DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment WDR81 and Wdr81

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001157281.1 Gene:WDR81 / 124997 HGNCID:26600 Length:1941 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_038941944.1 Gene:Wdr81 / 303312 RGDID:1311334 Length:1944 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1954 Identity:1687/1954 - (86%)
Similarity:1781/1954 - (91%) Gaps:23/1954 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MAQGSGGREGALRTPAGGWHSPPSPDMQELLRSVERDLSIDPRQLAPAPGGTHVVALVPARWLAS 65
            |||||..|:..|...|.|..|...|||:||||..||||:||.||||.|||||||||||..|||||
  Rat     1 MAQGSRRRKVVLTAGAEGCSSSSGPDMEELLRCAERDLNIDARQLALAPGGTHVVALVSTRWLAS 65

Human    66 LRDRRLPLGPCPRAEGLGEAEVRTLLQRSVQRLPAGWTRVEVHGLRKRRLSYPLGGGLPFEDGSC 130
            ||:||  |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||...||||:|||
  Rat    66 LRERR--LGPCPRAEGLGEAEVRTLLQRSVQRLPQGWTRVEVHGLRKRRLSYPLSRVLPFEEGSC 128

Human   131 GPETLTRFMQEVAAQNYRNLWRHAYHTYGQPYSHSPAPSAVPALDSVRQALQRVYGCSFLPVGET 195
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||:|||||:||||||||||:||||||:
  Rat   129 SPETLTRFMQEVAAQNYRNLWRHAYHTYGQPYSHSTAPSAIPALDSIRQALQRVYGCTFLPVGES 193

Human   196 TQCPSYAREGPCPPRGSPACPSLLRAEALLESPEMLYVVHPYVQFSLHDVVTFSPAKLTNSQAKV 260
            .||.|..|:|  |.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   194 MQCLSNVRDG--PSRGSSACPSLLRAEALLESPEMLYVVHPYVQFSLHDVVTFSPAKLTNSQAKV 256

Human   261 LFILFRVLRAMDACHRQGLACGALSLYHIAVDEKLCSELRLDLSAYERPEEDENEEAPVARDEAG 325
            ||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||.|.||||:|....:|..|
  Rat   257 LFILFRVLRAMDACHRQGLACGALSLHHIAVDEKLCSELRLDLSAYEMPSEDENQEVSEEKDRTG 321

Human   326 IVSQEEQGGQPGQPTGQEELRSLVLDWVHGRISNFHYLMQLNRLAGRRQGDPNYHPVLPWVVDFT 390
            :.|:::..|:||.||.|:|||.|||||||||:|||:|||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   322 VKSEKDGEGRPGCPTCQKELRGLVLDWVHGRVSNFYYLMQLNRLAGRRQGDPNYHPVLPWVVDFT 386

Human   391 TPHGRFRDLRKSKFRLNKGDKQLDFTYEMTRQAFVAGGAGGGEPPHVPHHISDVLSDITYYVYKA 455
            ||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||
  Rat   387 TPYGRFRDLRKSKFRLNKGDKQLDFTYEMTRQAFVAGGAGSGEPLHVPHHISDVLSDITYYVYKA 451

Human   456 RRTPRSVLCGHVRAQWEPHEYPASMERMQNWTPDECIPEFYTDPSIFRSIHPDMPDLDVPAWCSS 520
            |||||||||||||||||||||||:|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||
  Rat   452 RRTPRSVLCGHVRAQWEPHEYPATMERMQTWTPDECIPEFYTDPSIFCSIHPDMPDLDVPAWCSS 516

Human   521 SQEFVAAHRALLESREVSRDLHHWIDLTFGYKLQGKEAVKEKNVCLHLVDAHTHLASYGVVQLFD 585
            :||||.||||||||.|||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
  Rat   517 NQEFVTAHRALLESWEVSQDLHHWIDLTFGYKLQGKEAVKEKNVCLHLVDAHTHLTSYGVVQLFD 581

Human   586 QPHPQRLAGAPALAPEPPLIPKLLVQTIQETTGREDFTENPGQLPNGVGRPVLEATPCEASWTRD 650
            |||||||||||||||||||||:||||.|||.||:||.:   |||.||.||.|:|.||||:.|||:
  Rat   582 QPHPQRLAGAPALAPEPPLIPRLLVQPIQEATGQEDIS---GQLINGAGRHVVEVTPCESGWTRE 643

Human   651 RPVAGEDDLEQATEALDSISLAGKAGDQLG-SSSQASPGLLSFSVASASRPGRRNKAAGADPGEG 714
            ||.|||||||||||||||||:.||||||.| ||||||||||.||..|.||||||:||.|.|.|||
  Rat   644 RPTAGEDDLEQATEALDSISIPGKAGDQPGSSSSQASPGLLPFSAPSGSRPGRRSKATGLDSGEG 708

