DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MED12L and Med12l

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_016861165.1 Gene:MED12L / 116931 HGNCID:16050 Length:2197 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_038959614.1 Gene:Med12l / 690752 RGDID:1592212 Length:2199 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2222 Identity:2070/2222 - (93%)
Similarity:2112/2222 - (95%) Gaps:48/2222 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MAAFGLLSYEQRPLKRPRLGPPDVYPQDPKQKEDELTAVNVKQGFNNQPAFTGDEHGSARNIVIN 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MAAFGLLSYEQRPLKRPRLGPPDVYPQDPKQKEDELTAVNVKQGFNNQPAFTGDEHGSARNIVIN 65

Human    66 PSKIGAYFSSILAEKLKLNTFQDTGKKKPQVNAKDNYWLVTARSQSAIHSWFSDLAGNKPLSILA 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||
  Rat    66 PSKIGAYFSSILAEKLKLNTFQDTGKKKPQVNAKDNYWLVTARSQSAIHSWFSDLAGNKPLAILA 130

Human   131 KK-----------VPILSKKEDVFAYLAKYSVPMVRATWLIKMTCAYYSAISEAKIKKRQAPDPN 184
            ||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 KKELPLAKSGVPQVPILSKKEDVFAYLAKYSVPMVRATWLIKMTCAYYSAISEAKIKKRQAPDPN 195

Human   185 LEWTQISTRYLREQLAKISDFYHMASSTGDGPVPVPPEVEQAMKQWEYNEKLAFHMFQEGMLEKH 249
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 LEWTQISTRYLREQLVKISDFYHMASSTGDGPVPVPPEVEQAMKQWEYNEKLAFHMFQEGMLEKH 260

Human   250 EYLTWILDVLEKIRPMDDDLLKLLLPLMLQYSDEFVQSAYLSRRLAYFCARRLSLLLSDSPNLLA 314
            |||:|||||||||||:||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 EYLSWILDVLEKIRPVDDSLLKLLLPLMLQYSDEFVQSAYLSRRLAYFCARRLSLLLSDSPNLLA 325

Human   315 AHSPHMMIGPNNSSIGAPSPGPPGPGMSPVQLAFSDFLSCAQHGPLVYGLSCMLQTVTLCCPSAL 379
            ||||||:||.||:|||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 AHSPHMIIGANNTSIGTPSPGTPGPGMSPVQLAFSDFLSCAQHGPLVYGLSCMLQTVTLCCPSAL 390

Human   380 VWNYSTNENKSANPGSPLDLLQVAPSSLPMPGGNTAFNQQVRARIYEVEQQIKQRGRAVEVRWSF 444
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 VWNYSTNENKIANPGSPLDLLQVAPSSLPMPGGNTAFNQQVRARIYEVEQQIKQRGRAVEVRWSF 455

Human   445 DKCQESTAGVTISRVLHTLEVLDRHCFDRTDSSNSMETLYHKIFWANQNKDNQEVAPNDEAVVTL 509
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 DKCQESTAGVTISRVLHTLEVLDRHCFDRTDSSNSMETLYHKIFWANQNKDNQEVAPNDEAVVTL 520

Human   510 LCEWAVSCKRSGKHRAMAVAKLLEKRQAEIEAERCGESEVLDEKESISSSSLAGSSLPVFQNVLL 574
            |||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||:|||||||||||||||
  Rat   521 LCEWAVSCKRSGKHRAMAVAKLLEKRQAEVEAERCGESEVLDEKESISSASLAGSSLPVFQNVLL 585

Human   575 RFLDTQAPSLSDPNSECEKVEFVNLVLLFCEFIRHDVFSHDAYMCTLISRGDLSVTASTRPRSPV 639
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||.
  Rat   586 RFLDTQAPSLSDPNSECEKVEFVNLVLLFCEFIRHDVFSHDAYMCTLISRGDLSVTASTGLRSPA 650

Human   640 GENADEHYSKDHDVKMEEQSIMAHMGIDSGTTNIFDEVDKSDFKTDFGSEFPIFSPMPGESCENA 704
            |||:||||||||::||||.::|||||:.||||||||||||||||:|||||||||||||||||||.
  Rat   651 GENSDEHYSKDHEMKMEEHAVMAHMGLGSGTTNIFDEVDKSDFKSDFGSEFPIFSPMPGESCENI 715

Human   705 NTSLGRRMSVNCEKLVKREKPRELIFPSNYDLLRHLQYATHFPIPLDESSSHECNQRTILLYGVG 769
            |.||.||||.|.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   716 NPSLSRRMSGNGEKLGKREKPRELIFPSNYDLLRHLQYATHFPIPLDESSSHECNQRTILLYGVG 780

