DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment PRICKLE2 and Prickle2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_942559.1 Gene:PRICKLE2 / 166336 HGNCID:20340 Length:844 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_038963548.1 Gene:Prickle2 / 312563 RGDID:1306723 Length:939 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:847 Identity:804/847 - (94%)
Similarity:826/847 - (97%) Gaps:3/847 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MVTVMPLEMEKTISKLMFDFQRNSTSDDDSGCALEEYAWVPPGLKPEQVHQYYSCLPEEKVPYVN 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    93 MVTVMPLEMEKTISKLMFDFQRNSTSDDDSGCALEEYAWVPPGLKPEQVHQYYSCLPEEKVPYVN 157

Human    66 SPGEKLRIKQLLHQLPPHDNEVRYCNSLDEEEKRELKLFSSQRKRENLGRGNVRPFPVTMTGAIC 130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||
  Rat   158 SPGEKLRIKQLLHQLPPHDNEVRYCNSLDEEEKRELKLFSNQRKRENLGRGNVRPFPVTMTGAIC 222

Human   131 EQCGGQINGGDIAVFASRAGHGVCWHPPCFVCTVCNELLVDLIYFYQDGKIYCGRHHAECLKPRC 195
            |||||||.||||||||||||||:|||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   223 EQCGGQIKGGDIAVFASRAGHGICWHPPCFICTVCNELLVDLIYFYQDGKIYCGRHHAECLKPRC 287

Human   196 AACDEIIFADECTEAEGRHWHMKHFCCFECETVLGGQRYIMKEGRPYCCHCFESLYAEYCDTCAQ 260
            ||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   288 AACDEIIFADECTEAEGRHWHMRHFCCFECETVLGGQRYIMKEGRPYCCHCFESLYAEYCDTCAQ 352

Human   261 HIGIDQGQMTYDGQHWHATETCFCCAHCKKSLLGRPFLPKQGQIFCSRACSAGEDPNGSDSSDSA 325
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   353 HIGIDQGQMTYDGQHWHATENCFCCAHCKKSLLGRPFLPKQGQIFCSRACSAGEDPNGSDSSDSA 417

Human   326 FQNARAKESRRSAKIGKNKGKTEEPMLNQHSQLQVSSNRLSADVDPLSLQMDMLSLSSQTPSLNR 390
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||:|||:||||||||||||
  Rat   418 FQNARAKESRRSAKIGKNKGKTEETMLNQHSQLQVSSNRLSADVDPLSVQMDLLSLSSQTPSLNR 482

Human   391 DPIWRSREEPYHYGNKMEQNQTQSPLQLLSQCNIRTSYSPGGQGAGAQPEMWGKHFSNPKRSSSL 455
            |||||||:||:||||||||||:|||||||||||||||||||||.|||||:||.|||||||||||:
  Rat   483 DPIWRSRDEPFHYGNKMEQNQSQSPLQLLSQCNIRTSYSPGGQAAGAQPDMWAKHFSNPKRSSSM 547

Human   456 AMTGHAGSFIKECREDYYPGRLRSQESYSDMSSQSFSETRGSIQVPKY---EEEEEEEGGLSTQQ 517
            |:.||.||||:|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||   |||||||||:||||
  Rat   548 ALKGHGGSFIQECREDYYPGRLMSQESYSDMSSQSFSETRGSIPVPKYEEEEEEEEEEGGISTQQ 612

Human   518 CRTRHPISSLKYTEDMTPTEQTPRGSMESLALSNATGLSADGGAKRQEHLSRFSMPDLSKDSGMN 582
            ||.|.|:|||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||
  Rat   613 CRPRRPLSSLKYTEDMTPTEQTPRGSMESLALSNATGLSAEGGAKRQEHLSRFSMPDLSKDSGMN 677

Human   583 VSEKLSNMGTLNSSMQFRSAESVRSLLSAQQYQEMEGNLHQLSNPIGYRDLQSHGRMHQSFDFDG 647
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||
  Rat   678 VSEKLSNMGTLNSSMQFRSAESVRSLLSAQQYQEMEGNLHQLSNPLGYRDLQSHGRMHQSFDFDG 742

Human   648 GMAGSKLPGQEGVRIQPMSERTRRRATSRDDNRRFRPHRSRRSRRSRSDNALHLASEREAISRLK 712
            |:|.|||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|:|||
  Rat   743 GIASSKLPGQEGVHIQPMSERTRRRTTSRDDNRRFRPHRSRRSRRSRSDNALHLASEREVIARLK 807

Human   713 DRPPLRAREDYDQFMRQRSFQESMGHGSRRDLYGQCPRTVSDLALQNAFGDRWGPYFAEYDWCST 777
            ||||||||||||||:||||||||||.|||||||.||||||||||||||||:||||||.|||||||
  Rat   808 DRPPLRAREDYDQFVRQRSFQESMGQGSRRDLYSQCPRTVSDLALQNAFGERWGPYFTEYDWCST 872

Human   778 CSSSSESDNEGYFLGEPIPQPARLRYVTSDELLHKYSSYGLPKSSTLGGRGQLHSRKRQKSKNCI 842
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||
  Rat   873 CSSSSESDNEGYFLGEPIPQPARLRYVTSDELLHKYSSYGVPKSSTLGGRGQLHSRKRQKSKNCI 937

Human   843 IS 844
            ||
  Rat   938 IS 939

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
PRICKLE2NP_942559.1 PET_Prickle 26..122 CDD:193602 94/95 (99%)
LIM1_Prickle 130..188 CDD:188799 54/57 (95%)
LIM2_Prickle 193..248 CDD:188802 53/54 (98%)
LIM3_Prickle 253..311 CDD:188804 56/57 (98%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 314..350 35/35 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 481..519 35/40 (88%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 639..709 64/69 (93%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 822..844 21/21 (100%)
Prickle2XP_038963548.1 PET_Prickle 118..214 CDD:193602 94/95 (99%)
LIM1_Prickle 222..280 CDD:188799 54/57 (95%)
LIM2_Prickle 285..340 CDD:188802 53/54 (98%)
LIM3_Prickle 345..403 CDD:188804 56/57 (98%)

Return to query results.
Submit another query.