DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment VCAN and Vcan

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_004376.2 Gene:VCAN / 1462 HGNCID:2464 Length:3396 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001164029.1 Gene:Vcan / 114122 RGDID:619940 Length:3357 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:3419 Identity:2101/3419 - (61%)
Similarity:2488/3419 - (72%) Gaps:85/3419 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MFINIKSILWMCSTLIVTHALHKVKVGKSPPVRGSLSGKVSLPCHFSTMPTLPPSYNTSEFLRIK 65
            |.||:..||||||||::||||||.|:.::|||:|||||||.|||||||:|||||.||||||||||
  Rat     1 MLINMNGILWMCSTLLLTHALHKAKMEENPPVKGSLSGKVILPCHFSTLPTLPPDYNTSEFLRIK 65

Human    66 WSKIEVDKNGKDLKETTVLVAQNGNIKIGQDYKGRVSVPTHPEAVGDASLTVVKLLASDAGLYRC 130
            ||||||||||||:|||||||||:|||||||||||||||||||:.|||||||:|||.|||||:|||
  Rat    66 WSKIEVDKNGKDIKETTVLVAQDGNIKIGQDYKGRVSVPTHPDDVGDASLTMVKLRASDAGVYRC 130

Human   131 DVMYGIEDTQDTVSLTVDGVVFHYRAATSRYTLNFEAAQKACLDVGAVIATPEQLFAAYEDGFEQ 195
            ||||||||||:|:||.||||||||||||||||||||:||:||||:||||||||||||||||||||
  Rat   131 DVMYGIEDTQNTMSLAVDGVVFHYRAATSRYTLNFESAQQACLDIGAVIATPEQLFAAYEDGFEQ 195

Human   196 CDAGWLADQTVRYPIRAPRVGCYGDKMGKAGVRTYGFRSPQETYDVYCYVDHLDGDVFHLTVPSK 260
            ||||||:||||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||:|.|||
  Rat   196 CDAGWLSDQTVRYPIRAPREGCYGDMMGKEGVRTYGFRSPQETYDVYCYVDHLDGDVFHITAPSK 260

Human   261 FTFEEAAKECENQDARLATVGELQAAWRNGFDQCDYGWLSDASVRHPVTVARAQCGGGLLGVRTL 325
            ||||||..||.|:||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 FTFEEAEAECANRDARLATVGELHAAWRNGFDQCDYGWLSDASVRHPVTVARAQCGGGLLGVRTL 325

Human   326 YRFENQTGFPPPDSRFDAYCFKPK----EATTIDLSILAETASPSLSKEPQMVSDRTTPIIPLVD 386
            |||||||.||.|||||||||||||    |||||:.:.|||||||||||||.||.:|.||:||||.
  Rat   326 YRFENQTCFPLPDSRFDAYCFKPKQNISEATTIETNTLAETASPSLSKEPHMVPERATPVIPLVT 390

Human   387 ELPVIPTEFPPVGNIVSFEQKATVQPQAITDSLATKLPTPTGSTKKPWDMDDYSPSASGPLGKLD 451
            |||:..|.|||.||||:.|||:.:..|||||.:||:.||..||....||.|||.||.||||||.|
  Rat   391 ELPIFTTHFPPAGNIVNSEQKSVIYSQAITDRVATESPTAAGSPINSWDADDYLPSGSGPLGKPD 455

Human   452 ISEIKEEVLQSTTGVSHYATDSWDGVVEDKQTQESVTQIEQIEVGPLVTSMEILKHIPSKEFPVT 516
            |||||||.|||||..|.:||.|..|:.||.||.||||||||||||||||||||..||..|||..|
  Rat   456 ISEIKEEGLQSTTVTSQHATASHHGITEDTQTHESVTQIEQIEVGPLVTSMEITNHISFKEFLET 520

