASLANNLHLKMPSG 65
            ||||||.|:|||||.|||||.::.|.|||.||||:|||..|.|.||.||::.||||:|||||.||
Mouse     1 MNGRSCGMNLHRTSRTPQGPGLLGGQHIPPIRAHAGTPCSSSCASTPSPSIGSLANSLHLKMSSG 65

Human    66 GGMAPQNNVAESRIHLPALSPRRQMLTNGKPRFQVTQAGGMSGSHTLKPKQQEFGSPFPPNPGKG 130
            .|||||:|:|.|.|||||||||||:|.||||:||||.||.|:..||:||||||||.||.|||.||
Mouse    66 AGMAPQSNMAASPIHLPALSPRRQLLANGKPQFQVTPAGVMAAPHTIKPKQQEFGDPFSPNPEKG 130

Human   131 ALGFGPQCKSIGKGSCNNLVVTSSPMMVQRLGLISPPASQVSTACNQISPSLQRAMNAANLNIPP 195
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||.||:||||||.||
Mouse   131 ALGFGPQCKSIGKGSCNNLVVTSSPMMVQRLGPISPPASQVSTACKQISPSLPRAVNAANLNRPP 195

Human   196 SDTRSLISRESLASTTLSLTESQSASSMKQEWSQGYRALPSL-SNHGSQNGLDLGDLLSLPPGTS 259
            |||||:|.:|||.||||||||||||.|:||||||.|||.||| |:|.||||.||||||||||||.
Mouse   196 SDTRSVILQESLVSTTLSLTESQSALSVKQEWSQSYRAFPSLSSSHSSQNGTDLGDLLSLPPGTP 260

Human   260 MSSNSVSNSLPSYLFGTESSHSPYPSPRHSSTRSHSARSKKRALSLSPLSDGIGIDFNTIIRTSP 324
            :|.||||||||.||||.|:|||||||||||:||:||.||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   261 VSGNSVSNSLPPYLFGMENSHSPYPSPRHSATRAHSTRSKKRALSLSPLSDGIGIDFNTIIRTSP 325

Human   325 TSLVAYINGSRASPANLSPQPEVYGHFLGVRGSCIPQPRPVPGSQKGVLVAPGGLALPAYGEDGA 389
            |||||||||.||||||||||.||||||||||||||||...|...|||:|||.||..||.|||||.
Mouse   326 TSLVAYINGPRASPANLSPQSEVYGHFLGVRGSCIPQSCAVASGQKGILVASGGHTLPGYGEDGT 390

Human   390 LEHERMQQLEHGGLQPGLVNHMVVQHGLPGPDSQSAGLFKTERLEEFPGSTVDLPPAPPLPPLPP 454
            ||:||||||||||||||.||:||:|.||||.|.|:|.:.|||||||||.|.:|||.|.|| ||||
Mouse   391 LEYERMQQLEHGGLQPGPVNNMVLQPGLPGQDGQTANMLKTERLEEFPASALDLPSALPL-PLPP 454

Human   455 PPGPPPPYHAHAHLHHPELGPHAQQLALPQATLDDDGEMDGIGGKHCCRWIDCSALYDQQEELVR 519
            |.|||||||||.|||||||.||.|.|:|.|..|::||||:..|||||||||||||||||||||||
Mouse   455 PQGPPPPYHAHPHLHHPELLPHTQSLSLAQTGLEEDGEMEDSGGKHCCRWIDCSALYDQQEELVR 519

Human   520 HIEKVHIDQRKGEDFTCFWAGCPRRYKPFNARYKLLIHMRVHSGEKPNKCTFEGCEKAFSRLENL 584
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||
Mouse   520 HIEKVHIDQRKGEDFTCFWTGCPRRYKPFNARYKLLIHMRVHSGEKPNKCTFEGCKKAFSRLENL 584

Human   585 KIHLRSHTGEKPYLCQHPGCQKAFSNSSDRAKHQRTHLDTKPYACQIPGCTKRYTDPSSLRKHVK 649
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   585 KIHLRSHTGEKPYLCQHPGCQKAFSNSSDRAKHQRTHLDTKPYACQIPGCTKRYTDPSSLRKHVK 649

Human   650 AHSSKEQQARKKLRSSTELHPDLLTDCLTVQSLQPATSPRDAAAEGTVGRSPGPGP------DLY 708
            ||||:|||||||||||||||||||||||.||.|||||||.| ||:.|||.||||||      :||
Mouse   650 AHSSREQQARKKLRSSTELHPDLLTDCLAVQPLQPATSPGD-AADHTVGHSPGPGPGPGPGAELY 713

Human   709 SAPIFSSNYSSRSGTAAGAVPPPHPVSHPSPGHNVQGSPHNPSSQLPPLTAVDAGAERFAPSAPS 773
            |||||:||:|:||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||
Mouse   714 SAPIFASNHSTRSGTAAGAGPPPHPVSHPSPGHNVQGSPHNPSSQLPPLTAVDAGAERFAPPTPS 778

Human   774 PHHISPRRVPAPSSILQRTQPPYTQQPSGSHLKSYQPETNSSFQPNGIHVHGFYGQLQKFCPPHY 838
            ||||||.|||||.|:|||.|.|::|||.||.||.||||||||||||||||||||||||.||||||
Mouse   779 PHHISPGRVPAPPSLLQRAQAPHSQQPPGSLLKPYQPETNSSFQPNGIHVHGFYGQLQTFCPPHY 843

Human   839 PDSQRIVPPVSSCSVVPSFEDCLVPTSMGQASFDVFHRAFSTHSGITVYDLPSSSSSLFGESLRS 903
            |||||.|||..|||:||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||:|||||||||||
Mouse   844 PDSQRTVPPSGSCSMVPSFEDCLVPTSMGQAGFDVFHRAFSTHSGITVYDLPSASSSLFGESLRS 908

Human   904 GAEDATFLQISTVDRCPSQLSSVYTEG 930
            |.||.||||:|.|||||||||||||||
Mouse   909 GPEDPTFLQLSAVDRCPSQLSSVYTEG 935

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
GLIS3NP_001035878.1 SFP1 <558..652 CDD:227516 92/93 (99%)
C2H2 Zn finger 569..591 CDD:275368 20/21 (95%)
C2H2 Zn finger 599..621 CDD:275368 21/21 (100%)
C2H2 Zn finger 629..651 CDD:275368 21/21 (100%)
Glis3NP_780668.3 C2H2 Zn finger 506..525 CDD:275368 18/18 (100%)
C2H2 Zn finger 536..561 CDD:275368 23/24 (96%)
SFP1 <558..652 CDD:227516 92/93 (99%)
C2H2 Zn finger 569..591 CDD:275368 20/21 (95%)
C2H2 Zn finger 599..621 CDD:275368 21/21 (100%)
PHA03247 <612..861 CDD:223021 213/249 (86%)
C2H2 Zn finger 629..651 CDD:275368 21/21 (100%)

Return to query results.
Submit another query.