Protein Alignment DCTN1 and Dctn1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_004073.2
• Gene: DCTN1 / 1639
• HGNCID: 2711
• Length: 1278
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: NP_077044.2
• Gene: Dctn1 / 29167
• RGDID: 62038
• Length: 1281
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 1281
• Identity: 1240/1281 - (96%)
• Similarity: 1256/1281 - (98%)
• Gaps: 3/1281 - (0%)

Human     1 MAQSKRHVYSRTPSGSRMSAEASARPLRVGSRVEVIGKGHRGTVAYVGATLFATGKWVGVILDEA 65
            |||||||:|:|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MAQSKRHMYNRTPSGSRMSTEASARPLRVGSRVEVIGKGHRGTVAYVGATLFATGKWVGVILDEA 65

Human    66 KGKNDGTVQGRKYFTCDEGHGIFVRQSQIQVFEDGADTTSPETPDSSASKVLKREGTDTTAKTSK 130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||.|..|||||
  Rat    66 KGKNDGTVQGRKYFTCDEGHGIFVRQSQIQVFEDGADTTSPETPDSSASKILKREGADAAAKTSK 130

Human   131 LRGLKPKKAPTARKTTTRRPKPTRPASTGVAGASSSLGPSGSASAGELSSSEPSTPAQTPLAAPI 195
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 LRGLKPKKAPTARKTTTRRPKPTRPASTGVAGPSSSLGPSGSASAGELSSSEPSTPAQTPLAAPI 195

Human   196 IPTPVLTSPGAVPPLPSPSKEEEGLRAQVRDLEEKLETLRLKRAEDKAKLKELEKHKIQLEQVQE 260
            ||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||
  Rat   196 IPTPALTSPGAAPPLPSPSKEEEGLRAQVRDLEEKLETLRLKRSEDKAKLKELEKHKIQLEQVQE 260

Human   261 WKSKMQEQQADLQRRLKEARKEAKEALEAKERYMEEMADTADAIEMATLDKEMAEERAESLQQEV 325
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  Rat   261 WKSKMQEQQADLQRRLKEARKEAKEALEAKERYMEEMADTADAIEMATLDKEMAEERAESLQQEV 325

Human   326 EALKERVDELTTDLEILKAEIEEKGSDGAASSYQLKQLEEQNARLKDALVRMRDLSSSEKQEHVK 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 EALKERVDELTTDLEILKAEIEEKGSDGAASSYQLKQLEEQNARLKDALVRMRDLSSSEKQEHVK 390

Human   391 LQKLMEKKNQELEVVRQQRERLQEELSQAESTIDELKEQVDAALGAEEMVEMLTDRNLNLEEKVR 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 LQKLMEKKNQELEVVRQQRERLQEELSQAESTIDELKEQVDAALGAEEMVEMLTDRNLNLEEKVR 455

Human   456 ELRETVGDLEAMNEMNDELQENARETELELREQLDMAGARVREAQKRVEAAQETVADYQQTIKKY 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 ELRETVGDLEAMNEMNDELQENARETELELREQLDMAGARVREAQKRVEAAQETVADYQQTIKKY 520

Human   521 RQLTAHLQDVNRELTNQQEASVERQQQPPPETFDFKIKFAETKAHAKAIEMELRQMEVAQANRHM 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   521 RQLTAHLQDVNRELTNQQEASVERQQQPPPETFDFKIKFAETKAHAKAIEMELRQMEVAQANRHM 585

Human   586 SLLTAFMPDSFLRPGGDHDCVLVLLLMPRLICKAELIRKQAQEKFELSENCSERPGLRGAAGEQL 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||
  Rat   586 SLLTAFMPDSFLRPGGDHDCVLVLLLMPRLICKAELIRKQAQEKFDLSENCSERPGLRGAAGEQL 650

Human   651 SFAAGLVYSLSLLQATLHRYEHALSQCSVDVYKKVGSLYPEMSAHERSLDFLIELLHKDQLDETV 715
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   651 SFAAGLVYSLSLLQATLHRYEHALSQCSVDVYKKVGSLYPEMSAHERSLDFLIELLHKDQLDETV 715

Human   716 NVEPLTKAIKYYQHLYSIHLAEQPEDCTMQLADHIKFTQSALDCMSVEVGRLRAFLQGGQEATDI 780
            |||||||||||||||||||||||||:.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   716 NVEPLTKAIKYYQHLYSIHLAEQPEESTMQLADHIKFTQSALDCMSVEVGRLRAFLQGGQEATDI 780

