Protein Alignment DCC and Dcc

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_005206.2
• Gene: DCC / 1630
• HGNCID: 2701
• Length: 1447
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: XP_038952516.2
• Gene: Dcc / 25311
• RGDID: 2492
• Length: 1456
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 1416
• Identity: 1369/1416 - (96%)
• Similarity: 1394/1416 - (98%)
• Gaps: 0/1416 - (0%)

Human    32 FQIKAFTALRFLSEPSDAVTMRGGNVLLDCSAESDRGVPVIKWKKDGIHLALGMDERKQQLSNGS 96
            ||||.||:|.|:||||||||||||||||:||||||||||||||||||:.||||||:|||||.|||
  Rat    41 FQIKPFTSLHFVSEPSDAVTMRGGNVLLNCSAESDRGVPVIKWKKDGLILALGMDDRKQQLPNGS 105

Human    97 LLIQNILHSRHHKPDEGLYQCEASLGDSGSIISRTAKVAVAGPLRFLSQTESVTAFMGDTVLLKC 161
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||:||||||||||||
  Rat   106 LLIQNILHSRHHKPDEGLYQCEASLGDSGSIISRTAKVMVAGPLRFLSQTESITAFMGDTVLLKC 170

Human   162 EVIGEPMPTIHWQKNQQDLTPIPGDSRVVVLPSGALQISRLQPGDIGIYRCSARNPASSRTGNEA 226
            ||||:||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|:||||||||||:||||||
  Rat   171 EVIGDPMPTIHWQKNQQDLNPIPGDSRVVVLPSGALQISRLQPGDSGVYRCSARNPASTRTGNEA 235

Human   227 EVRILSDPGLHRQLYFLQRPSNVVAIEGKDAVLECCVSGYPPPSFTWLRGEEVIQLRSKKYSLLG 291
            |||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   236 EVRILSDPGLHRQLYFLQRPSNVIAIEGKDAVLECCVSGYPPPSFTWLRGEEVIQLRSKKYSLLG 300

Human   292 GSNLLISNVTDDDSGMYTCVVTYKNENISASAELTVLVPPWFLNHPSNLYAYESMDIEFECTVSG 356
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  Rat   301 GSNLLISNVTDDDSGTYTCVVTYKNENISASAELTVLVPPWFLNHPSNLYAYESMDIEFECAVSG 365

Human   357 KPVPTVNWMKNGDVVIPSDYFQIVGGSNLRILGVVKSDEGFYQCVAENEAGNAQTSAQLIVPKPA 421
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||
  Rat   366 KPVPTVNWMKNGDVVIPSDYFQIVGGSNLRILGVVKSDEGFYQCVAENEAGNAQSSAQLIVPKPA 430

Human   422 IPSSSVLPSAPRDVVPVLVSSRFVRLSWRPPAEAKGNIQTFTVFFSREGDNRERALNTTQPGSLQ 486
            |||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   431 IPSSSILPSAPRDVVPVLVSSRFVRLSWRPPAEAKGNIQTFTVFFSREGDNRERALNTTQPGSLQ 495

Human   487 LTVGNLKPEAMYTFRVVAYNEWGPGESSQPIKVATQPELQVPGPVENLQAVSTSPTSILITWEPP 551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||
  Rat   496 LTVGNLKPEAMYTFRVVAYNEWGPGESSQPIKVATQPELQVPGPVENLHAVSASPTSILITWEPP 560

Human   552 AYANGPVQGYRLFCTEVSTGKEQNIEVDGLSYKLEGLKKFTEYSLRFLAYNRYGPGVSTDDITVV 616
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||
  Rat   561 AYANGPVQGYRLFCTEVSTGKEQNIEVDGLSYKLEGLKKFTEYTLRFLAYNRYGPGVSTDDITVV 625

Human   617 TLSDVPSAPPQNVSLEVVNSRSIKVSWLPPPSGTQNGFITGYKIRHRKTTRRGEMETLEPNNLWY 681
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   626 TLSDVPSAPPQNVSLEVVNSRSIKVSWLPPPSGTQNGFITGYKIRHRKTTRRGEMETLEPNNLWY 690

Human   682 LFTGLEKGSQYSFQVSAMTVNGTGPPSNWYTAETPENDLDESQVPDQPSSLHVRPQTNCIIMSWT 746
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   691 LFTGLEKGSQYSFQVSAMTVNGTGPPSNWYTAETPENDLDESQVPDQPSSLHVRPQTNCIIMSWT 755

Human   747 PPLNPNIVVRGYIIGYGVGSPYAETVRVDSKQRYYSIERLESSSHYVISLKAFNNAGEGVPLYES 811
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   756 PPLNPNIVVRGYIIGYGVGSPYAETVRVDSKQRYYSIERLESSSHYVISLKAFNNAGEGVPLYES 820

Human   812 ATTRSITDPTDPVDYYPLLDDFPTSVPDLSTPMLPPVGVQAVALTHDAVRVSWADNSVPKNQKTS 876
            |||||||||||||||||||||||||.||:|||||||||||||||||:||||||||||||||||||
  Rat   821 ATTRSITDPTDPVDYYPLLDDFPTSGPDVSTPMLPPVGVQAVALTHEAVRVSWADNSVPKNQKTS 885

