DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment FASN2 and Fasn

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001259986.1 Gene:FASN2 / 117361 FlyBaseID:FBgn0042627 Length:2410 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_059028.2 Gene:Fasn / 50671 RGDID:620665 Length:2505 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2525 Identity:1084/2525 - (42%)
Similarity:1562/2525 - (61%) Gaps:195/2525 - (7%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    18 DIVISGLSGKLPESSNIEEFKYNLLNGIDMVTDEPRRWEAGIYGLPERMAKMKDSDLEKFDDKFF 82
            ::||:|:|||||||.|::||..||:.|:|||||:.|||:||:||||:|..|:|  ||.|||..||
  Rat     3 EVVIAGMSGKLPESENLQEFWANLIGGVDMVTDDDRRWKAGLYGLPKRSGKLK--DLSKFDASFF 65

  Fly    83 SVHQKQAELMDPCMRMLLELTHEAIIDAGINPVQLRGSRTGVYIGLSFVETEHEIPNMEPSSING 147
            .||.|||..|||.:|:|||:::|||:|.||||..|||:.|||::|:|..|.. |..:.:|.::.|
  Rat    66 GVHPKQAHTMDPQLRLLLEVSYEAIVDGGINPASLRGTNTGVWVGVSGSEAS-EALSRDPETLLG 129

  Fly   148 YCLTGCARAMFANRISYTFDFKGPSFIVDTACSSSLVALNHAFADMRAGRCDYALVAGVNLILKP 212
            |.:.||.|||.|||:|:.|||||||..:||||||||:||.:|:..:|:|.|..|:|.|:||:|||
  Rat   130 YSMVGCQRAMMANRLSFFFDFKGPSIALDTACSSSLLALQNAYQAIRSGECPAAIVGGINLLLKP 194

  Fly   213 IFALQFLRLGIVSHDGSCKTFDAAANGYARADTCAVVLLQRRKEAKRVYASILNVRTNTDGFKEQ 277
            ..::||::||::|.||:|::||.:.|||.||:....|||.::..|:||||:|||..|||||.|||
  Rat   195 NTSVQFMKLGMLSPDGTCRSFDDSGNGYCRAEAVVAVLLTKKSLARRVYATILNAGTNTDGCKEQ 259

  Fly   278 GVTFPDGRMQQALLEETYSEIGLNPDEVVYVEAHGSGTPVGDDQEANMLSNFFCRPSRSTPLLIG 342
            |||||.|..|:.|:...|...|:.|:.:.|:||||:||.|||.||.|.::...| ..|.:|||||
  Rat   260 GVTFPSGEAQEQLIRSLYQPGGVAPESLEYIEAHGTGTKVGDPQELNGITRSLC-AFRQSPLLIG 323

  Fly   343 SVKSNMGHAEPASGVSALAKMIIAMEEGIIPKNLHYRTPNPSVPALVEGKLKVVDRNLPWQGGIV 407
            |.||||||.|||||::||.|:::::|.|:...|||:..|||.:|||::|:|:||||.||.:||||
  Rat   324 STKSNMGHPEPASGLAALTKVLLSLENGVWAPNLHFHNPNPEIPALLDGRLQVVDRPLPVRGGIV 388

  Fly   408 GLNSFGFGGANAHVVLKSHTKAKEPKACPKAGEAEQSLSLVTCSGRTEDAVNQLLKVATEQRHDQ 472
            |:|||||||||.||:|:.:|: :.|...|.|....    |:..||||.:||..||:...:...|.
  Rat   389 GINSFGFGGANVHVILQPNTQ-QAPAPAPHAALPH----LLHASGRTMEAVQGLLEQGRQHSQDL 448

  Fly   473 ELLTLINDIHSHPIPLHPFRGYAVLGTSGCVKEEVLPYEEEERPIWFVYAGMGSQWARMAKDLMQ 537
            ..::::|||.:.|....|||||.|||..|.| :||......:||:||:.:|||:||..|...||:
  Rat   449 AFVSMLNDIAATPTAAMPFRGYTVLGVEGHV-QEVQQVPASQRPLWFICSGMGTQWRGMGLSLMR 512

