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Protein Alignment LRRK2 and Lrrk2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_940980.4 Gene:LRRK2 / 120892 HGNCID:18618 Length:2527 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_080006.3 Gene:Lrrk2 / 66725 MGIID:1913975 Length:2527 Species:Mus musculus


Alignment Length:63 Identity:16/63 - (25%)
Similarity:25/63 - (39%) Gaps:16/63 - (25%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     8 KIHDLALRADYEIASKERDLFFELDAMDHLESFIAE--CDRRT---ELAKKRLAETQEEISAE 65
            |:|..         ...:|..|::....|.|:.:|.  .|||.   :|:|  :.|.|....||
Mouse   309 KLHSF---------ESHKDEIFQVQWSPHNETILASSGTDRRLNVWDLSK--IGEEQSPEDAE 360

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
LRRK2NP_940980.4 Required for RAB29-mediated activation. /evidence=ECO:0000269|PubMed:29212815, ECO:0000269|PubMed:38127736 1..969 16/63 (25%)
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LRR <1009..1279 CDD:443914
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leucine-rich repeat 1013..1036 CDD:275380
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leucine-rich repeat 1037..1084 CDD:275380
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leucine-rich repeat 1085..1108 CDD:275380
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RocCOR 1334..1507 CDD:206741
COR 1527..1740 CDD:406489
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WD 4. /evidence=ECO:0000269|PubMed:38127736, ECO:0007744|PDB:8FO2, ECO:0007744|PDB:8FO8, ECO:0007744|PDB:8FO9 2281..2327
WD 5. /evidence=ECO:0000269|PubMed:38127736, ECO:0007744|PDB:8FO2, ECO:0007744|PDB:8FO8, ECO:0007744|PDB:8FO9 2333..2377
WD 6. /evidence=ECO:0000269|PubMed:38127736, ECO:0007744|PDB:8FO2, ECO:0007744|PDB:8FO8, ECO:0007744|PDB:8FO9 2402..2438
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Lrrk2NP_080006.3 Required for RAB29-mediated activation. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:Q5S007 1..969 16/63 (25%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 957..979
LRR <982..1279 CDD:443914
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RocCOR 1334..1507 CDD:206741
COR 1527..1740 CDD:406489
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WD 1. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:Q5S007 2139..2183
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WD 7. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:Q5S007 2443..2497
Blue background indicates that the domain is not in the aligned region.

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