Protein Alignment CLCN5 and Clcn5

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001427685.1
• Gene: CLCN5 / 1184
• HGNCID: 2023
• Length: 820
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: NP_001401322.1
• Gene: Clcn5 / 25749
• RGDID: 2362
• Length: 816
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 820
• Identity: 797/820 - (97%)
• Similarity: 809/820 - (98%)
• Gaps: 4/820 - (0%)

Human     1 MAMWQGAMDNRGFQQGSFSSFQNSSSDEDLMDIPATAMDFSMRDDVPPLDREVGGIIIEDKSYNG 65
            |||||||||||||.||||||||:|||||||||||.|||||||||||||||||:.|    :|||||
  Rat     1 MAMWQGAMDNRGFHQGSFSSFQSSSSDEDLMDIPGTAMDFSMRDDVPPLDREIEG----NKSYNG 61

Human    66 GGIGSSNRIMDFLEEPIPGVGTYDDFNTIDWVREKSRDRDRHREITNKSKESTWALIHSVSDAFS 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    62 GGIGSSNRIMDFLEEPIPGVGTYDDFNTIDWVREKSRDRDRHREITNKSKESTWALIHSVSDAFS 126

Human   131 GWLLMLLIGLLSGSLAGLIDISAHWMTDLKEGICTGGFWFNHEHCCWNSEHVTFEERDKCPEWNS 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||
  Rat   127 GWLLMLLIGLLSGSLAGLIDISAHWMTDLKEGICTGGFWFNHEHCCWNSEHVTFEDRDKCPEWNS 191

Human   196 WSQLIISTDEGAFAYIVNYFMYVLWALLFAFLAVSLVKVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYL 260
            |||||||||:||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
  Rat   192 WSQLIISTDQGAFAYIVNYFMYVLWALLFAFLAVSLVKAFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYL 256

Human   261 GKWTLVIKTITLVLAVSSGLSLGKEGPLVHVACCCGNILCHCFNKYRKNEAKRREVLSAAAAAGV 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   257 GKWTLVIKTITLVLAVSSGLSLGKEGPLVHVACCCGNILCHCFNKYRKNEAKRREVLSAAAAAGV 321

Human   326 SVAFGAPIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFTLRSINPFGNSRLVLFYVEFHTPWHL 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   322 SVAFGAPIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFTLRSINPFGNSRLVLFYVEFHTPWHL 386

Human   391 FELVPFILLGIFGGLWGALFIRTNIAWCRKRKTTQLGKYPVIEVLVVTAITAILAFPNEYTRMST 455
            |||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||:|||:|||||||||||||||||||
  Rat   387 FELVPFIVLGIFGGLWGALFIRTNIAWCRKRKTTQLGKYPVVEVLIVTAITAILAFPNEYTRMST 451

Human   456 SELISELFNDCGLLDSSKLCDYENRFNTSKGGELPDRPAGVGVYSAMWQLALTLILKIVITIFTF 520
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   452 SELISELFNDCGLLDSSKLCDYENHFNTSKGGELPDRPAGVGVYSAMWQLALTLILKIVITIFTF 516

Human   521 GMKIPSGLFIPSMAVGAIAGRLLGVGMEQLAYYHQEWTVFNSWCSQGADCITPGLYAMVGAAACL 585
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.:|.:||||||||||||||||||||||||||
  Rat   517 GMKIPSGLFIPSMAVGAIAGRLLGVGMEQLAYYHHDWGIFNSWCSQGADCITPGLYAMVGAAACL 581

Human   586 GGVTRMTVSLVVIMFELTGGLEYIVPLMAAAMTSKWVADALGREGIYDAHIRLNGYPFLEAKEEF 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   582 GGVTRMTVSLVVIMFELTGGLEYIVPLMAAAMTSKWVADALGREGIYDAHIRLNGYPFLEAKEEF 646

Human   651 AHKTLAMDVMKPRRNDPLLTVLTQDSMTVEDVETIISETTYSGFPVVVSRESQRLVGFVLRRDLI 715
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   647 AHKTLAMDVMKPRRNDPLLTVLTQDSMTVEDVETIISETTYSGFPVVVSRESQRLVGFVLRRDLI 711

Human   716 ISIENARKKQDGVVSTSIIYFTEHSPPLPPYTPPTLKLRNILDLSPFTVTDLTPMEIVVDIFRKL 780
            |||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   712 ISIENARKKQDGVVSTSIIYFTEHSPPMPPYTPPTLKLRNILDLSPFTVTDLTPMEIVVDIFRKL 776

Human   781 GLRQCLVTHNGRLLGIITKKDVLKHIAQMANQDPDSILFN 820
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||
  Rat   777 GLRQCLVTHNGRLLGIITKKDVLKHIAQMANQDPESILFN 816

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CLCN5	NP_001427685.1	Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1..26		22/24 (92%)
		Selectivity filter part_1. /evidence=ECO:0000250	241..245		3/3 (100%)
		Selectivity filter part_2. /evidence=ECO:0000250	283..287		3/3 (100%)
		Selectivity filter part_3. /evidence=ECO:0000250	527..531		3/3 (100%)
Clcn5	NP_001401322.1	ClC_3_like	142..640	CDD:239656	486/497 (98%)
		Selectivity filter part_1. /evidence=ECO:0000250	237..241		3/3 (100%)
		Selectivity filter part_2. /evidence=ECO:0000250	279..283		3/3 (100%)
		Selectivity filter part_3. /evidence=ECO:0000250	523..527		3/3 (100%)
		CBS_pair_voltage-gated_CLC_euk_bac	651..801	CDD:341367	148/149 (99%)
		CBS repeat	657..752	CDD:341367	93/94 (99%)
		CBS repeat	758..800	CDD:341367	41/41 (100%)