Human   517 ETPLVTARMILES-KTEKKMVSTVSELVTTGHYGFTLGEEDDEDRTLTVGSDESTLIFDQIPEVI 580
            :|||.:..:.||. :|:...|.|..||.||.|||.||.|:|.||..|||.|.:||.:|.||||||
  Rat   521 KTPLESTEVTLEQHQTDMPTVITSPELATTSHYGVTLREDDREDIALTVRSGQSTRVFSQIPEVI 585

Human   581 TVSKTSEDTIHTHLEDLESVSASTTVSPLIMPDNNGSSMDDWEERQTSGRITEEFLGKYLSTTPF 645
            |||||||||.::.|.|||.||.:|    :.|...:||..|:.:|.||..:..|:..|:...|.||
  Rat   586 TVSKTSEDTTYSQLGDLEFVSTAT----ITMLGTDGSLTDEGKEPQTDDKTAEDEFGQSQPTIPF 646

Human   646 PSQHRTEIELFPYSGDKILVEGISTVIYPSLQTEMTHRRERTETLIPEMRTDTY-TDEIQEEITK 709
            ||||.||:|..|||||.|.||.||||.||||||::|..|||||...|.::.|.| .|||||:|||
  Rat   647 PSQHLTEVESLPYSGDTISVERISTVSYPSLQTDVTQGRERTEVPRPGLKKDPYAVDEIQEKITK 711

Human   710 SPFMGKTEEEVFSGMKLSTSLSEPIHVTESSVEMTKSFDFPTLITKLSAEPTEVRDMEEDFTATP 774
            .||:| |.||.||||.||||.|      |:|.|.|:|......|.||:.:|....|::|....|.
  Rat   712 DPFIG-TIEEGFSGMSLSTSSS------ETSAERTESVSPALTIEKLTVKPAVASDVDEMTILTR 769

Human   775 GTTKY---DENITTVLLAHGTLSVEAATVSKWSWDEDNTTSKPLESTEPSASSKLPPALLTTVGM 836
            ..|..   ||::|:..|.|.||:||..||.||..:|||:|||||..||.:..:|.||..|:|||:
  Rat   770 LETDVPTSDEDVTSAHLTHSTLNVEVVTVLKWPGNEDNSTSKPLPPTERAGFTKSPPVSLSTVGI 834

Human   837 NGKDKDIPSFTEDGADEFTLIPDSTQKQLEEVTDEDIAAHGKFTIRFQPTTSTGIAEKSTLRDST 901
            .||||:.|||| ||.||:||..|.|.|.||:.::||:.: |:|.:....:.|...||||||.:.|
  Rat   835 VGKDKETPSFT-DGGDEYTLSLDGTPKPLEKFSEEDLTS-GEFAVTIPTSISIDSAEKSTLGEPT 897

Human   902 TEEKVPPITSTEGQVY-ATMEGSALGEVEDVDLSKPVSTVPQFAHTSEVEGLAFVSYSSTQEPTT 965
            |.::|...|||:..|. ||:|||||.  ||:|.|||:.|...|.|||:||..|||:|||||:|||
  Rat   898 TGDRVLSTTSTKDLVINATVEGSALD--EDMDASKPLFTATPFVHTSDVEESAFVNYSSTQQPTT 960

Human   966 YVDSSHTIPLSVIPKTDWGVLVPSVPSEDEVLGEPSQDILVIDQTRLEATISPETMRTTKITEGT 1030
            |||.|||.|||:||||:|.|...|||.||||||:..||.|  :||.||||:|||.:.|.::|:|.
  Rat   961 YVDISHTSPLSIIPKTEWSVSETSVPLEDEVLGKSDQDTL--EQTHLEATMSPEALSTIEVTQGE 1023

