DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment DIS3L2 and Dis3l2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_689596.4 Gene:DIS3L2 / 129563 HGNCID:28648 Length:885 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001102477.2 Gene:Dis3l2 / 367307 RGDID:1560168 Length:890 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:895 Identity:768/895 - (85%)
Similarity:816/895 - (91%) Gaps:19/895 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MSHPDYRMNLRPLGTPRGVSAVAGPHDIGASPGDKKSKNRSTRGKKKSIFETYMSKEDVSEGLKR 65
            |:||||::||:..|||||||:|.||:.:|||||||||||:|.||||||||||||||||||||||:
  Rat     1 MNHPDYKLNLQSPGTPRGVSSVVGPNAVGASPGDKKSKNKSMRGKKKSIFETYMSKEDVSEGLKK 65

Human    66 GTLIQGVLRINPKKFHEAFIPSPDGDRDIFIDGVVARNRALNGDLVVVKLLPEEHWKV------- 123
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:.||.       
  Rat    66 GTLIQGVLRINPKKFHEAFIPSPDGDRDIFIDGVVARNRALNGDLVVVKLLPEDQWKPRITLSLP 130

Human   124 -------VKPESNDKETEAAYESDIPEELCGHHLPQQSLKSYNDSPDVIVEAQFDGSDSEDGHGI 181
                   ||||||||||||..|:||.||.|||||.|:|.|.:| .||||:|||||.|||||.||.
  Rat   131 GVLGLQGVKPESNDKETEATNETDISEESCGHHLLQKSPKGWN-GPDVIIEAQFDDSDSEDRHGN 194

Human   182 TQNVLVDGVKKLSVCVSEKGREDGDAPVTKDETTCISQDTRALSEKSLQRSAKVVYILEKKHSRA 246
            |.. ||||:||||||..:||:||..|||.|||.|..|||||||||||||:|||||||||||||||
  Rat   195 TSG-LVDGMKKLSVCTPDKGKEDSSAPVMKDENTPKSQDTRALSEKSLQKSAKVVYILEKKHSRA 258

Human   247 ATGFLKLLADKNSELFRKYALFSPSDHRVPRIYVPLKDCPQDFVARPKDYANTLFICRIVDWKED 311
            |||.|||||||||:||:||||||||||||||||||||||||||:.||||||||||||||:|||||
  Rat   259 ATGILKLLADKNSDLFKKYALFSPSDHRVPRIYVPLKDCPQDFMTRPKDYANTLFICRIIDWKED 323

Human   312 CNFALGQLAKSLGQAGEIEPETEGILTEYGVDFSDFSSEVLECLPQGLPWTIPPEEFSKRRDLRK 376
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||..|||||||
  Rat   324 CNFALGQLAKSLGQAGEIEPETEGILTEYGVDFSDFSSEVLECLPQSLPWTIPPEEVGKRRDLRK 388

Human   377 DCIFTIDPSTARDLDDALSCKPLADGNFKVGVHIADVSYFVPEGSDLDKVAAERATSVYLVQKVV 441
            ||||||||||||||||||||:.|.||.|:||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
  Rat   389 DCIFTIDPSTARDLDDALSCRQLTDGTFEVGVHIADVSYFVPEGSSLDKVAAERATSVYLVQKVV 453

Human   442 PMLPRLLCEELCSLNPMSDKLTFSVIWTLTPEGKILDEWFGRTIIRSCTKLSYEHAQSMIESPTE 506
            |||||||||||||||||:|||||||||.||||||||:||||||||||||||||:|||||||:|||
  Rat   454 PMLPRLLCEELCSLNPMTDKLTFSVIWKLTPEGKILEEWFGRTIIRSCTKLSYDHAQSMIENPTE 518

Human   507 KIPAKELPPISPEHSSEEVHQAVLNLHGIAKQLRQQRFVDGALRLDQLKLAFTLDHETGLPQGCH 571
            |||.:||||||||||.|||||||||||.||||||:||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   519 KIPKEELPPISPEHSIEEVHQAVLNLHSIAKQLRRQRFVDGALRLDQLKLAFTLDHETGLPQGCH 583

Human   572 IYEYRESNKLVEEFMLLANMAVAHKIHRAFPEQALLRRHPPPQTRMLSDLVEFCDQMGLPVDFSS 636
            |||||:||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||:|||||||||||||||:|.||
  Rat   584 IYEYRDSNKLVEEFMLLANMAVAHKIFRTFPEQALLRRHPPPQTKMLSDLVEFCDQMGLPMDVSS 648

Human   637 AGALNKSLTQTFGDDKYSLARKEVLTNMCSRPMQMALYFCSGLLQDPAQFRHYALNVPLYTHFTS 701
            |||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||:|||.||||||||||||||||||
  Rat   649 AGALNKSLTNTFGDDKYSLARKEVLTNMYSRPMQMALYFCSGMLQDQAQFRHYALNVPLYTHFTS 713

Human   702 PIRRFADVLVHRLLAAALGYRERLDMAPDTLQKQADHCNDRRMASKRVQELSTSLFFAVLVKESG 766
            ||||||||:|||||||||||.|:.|:.||.||||||||||||||||||||||..|||::||||||
  Rat   714 PIRRFADVIVHRLLAAALGYSEQPDVEPDALQKQADHCNDRRMASKRVQELSIGLFFSILVKESG 778

Human   767 PLESEAMVMGILKQAFDVLVLRYGVQKRIYCNALALRSHHFQKVGKKPELTLVWEPEDMEQEPAQ 831
            ||||||||||:|.|||||||||:|||||||||||||||:|||||||||||||||||:|:|:||.|
  Rat   779 PLESEAMVMGVLNQAFDVLVLRFGVQKRIYCNALALRSYHFQKVGKKPELTLVWEPDDLEEEPIQ 843

Human   832 QVITIFSLVEVVLQAESTALKYSAILKRPGTQGHLGPEKEEEESDGEPED 881
            |||||||||:||||||:|||||||||||||.:..||.||   |||.||||
  Rat   844 QVITIFSLVDVVLQAEATALKYSAILKRPGPEHSLGLEK---ESDEEPED 890

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
DIS3L2NP_689596.4 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1..45 30/43 (70%)
Rrp44_CSD1 50..238 CDD:375054 152/201 (76%)
VacB 231..745 CDD:440323 470/513 (92%)
Dis3l2_C_term 766..855 CDD:465547 78/88 (89%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 860..885 13/22 (59%)
Dis3l2NP_001102477.2 Rrp44_CSD1 50..>159 CDD:375054 86/108 (80%)
VacB 245..757 CDD:440323 469/511 (92%)
Dis3l2_C_term 778..867 CDD:465547 78/88 (89%)

Return to query results.
Submit another query.