DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment FASN2 and fasn-1

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001259986.1 Gene:FASN2 / 117361 FlyBaseID:FBgn0042627 Length:2410 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_492417.2 Gene:fasn-1 / 172715 WormBaseID:WBGene00009342 Length:2613 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:2633 Identity:1009/2633 - (38%)
Similarity:1451/2633 - (55%) Gaps:305/2633 - (11%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    18 DIVISGLSGKLPESSNIEEFKYNLLNGIDMVTDEPRRWEAGIYGLPERMAKMKDSDLEKFDDKFF 82
            ||||||:||:.|...|::.|...||.|.|:||::..||..|...||:|..|:|  .|.|||..||
 Worm    39 DIVISGVSGRFPRCDNVKMFGDMLLAGEDLVTEDSLRWTPGFCDLPKRHGKLK--VLNKFDAGFF 101

  Fly    83 SVHQKQAELMDPCMRMLLELTHEAIIDAGINPVQLRGSRTGVYIGLSFVETEHEIPNMEPSSING 147
            .|..|||..|||.:|:|||.:.||::||||||..||||:|||::|.|..||...: ..:|.::.|
 Worm   102 QVTPKQANFMDPQVRLLLEASWEAMVDAGINPTDLRGSKTGVFVGCSASETSGML-TQDPDTVTG 165

  Fly   148 YCLTGCARAMFANRISYTFDFKGPSFIVDTACSSSLVALNHAFADMRAGRCDYALVAGVNLILKP 212
            |.||||.|:||:||||||||.:||||.|||||||||:||..|...:|.|:||.|:|||.:|.|.|
 Worm   166 YTLTGCVRSMFSNRISYTFDLQGPSFSVDTACSSSLLALQLAVDSIRQGQCDAAIVAGAHLTLTP 230

  Fly   213 IFALQFLRLGIVSHDGSCKTFDAAANGYARADTCAVVLLQRRKEAKRVYASILNVRTNTDGFKEQ 277
            ..||||||||:::..|||::||.:.:||.|.:..|.:.:||:|:|:|:||::::.::||||.||.
 Worm   231 TAALQFLRLGMLTDKGSCRSFDESGDGYCRTEGVAAIFIQRKKKAQRLYATVVHAKSNTDGHKEH 295

  Fly   278 GVTFPDGRMQQALLEETYSEIGLNPDEVVYVEAHGSGTPVGDDQEANMLSNFFCRPSRSTPLLIG 342
            |:|||.|..|..||:|.|||.|::|:.|.||||||:||.|||.||||.:...|| ..|:..||||
 Worm   296 GITFPSGERQAQLLQEVYSEAGIDPNSVYYVEAHGTGTKVGDPQEANAICEVFC-SKRTDSLLIG 359

  Fly   343 SVKSNMGHAEPASGVSALAKMIIAMEEGIIPKNLHYRTPNPSVPALVEGKLKVVDRNLPWQGGIV 407
            |||||||||||||||.:|.|:::::|..:||.||||.|||..:|.|.:|:||||.......||::
 Worm   360 SVKSNMGHAEPASGVCSLTKILLSIERQLIPPNLHYNTPNQYIPGLTDGRLKVVTEPTALPGGLI 424

  Fly   408 GLNSFGFGGANAHVVLKSHTKAKEPKACPKAGEAEQSLSLVTCSGRTEDAVNQLLKVATEQRHDQ 472
            |:|||||||:|.||:||:......|..      ......|||..|||::||..:.......:.|.
 Worm   425 GINSFGFGGSNTHVILKAADHIAPPIT------PHPFTKLVTYCGRTQEAVENIFTEIESNKDDL 483

  Fly   473 ELLTLINDIHSHPIPLHPFRGYAVLGTSGCVKE----EVLPYEEEERPIWFVYAGMGSQWARMAK 533
            .|..|:.:..:.|..|.|||||.:|.....|:.    ..:|. .|.|||:|:|:||||||..||.
 Worm   484 YLQALLANQANMPANLLPFRGYMLLDRENNVETLKSITKVPI-TEARPIYFIYSGMGSQWPGMAI 547