Human   877 EVRLYTVRWRTSFSASAKYKSEDTTSLSYTATGLKPNTMYEFSVMVTKNRRSSTWSMTAHATTYE 941
            :||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   886 DVRLYTVRWRTSFSASAKYKSEDTTSLSYTATGLKPNTMYEFSVMVTKNRRSSTWSMTAHATTYE 950

Human   942 AAPTSAPKDLTVITREGKPRAVIVSWQPPLEANGKITAYILFYTLDKNIPIDDWIMETISGDRLT 1006
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   951 AAPTSAPKDLTVITREGKPRAVIVSWQPPLEANGKITAYILFYTLDKNIPIDDWIMETISGDRLT 1015

Human  1007 HQIMDLNLDTMYYFRIQARNSKGVGPLSDPILFRTLKVEHPDKMANDQGRHGDGGYWPVDTNLID 1071
            ||||||:|||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1016 HQIMDLSLDTMYYFRIQARNAKGVGPLSDPILFRTLKVEHPDKMANDQGRHGDGGYWPVDTNLID 1080

Human  1072 RSTLNEPPIGQMHPPHGSVTPQKNSNLLVIIVVTVGVITVLVVVIVAVICTRRSSAQQRKKRATH 1136
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||:|||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1081 RSTLNEPPIGQMHPPHGSVTPQKNSNLLVITVVTVGVLTVLVVVIVAVICTRRSSAQQRKKRATH 1145

Human  1137 SAGKRKGSQKDLRPPDLWIHHEEMEMKNIEKPSGTDPAGRDSPIQSCQDLTPVSHSQSETQLGSK 1201
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||:|||||||.||||||||||||||||||:|:|||
  Rat  1146 SASKRKGSQKDLRPPDLWIHHEEMEMKNIEKPAGTDPAGRGSPIQSCQDLTPVSHSQSESQMGSK 1210

Human  1202 STSHSGQDTEEAGSSMSTLERSLAARRAPRAKLMIPMDAQSNNPAVVSAIPVPTLESAQYPGILP 1266
            |.||||||||||||||||||||||||||.|.||||||:|||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1211 SASHSGQDTEEAGSSMSTLERSLAARRATRTKLMIPMEAQSNNPAVVSAIPVPTLESAQYPGILP 1275

Human  1267 SPTCGYPHPQFTLRPVPFPTLSVDRGFGAGRSQSVSEGPTTQQPPMLPPSQPEHSSSEEAPSRTI 1331
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||:||||.||||||||||
  Rat  1276 SPTCGYPHPQFTLRPVPFPTLSVDRGFGAGRSQSVSEGPTAQQQPMLPPAQPEHPSSEEAPSRTI 1340

Human  1332 PTACVRPTHPLRSFANPLLPPPMSAIEPKVPYTPLLSQPGPTLPKTHVKTASLGLAGKARSPLLP 1396
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1341 PTACVRPTHPLRSFANPLLPPPMSAIEPKVPYTPLLSQPGPTLPKTHVKTASLGLAGKARSPLLP 1405

Human  1397 VSVPTAPEVSEESHKPTEDSANVYEQDDLSEQMASLEGLMKQLNAITGSAF 1447
            |||||||||||||||||||.|:|||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1406 VSVPTAPEVSEESHKPTEDPASVYEQDDLSEQMASLEGLMKQLNAITGSAF 1456

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
DCC	NP_005206.2	IgI_1_Neogenin_like	39..136	CDD:409387	88/96 (92%)
		Ig strand A	39..42	CDD:409387	1/2 (50%)
		Ig strand A'	45..51	CDD:409387	5/5 (100%)
		Ig strand B	55..65	CDD:409387	8/9 (89%)
		Ig strand C	70..76	CDD:409387	5/5 (100%)
		Ig strand C'	78..81	CDD:409387	1/2 (50%)
		Ig strand D	88..93	CDD:409387	4/4 (100%)
		Ig strand E	95..101	CDD:409387	5/5 (100%)
		Ig strand F	113..120	CDD:409387	6/6 (100%)
		Ig strand G	125..136	CDD:409387	10/10 (100%)
		Ig_3	139..216	CDD:464046	71/76 (93%)
		I-set	241..327	CDD:400151	83/85 (98%)
		Ig strand B	257..261	CDD:409562	3/3 (100%)
		Ig strand C	270..274	CDD:409562	3/3 (100%)
		Ig strand E	293..297	CDD:409562	3/3 (100%)
		Ig strand F	307..312	CDD:409562	3/4 (75%)
		Ig strand G	322..325	CDD:409562	2/2 (100%)
		Ig	334..417	CDD:472250	80/82 (98%)
		Ig strand B	348..352	CDD:409388	3/3 (100%)
		Ig strand C	361..365	CDD:409388	3/3 (100%)
		Ig strand E	383..387	CDD:409388	3/3 (100%)
		Ig strand F	397..402	CDD:409388	4/4 (100%)
		Ig strand G	410..413	CDD:409388	1/2 (50%)
		FN3	429..521	CDD:238020	91/91 (100%)
		FN3	<478..901	CDD:442628	415/422 (98%)
		FN3	946..1041	CDD:238020	92/94 (98%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1126..1152		24/25 (96%)
		Neogenin_C	1148..1445	CDD:461954	282/296 (95%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1165..1222		51/56 (91%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1288..1330		37/41 (90%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1394..1419		23/24 (96%)
		Interaction with MYO10. /evidence=ECO:0000269|PubMed:21642953	1432..1439		6/6 (100%)
Dcc	XP_038952516.2	None