Human   770 KERDEARHQLKKITKDILKILNKKSTTETGVGDEGQKARKNKQETFPTLETVFTKLQLLSYFDQH 834
            ||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||
  Rat   781 KERDEARHQLKKITKDILKILNKKSTTESGVGDEGQKARKNKQEVFPTPENVFTKLQLLSYFDQH 845

Human   835 QVTSQISNNVLEQITSFASGTSYHLPLAHHIQLIFDLMEPALNINGLIDFAIQLLNELSVVEAEL 899
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   846 QVTSQISNNVLEQITSFASGTSYHLPLAHHIQLIFDLMEPALNINGLIDFAIQLLNELSVVEAEL 910

Human   900 LLKSSSLAGSYTTGLCVCIVAVLRRYHSCLILNPDQTAQVFEGLCGVVKHVVNPSECSSPERCIL 964
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   911 LLKSSSLAGSYTTGLCVCIVAVLRRYHSCLILNPDQTAQVFEGLCGVVKHVVNPSECSSPERCIL 975

Human   965 AYLYDLYVSCSHLRSKFGDLFSSACSKVKQTIYNNVMPANSNLRWDPDFMMDFIENPSARSINYS 1029
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   976 AYLYDLYVSCSHLRSKFGDLFSSACSKVKQTIYNNVMPANSNLRWDPDFMMDFIENPSARSINYS 1040

Human  1030 MLGKILSDNAANRYSFVCNTLMNVCMGHQDAGRINDIANFSSELTACCTVLSSEWLGVLKALCCS 1094
            ||||:|:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1041 MLGKVLNDNAANRYSFVCNTLMNVCMGHQDAGRINDIANFSSELTACCTVLSSEWLGVLKALCCS 1105

Human  1095 SNHVWGFNDVLCTVDVSDLSFHDSLATFIAILIARQCFSLEDVVQHVALPSLLAAACGDADAEPG 1159
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1106 SNHVWGFNDVLCTVDVSDLSFHDSLATFIAILIARQCFSLEDVVQHVALPSLLAAACGDADAEPG 1170

Human  1160 ARMTCRLLLHLFRAPQACFLPQATGKPFPGIRSSCDRHLLAAAHNSIEVGAVFAVLKAIMMLGDA 1224
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1171 ARMTCRLLLHLFRAPQACFFPQATGKPFPGIRSSCDRHLLAAAHNSIEVGAVFAVLKAIMMLGDA 1235

Human  1225 KIGNNSVSSLKNDDFTMRGLRCDGNADDIWTASQNPKSCGKSISIETANLREYARYVLRTICQQE 1289
            |||:|:|::|||:||:|||||.||:|:|.|..|||.|..||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1236 KIGSNNVNTLKNEDFSMRGLRRDGSAEDAWATSQNSKPYGKSISIETANLREYARYVLRTICQQE 1300

Human  1290 WVGEHCLKEPERLCTDKELILDPVLSNMQAQKLLQLICYPHGIKECTEGDNLQRQHIKRILQNLE 1354
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1301 WVGEHCLKEPERLCTDKELILDPVLSNMQAQKLLQLICYPHGIKECTEGDNLQRQHIKRILQNLE 1365

Human  1355 QWTLRQSWLELQLMIKQCLKDPGSGSVAEMNNLLDNIAKATIEVFQQSADL-NNSSNSGMSLFNP 1418
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||| ||:|:||||||||
  Rat  1366 QWTLRQSWLELQLMIKQCLKDPSSGSVAEMNNLLDNIAKATIEVFQQSADLNNNASSSGMSLFNP 1430

Human  1419 NSIGSADTSSTRQNGIKTFLSSSERRGVWLVAPLIARLPTSVQGRVLKAAGEELEKGQHLGSSSK 1483
            |:|||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1431 NTIGSVDPSSTRQNGIKTFLSSSERRGVWLVAPLIARLPTSVQGRVLKAAGEELEKGQHLGSSSK 1495

Human  1484 KERDRQKQKSMSLLSQQPFLSLVLTCLKGQDEQREGLLTSLQNQVNQILSNWREERYQDDIKARQ 1548
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
  Rat  1496 KERDRQKQKSMSLLSQQPFLSLVLTCLKGQDEQREGLLTSLQNQVNQILSNWREERYQDDTKARQ 1560

Human  1549 MMHEALQLRLNLVGGMFDTVQRSTQWTTDWALLLLQIITSGTVDMHTNNELFTTVLDMLGVLING 1613
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1561 MMHEALQLRLNLVGGMFDTVQRSTQGTTDWALLLLQIITSGTVDMHTNNELFTTVLDMLGVLING 1625