  Fly   534 DLMQLEVFRNSIQHCAEVLAQVDFDLIDVLTR-STERTFDNMLYSFVSVSAVQVALTDLLRVLDI 597
            .||::.:|.:|::..::.|.:...|:..:|.. ..|:..:|.:...::::|:|:||||:|..|.:
 Worm   548 KLMKIPMFDDSLRASSKTLEEFGLDVYGMLCNPDPEQYSNNTMNCMLAITAIQIALTDVLTALGV 612

  Fly   598 RPDGIIGHSAGELGAAYMDGCLTAEQTVLAAYWRGRSVLDTPDLPRGKMAAVGLSWEQIGSQIPK 662
            .||||||||.||:|..|.||.:|.|||:..||.||.:::...:: :|.||||||:|||:..|.|.
 Worm   613 SPDGIIGHSTGEMGCGYADGGITREQTMRLAYHRGTTIMKHTEI-KGAMAAVGLTWEQVKEQAPP 676

  Fly   663 DCYPVCHNSDDNCTVSGPPSSMDAMIEDLTAKGIFVREVGSGGYAFHSPYIEGAAPMLRRSLERL 727
            .....|||..|:.|:||....:......|..|.||.:.|.:.|..||||.:......:...:...
 Worm   677 GVVAACHNGADSVTISGDAEGVATFCAQLKEKDIFAKVVDTSGIPFHSPAMLAVQDEMIECMRTA 741

  Fly   728 ITEPKKKSIRWLSTSVKEAEWDSEKNHLASAGYFINNLISPVLFHQAVKRIPQNALIVEIAPHGL 792
            :.|||.:|.:|:|||:.|.:|:|:.....||.|.::|..|||||::|:::||.||:.:|:|||.|
 Worm   742 VPEPKPRSSKWISTSIPEDDWESDLAATCSAEYHVHNACSPVLFYEAIQKIPANAVTIEMAPHSL 806

  Fly   793 FRAIL-RSLSPQISYVSLMQRGHANN---FEFLLSQLGRLYAAGGQPQILKISPSIPYP--VSRG 851
            .:||| |||...::.|.||.|..:.|   .|..|..||::|.||...||.::.|...|.  |.:|
 Worm   807 MQAILRRSLQKTVTNVGLMNRPKSENDDELESFLGSLGKIYQAGVNIQITELYPGGQYKGVVPKG 871

  Fly   852 TPMLGSLVGWDHTQKWNYPKFKGGRQ---------AGQLSVELD--LGKEENVYLAGHTIDGRVL 905
            |||:|.:..|||||.|   ....|||         |...:..:|  ....:..||..|.||||||
 Worm   872 TPMIGPMWKWDHTQDW---LTIDGRQVLAGGSGSVASSATYNIDPFATDSKETYLLDHVIDGRVL 933

  Fly   906 FPATGYMTLAWMSLAQQQGLDYLRTPVLFEDVVFHRATILSVGTVVKLTLNFFPGSSSFEICEGT 970
            :|.||:|.|||.:|.:.:||||.:|||:||::....||||:  ..:||.:...||:..|||....
 Worm   934 YPFTGHMVLAWRTLCKLKGLDYTKTPVVFENINVFSATILT--KPIKLDVVLSPGNGYFEIISDD 996

  Fly   971 SLVTSGKIRLVSNVQQ------EQLQLSSLPGIAGSNKLSTKDIYKELRLRGYDYTGVFQGILES 1029
            .:..||:|.:..:.|.      |.::.|.   ||...:|.|:|.|||..||||:|...|:||.::
 Worm   997 QVAASGRIYIPEDNQPFYYGKLEDIRTSE---IADRIELDTEDAYKEFLLRGYEYGQAFRGIYKT 1058

  Fly  1030 DISAVTGQLQWADNWISFMDTMLQFRILSNDIRELYVPTGIERALIDPLKHLELAKKHQQKLTVN 1094
            ..|...|.|.|..||::|:|::||..:|:.....|.:||.:....|||.||||...:......:.
 Worm  1059 CNSGERGFLYWTGNWVTFLDSLLQTALLAERSDTLRLPTRVRHLRIDPNKHLEHVVEKDGIQVIE 1123