Human  1031 TQEEFPWKEQTAEKPVPALSSTAWTPKEAVTPLDEQEGDGSAYTVSEDELLTGSERVPVLETTPV 1095
            ||||    .||...|.|||||||...||  |...|:||:||.||:|||.|:|.||.||.||||||
  Rat  1024 TQEE----PQTPGIPFPALSSTAVMTKE--TTAFEEEGEGSTYTLSEDRLMTDSEIVPSLETTPV 1082

Human  1096 GKIDHSVSYPPGAVTEHKVKTDEVVTLTPRIGPKVSLSPGPEQKYETEGSSTTGFTSSLSPFSTH 1160
            |     .|||.||:|:.:|:.|.:||....|.|.|.||..||..||.||||...|.|:|.||.|.
  Rat  1083 G-----TSYPGGAMTQQEVEMDTMVTQMSSIRPTVVLSTEPEVSYEAEGSSPMEFASTLKPFGTQ 1142

Human  1161 ITQLMEETTTE--KTSLEDIDLGSGLFEKPKATELIEFSTIKVTVPSDITTAFSSVDRLHTTSAF 1223
            :|||:||||.|  ||.|:..||||||||:|:.|||.:||    ..|||| :.|:::|.||.|:..
  Rat  1143 VTQLVEETTEEGKKTPLDYTDLGSGLFEQPRVTELPDFS----MTPSDI-SVFTAIDSLHRTTPL 1202

Human  1224 KPSSAITKKPPLIDREPGEETTSDMVIIGESTSHVPPTTLEDIVAKETETDIDREYFTTSSPPAT 1288
            :|.|..|::|.:.::||.|:||.|:::..||.:..|.|||.||:||:||:|||.||..||.||..
  Rat  1203 RPPSPFTEEPHIFEKEPSEKTTGDIILPRESVTQHPLTTLMDIIAKKTESDIDHEYHMTSKPPVM 1267

Human  1289 QPTRPPTVEDKEAFGPQALSTPQPPASTKFHPDINVYIIEVRENKTGRMSDLSVIGHPIDSESKE 1353
            |||||..||.|....||.|||..|||.||||||||||||||||||||||||:.|.||||||||||
  Rat  1268 QPTRPSVVERKTTSKPQELSTSPPPAGTKFHPDINVYIIEVRENKTGRMSDMVVNGHPIDSESKE 1332

Human  1354 DEPCSEETDPVHDLMAEILPEFPDIIEIDLYHSEENEEEEEECANATDVTTTPSVQYINGKHLVT 1418
            :|||||||||:|||.||||||.||..|||:|||||:|:.||:|.||||||||||||||.||..||
  Rat  1333 EEPCSEETDPLHDLFAEILPELPDSFEIDIYHSEEDEDGEEDCVNATDVTTTPSVQYITGKPHVT 1397

Human  1419 TVPKDPEAAEARRGQFESVAPSQNFSDSSESDTHPFVIAKTELSTAVQPNESTETTESLEVTWKP 1483
            ||||:|||||||||.:||||||||||::|.:|||.|:.|:|||||.:|..:|.|.||.||:||||
  Rat  1398 TVPKNPEAAEARRGLYESVAPSQNFSNTSATDTHQFIPAETELSTTMQFTKSKEATELLEITWKP 1462

Human  1484 ETYPETSEHFSGGEPDVFPTVPFHEEFESGTAKKGAESVTERDTEVGHQAHEHTEPVSLFPEESS 1548
            ||||||.||||.||||||||:|.|:    |...|.:|.:||.:....:..|:..:|:.|||||.|
  Rat  1463 ETYPETPEHFSSGEPDVFPTLPSHD----GKTTKWSEFITESNPNTENPEHKQPKPIPLFPEEFS 1523

Human  1549 GEIAIDQESQKIAFARATEVTFGEEVEKSTSVTYTPTIVPSSASAYVSEEEAVTLIGNPWPDDLL 1613
            ||.||||.||:..|:|||||..|:|.::|.::: |.:|...|.|.:..||:.:.|.|....|:.:
  Rat  1524 GEGAIDQASQQTIFSRATEVALGKETDQSPTIS-TSSIRSGSVSVHALEEDPIALTGISQTDESM 1587