  Fly   538 LEVFRNSIQHCAEVLAQVDFDLIDVLTRSTERTFDNMLYSFVSVSAVQVALTDLLRVLDIRPDGI 602
            |:.||.||....|.|..:...:.|:|..:.|.|||::::||||::|:|:||.|||..:.::||||
  Rat   513 LDSFRESILRSDEALKPLGVKVSDLLLSTDEHTFDDIVHSFVSLTAIQIALIDLLTSMGLKPDGI 577

  Fly   603 IGHSAGELGAAYMDGCLTAEQTVLAAYWRGRSVLDTPDLPRGKMAAVGLSWEQIGSQIPKDCYPV 667
            ||||.||:...|.||||:..:.||||||||:.:.|. :||.|.|||||||||:...:.|....|.
  Rat   578 IGHSLGEVACGYADGCLSQREAVLAAYWRGQCIKDA-NLPAGSMAAVGLSWEECKQRCPPGVVPA 641

  Fly   668 CHNSDDNCTVSGPPSSMDAMIEDLTAKGIFVREVGSGGYAFHSPYIEGAAPMLRRSLERLITEPK 732
            ||||:|..|:|||.::::..:|.|..:|:|.:||.:||.||||.::||.||.|.::|:::|.||:
  Rat   642 CHNSEDTVTISGPQAAVNEFVEQLKQEGVFAKEVRTGGLAFHSYFMEGIAPTLLQALKKVIREPR 706

  Fly   733 KKSIRWLSTSVKEAEWDSEKNHLASAGYFINNLISPVLFHQAVKRIPQNALIVEIAPHGLFRAIL 797
            .:|.||||||:.||:|.|.....:||.|.:|||:|||||.:|:..:|::|:::|||||.|.:|:|
  Rat   707 PRSARWLSTSIPEAQWQSSLARTSSAEYNVNNLVSPVLFQEALWHVPEHAVVLEIAPHALLQAVL 771

  Fly   798 -RSLSPQISYVSLMQRGHANNFEFLLSQLGRLYAAGGQPQILKISPSIPYPVSRGTPMLGSLVGW 861
             |.:.|..:.:.||:|.|.:|.||.|:.||:::..|.......:.|.:.:||.||||::...:.|
  Rat   772 KRGVKPSCTIIPLMKRDHKDNLEFFLTNLGKVHLTGIDINPNALFPPVEFPVPRGTPLISPHIKW 836

  Fly   862 DHTQKWNYP---KFKGGRQAGQLSV-ELDLGKE-ENVYLAGHTIDGRVLFPATGYMTLAWMSLAQ 921
            ||:|.|:.|   .|..|..:...:| .:|...| .:.||..|.||||||||.|||:.|.|.:||:
  Rat   837 DHSQTWDIPVAEDFPNGSSSSSATVYNIDASSESSDHYLVDHCIDGRVLFPGTGYLYLVWKTLAR 901

  Fly   922 QQGLDYLRTPVLFEDVVFHRATILSVGTVVKLTLNFFPGSSSFEICEGTSLVTSGKIRLVSNVQQ 986
            ...|....|||:||:|.||:||||.....|.|.:.....|.:||:.:..:|:.|||:....:...
  Rat   902 SLSLSLEETPVVFENVTFHQATILPRTGTVPLEVRLLEASHAFEVSDSGNLIVSGKVYQWEDPDS 966

  Fly   987 EQLQLSSLPGIAGS---NKLSTKDIYKELRLRGYDYTGVFQGILESDISAVTGQLQWADNWISFM 1048
            :......:|..|.|   ::|:..::|||||||||||...|||:.|:.:....|:|.|.|||::||
  Rat   967 KLFDHPEVPIPAESESVSRLTQGEVYKELRLRGYDYGPHFQGVYEATLEGEQGKLLWKDNWVTFM 1031