  Fly  1095 WHRNISVVKC--GGVEIHKMKTAQTQRRSGGQSPPSLERYRFWPHSQH---LGQREEQ------- 1147
            ...:.|...|  ||||...:......||.........|:..|.||..|   .|.::..       
 Worm  1124 LRNDHSTNGCIAGGVECCDLNAHSVARRIQVSGQLYHEKIFFVPHFDHNCLSGHKKTSTILKDYS 1188

  Fly  1148 --------------------EKSRSTALAVAIQLIIENSGG------------------------ 1168
                                :|.::.|..|....:::.|..                        
 Worm  1189 AVIKQQLYTGFSKWQSAGLLKKLKNGAQIVKALAVLKASQSDVVLDDTVTRFTHDGKCTVLHHIA 1253

  Fly  1169 ---------------AVKLKGV----EL-------------------------AGSRSTL---DA 1186
                           |.|||.|    ||                         ||..:|:   |.
 Worm  1254 DMFKIEDCEDFEDRVAAKLKSVRGIFELDRLWAGAVLNDRIVKSLQDICIENSAGHHATMAAVDL 1318

  Fly  1187 LSAVQLLELIE---REPILVGDMAVVTSSSNESELGEQLKEHGIRVIVKDIKAGAVEQQCHFVYS 1248
            :|..|:...||   ..|:|..|...:.::.      :.|.|..:.:|      |..:|:...  .
 Worm  1319 VSTDQIRHCIEANSSHPLLETDYTCIGANV------DHLDESTLEII------GGKKQKIDL--E 1369

  Fly  1249 VNMLAQNSVKDLQHCL----DSLKSD--------------SGFLLLEEAASRYNI-------IGK 1288
            .|......||:|.:.|    .|.|:|              :||||:.|..|:|.|       :|.
 Worm  1370 NNFTGHGEVKNLDYVLLDKVISKKADPIAFIEACKHLIRETGFLLVVEVTSQYEIALAIEGLLGN 1434

  Fly  1289 EKLNKLKLVSVLEQFFGTDRVLVLVRK----LSKVQSSQAL--TLHLTN---------------- 1331
            |.:....  ....|||..:::|.:.:.    :...||..||  |.:...                
 Worm  1435 EMVGDAS--RKYNQFFTHEQLLDMFKSTGFLICNFQSDPALMTTTYAVRRVSPIPRDPVFIDVDD 1497

  Fly  1332 -KQFKWVNELKNSIAKAQAEE---KNLYLVAQGEPNSGALGLMNC-------LKREAGGHFLRLY 1385
             |:|.|:..|: .:::.:..|   |.::||:....|:|.:||..|       :.|......:...
 Worm  1498 VKEFNWIEPLQ-KVSEERLNEPDSKTIWLVSNKCRNNGIVGLGLCFVEENLKINRFRSAFDMSAN 1561

  Fly  1386 LILDEGVPQFSLDDPFYAAQLAKDLVVNVYRNGSWGSYRHL--KMESRPPMLPVEQAYVNTLVKG 1448
            ..:.:|.|.:::.|......:..||..|.|.:|.|||.||:  |.|........|.|::|||.:|
 Worm  1562 KEIRDGPPVWNIGDEETKKIVELDLHANDYMDGQWGSMRHIVVKDEDVHVYKDCEHAFINTLTRG 1626

  Fly  1449 DLSSLRWIESPR---SSPIQSQL--EPCTVYYAPLNFRDVMLASGKLGVDALPGDLAYQDCVLGL 1508
            |:|||.|.|||.   .|.::|:.  |.|:|||||:||||:|||.|:|..||:||:.|.::|:||:
 Worm  1627 DVSSLTWFESPNQYFDSMVKSKATQELCSVYYAPINFRDIMLAYGRLPPDAIPGNFADRECLLGM 1691

  Fly  1509 EFAGRDSCGRRVMAMVTAKSLATNCLANRNLLWEVPSKWTMEQASTVPCVYATVYYALVVRGQMK 1573
            ||:||...|.|:|.::.|::|||..:.:|:..||||..||:.:|||||.||.|.|||||.||.||
 Worm  1692 EFSGRLKDGTRLMGILPAQALATTVMVDRDYAWEVPRDWTLAEASTVPVVYTTAYYALVRRGLMK 1756