Human  1614 STKESWVEATPRQVVELSGSSSIPITEGSGEAEEDEDTMFTMVTDLSQRNTTDTLITLDTSRI-I 1677
            ||.|||||.||.|.||.|||||.|..|||||.||..:.:|..||||.||..|||||.||.|.| |
  Rat  1588 STVESWVEMTPSQTVEFSGSSSAPTIEGSGEVEEYTNKIFNTVTDLPQREPTDTLIPLDMSNIMI 1652

Human  1678 TESFFEVPATTIYPVSEQPSAKVVPTKFVSETDTSEWISSTTVEEKKRKEE-EGTTGTASTFEVY 1741
            |:.....||||....|:.||....||:|..:|.||||:|||:.|.:|.:|: |..|..|.|.||.
  Rat  1653 TDHHIYTPATTAPLDSQLPSTDARPTQFGIQTTTSEWVSSTSFEGRKTEEDKERDTNAAHTGEVQ 1717

Human  1742 SSTQRSDQLILPFELESPNVATSSDSGTRKSFMSLTTPTQSEREMTDSTPVFTETNTLENLGAQT 1806
            .:|:|||:|:|..||||.|||.||...|.:.|:..||.|.||:||.::|||||||:.:.||..|:
  Rat  1718 PATERSDRLLLTSELESSNVAASSPLDTWEGFVPETTSTVSEKEMANTTPVFTETSDVANLETQS 1782

Human  1807 TEHSSIHQPGVQEGLTTLPRSPASVFMEQGSGEAAADPETTTVSSFSLNVEYAIQAEKEVAGTLS 1871
            .||||..||.|||.||||...|..:||:.|||:|:.|.|..|.|||:|::|...:.:||:..|||
  Rat  1783 FEHSSSSQPRVQEELTTLSGKPPLIFMDLGSGDASTDMEFITASSFTLDLESDTKVKKELPSTLS 1847

Human  1872 PHVETTFSTEPTGLVLSTVMDRVVAENITQTSREIVISERLGEPNYGAEIRGFSTGFPLEEDFSG 1936
            |.|||:.|:||.||..|||:|..:.|.:.|||::.:|||..|:|...||:|....|  |.|||||
  Rat  1848 PSVETSSSSEPIGLAPSTVLDIEIVEVMNQTSKKTLISELSGKPTSQAEVRDLYPG--LGEDFSG 1910

Human  1937 DFREYSTVSHPIAKEETVMMEGSGDAAFRDTQTSPSTVPTSVHISHISDSEGPSSTMVSTSAFPW 2001
            |..||.|||....|||||.|.||.:...:||||..|..|||.:|:.:.||:|..||:.||:||||
  Rat  1911 DSSEYPTVSSTTMKEETVGMGGSENERVKDTQTLSSIPPTSDNINPVPDSKGFGSTVASTTAFPW 1975

Human  2002 EEFTSSAEGSGEQLVTVSSSVVPVLPSAVQKFSGTASSIIDEGLGEVGTVNEIDRRSTILPTAEV 2066
            |||.:|||||||:|.:|.|||..|||..|.....|.|...|:...|...|.|..::|. ||.|..
  Rat  1976 EEFMTSAEGSGEELSSVRSSVSLVLPLGVDILPTTESPYFDQEFEEAAAVTEAGKQSA-LPIAVS 2039

Human  2067 EGTKAPVEKEEVKVSGTVSTNFPQTIEPAKLWSRQEVNPVRQEIESETTSEEQIQEEKSFESPQN 2131
            ..|....|..:::|:.|:|.:.|||:|||||||:.||||.:|||.|||.::::.|.:|||||..:
  Rat  2040 GNTVDLTENRDIEVNSTMSVDLPQTMEPAKLWSKPEVNPEKQEIGSETVTQDKAQGQKSFESLHS 2104

