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Protein Alignment LRRK2 and Phlpp

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_940980.4 Gene:LRRK2 / 120892 HGNCID:18618 Length:2527 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_609938.1 Gene:Phlpp / 35178 FlyBaseID:FBgn0032749 Length:954 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:684 Identity:137/684 - (20%)
Similarity:257/684 - (37%) Gaps:175/684 - (25%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human   958 SLRSSKLQSHMRHSDSISSLASEREYITSLDLSANELR--DIDALSQ----KCCISVHLE----- 1011
            ||:.|:|..        |.|.....|:|.|::..||:.  |:.:|:|    ||..:..:|     
  Fly    52 SLKGSQLGG--------SILIGNYNYLTQLEVCENEMEVLDLSSLAQLETLKCSRNKLMELIING 108

Human  1012 -HLEKLELHQNAL------TSFPQQLCETLKSLTHLDLHSNKFTSFPSYLLKMSCIANLDVSRND 1069
             :|:.|....|.|      .:.|..|     .|..:|:..|.|:..|:::...:.:..::.|.|.
  Fly   109 TNLQTLVADHNYLHNISTTNTHPVPL-----KLQRIDISHNNFSELPNWVGACASLTAINASHNR 168

Human  1070 IGPSVVLDPTVKCPTLKQFNLSYNQLSFVPENLTDVVEKLEQLILEGNKISGICSPLRLKELKIL 1134
            :....||....:...|...:|:||.|           ::|:|.            |.....::.|
  Fly   169 LNNVAVLLRNYRITELVSLDLAYNDL-----------KQLDQF------------PEGFSSIRSL 210

Human  1135 NLSKNHISSLSENFLEAC-PKVESFSARMNFLAAMPFLPPSMTILKLSQNKFSCIPEAILNLPHL 1198
            .|..|.:.||.:||.... .::|:.:...|.|:.:|         :..||..:.:....|...||
  Fly   211 QLQSNELPSLPDNFFAVTHARLETLNVSCNKLSTLP---------RYEQNNHAALVNLSLAGNHL 266

Human  1199 RSLDMSSNDIQYLPGPAHWKSLNLRELLFSHNQISILDLSEKAYLWSRVEKLHLSHNKLKEIPPE 1263
                   ||..:  .|.| .:..||.|..::|:|.:|. :.....|..:|.|.||.|.|:::|.|
  Fly   267 -------NDSIF--EPLH-NAAKLRVLHLAYNRIGVLP-AACVRNWPELEILVLSGNMLQQLPEE 320

Human  1264 IGCLENLTSLDVSYNLELRSFPNEMGKLS--KIWDLP---LDELHL-----NFDFKHIGCKAKDI 1318
            :..|..|..|....||.|.:  .::.||:  |:.||.   ||.::|     :.:.|::.......
  Fly   321 VATLGQLRVLRCCNNLLLCT--PQLAKLAMLKVLDLSHNHLDRVNLLALVPSRNLKYLDLSGNLQ 383

Human  1319 IRFLQQRLKKAVPYNRMKLMIVGNTGSGK----TTLLQQLMKTKKSDLGMQSATVGIDVKDWPIQ 1379
            ::..:|:.|.....::....:|..:|:.:    ||.::|:...:.     |:.|.|    .|.:.
  Fly   384 LQVDEQQFKVCQSQSQRHWSLVDVSGNNRAALPTTKIRQVSAQRN-----QNKTSG----PWTMG 439

Human  1380 IR------DKRKRDLV-LNVWDFAGREEFYSTHPHFMTQRALYLAVYDLSKGQAEVDAMKPWLFN 1437
            ..      |.||..:. |...::.|.:|            ||| .:::..:|             
  Fly   440 FAETPGSGDCRKLSVYQLRAANYGGSDE------------ALY-GMFEALEG------------- 478

Human  1438 IKARASSSPVILVGTHLDVSDEKQRKACMSKITKELLNKRGF---PAIRDYHFVNATEESDALAK 1499
             :.||:..                    ||.:..:|:.:...   .|:|||..............
  Fly   479 -RGRAAQE--------------------MSHLVPDLMKQEQMVKDSAVRDYMKFTLLAAQQQCGS 522

Human  1500 LRKTIINESLNFKIRDQLVVGQLIPDCYVELEKIILSERKNVPIEFPVIDRKRLLQLVRENQLQL 1564
            :|...:     |.:.......::.|   ::.::.:|.......::..:|.|...|:|.:.:.:|.
  Fly   523 VRSAAL-----FHLTRTRAPSKVRP---LKSKRYVLRMASTGGLDAYLIRRTSQLRLTKPDVIQK 579

Human  1565 DENELPHAVHFLNESGVLLHFQDPALQLSDLYFV 1598
            |:      :|.:.:..||    :..|...|.|.|
  Fly   580 DQ------IHSMPDPHVL----ELILSNDDEYLV 603

