DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Ranbp16 and Xpo7

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001188596.1 Gene:Ranbp16 / 118436 FlyBaseID:FBgn0053180 Length:1110 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_008769054.1 Gene:Xpo7 / 361070 RGDID:1310928 Length:1098 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1091 Identity:636/1091 - (58%)
Similarity:822/1091 - (75%) Gaps:22/1091 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     3 IQQLEVLCKQLYEATDIRIRSEAEKALVTFVSSQDALPKCQLLLQRADSSYAQLLAASTLTKLI- 66
            :.|||.|||||||.||...|.:||||||.|.:|.|.|.||||||:|..|||:|||||:.||||: 
  Rat    10 LAQLENLCKQLYETTDTTTRLQAEKALVEFTNSPDCLSKCQLLLERGSSSYSQLLAATCLTKLVS 74

  Fly    67 ---QGLSLQERIDIRSYALNYLATVPNLQHFVVQALVSLLAKLTKYGWFDSYKEEMVFQNLLEDV 128
               ..|.|::|||||:|.||||||.|.|..||.|||:.|.|::||.||||..|::.||:|.:.||
  Rat    75 RTNNPLPLEQRIDIRNYVLNYLATRPKLATFVTQALIQLYARITKLGWFDCQKDDYVFRNAITDV 139

  Fly   129 KKFLQGSVEHCTIGVQILSQLVCEMNSV------VEMDVQVSFSKMRKIATSFRDQQLLETFLLS 187
            .:|||.|||:|.|||.|||||..|:|.|      :|.|.....:|.||||:||||..|.:.|.||
  Rat   140 TRFLQDSVEYCIIGVTILSQLTNEINQVSATAFFIEADTTHPLTKHRKIASSFRDSSLFDIFTLS 204

  Fly   188 CSLLVSARDNSKNISFMDESQQALISHVLRLTKNCLSFDFIGSSTDESADDMNNVQIPTAWRPAF 252
            |:||..|  :.||::..||||..|:..:|:||.|||:|||||:|||||:||:..|||||:||.||
  Rat   205 CNLLKQA--SGKNLNLNDESQHGLLMQLLKLTHNCLNFDFIGTSTDESSDDLCTVQIPTSWRSAF 267

  Fly   253 LDSNTLKLFFDLYQILPNGLASYSISCLVQITSVRRSLFNNSERTKFLTHLVEGVKDILTTLHGL 317
            |||:||:||||||..:|...:...:||||||.|||||||||:||.|||:|||:|||.||.....|
  Rat   268 LDSSTLQLFFDLYHSIPPSFSPLVLSCLVQIASVRRSLFNNAERAKFLSHLVDGVKRILENPQSL 332

  Fly   318 SDPDNYHEFCRLLARLKSNYQLGELIAVPCYPEAIQLIAKFTVESLHLWLFAPNSVHYLLTLWQR 382
            |||:|||||||||||||||||||||:.|..||:.|:|||.|||.||..|.||||||||||:||||
  Rat   333 SDPNNYHEFCRLLARLKSNYQLGELVKVENYPDVIRLIANFTVTSLQHWEFAPNSVHYLLSLWQR 397

  Fly   383 MVASVPYVKSPDPHLLGTYTPEVIKAYIESRLDAVPVIIRDNLDDPLDDFCMVQQQLEQLSVIER 447
            :.|||||||:.:||:|.||||||.||||.|||::|.:|:||.|:|||:|..:|||||:|||.|.|
  Rat   398 LAASVPYVKATEPHMLETYTPEVTKAYITSRLESVHIILRDGLEDPLEDTGLVQQQLDQLSTIGR 462

  Fly   448 CEYNKTCNLLVQHFDQKAREYENLLQTPNANSIDITIHELQLTWLVYIIGSAIVGRLTVATSDEH 512
            |||.|||.||||.|||.|:.|:.|||:.:|:.:||.:.|.:|||||||||:.|.||::.|::||.
  Rat   463 CEYEKTCALLVQLFDQSAQSYQELLQSASASPMDIAVQEGRLTWLVYIIGAVIGGRVSFASTDEQ 527

  Fly   513 DTMDAELVIRVLQLMTLTDARLPQAGCEKLELAILSFLDQVRKMHSSEQAQKAN-LNKRLSEVFG 576
            |.||.|||.||||||.|||:||.|||.||||||:|||.:|.||::..:|.||:: |.:|||||.|
  Rat   528 DAMDGELVCRVLQLMNLTDSRLAQAGNEKLELAMLSFFEQFRKIYIGDQVQKSSKLYRRLSEVLG 592