Human   715 EEGRILLPEGFNPMQALEELEKTGNFLAKGLGGLLEVPEQPRVQPAVPLQCLLHRDMQALGVLLA 779
            :||:|:|||||:|:||||||||.|||||:|||..||.||:|:.||.|.||.|.|||||.||||||
  Rat   709 DEGKIVLPEGFSPIQALEELEKVGNFLARGLGSQLEEPEKPQAQPPVYLQSLFHRDMQVLGVLLA 773

Human   780 EMVFATRVRTLQPDAPLWVRFQAVRGLCTRHPKEVPVSLQPVLDTLLQMSGPEVPMGAERGKLDQ 844
            |||||||||.|||||||||||:|||||||||.|::|||||||||||||:|||:.|:..::||||.
  Rat   774 EMVFATRVRILQPDAPLWVRFEAVRGLCTRHSKDIPVSLQPVLDTLLQLSGPKSPLVVKKGKLDP 838

Human   845 LFEYRPVSQGLPPPCPSQLLSPFSSVVPFPPYFPALHRFILLYQARRVEDEAQGRELVFALWQQL 909
            ||||||||||||||.|:|||||||||||||.||||||:|||||||||||||.|||||||||||||
  Rat   839 LFEYRPVSQGLPPPSPAQLLSPFSSVVPFPTYFPALHKFILLYQARRVEDEVQGRELVFALWQQL 903

Human   910 GAVLKDITPEGLEILLPFVLSLMSEEHTAVYTAWYLFEPVAKALGPKNANKYLLKPLIGAYESPC 974
            ||||.:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||:||
  Rat   904 GAVLNEITPEGLEILLPFVLSLMSEEHTAVYTAWYLFEPVAKALGPKNTIKYLLKPLIGAYENPC 968

Human   975 QLHGRFYLYTDCFVAQLMVRLGLQAFLTHLLPHVLQVLAGAEASQEESKDLAGAAEEEESGLPGA 1039
            :||||||||||||||||:|||||||||.||||||||||||.||||||.|.|.|..|:||:.||..
  Rat   969 RLHGRFYLYTDCFVAQLVVRLGLQAFLIHLLPHVLQVLAGVEASQEEGKGLVGTTEDEENELPVP 1033

Human  1040 GPGSCAFGEEIPMDGEPPASSGLGLPDYTSGVSFHDQADLPETEDFQAGLYVTESPQPQEAEAVS 1104
            |||||||||||.|.|:|.||||||||||.||||||||||||:||||||||||.||||||||||||
  Rat  1034 GPGSCAFGEEIQMGGQPAASSGLGLPDYRSGVSFHDQADLPDTEDFQAGLYVAESPQPQEAEAVS 1098

Human  1105 LGRLSDKSSTSETSLGEERAPDEGGAPVDKSSLRSGDSSQDLKQSEGSEEEEEEEDSCVVLEEEE 1169
            ||:|||||||||.|.||||..|:|||||||:|::|||||||||||||||||||||:.||||||| 
  Rat  1099 LGQLSDKSSTSEASQGEERGGDDGGAPVDKNSVKSGDSSQDLKQSEGSEEEEEEEEGCVVLEEE- 1162

Human  1170 GEQEEVTGASELTLSDTVLSMETVVAGGSGGDGEEEEEALPEQSEGKEQKILLDTACKMVRWLSA 1234
             ||:||||.||||||||:||||||||.|.|.|.|||||.||||:|||||||||||||||||||||
  Rat  1163 -EQDEVTGTSELTLSDTILSMETVVAPGDGRDREEEEEPLPEQTEGKEQKILLDTACKMVRWLSA 1226

Human  1235 KLGPTVASRHVARNLLRLLTSCYVGPTRQQFTVSSGESPPLSAGNIYQKRPVLGDIVSGPVLSCL 1299
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||..:||||:|||||||||||||||||||||||
  Rat  1227 KLGPTVASRHVARNLLRLLTSCYVGPTRQQFTVSCDDSPPLNAGNIYQKRPVLGDIVSGPVLSCL 1291

Human  1300 LHIARLYGEPVLTYQYLPYISYLVAPGSASGPSRLNSRKEAGLLAAVTLTQKIIVYLSDTTLMDI 1364
            ||||.|||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1292 LHIAHLYGEPVLTYQYLPYISYLVAPGSNSSPSRLNSRKEAGLLAAVTLTQKIIVYLSDTTLMDI 1356

Human  1365 LPRISHEVLLPVLSFLTSLVTGFPSGAQARTILCVKTISLIALICLRIGQEMVQQHLSEPVATFF 1429
            ||||||||||||||||||.||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1357 LPRISHEVLLPVLSFLTSFVTGFPSGAQARTVLCVKTISLIALICLRIGQEMVQQHLSEPVATFF 1421

Human  1430 QVFSQLHELRQQDLKLDPAGRGEGQLPQVVFSDGQQRPVDPALLDELQKVFTLEMAYTIYVPFSC 1494
            ||||.|||||||||:||..|..|||||:..|||||:|||||.||:||||||||||||||||||||
  Rat  1422 QVFSHLHELRQQDLQLDLKGCTEGQLPEATFSDGQRRPVDPTLLEELQKVFTLEMAYTIYVPFSC 1486