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
LRRK2NP_940980.4 Required for RAB29-mediated activation. /evidence=ECO:0000269|PubMed:29212815, ECO:0000269|PubMed:38127736 1..969 4/10 (40%)
LRR 1. /evidence=ECO:0000269|PubMed:38127736, ECO:0007744|PDB:8FO2, ECO:0007744|PDB:8FO8, ECO:0007744|PDB:8FO9 983..1004 8/26 (31%)
leucine-rich repeat 985..1012 CDD:275380 10/38 (26%)
LRR <1009..1279 CDD:443914 62/282 (22%)
LRR 2. /evidence=ECO:0000269|PubMed:38127736, ECO:0007744|PDB:8FO2, ECO:0007744|PDB:8FO8, ECO:0007744|PDB:8FO9 1012..1033 6/26 (23%)
leucine-rich repeat 1013..1036 CDD:275380 6/28 (21%)
LRR 3. /evidence=ECO:0000269|PubMed:38127736, ECO:0007744|PDB:8FO2, ECO:0007744|PDB:8FO8, ECO:0007744|PDB:8FO9 1036..1057 5/20 (25%)
leucine-rich repeat 1037..1084 CDD:275380 9/46 (20%)
LRR 4. /evidence=ECO:0000269|PubMed:38127736, ECO:0007744|PDB:8FO2, ECO:0007744|PDB:8FO8, ECO:0007744|PDB:8FO9 1059..1080 4/20 (20%)
LRR 5. /evidence=ECO:0000269|PubMed:38127736, ECO:0007744|PDB:8FO2, ECO:0007744|PDB:8FO8, ECO:0007744|PDB:8FO9 1084..1105 5/20 (25%)
leucine-rich repeat 1085..1108 CDD:275380 5/22 (23%)
LRR 6. /evidence=ECO:0000269|PubMed:38127736, ECO:0007744|PDB:8FO2, ECO:0007744|PDB:8FO8, ECO:0007744|PDB:8FO9 1108..1129 3/20 (15%)
leucine-rich repeat 1109..1130 CDD:275380 3/20 (15%)
LRR 7. /evidence=ECO:0000269|PubMed:38127736, ECO:0007744|PDB:8FO2, ECO:0007744|PDB:8FO8, ECO:0007744|PDB:8FO9 1130..1150 7/19 (37%)
leucine-rich repeat 1131..1174 CDD:275380 11/43 (26%)
LRR 8. /evidence=ECO:0000269|PubMed:38127736, ECO:0007744|PDB:8FO2, ECO:0007744|PDB:8FO8, ECO:0007744|PDB:8FO9 1156..1171 4/14 (29%)
LRR 9. /evidence=ECO:0000269|PubMed:38127736, ECO:0007744|PDB:8FO2, ECO:0007744|PDB:8FO8, ECO:0007744|PDB:8FO9 1174..1196 3/21 (14%)
leucine-rich repeat 1175..1197 CDD:275380 3/21 (14%)
LRR 10. /evidence=ECO:0000269|PubMed:38127736, ECO:0007744|PDB:8FO2, ECO:0007744|PDB:8FO8, ECO:0007744|PDB:8FO9 1197..1218 6/20 (30%)
leucine-rich repeat 1198..1221 CDD:275380 5/22 (23%)
LRR 11. /evidence=ECO:0000269|PubMed:38127736, ECO:0007744|PDB:8FO2, ECO:0007744|PDB:8FO8, ECO:0007744|PDB:8FO9 1221..1245 6/23 (26%)
leucine-rich repeat 1222..1246 CDD:275380 7/23 (30%)
LRR 12. /evidence=ECO:0000269|PubMed:38127736, ECO:0007744|PDB:8FO2, ECO:0007744|PDB:8FO8, ECO:0007744|PDB:8FO9 1246..1267 8/20 (40%)
leucine-rich repeat 1247..1269 CDD:275380 9/21 (43%)
LRR 13. /evidence=ECO:0000269|PubMed:38127736, ECO:0007744|PDB:8FO2, ECO:0007744|PDB:8FO8, ECO:0007744|PDB:8FO9 1269..1291 5/21 (24%)
RocCOR 1334..1507 CDD:206741 29/186 (16%)
COR 1527..1740 CDD:406489 14/72 (19%)
STKc_LRRK2 1884..2135 CDD:270970
WD 1. /evidence=ECO:0000269|PubMed:38127736, ECO:0007744|PDB:8FO2, ECO:0007744|PDB:8FO8, ECO:0007744|PDB:8FO9 2139..2183
WD 2. /evidence=ECO:0000269|PubMed:38127736, ECO:0007744|PDB:8FO2, ECO:0007744|PDB:8FO8, ECO:0007744|PDB:8FO9 2188..2228
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PhlppNP_609938.1 LRR 82..>381 CDD:443914 79/348 (23%)
leucine-rich repeat 91..110 CDD:275380 3/18 (17%)
leucine-rich repeat 111..135 CDD:275380 6/28 (21%)
leucine-rich repeat 136..158 CDD:275380 5/21 (24%)
leucine-rich repeat 159..183 CDD:275380 4/23 (17%)
leucine-rich repeat 184..209 CDD:275380 8/47 (17%)
leucine-rich repeat 210..230 CDD:275380 7/19 (37%)
leucine-rich repeat 232..255 CDD:275380 6/31 (19%)
leucine-rich repeat 256..276 CDD:275380 7/29 (24%)
leucine-rich repeat 280..303 CDD:275380 7/23 (30%)
leucine-rich repeat 304..348 CDD:275380 16/45 (36%)
leucine-rich repeat 349..372 CDD:275380 6/22 (27%)
PP2Cc 461..655 CDD:469621 32/208 (15%)
Blue background indicates that the domain is not in the aligned region.

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