  Fly  1049 DTMLQFRILSNDIRELYVPTGIERALIDPLKHLE---LAKKHQQKLTVNWHRNISVVKCGGVEIH 1110
            |||||..||....:.|.:||.:....|||..||:   :.:...|...|...|.:.|...|||.|.
  Rat  1032 DTMLQISILGFSKQSLQLPTRVTAIYIDPATHLQKVYMLEGDTQVADVTTSRCLGVTVSGGVYIS 1096

  Fly  1111 KMKTAQTQRRSGGQSPPSLERYRFWPHSQHLGQRE----EQEKSRSTALAVAIQLIIENSGGAVK 1171
            :::|..|.||...|..|:||::.|.||.:.....|    ::|......||.|:|......|..:.
  Rat  1097 RLQTTATSRRQQEQLVPTLEKFVFTPHVEPECLSESAILQKELQLCKGLAKALQTKATQQGLKMT 1161

  Fly  1172 LKGVE-----------LAGSRSTLDALSAVQLLELIEREPILVGDMAVVTSSSNESELG------ 1219
            :.|:|           .|..:..|:....::|.|::.||.:|:.:..:::...|...|.      
  Rat  1162 VPGLEDLPQHGLPRLLAAACQLQLNGNLQLELGEVLARERLLLPEDPLISGLLNSQALKACIDTA 1226

  Fly  1220 -EQLKEHGIRVIVKDIKAGAVEQQCHFVYSVN---MLA---------QNSVKDLQ---------- 1261
             |.|....::|:  ::.||......|....:|   ||.         ..::||:|          
  Rat  1227 LENLSTLKMKVV--EVLAGEGHLYSHISALLNTQPMLQLEYTATDRHPQALKDVQTKLQQHDVAQ 1289

  Fly  1262 ---------------------HC-----------LDSLKS---DSGFLLL--------------- 1276
                                 :|           ||::.:   |.||||:               
  Rat  1290 GQWDPSGPAPTNLGALDLVVCNCALATLGDPALALDNMVAALKDGGFLLMHTVLKGHALGETLAC 1354

  Fly  1277 --EEAASRYNIIGKEKLNK------LKLVSVLEQFFGTDRVLVLVRKLSKVQSSQALTLHLTNKQ 1333
              .|.....:.:.:|:...      |.||.:.:.|:||  .|.|.|:||  ...:.:.|.:.:..
  Rat  1355 LPSEVQPGPSFLSQEEWESLFSRKALHLVGLKKSFYGT--ALFLCRRLS--PQDKPIFLPVEDTS 1415

  Fly  1334 FKWVNELKNSIAKAQAEEKNLYLVAQGEPNSGALGLMNCLKREAGGHFLRLYLILD----EGVPQ 1394
            |:||:.||:.:|.:.::.  ::|.|...|.||.:||:|||::|.|||.:|..|:.:    ..||:
  Rat  1416 FQWVDSLKSILATSSSQP--VWLTAMNCPTSGVVGLVNCLRKEPGGHRIRCILLSNLSSTSHVPK 1478

  Fly  1395 FSLDDPFYAAQLAKDLVVNVYRNGSWGSYRHLKMESRPPMLPVEQAYVNTLVKGDLSSLRWIESP 1459
            ...........|..|||:||||:|:||::||.::|...|......|:||.|.:|||:|:||:.||
  Rat  1479 LDPGSSELQKVLESDLVMNVYRDGAWGAFRHFQLEQDKPEEQTAHAFVNVLTRGDLASIRWVSSP 1543

  Fly  1460 ---RSSPIQSQLEPCTVYYAPLNFRDVMLASGKLGVDALPGDLAYQDCVLGLEFAGRDSCGRRVM 1521
               ...|..|..:.||||||.|||||:|||:|||..||:||..|.:||:||:||:|||.||||||
  Rat  1544 LKHMQPPSSSGAQLCTVYYASLNFRDIMLATGKLSPDAIPGKWASRDCMLGMEFSGRDKCGRRVM 1608