Human  2132 SPATEQTIFDSQTFTETELKTTDYSVLTTKKTYSDDKEMKEEDTSLVNMSTPDPDANGLESYTTL 2196
            |.|.|||..:||:..|||::|:.||:|||.|||:.::|::||.||:.:||||.|...|||||.|.
  Rat  2105 SLAPEQTTLESQSLIETEVQTSYYSMLTTMKTYNTNEEVEEEGTSIAHMSTPGPGIKGLESYPTH 2169

Human  2197 PEATEKSHFFLATALVTESIPAEHVVTDSPIKKEESTKHFPKGMRPTIQESDTELLFSGLGSGEE 2261
            ||||.||:.|.|:||||||.||..||.||..::|||.|.|.|.|..|.:||:::|.||||||| |
  Rat  2170 PEATGKSYSFSASALVTESGPARSVVMDSSTQEEESIKLFQKDMILTHKESNSDLSFSGLGSG-E 2233

Human  2262 VLPTLPTESVNFTEVEQINNTLYPHTSQVESTSSDKIED-FNRMENVAKEVGPLVSQT-DIFEGS 2324
            .||.|||.||:.|::.:||:||||.||.:||..:..:.| ..||:||:.||..|:|:| .|.:.|
  Rat  2234 ALPPLPTTSVSLTDMGKINSTLYPETSHMESLGTSILGDNHERMKNVSNEVRTLISETGSISQDS 2298

Human  2325 GSVTSTTLIEILSDTGAEGPTVAPLPFS--TDIGHPQNQTVRWAEEIQTSRPQTITEQDSNKNSS 2387
            ....:||    ||||..|..|.:||||.  .|..|...||:||.|||||.||||:|.|.:|.|||
  Rat  2299 TEAPNTT----LSDTRTEESTTSPLPFMKLMDTEHSPKQTLRWEEEIQTHRPQTMTGQMTNDNSS 2359

Human  2388 TAEINETTTSSTDFLARAYGFEMAKEFVTSAPKPSDLYYEPSGEGSGEVDIVDSFHTSATTQATR 2452
            .:|.....||:..||...|..||.|.|.||..:.|||:...|||||||||.:|..:||.||||:.
  Rat  2360 VSEAEAAATSAPAFLPETYSVEMTKAFATSPSQTSDLFDANSGEGSGEVDGLDLVYTSRTTQASS 2424

Human  2453 QESSTTFVSDGSLEKHPEVPSAKAVTADGFPTVSVMLPLHSEQNKSSPDPTSTLSNTVSYERSTD 2517
            |..| .|.|.|.:||||||...:....||.||.|.|....||.|:||..|||||.:||:||..::
  Rat  2425 QGDS-MFASHGFIEKHPEVSRTETGATDGSPTASAMFLHQSEYNESSLYPTSTLPSTVTYESPSE 2488

Human  2518 G---SFQDRFREFEDSTLKPNRKKPTENIIIDLDKED-KDLILTITESTILEILPELTSDKNTII 2578
            |   ..||..| ||.|||||:|:|.||::|||||||| |||.|.||||.|:|||||||||:|.||
  Rat  2489 GIADGLQDHIR-FEVSTLKPSRRKATESVIIDLDKEDSKDLGLAITESAIVEILPELTSDRNIII 2552

Human  2579 DIDHTKPVYEDILGMQTDIDTEVPSEPHDSNDESNDDSTQVQEIYEAAVNLSLTEETFEGSADVL 2643
            ||||||||||.|.|:|||:|:::|...|.|::|    |.:|||.|||.:|||.|||.|:||.|.|
  Rat  2553 DIDHTKPVYEYIPGIQTDLDSDIPLGSHGSSEE----SLEVQEKYEATINLSPTEEAFDGSGDAL 2613