  Fly  1574 EGERILIHAGSGGVGQAAISVALAHGLTVFTTVGSKEKREFLLKRFPKLKAKNIGNSRDTSFEQL 1638
            :|::||||.|:||||||||::|||.|..|||||||.||||||...||:|:..:..|||...||..
 Worm  1757 KGDKILIHGGAGGVGQAAIAIALAAGCEVFTTVGSAEKREFLKNLFPQLQEHHFANSRSADFELH 1821

  Fly  1639 IMSETHGNGVELVLNSLSEEKLQASIRCLALNGRFLEIGKFDLSNNTPLGMSVFLKNTSFHGILL 1703
            |...|.|.||.:|||||:.|.||||:||||.:||||||||.|||.|:.|||:..|.|.|.|||||
 Worm  1822 IRQHTKGRGVNIVLNSLANEMLQASLRCLARHGRFLEIGKVDLSQNSSLGMAKLLDNVSVHGILL 1886

  Fly  1704 DSVME---GEEEMQLMVAKLVAEGIKSGAVQPLPTTVFAEQEIEKAFRFMASGKHIGKVVIKVRL 1765
            ||:|:   |:.:....:|:|:.:|||||.|:||.:..|...:.|:|||||::|||||||::::|.
 Worm  1887 DSIMDPTVGDLDEWKEIARLLEQGIKSGVVKPLHSHSFPADKAEEAFRFMSAGKHIGKVIMEIRP 1951

  Fly  1766 EEEQQAALPRLRQIQAIPRSYMHPEKSYILVGGLGGFGLELANWLVSRGARFLVLSSRSGVKSGY 1830
            :|..:...|....::||.|:..||:.:|::.|||||||||||.||::||||.|||:||:|:::||
 Worm  1952 DEGTKVCPPSKISVRAICRTLCHPQHTYLITGGLGGFGLELAQWLINRGARKLVLTSRTGIRTGY 2016

  Fly  1831 QALMIRRWHDRGVQVQIDTNDVTTAVGCQRLLEVSNKLALVGGIFNLAAVLRDGLIEDQSPKNFE 1895
            ||..:..|...||.|.:.|.::........|:.....:..:||||:||.||||.|.|:|:.:||:
 Worm  2017 QARCVHFWRRTGVSVLVSTLNIAKKSDAVELINQCTAMGPIGGIFHLAMVLRDCLFENQNVQNFK 2081

  Fly  1896 KVSAPKLLATIHLDKISREICP--ALEYFVCFSSLSCGRGNMGQTNYGLANSTMERICEQRQEYG 1958
            ..:..|...||:||..|||.|.  .|::||.|||::.||||.||||||.:||.|||:.:||:..|
 Worm  2082 DAAEAKYYGTINLDYASREHCDKNILKWFVVFSSITSGRGNAGQTNYGWSNSCMERMIDQRRADG 2146

  Fly  1959 YPGTAIQWGAIGDTGLIIEHMGNNETVVGGTLPQRMISCLETLDLFLQQPHPVMASMVVAEKRKT 2023
            :||.|||||||||.|:|:|:||:|.|||||||||||.|||.:||.||...||:::|.:.||....
 Worm  2147 FPGIAIQWGAIGDVGVILENMGDNNTVVGGTLPQRMPSCLSSLDNFLSWNHPIVSSFIKAELGSK 2211

  Fly  2024 EQANRLSLIATIANIMGLRDVKSVSDKTTLFDLGMDSLMSTEIKQTLERHFDLVLSAQEIRQLTF 2088
            :......|:||||:|:|:.|:..::....|.|||:||||..||||.|||..|:|||.:|||.||.
 Worm  2212 KNVGGGDLMATIAHILGVNDISQLNADANLSDLGLDSLMGVEIKQALERDHDIVLSMKEIRTLTL 2276

  Fly  2089 SALRQIDAQEPPSASVSSPSASSTLSRIKEEACVEVQPQSDETRKVFAKEVL------------- 2140
            :.|:|:..|         .....|..::.|   :|::...:...::...|:|             
 Worm  2277 NKLQQLADQ---------GGTGRTALQVNE---LEMKKDGERDAELNTAEMLEQQMNQLFKMRVD 2329

