DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment PKD1L1 and Pkd1l1

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_016867287.1 Gene:PKD1L1 / 168507 HGNCID:18053 Length:2920 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_063129791.1 Gene:Pkd1l1 / 289796 RGDID:1564724 Length:2543 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2759 Identity:1580/2759 - (57%)
Similarity:1898/2759 - (68%) Gaps:274/2759 - (9%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human   155 NIWKTTSEAALSVVNEKTQAVVNEKTQAPLDCDNSADRIPHKPFIIIARAWSSGGPRFHHRRLCA 219
            ||..||||..||        ..|.:.|.|.:.|.:.:|             ||..|....:.|..
  Rat    27 NILNTTSEGRLS--------FTNREPQTPPEWDEATNR-------------SSTSPSSQLQWLRE 70

Human   220 TGTADSTFSALLQ--LQGTTSAAAPCSLKMEASCC-VLRLLCCAEDVATGLLPGTVTMETPTKVA 281
            ....|.:||...|  ||| .|:|||||||.||.|| ..||||..||.|..||    :...|    
  Rat    71 AEREDGSFSGRQQVDLQG-VSSAAPCSLKKEAFCCNGTRLLCSGEDSANTLL----SFSDP---- 126

Human   282 RPTQTSSQRVPLWPISHFPTSPRSSHGLPPGIPRTPSFTASQSGSEILYPPTQHPPVAILARNSD 346
                                        ||||.:|.:.:||....|...|.||||..|:||...:
  Rat   127 ----------------------------PPGISQTRNLSASWYHPESSCPLTQHPLGAVLATQPE 163

Human   347 NFMNPVLNCSLEVEARAPPNLGFRVHMASGEALCLMMDFGDSSGVEMRLHNMSEAMAVTAYHQYS 411
            |..:....|..|.:|:|||.||.|||.||..||||::||||:.|.||:|..::.|..:|.|:||.
  Rat   164 NAGHFATCCFPETDAKAPPALGIRVHAASRTALCLLLDFGDNHGAEMKLSTVTGAATMTGYYQYR 228

Human   412 KGIFFHLLHFQLDMSTYKEAETQNTTLNVYLCQSENSCLEDSDPSNLGYELISAFVTKGVYMLKA 476
                                                                    |:|||.||.
  Rat   229 --------------------------------------------------------TEGVYKLKV 237

Human   477 VIYNEFHGTEVELGPYYVEIGHEAVSAFMNSSSVHEDEVLVFADSQVNQKSTVVIHHFPSIPSYN 541
            |: ::.||.:.||||||::|||..||.||||||:|.:|.|.||:|...|:.|||:|.|.|:.|||
  Rat   238 VV-SDCHGADEELGPYYMDIGHGNVSVFMNSSSIHNNESLAFANSLPQQEGTVVVHCFSSVSSYN 301

Human   542 VSFISQTQVGDSQAWHSMTVWYKMQSVSVYTNGTVFATDTDITFTAVTKETIPLEFEWYFGEDPP 606
            |||:|||:||.||||..:||.|.||||||||||||||.||:|||.|||:||:||||.|||||:||
  Rat   302 VSFMSQTRVGSSQAWSGVTVGYTMQSVSVYTNGTVFAADTNITFVAVTEETVPLEFTWYFGENPP 366

Human   607 VRTTSRSIKKRLSIPQWYRVMVKASNRMSSVVSEPHVIRVQKKIVANRLTSPSSALVNASVAFEC 671
            |.||||||::||||||||||||||::||.|||||||:|||||:|:||||.|.:||||||:|:|||
  Rat   367 VTTTSRSIRRRLSIPQWYRVMVKATSRMGSVVSEPHLIRVQKRILANRLVSTASALVNANVSFEC 431

Human   672 WINFGTDVAYLWDFGDGTVSLGSSSSSHVYSREGEFTVEVLAFNNVSASTLRQQLFIVCEPCQPP 736
            .:||||||||||:||||::.||||||.|||.||||||||||||||:|::|||:|:|||.||||||
  Rat   432 RLNFGTDVAYLWNFGDGSIELGSSSSGHVYDREGEFTVEVLAFNNISSATLRKQIFIVQEPCQPP 496