Human  2644 -ASYTQATHDESMTYEDRSQLDHMGFHFTTGIPAPSTETELDVLLPTATSLPIPRKSATVIPEIE 2707
             |.:|||.::||:|..|..|.:.:.|.|.||||..||||||:...||.::|.||.|..|..|||:
  Rat  2614 PAGHTQAIYNESVTPSDGKQPEDISFSFATGIPVSSTETELNTFFPTVSTLHIPSKLTTASPEID 2678

Human  2708 GIKAEAKALDDMFESSTLSDGQAIADQSEIIPTLGQFERTQEEYEDKKHAGPSFQPEFSSGAEEA 2772
            ....||.:|||:|||||||||||||||||:|.|||..|:||||||:||:.||||||||.||..|.
  Rat  2679 KPNIEAISLDDIFESSTLSDGQAIADQSEVISTLGHLEKTQEEYEEKKYGGPSFQPEFFSGVGEV 2743

Human  2773 LVDHTPYLSIATTHLMDQSVTEVPDVMEGSNPPYYTDTTLAVSTFAKLSSQTPSSPLTIYSGSEA 2837
            ..|...|:||..|:.:.|.:||.|:|:..|:..:||:.|.|||:..:||.||||||..:|..|..
  Rat  2744 FTDAPAYVSIGRTYSVAQPLTEFPNVVGQSDSTHYTEATSAVSSVTELSPQTPSSPSPVYIDSGV 2808

Human  2838 SGHTEIPQPSALPGIDVGSSVMSPQDSFKEIHVNIEATFKPSSEEYLHITEPPSLSPDTKLEPSE 2902
            |..||:|..||.|.....||....:.|||::..|||||.| |..|..|.||.||:||...|:.||
  Rat  2809 SEFTEVPHKSAQPAPTAASSQKLIEGSFKKVRANIEATIK-SLGENDHGTESPSMSPSPALDISE 2872

Human  2903 DDGKPELLEEMEASPTELIAVEGTEILQDFQNKTDGQVSGEAIKMFPTIKTPEAGTVITTADEIE 2967
            ||.||:|||::|.|||:      ||..||..||.:.|:.|:...:...|||.|:|.|:|.||::|
  Rat  2873 DDSKPKLLEDLETSPTK------TETSQDSPNKANDQIPGKTAGILAGIKTTESGPVVTAADDME 2931

Human  2968 LEGATQWPHSTSASATYGVEAGVVPWLSPQTSERPTLSSSPEINPETQAALIRGQDSTIAASEQQ 3032
            |..|||.|||.||.|.:.||..:||...||..||||..|. |||.||..:|.  ::|.:|.||:|
  Rat  2932 LGDATQRPHSASAPAAFRVETSMVPQPIPQEPERPTFPSL-EINHETHTSLF--EESILATSEKQ 2993

Human  3033 VAARILDSNDQATVNPVEFNTEVATPPFSLLETSNETDFLIGINEESVEGTAIYLPGPDRCKMNP 3097
            |:.||||.::||||:.::.|||.:.||||:|:.||||.|||||:||:|||||:||||||.||.||
  Rat  2994 VSQRILDYSNQATVSTLDLNTEHSIPPFSILDNSNETAFLIGISEETVEGTAVYLPGPDLCKTNP 3058

Human  3098 CLNGGTCYPTETSYVCTCVPGYSGDQCELDFDECHSNPCRNGATCVDGFNTFRCLCLPSYVGALC 3162
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
  Rat  3059 CLNGGTCYPTETSYVCTCAPGYSGDQCELDFDECHSNPCRNGATCVDGLNTFRCLCLPSYVGALC 3123

Human  3163 EQDTETCDYGWHKFQGQCYKYFAHRRTWDAAERECRLQGAHLTSILSHEEQMFVNRVGHDYQWIG 3227
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  3124 EQDTETCDYGWHKFQGQCYKYFAHRRTWDAAERECRLQGAHLTSILSHEEQMFVNRVGHDYQWIG 3188