  Fly  1522 AMVTAKSLATNCLANRNLLWEVPSKWTMEQASTVPCVYATVYYALVVRGQMKEGERILIHAGSGG 1586
            .:|.|:.|||:.|.:.:.||:|||.||:|:|::||.||.|.||:|||||:::.||.:|||:||||
  Rat  1609 GLVPAEGLATSVLLSPDFLWDVPSSWTLEEAASVPVVYTTAYYSLVVRGRIQHGETVLIHSGSGG 1673

  Fly  1587 VGQAAISVALAHGLTVFTTVGSKEKREFLLKRFPKLKAKNIGNSRDTSFEQLIMSETHGNGVELV 1651
            |||||||:||:.|..|||||||.|||.:|..|||:|...:..|||||||||.::..|.|.||:||
  Rat  1674 VGQAAISIALSLGCRVFTTVGSAEKRAYLQARFPQLDDTSFANSRDTSFEQHVLLHTGGKGVDLV 1738

  Fly  1652 LNSLSEEKLQASIRCLALNGRFLEIGKFDLSNNTPLGMSVFLKNTSFHGILLDSVMEGEEEMQLM 1716
            ||||:|||||||:||||.:||||||||||||||.||||::||||.:|||||||::.||..:....
  Rat  1739 LNSLAEEKLQASVRCLAQHGRFLEIGKFDLSNNHPLGMAIFLKNVTFHGILLDALFEGANDSWRE 1803

  Fly  1717 VAKLVAEGIKSGAVQPLPTTVFAEQEIEKAFRFMASGKHIGKVVIKVRLEEEQQAALPRLRQ--I 1779
            ||:|:..||:.|.|:||..|||.:.::|.|||:||.|||||||:::|| |||.:|.||..:.  |
  Rat  1804 VAELLKAGIRDGVVKPLKCTVFPKAQVEDAFRYMAQGKHIGKVLVQVR-EEEPEAMLPGAQPTLI 1867

  Fly  1780 QAIPRSYMHPEKSYILVGGLGGFGLELANWLVSRGARFLVLSSRSGVKSGYQALMIRRWHDRGVQ 1844
            .||.:::....||||:.|||||||||||.|||.|||:.|||:||||:::||||..:|.|..:|:.
  Rat  1868 SAISKTFCPEHKSYIITGGLGGFGLELARWLVLRGAQRLVLTSRSGIRTGYQAKHVREWRRQGIH 1932

  Fly  1845 VQIDTNDVTTAVGCQRLLEVSNKLALVGGIFNLAAVLRDGLIEDQSPKNFEKVSAPKLLATIHLD 1909
            |.:.|::|::..|.:.|:..:.||..|||:||||.||||.::|:|:|:.|:.|:.||...|::||
  Rat  1933 VLVSTSNVSSLEGARALIAEATKLGPVGGVFNLAMVLRDAMLENQTPELFQDVNKPKYNGTLNLD 1997

  Fly  1910 KISREICPALEYFVCFSSLSCGRGNMGQTNYGLANSTMERICEQRQEYGYPGTAIQWGAIGDTGL 1974
            :.:||.||.|:|||.|||:||||||.||:|||.||||||||||||:..|.||.|:|||||||.|:
  Rat  1998 RATREACPELDYFVAFSSVSCGRGNAGQSNYGFANSTMERICEQRRHDGLPGLAVQWGAIGDVGI 2062

  Fly  1975 IIEHMGNNETVVGGTLPQRMISCLETLDLFLQQPHPVMASMVVAEKRKTE----QANRLSLIATI 2035
            |:|.||.|:||||||||||:.||:|.|||||.|||.|::|.|:|||:...    :|.| .|:..:
  Rat  2063 ILEAMGTNDTVVGGTLPQRISSCMEVLDLFLNQPHAVLSSFVLAEKKAVAHGDGEAQR-DLVKAV 2126