Human   737 LVKNMGPGKVQIWRSQPVRLGVTFEAAVFCDISQGLSYTWNLMDSEGLPVSLPAAVDTHRQTLIL 801
            .||||||.|||||||||:|||||||||:.|:|||||||||:.:.:|...|:|||||:|||||::|
  Rat   497 PVKNMGPAKVQIWRSQPLRLGVTFEAAIICNISQGLSYTWSFVGAEATAVTLPAAVNTHRQTIML 561

Human   802 PSHTLEYGNYTALAKVQIEGSVVYSNYCVGLEVRAQAPVSVISEGTHLFFSRTTSSPIVLRGTQS 866
            ||:|||.|||||:|||||:||:||||||||:||||:|||||||||||:|.|:.||:.|:|.|:||
  Rat   562 PSYTLECGNYTAVAKVQIKGSMVYSNYCVGVEVRARAPVSVISEGTHIFLSKATSTSIILSGSQS 626

Human   867 FDPDDPGATLRYHWECATAGSPAHPCFDSSTAHQLDAAAPTVSFEAQWLSDSYDQFLVMLRVSSG 931
            :|||:|||.|||||.|..|.||..||||.||::|:|..||.:||.|:|||:..|||||.|.|||.
  Rat   627 YDPDNPGAALRYHWTCTAASSPIWPCFDDSTSYQMDTQAPAISFPAKWLSECCDQFLVTLTVSSS 691

Human   932 GRNSSETRVFLSPYPDSAFRFVHISWVSFKDTFVNWNDELSLQAMCEDCSEIPNLSYSWDLFLVN 996
            |||||:...|||..||.||||:|:|||:|:|..||||:|:||:|:||||.::.:|:|||||||||
  Rat   692 GRNSSQALTFLSTRPDLAFRFIHVSWVNFRDISVNWNEEVSLRAVCEDCGDVSDLTYSWDLFLVN 756

Human   997 ATEKNRIEVPFCRVVGLLGSLGLGAISESSQLNLLPTEPGTADPDATTTPFSREPSPVTLGQPAT 1061
            |||||.:|...|..:.|:|.:                                 ..||       
  Rat   757 ATEKNAVEGKSCYSILLIGKV---------------------------------HGPV------- 781

Human  1062 SAPRGTPTEPMTGVYWIPPAGDSAVLGEAPEEGSLDLEPGPQSKGSLMTGRSERSQPTHSPDPHL 1126
             |..|.|.|                     :.|||...|...::.:||....|.|.|..|..   
  Rat   782 -AGSGEPME---------------------DYGSLSPAPSSLAEEALMMSDPEGSWPFPSSS--- 821

Human  1127 SDFEAYYSDIQEAIPSGGRQPAKDTSFPGSGPSLSAEESPGDGDNLVDPSLSAGRAEPVLMIDWP 1191
            :.|:...::.|||                 |.|||||||...||||:.|.|..|||:|.||||||
  Rat   822 TAFDGISANFQEA-----------------GSSLSAEESASYGDNLLGPFLHTGRAKPTLMIDWP 869

Human  1192 KALLGRAVFQGYSSSGITEQTVTIKPYSLSSGETYVLQVSVASKHGLLGKAQLYLTVNPAPRDMA 1256
            |||:.||||.||::|||....|||||:||||||.||||.||||||.||||||||||||.||:||:
  Rat   870 KALVSRAVFHGYTTSGIMGPDVTIKPFSLSSGEMYVLQASVASKHVLLGKAQLYLTVNQAPQDMS 934

Human  1257 CQVQPHHGLEAHTVFSVFCMSGKPDFHYEFSYQIGNTSKHTLYHGRDTQYYFVLPAGEHLDNYKV 1321
            |||:||.|:||||:||:|||||||||||||.|:|||.|.||||.|:||||||:||||:..|:|||
  Rat   935 CQVRPHRGMEAHTIFSIFCMSGKPDFHYEFRYRIGNASSHTLYRGQDTQYYFLLPAGDSSDSYKV 999