Human   781 ALLLRDLETSCSDIRQFCKKIRRRMPGTDAPGIPAALAFGPQVSDTLLDCRKHLTWVVAVLQEVA 845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
  Rat   781 ALLLRDLETSCSDIRQFCKKIRRRMPGTDAPGIPAALAFGSQVSDTLLDCRKHLTWVVAVLQEVA 845

Human   846 AAAAQLIAPLAENEGLLVAALEELAFKASEQIYGTPSSSPYECLRQSCNILISTMNKLATAMQEG 910
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||:|||||||||||||:||||||||||||||||
  Rat   846 AAAAQLIAPLAENEGLPVAALEELAFKASEQIYGSPSSSPYECLRQSCSILISTMNKLATAMQEG 910

Human   911 EYDAERPPSKPPPVELRAAALRAEITDAEGLGLKLEDRETVIKELKKSLKIKGEELSEANVRLSL 975
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   911 EYDAERPPSKPPPVELRAAALRAEITDAEGLGLKLEDRETVIKELKKSLKIKGEELSEANVRLSL 975

Human   976 LEKKLDSAAKDADERIEKVQTRLEETQALLRKKEKEFEETMDALQADIDQLEAEKAELKQRLNSQ 1040
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
  Rat   976 LEKKLDSAAKDADERIEKVQTRLEETQTLLRKKEKEFEETMDALQADIDQLEAEKTELKQRLNSQ 1040

Human  1041 SKRTIEGLRGPPPSGIATLVSGIAGEEQQRGAIPGQAPGSVPGPGLVKDSPLLLQQISAMRLHIS 1105
            |||||||||||||||||||||||||||||||..||||||::||||.|||||||||||||||||||
  Rat  1041 SKRTIEGLRGPPPSGIATLVSGIAGEEQQRGGTPGQAPGALPGPGPVKDSPLLLQQISAMRLHIS 1105

Human  1106 QLQHENSILKGAQMKASLASLPPLHVAKLS---HEGPGSELPAGALYRKTSQLLETLNQLSTHTH 1167
            |||||||||:|||||||||:||||||||.|   |||||..|.:||||||||||||.|||||||||
  Rat  1106 QLQHENSILRGAQMKASLAALPPLHVAKFSLPPHEGPGGNLLSGALYRKTSQLLEKLNQLSTHTH 1170

Human  1168 VVDITRTSPAAKSPSAQLMEQVAQLKSLSDTVEKLKDEVLKETVSQRPGATVPTDFATFPSSAFL 1232
            ||||||:||||||||||||||||||||||||:||||||||||||:||||||||||||||||||||
  Rat  1171 VVDITRSSPAAKSPSAQLMEQVAQLKSLSDTIEKLKDEVLKETVTQRPGATVPTDFATFPSSAFL 1235

Human  1233 RAKEEQQDDTVYMGKVTFSCAAGFGQRHRLVLTQEQLHQLHSRLIS 1278
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
  Rat  1236 RAKEEQQDDTVYMGKVTFSCAAGLGQRHRLVLTQEQLHQLHGRLIS 1281

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
DCTN1	NP_004073.2	Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1..25		20/23 (87%)
		CAP_GLY	29..94	CDD:460154	64/64 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	100..223		115/122 (94%)
		PHA03247	<101..220	CDD:223021	111/118 (94%)
		SMC_prok_B	220..>540	CDD:274008	318/319 (100%)
		Dynactin	527..805	CDD:463591	274/277 (99%)
		Interaction with HPS6. /evidence=ECO:0000269|PubMed:25189619	911..1278		346/369 (94%)
		Smc	<926..>1046	CDD:440809	117/119 (98%)
Dctn1	NP_077044.2	Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1..26		21/24 (88%)
		CAP_GLY	29..94	CDD:460154	64/64 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	99..223		116/123 (94%)
		Herpes_BLLF1	<101..>214	CDD:282904	105/112 (94%)
		SMC_prok_B	220..>540	CDD:274008	318/319 (100%)
		Dynactin	527..805	CDD:463591	274/277 (99%)
		Interaction with HPS6. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:O08788	911..1281		346/369 (94%)
		Smc	<926..>1046	CDD:440809	117/119 (98%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1065..1090		19/24 (79%)