  Fly   577 LTDEQMLLSFINRKIITNLKFWGRSESIITKTLMLLSELSVHFNSVRKLARLEEVQFMLTHHTSE 641
            |.||.|:||....|:|||||:|||.|.|.:|||.||::||:.::|||||.:|..|||||.:||||
  Rat   593 LNDETMVLSVFIGKVITNLKYWGRCEPITSKTLQLLNDLSIGYSSVRKLVKLSAVQFMLNNHTSE 657

  Fly   642 HFPFLGTN--SSLSEMRCRTMFYTSLGRLLMFDLGEDEERFYNFLEPLTNQFESLGSVMMDNNIF 704
            ||.|||.|  |:|::|||||.|||:||||||.||||||:::..|:.|||..||::.. |...|.|
  Rat   658 HFSFLGINNQSNLTDMRCRTTFYTALGRLLMVDLGEDEDQYEQFMLPLTAAFEAVAQ-MFSTNSF 721

  Fly   705 SNEEAKKVIIGLARDLRGLALPLNARIQYTMLFEWLYYADYLPILLRAMDLWAHDPAVTTPILKL 769
            :.:|||:.::||.|||||:|...||:..:.|||||: |..|:|||.||::||.||||.|||:|||
  Rat   722 NEQEAKRTLVGLVRDLRGIAFAFNAKTSFMMLFEWI-YPSYMPILQRAIELWYHDPACTTPVLKL 785

  Fly   770 FAELVHCRTQRLAGNVSSPMGILLFREASKLICIYGNRILH-QEVPRERLYPMRLKGIAICFLIL 833
            .|||||.|:|||..:||||.|||||||.||:|.:||||||. .|||::::|.::||||:|||.:|
  Rat   786 MAELVHNRSQRLQFDVSSPNGILLFRETSKMITMYGNRILTLGEVPKDQVYALKLKGISICFSML 850

  Fly   834 KNSLGGNYVNCGVFKLYGDDTLDSVLNIIAKLILTIEQRDLIEYPKLSTAYYNLLNCLSQDHVSY 898
            |.:|.|:|||.|||:|||||.|::.|....||:|:|...||::|||||.:||:||..|:|||:::
  Rat   851 KAALSGSYVNFGVFRLYGDDALENALQTFIKLLLSIPHSDLLDYPKLSQSYYSLLEVLTQDHMNF 915

  Fly   899 LAALEPAAFVYILKSLTKGLAALDSATYISCCTILDSIVSYIFKQLQMKVSTFPNKKLRSLNQEN 963
            :|:|||...:|||.|:::||.|||:.....||:.||.||:|:||||    |....|:...||:|:
  Rat   916 IASLEPHVIMYILSSISEGLTALDTMVCTGCCSCLDHIVTYLFKQL----SRSTKKRTAPLNRES 976

  Fly   964 VQFLKVVEMNSELLQSMMSSLLNNVLQEDCRNQWSMSRPLLVLILLYEDYYRSLKDRIICAQPIE 1028
            ..||.:::.:..::|.|:|::||.::.||||||||||||||.||||.|.|:..|::.|:.:||.|
  Rat   977 DCFLHIMQQHPAMIQQMLSTVLNIIIFEDCRNQWSMSRPLLGLILLNEKYFSDLRNSIVNSQPPE 1041

  Fly  1029 KQQTMAQWFDDLMVGIERNVSSKNKEKFTQNMSTFRRDVVNLPKSTAGGAD 1079
            |||.|...|::||.|||||:.:||:::||||:|.|||:|.:..|::..|.:
  Rat  1042 KQQAMHLCFENLMEGIERNLLTKNRDRFTQNLSAFRREVNDSMKNSTYGVN 1092

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Ranbp16NP_001188596.1 IBN_N 25..87 CDD:281761 41/65 (63%)
Xpo7XP_008769054.1 IBN_N 32..98 CDD:281761 41/65 (63%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C166353027
Domainoid 1 1.000 1119 1.000 Domainoid score I18
eggNOG 1 0.900 - - E1_KOG1410
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H22857
Inparanoid 1 1.050 1223 1.000 Inparanoid score I172
OMA 1 1.010 - - QHG53933
OrthoDB 1 1.010 - - D198413at2759
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0004030
OrthoInspector 1 1.000 - - otm45359
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_102412
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR12596
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X2778
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 1 0.960 - -
1615.770

Return to query results.
Submit another query.