Human  1322 MVSTEITDGKGSKVQPCTVVVTVLPRYHGNDCLGEDLYNSSLKNLSTLQLMGSYTEIRNYITVIT 1386
            :||||:|||:|||||||||.||||||||||||..:|||||:|:|||||||:||||||||||.:||
  Rat  1000 IVSTEVTDGQGSKVQPCTVEVTVLPRYHGNDCHDKDLYNSTLENLSTLQLVGSYTEIRNYIAMIT 1064

Human  1387 RILSRLSKEDK-TASCNQWSRIQDALISSVCRLAFVDQEEMIGSVLMLRDLVSFSNKLGFMSAVL 1450
            .|||||..|.: |:||.|||:|||.||.|.|::.:.|||.|:.|:.:||||:||.|||..|||.|
  Rat  1065 GILSRLYVESRNTSSCGQWSQIQDVLIFSACKVPYTDQETMMDSIHILRDLISFPNKLSLMSAEL 1129

Human  1451 ILKYTRALLAQGQFSGPFVIDKGVRLELIGLISRVWEVSEQENSKEEVYRHEEGITVISDLLLGC 1515
            |.||.:..|||||.|...::|:.:|:|.|.|||.|||.: :|:.::..|..:||:.::||:||.|
  Rat  1130 IYKYAQMFLAQGQVSRRLLVDEKLRVEFILLISGVWEAA-KEDVRDGYYLQKEGMKIVSDMLLAC 1193

Human  1516 LSLN-----HVSTGQMEFRTLLHYNLQSSVQSLGSVQVHLPGDLAGHSPAGAETQSPCYISQLIL 1575
            |||:     |:|||||||:||:|.:.|||:|:||.::||||.|:|.|||...|||||||||||..
  Rat  1194 LSLSPKHQIHISTGQMEFQTLVHRSPQSSIQNLGFIRVHLPNDVALHSPTQEETQSPCYISQLTF 1258

Human  1576 FKKNPYPGSQAPGQIGGVVGLNLYTCSSRRPINRQWLRKPVMVEFGEEDGLDNRRNKTTFVLLRD 1640
            |.|:||.|.|||||:|||:...||:|.|||||.|..|..||.:||||||.| :::|...||||||
  Rat  1259 FMKSPYSGEQAPGQLGGVMSPWLYSCKSRRPILRGRLETPVTIEFGEEDHL-HKKNPAMFVLLRD 1322

Human  1641 KVNLHQFTELSENPQESLQIEIEFSKPVTRAFPVMLLVRFSEKPTPSDFLVKQIYFWDESIVQIY 1705
            :||:||||.||||.||||||.|||||||.||||::||||||||.||||||:||:|||||..||:|
  Rat  1323 EVNVHQFTGLSENSQESLQIHIEFSKPVIRAFPIILLVRFSEKATPSDFLMKQVYFWDEQTVQMY 1387

Human  1706 IPAASQKDASVGYLSLLDADYDRKPPNRYLAKAVNYTVHFQWIRCLFWDKREWKSERFSPQPGTS 1770
            :|||..:.|:|||||||||||||||||:|||.|||||||||||:|:||||.||:||...||||||
  Rat  1388 VPAAPWRGANVGYLSLLDADYDRKPPNKYLAGAVNYTVHFQWIQCVFWDKTEWRSEGPCPQPGTS 1452

Human  1771 PEKVNCSYHRLAAFALLRRKLKASFEVSDISKLQSHPENLLPSIFIMGSVILYGFLVAKSRQVDH 1835
            ||||||||||||.|::|||||.|:|:||.:|:.||||.|||||||.:..::|||||::||..||.
  Rat  1453 PEKVNCSYHRLAPFSVLRRKLNATFQVSSVSEFQSHPHNLLPSIFSVFFLVLYGFLMSKSSCVDC 1517