Human  3228 LNDKMFEHDFRWTDGSTLQYENWRPNQPDSFFSAGEDCVVIIWHENGQWNDVPCNYHLTYTCKKG 3292
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  3189 LNDKMFEHDFRWTDGSALQYENWRPNQPDSFFSAGEDCVVIIWHENGQWNDVPCNYHLTYTCKKG 3253

Human  3293 TVACGQPPVVENAKTFGKMKPRYEINSLIRYHCKDGFIQRHLPTIRCLGNGRWAIPKITCMNPSA 3357
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||
  Rat  3254 TVACGQPPVVENAKTFGKMKPRYEINSLIRYHCKDGFIQRHLPTIRCLGNGRWAMPKITCMNPSA 3318

Human  3358 YQRTYSMKYFKNSSSAKDNSINTSKHDHRWSRRWQESRR 3396
            ||||||.||.|||||.||||||||||:|||||||||:||
  Rat  3319 YQRTYSKKYLKNSSSVKDNSINTSKHEHRWSRRWQETRR 3357

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
VCANNP_004376.2 IG_like 29..147 CDD:214653 103/117 (88%)
Ig_Versican 36..151 CDD:143309 101/114 (89%)
Link_domain_CSPGs_modules_1_3 150..244 CDD:239594 86/93 (92%)
Link_domain_CSPGs_modules_2_4 251..346 CDD:239597 85/94 (90%)
GAG-alpha (glucosaminoglycan attachment domain) 348..1335 552/998 (55%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 420..439 9/18 (50%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 603..622 5/18 (28%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 807..829 12/21 (57%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1126..1154 15/27 (56%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1277..1316 22/38 (58%)
GAG-beta 1336..3089 943/1763 (53%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1420..1497 54/76 (71%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1510..1539 6/28 (21%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1717..1737 8/20 (40%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1759..1789 14/29 (48%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1962..1994 14/31 (45%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2107..2134 13/26 (50%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2168..2188 10/19 (53%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2371..2396 12/24 (50%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2445..2473 16/27 (59%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2493..2518 14/24 (58%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2598..2617 5/18 (28%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2834..2856 8/21 (38%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2881..2905 12/23 (52%)
EGF_CA 3091..3125 CDD:238011 30/33 (91%)
EGF_CA 3127..3163 CDD:238011 34/35 (97%)
CLECT_CSPGs 3169..3292 CDD:153058 121/122 (99%)
CCP 3296..3352 CDD:153056 54/55 (98%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 3371..3396 21/24 (88%)
VcanNP_001164029.1 IG_like 30..147 CDD:214653 103/116 (89%)
Ig_Versican 36..151 CDD:143309 101/114 (89%)
Link_domain_CSPGs_modules_1_3 150..244 CDD:239594 86/93 (92%)
Link_domain_CSPGs_modules_2_4 251..346 CDD:239597 85/94 (90%)
EGF_CA 3052..3086 CDD:238011 30/33 (91%)
EGF_CA 3088..3124 CDD:238011 34/35 (97%)
CLECT_CSPGs 3130..3253 CDD:153058 121/122 (99%)
CCP 3257..3313 CDD:153056 54/55 (98%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C83689623
Domainoid 1 1.000 2021 1.000 Domainoid score I257
eggNOG 1 0.900 - - E1_28IZN
HGNC 1 1.500 - -
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H3228
Inparanoid 1 1.050 2686 1.000 Inparanoid score I684
NCBI 1 1.000 - -
OMA 1 1.010 - - QHG39324
OrthoDB 1 1.010 - - D1274at314146
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0015965
OrthoInspector 1 1.000 - - oto135237
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_109456
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR22804
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X10105
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1717.310

Return to query results.
Submit another query.