  Fly  2141 -----PQEVMVRLRSKAPVASEDPAVFFLAPIEGFTIAVEALAASLTCPAYGLQCTEQVPLDSIE 2200
                 ||:::|    ||....|.|..||:..|||....::.:......|||..|.|:.||..|||
 Worm  2330 VNDLDPQDIIV----KANKVEEGPITFFVHSIEGIATPLKKVMNKCEFPAYCFQSTKNVPQTSIE 2390

  Fly  2201 ACAAYYLRQIQKLQPLGPYHIVGYSYGCLLAHAIAVALEQ---RRFGVKVIMLDGA----PTMAS 2258
            ..|..|:|:::|:||.|||.:||||||..:...:|..|::   |....::|:|||:    .|..:
 Worm  2391 DVAKCYIREMKKIQPSGPYRLVGYSYGACIGFEMANMLQESDGRDAVERLILLDGSHLYMQTYRN 2455

  Fly  2259 GYVQEAKKQTDDLNRQQ--------SMTLAYFGALLADVDYNQVLLQLLDGVQTWPSKLDKLAD- 2314
            .|........|.|....        :|||.:     |:|||.:...:||. ...:.:::.|:.| 
 Worm  2456 VYRMAFGVTGDSLVNNPLFESEIMCAMTLRF-----ANVDYKKFRFELLQ-QPGFKARVQKVVDQ 2514

  Fly  2315 -TLAGYTQQTREVIKKAACMFKQKLLLSESYKGAKQLHSDVVLIKSAEHNAI----MAQDYGLKE 2374
             .|.|.. ::.|.:..|......|.|:::.||..:.....:.||: ||..|.    :.:|||:..
 Worm  2515 VMLTGLF-KSPETVAFACEAMHSKFLMADKYKPRRNFGGHITLIR-AEQGAAREEDVGEDYGVAA 2577

  Fly  2375 ICSAQIDMHVVEGTHRTFLKEPHTLQIIERVLR 2407
            : |...::..|:|.|.||::...:...:|.:.|
 Worm  2578 V-SEDCEVLKVKGDHDTFVQGKSSSVTVEHINR 2609

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
FASN2NP_001259986.1 PksD 15..1043 CDD:225858 458/1052 (44%)
PKS 18..423 CDD:238429 220/404 (54%)
KAsynt_C_assoc 381..498 CDD:292814 43/116 (37%)
Acyl_transf_1 518..835 CDD:298668 126/321 (39%)
hot_dog 875..1072 CDD:294345 78/213 (37%)
NADB_Rossmann 1263..>1429 CDD:304358 51/225 (23%)
PKS_ER 1471..1761 CDD:214840 167/292 (57%)
enoyl_red 1473..1761 CDD:176179 166/290 (57%)
KR_1_FAS_SDR_x <1780..2018 CDD:187657 125/239 (52%)
PKS_PP 2031..>2083 CDD:214834 27/51 (53%)
Abhydrolase 2159..2408 CDD:304388 77/270 (29%)
fasn-1NP_492417.2 PKS 38..440 CDD:238429 220/404 (54%)
KAsynt_C_assoc 398..507 CDD:374425 43/114 (38%)
Acyl_transf_1 533..852 CDD:385314 126/319 (39%)
hot_dog 892..1104 CDD:382049 78/216 (36%)
NADB_Rossmann 1406..>1602 CDD:389744 45/198 (23%)
PKS_ER 1654..1946 CDD:214840 166/291 (57%)
KR_1_FAS_SDR_x <1968..2204 CDD:187657 124/235 (53%)
PP-binding 2219..2284 CDD:376348 34/64 (53%)
Abhydrolase 2385..>2444 CDD:389770 23/58 (40%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C160159756
Domainoid 1 1.000 280 1.000 Domainoid score I887
eggNOG 1 0.900 - - E1_COG3321
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H55800
Inparanoid 1 1.050 1739 1.000 Inparanoid score I26
Isobase 1 0.950 - 0 Normalized mean entropy S4124
OMA 1 1.010 - - QHG56071
OrthoDB 1 1.010 - - D19161at2759
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0001625
OrthoInspector 1 1.000 - - otm14295
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100178
Panther 1 1.100 - - O PTHR43775
Phylome 1 0.910 - -
RoundUp 00.000 Not matched by this tool.
SonicParanoid 1 1.000 - - X4095
SwiftOrtho 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 1 0.960 - -
1615.720

Return to query results.
Submit another query.