Human  1836 HEKKKAGYIFLQEASLPGHQLYAVVIDTGFRAPARLTSKVYIVLCGDNGLSETKELSCPEKPLFE 1900
            |:||..|.|||:|.:|.||||||||||||||:|||.||||:|||||:||.||||||.|||||||.
  Rat  1518 HKKKDPGCIFLEEEALLGHQLYAVVIDTGFRSPARFTSKVFIVLCGENGHSETKELCCPEKPLFG 1582

Human  1901 RNSRHTFILSAPAQLGLLRKIRLWHDSRGPSPGWFISHVMVKELHTGQGWFFPAQCWLSAGRHDG 1965
            ||||||||||.|.|||.|:||||||||.|.||.|||||||||||.:||.|||.|||||:..:..|
  Rat  1583 RNSRHTFILSTPHQLGPLQKIRLWHDSSGLSPSWFISHVMVKELCSGQAWFFSAQCWLAVSKRGG 1647

Human  1966 RVERELTCLQGGLGFRKLFYCKFTEYLEDFHVWLSVYSRPSSSRYLHTPRLTVSFSLLCVYACLT 2030
            :|..|..||..||.|.||||.||||||||||:|.|:||:|.||.||||.||.|||.||.||:|||
  Rat  1648 QVLGEFFCLSHGLSFWKLFYSKFTEYLEDFHIWFSLYSQPPSSNYLHTQRLAVSFCLLSVYSCLT 1712

Human  2031 ALVAAGGQEQPHLDVSP---TLGSFRVGLLCTLLASPGAQLLSLLFRLSKEAPGSARVEPHSPLR 2092
            |||..||.||..|.|.|   ||.||.:.||||:||.|.|||||||||.||..           |:
  Rat  1713 ALVTVGGHEQRPLGVGPTAITLDSFSLALLCTILACPPAQLLSLLFRCSKWT-----------LQ 1766

Human  2093 GGAQTEAPHGPNSWGRIPDAQEPRKQPASAILSGSGRAQRKAASDNGTACPAPKLQVHGADHSRT 2157
            ..:.|       :|..:.........|.|.:|.|:.:|.|..||::                   
  Rat  1767 SNSLT-------AWSCLEATSIGPMHPISDLLPGTDQAWRMTASNS------------------- 1805

Human  2158 SLMGKSHCCPPHTQAPSSGLEGLMPQWSRALQPWWSSAVWAICGTASLACSLGTGFLAYRFGQEQ 2222
                          |||||.|.|.||.||....|.||..|||.|||||||.||||||.|:|...|
  Rat  1806 --------------APSSGFEELRPQQSRVCLLWSSSVAWAISGTASLACGLGTGFLGYKFVPAQ 1856

Human  2223 CVQWLHLLSLSVVCCIFITQPLMVCLMALGFAWKRRADNHFFTESLCEATRDLDSELAERSWTRL 2287
            ||.|||||.||:|||..||||||:||.|..|||||:.|:.||||||.:||:.||.||.|||.|.:
  Rat  1857 CVWWLHLLLLSLVCCALITQPLMICLAASAFAWKRKHDSEFFTESLQDATKGLDLELEERSRTHI 1921

Human  2288 PFSSSCSIPDCAGEVEKVLAARQQARHLRWAHPPSKAQLRGTRQRMRRESRTRAALRDISMDILM 2352
            |.|.....||.|.|.|:||||||:.||||||..||..:.|..|:|:|||...:|||||::|..:|
  Rat  1922 PLSPVSYSPDSAEEAERVLAARQRERHLRWAQTPSGPKFRVMRERLRRERLMQAALRDVTMHSVM 1986

Human  2353 LLLLLCVIYGRFSQDEYSLNQAIRKEFTRNARNCLGGLRNIADWWDWSLTTLLDGLYPGGTPSAR 2417
            |||||.:.||||...|||||||||:.|||||.:.||.|.:..|||||:|:||||||:|...| |.
  Rat  1987 LLLLLFIAYGRFCPGEYSLNQAIRRAFTRNAHHSLGDLSSTEDWWDWTLSTLLDGLHPERMP-AT 2050