  Fly  2036 ANIMGLRDVKSVSDKTTLFDLGMDSLMSTEIKQTLERHFDLVLSAQEIRQLTFSALRQIDAQEPP 2100
            |:|:|:||:..::..::|.|||:||||..|::|.|||..||||..:|:||||...|:::.::...
  Rat  2127 AHILGIRDLAGINLDSSLADLGLDSLMGVEVRQILEREHDLVLPIREVRQLTLRKLQEMSSKAGS 2191

  Fly  2101 SASVSSPSASSTLSRIKEE----ACVEVQPQSDETRKVFAKEVLPQEVMVRLRSKAPVASEDPAV 2161
            ...:::|.:.:..| :|:.    :.:.|.|:.              ..:.||.|   |.|.:..:
  Rat  2192 DTELAAPKSKNDTS-LKQAQLNLSILLVNPEG--------------PTLTRLNS---VQSSERPL 2238

  Fly  2162 FFLAPIEGFTIAVEALAASLTCPAYGLQCTEQVPLDSIEACAAYYLRQIQKLQPLGPYHIVGYSY 2226
            |.:.||||......:|||.|:.|.||||||:..|||||...||||:..|:::||.|||.:.|||:
  Rat  2239 FLVHPIEGSITVFHSLAAKLSVPTYGLQCTQAAPLDSIPNLAAYYIDCIKQVQPEGPYRVAGYSF 2303

  Fly  2227 GCLLAHAIAVALEQRRFGV----KVIMLDGAPTMASGYVQEAK-KQTDDLNRQ-QSMTLAYFGAL 2285
            |..:|..:...|:.::...    .:.:.||:.|....|.|..: |.|.....: ::..:.:|...
  Rat  2304 GACVAFEMCSQLQAQQGPAPAHNNLFLFDGSHTYVLAYTQSYRAKLTPGCEAEAEAEAICFFIKQ 2368

  Fly  2286 LADVDYNQVLLQLLDGVQTWPSKLDKLADTLA--------GYTQQTREVIKKAACMFKQKLLLSE 2342
            ..|.::::||..||        .|..|.|.:|        .:....|..:..||..|..||..::
  Rat  2369 FVDAEHSKVLEALL--------PLKSLEDRVAAAVDLITRSHQSLDRRDLSFAAVSFYYKLRAAD 2425

  Fly  2343 SYKGAKQLHSDVVLIKS---AEHNAIMAQDYGLKEICSAQIDMHVVEGTHRTFLK 2394
            .||...:.|.:|:|:::   ..:...:..||.|.::|..::.:|::||.|||.|:
  Rat  2426 QYKPKAKYHGNVILLRAKTGGTYGEDLGADYNLSQVCDGKVSVHIIEGDHRTLLE 2480

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

Software error:

Illegal division by zero at /www/www.flyrnai.org/docroot/cgi-bin/DRSC_prot_align.pl line 591.

For help, please send mail to the webmaster (ritg@hms.harvard.edu), giving this error message and the time and date of the error.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
FASN2NP_001259986.1 PksD 15..1043 CDD:225858 487/1033 (47%)
PKS 18..423 CDD:238429 226/404 (56%)
KAsynt_C_assoc 381..498 CDD:292814 55/116 (47%)
Acyl_transf_1 518..835 CDD:298668 148/317 (47%)
hot_dog 875..1072 CDD:294345 81/201 (40%)
NADB_Rossmann 1263..>1429 CDD:304358 59/206 (29%)
PKS_ER 1471..1761 CDD:214840 184/289 (64%)
enoyl_red 1473..1761 CDD:176179 182/287 (63%)
KR_1_FAS_SDR_x <1780..2018 CDD:187657 140/237 (59%)
PKS_PP 2031..>2083 CDD:214834 23/51 (45%)
Abhydrolase 2159..2408 CDD:304388 76/253 (30%)
FasnNP_059028.2 Beta-ketoacyl synthase 1..413 228/414 (55%)
PKS 2..404 CDD:238429 226/404 (56%)
KAsynt_C_assoc 362..472 CDD:406579 54/114 (47%)
Acyl and malonyl transferases 429..817 173/389 (44%)
Acyl_transf_1 493..809 CDD:395567 148/316 (47%)