Human  1495 LL-----------GDIIRKIIPNHELVGELAALYLESISPSS-RNPASVEPTMPGTGPEWDPHGG 1547
            ||           ||||||||||||||||||.|||||:|||| |||||:||..|..||||:|..|
  Rat  1487 LLGIAHHVPLHRVGDIIRKIIPNHELVGELAGLYLESMSPSSLRNPASMEPVTPSAGPEWNPQSG 1551

Human  1548 GCPQDDGHSGTFGSVLVGNRIQIPNDSRPENPGPLGPISGVGGGGLGSGSDDNALKQELPRSVHG 1612
            .|.||||||||||||||||||||| ||:|::.||||.|||||.|||.|.::|||||:|||||.||
  Rat  1552 SCLQDDGHSGTFGSVLVGNRIQIP-DSQPQSSGPLGSISGVGSGGLSSRNEDNALKRELPRSAHG 1615

Human  1613 LSGNWLAYWQYEIGVSQQDAHFHFHQIRLQSFPGHSGAVKCVAPLSSEDFFLSGSKDRTVRLWPL 1677
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||.|||||||||||||||||||||
  Rat  1616 LSGNWLAYWQYEIGVSQQDAHFHFHQIRLQSFPGHTGAVKCVAALSSEDFFLSGSKDRTVRLWPL 1680

Human  1678 YNYGDGTSETAPRLVYTQHRKSVFFVGQLEAPQHVVSCDGAVHVWDPFTGKTLRTVEPLDSRVPL 1742
            ||||||||||||||:|.|||||||:||||||||:||||||||||||||||||||||:|.||||||
  Rat  1681 YNYGDGTSETAPRLIYAQHRKSVFYVGQLEAPQYVVSCDGAVHVWDPFTGKTLRTVDPSDSRVPL 1745

Human  1743 TAVAVMPAPHTSITMASSDSTLRFVDCRKPGLQHEFRLGGGLNPGLVRALAISPSGRSVVAGFSS 1807
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||:|||||||||||||
  Rat  1746 TAVAVMPAPHTSITMASSDSTLRFVDCRKPGLQHEFRLGGGLNPGLVRSLAVSPSGRSVVAGFSS 1810

Human  1808 GFMVLLDTRTGLVLRGWPAHEGDILQIKAVEGSVLVSSSSDHSLTVWKELEQKPTHHYKSASDPI 1872
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1811 GFMVLLDTRTGLVLRGWPAHEGDILQIKAVEGSVIVSSSSDHSLTVWKELEQKPTHHYKSASDPI 1875

Human  1873 HTFDLYGSEVVTGTVSNKIGVCSLLEPPSQATTKLSSENFRGTLTSLALLPTKRHLLLGSDNGVI 1937
            |||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|
  Rat  1876 HTFDLYGSEVVTGTVANKIGVCSLLEPPSQATTKLSSENFRGTLTSLALLPTKRHLLLGSDNGII 1940

Human  1938 RLLA 1941
            ||||
  Rat  1941 RLLA 1944

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
WDR81NP_001157281.1 Necessary and sufficient for the interaction with SQSTM1. /evidence=ECO:0000269|PubMed:28404643 1..650 551/648 (85%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1..27 11/25 (44%)
Beach 351..591 CDD:100117 226/239 (95%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 618..637 10/18 (56%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 694..718 15/23 (65%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1022..1074 36/51 (71%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1097..1217 97/119 (82%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1523..1556 22/33 (67%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1569..1602 21/32 (66%)
WD 1 1639..1677 35/37 (95%)
WD40 <1640..1939 CDD:441893 285/298 (96%)
WD40 repeat 1652..1695 CDD:293791 40/42 (95%)
WD 2 1686..1724 33/37 (89%)
WD40 repeat 1700..1734 CDD:293791 31/33 (94%)
WD 3 1729..1769 37/39 (95%)
WD40 repeat 1743..1779 CDD:293791 35/35 (100%)
WD 4 1777..1815 35/37 (95%)
WD40 repeat 1789..1822 CDD:293791 30/32 (94%)
WD 5 1819..1856 35/36 (97%)
WD40 repeat 1831..1864 CDD:293791 31/32 (97%)
WD 6 1860..1896 34/35 (97%)
WD40 repeat 1871..1893 CDD:293791 20/21 (95%)
WD 7 1902..1941 37/38 (97%)
Wdr81XP_038941944.1 Beach 347..587 CDD:100117 226/239 (95%)
WD40 <1643..1942 CDD:441893 285/298 (96%)
WD40 repeat 1655..1698 CDD:293791 40/42 (95%)
WD40 repeat 1703..1737 CDD:293791 31/33 (94%)
WD40 repeat 1746..1782 CDD:293791 35/35 (100%)
WD40 repeat 1792..1825 CDD:293791 30/32 (94%)
WD40 repeat 1834..1867 CDD:293791 31/32 (97%)
WD40 repeat 1874..1896 CDD:293791 20/21 (95%)

Return to query results.
Submit another query.