Human  2418 VPGAQPGALGGKCYLIGSSVIRQLKVFPRHLCKPPRPFSALIEDSIPTCSPEVGGPENPYLIDPE 2482
            ..|:|||||||:|:|||.|||:||||.....|..|:|||.|:||.:|..|         :.:|.|
  Rat  2051 AWGSQPGALGGQCHLIGPSVIKQLKVSAGTACVAPKPFSELVEDVLPMHS---------HALDLE 2106

Human  2483 NQNVTLNGPGGCGT-REDCVLSLGRTRTEAHTALSRLRASMWIDRSTRAVSVHFTLYNPPTQLFT 2546
            |:|||.:.|..||. :|....||||||.|||.||:.||||.|||.||||||||||||||||:|||
  Rat  2107 NRNVTPDDPKTCGVKKESYTHSLGRTRHEAHAALTALRASRWIDHSTRAVSVHFTLYNPPTRLFT 2171

Human  2547 SVSLRVEILPTGSLVPSSLVESFSIFRSDSALQYHLMLPQLVFLALSLIHLCVQLYRMMDKGVLS 2611
            ||:|..|.|.|..||.|||:||||||..|||||..|||.:|:||.|::||||.||:.|..||:||
  Rat  2172 SVTLGAEFLSTRGLVSSSLIESFSIFYRDSALQCLLMLSELLFLVLNMIHLCFQLWEMATKGILS 2236

Human  2612 YWRKPRNWLELSVVGVSLTYYAVSGHLVTLAGDVTNQFHRGLCRAFMDLTLMASWNQRARWLRGI 2676
            ||||||.|||||:|||:|.|.|.||||.|||.::|:|||:||.:.|:|::||.|||||||.|:||
  Rat  2237 YWRKPRQWLELSMVGVALAYCAASGHLTTLAENITDQFHKGLYQRFVDISLMVSWNQRARCLQGI 2301

Human  2677 LLFLFTLKCVYLPGIQNTMASCSSMMRHSLPSIFVAGLVGALMLAALSHLHRFLLSMWVLPPGTF 2741
            ||||:.||||:|....:|||..|:||.| .|.:|...|||||:|||.|||..|||....|..||.
  Rat  2302 LLFLWMLKCVHLFSSLSTMAPFSAMMGH-CPGVFSLQLVGALLLAAHSHLRWFLLYTSTLSRGTS 2365

Human  2742 TDAFPGLLFHFPRRSQKDCLLGLSKSDQRAMACYFGILLIVSATLCFGMLRGFLMTLPQKRKSFQ 2806
            .:||||||..||.|||||......:||.||:.||:|.|.::.|||.|.|||...:||.|.||||.
  Rat  2366 AEAFPGLLLQFPGRSQKDSQHNHLESDHRAVNCYYGTLFLLLATLGFRMLRATSLTLFQDRKSFH 2430

Human  2807 SKSFVRLKDVTAYMWEKVLTFLRLETPKLEEAEMVENHNYYLDEFANLLDELLMKINGLSDSLQL 2871
            .||.|.||||...||.::||||||||....|.|:..:|.||||||::|||||||||:||||||:|
  Rat  2431 RKSLVTLKDVAVSMWHRLLTFLRLETTTSGETEVTTDHIYYLDEFSSLLDELLMKIDGLSDSLEL 2495

Human  2872 PLLEKTSNNTGEARTEESPLVDISSYQAA 2900
            .:|||....|.|:||.:||.|.|..||||
  Rat  2496 SILEKQWRRTVESRTGDSPSVGILEYQAA 2524

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
PKD1L1XP_016867287.1 PCC <519..892 CDD:188093 275/372 (74%)
REJ 798..>990 CDD:366875 125/191 (65%)
REJ <1199..1343 CDD:366875 109/143 (76%)
PLAT_polycystin 1855..1973 CDD:238850 89/117 (76%)
Polycystin_dom 2395..2570 CDD:466668 104/175 (59%)
Pkd1l1XP_063129791.1 None

Return to query results.
Submit another query.