Human  1614 TLASDLSNASPGGSEENKRAYMNLVKKLKKELGDKRSESIDKVRQLLPLPKQTCDVITCEPMGSL 1678
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1626 TLASDLSTASPGGSEENKRAYMNLVKKLKKELGDKRSESIDKVRQLLPLPKQTCDVITCEPMGSL 1690

Human  1679 IDTKGNKIAGFDSIDKKQGLQVSTKQKVSPWDLFEGQKNPAPLSWAWFGTVRVDRRVIKYEEQHH 1743
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1691 IDTKGNKIAGFDSIDKKQGLQVSTKQKVSPWDLFEGQKNPAPLSWAWFGTVRVDRRVIKYEEQHH 1755

Human  1744 LLLYHTHPMPKPRSYYLQPLPLPPEEEEEEPTSPVSQEPERKSAELSDQGKTTTDEEKKTKGRKR 1808
            .||||||.|||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||.||:..|||||||||||
  Rat  1756 FLLYHTHTMPKPRSYYLEPLPLPPEEEEEEPTSPVSQEPERKSAELSDHGKSAADEEKKTKGRKR 1820

Human  1809 KTKSSSRVDEYPQSNIYRVPPNYSPISSQMMHHPQSTLWGYNLVGQPQQPGFFLQNQSLTPGGSR 1873
            |||||||:|||.|:||||:||||||:|||||||.|..|||||||.|||||.||||||||..||||
  Rat  1821 KTKSSSRIDEYQQTNIYRLPPNYSPMSSQMMHHTQPALWGYNLVSQPQQPSFFLQNQSLNAGGSR 1885

Human  1874 LDPAGSFVPTNTKQALSNMLQRRSGAMMQPPSLHAITSQQQLIQMKLL-----------QQQQQQ 1927
            |||||||||||||||||||||||||||:|||||||:||||||:|||||           ||||||
  Rat  1886 LDPAGSFVPTNTKQALSNMLQRRSGAMLQPPSLHAVTSQQQLLQMKLLQQQQQQQQQQQQQQQQQ 1950

Human  1928 RLLRQAQTRPFQQDFCNSAVSLLEDFDNIMGQPGDQAALFAAQARPSPQLPQYPGL-QQAQTMPQ 1991
            |||||||||||||                 ||||||||||.||||||||||||||| ||||||||
  Rat  1951 RLLRQAQTRPFQQ-----------------GQPGDQAALFTAQARPSPQLPQYPGLQQQAQTMPQ 1998

Human  1992 GYTMYGTQMPLQQTSQQQAGSVVLSPSYNSRAYPAAHSNPVLMERLRQIQQQPSGYVQQQASPYL 2056
            |||||||||||||.:|||.|.|||||||:|||||||||:|.|||||||:||||.|||||||||||
  Rat  1999 GYTMYGTQMPLQQAAQQQPGGVVLSPSYSSRAYPAAHSSPALMERLRQLQQQPGGYVQQQASPYL 2063

Human  2057 QPLTGSQRLNHQALQQSPLVGGGIDAVLTSAHPNLPSVPLPQDPMRPRQPQVRQQQRLLQMQQPQ 2121
            ||:.||||||||||||||||||.||||||.||||||||||.||||||||.|||||||||||||||
  Rat  2064 QPVAGSQRLNHQALQQSPLVGGAIDAVLTPAHPNLPSVPLAQDPMRPRQQQVRQQQRLLQMQQPQ 2128

Human  2122 Q-PQPQQPPQPQQSSQSQSQTLGLQAMQPQQPLFPRQGLQQTQQQQQTAALVRQLQKQLSSNQPQ 2185
            | ||||||.||      |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2129 QAPQPQQPSQP------QSQALGLQAMQPQQPLFPRQGLQQTQQQQQTAALVRQLQKQLSSNQPQ 2187

Human  2186 QGVTPYGHPSHF 2197
            |||||..|||||
  Rat  2188 QGVTPCAHPSHF 2199

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MED12LXP_016861165.1 Med12 106..161 CDD:462818 53/65 (82%)
Med12-LCEWAV 283..765 CDD:463472 455/481 (95%)
Med12-PQL 1837..2071 CDD:463471 194/245 (79%)
Med12lXP_038959614.1 Med12 106..172 CDD:462818 53/65 (82%)
Med12-LCEWAV 294..776 CDD:463472 455/481 (95%)
Med12-PQL 1849..2078 CDD:463471 194/245 (79%)

Return to query results.
Submit another query.