DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MED12L and med12

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_016861165.1 Gene:MED12L / 116931 HGNCID:16050 Length:2197 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_012824460.1 Gene:med12 / 100495585 XenbaseID:XB-GENE-985871 Length:2221 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:2300 Identity:1331/2300 - (57%)
Similarity:1627/2300 - (70%) Gaps:232/2300 - (10%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MAAFGLLSYEQRPLKRPRLGPPDVYPQDPKQKEDELTAVNVKQGFNNQPAFTGDEHGSARNIVIN 65
            |||||:||||.|||||||||||||||||.|||||||||:|||||||||||.:.||||||:|:..|
 Frog    44 MAAFGILSYEHRPLKRPRLGPPDVYPQDAKQKEDELTALNVKQGFNNQPAVSADEHGSAKNVNFN 108

Human    66 PSKIGAYFSSILAEKLKLNTFQDTGKKKPQVNAKDNYWLVTARSQSAIHSWFSDLAGNKPLSILA 130
            |:||.:.||||::|||:.||..|||::|||||.|||:.|||.|:||:|::|||||||.|||:.||
 Frog   109 PAKISSNFSSIMSEKLRCNTLPDTGRRKPQVNQKDNFMLVTVRTQSSINTWFSDLAGTKPLTHLA 173

Human   131 KKVPILSKKEDVFAYLAKYSVPMVRATWLIKMTCAYYSAISEAKIKKRQAPDPNLEWTQISTRYL 195
            |||||..|||:||.:||::|||::||.||||||||||:||:|.|:|||...||.:|||||.||||
 Frog   174 KKVPIFGKKEEVFGFLARFSVPVMRAAWLIKMTCAYYAAITETKVKKRHVMDPIIEWTQIITRYL 238

Human   196 REQLAKISDFYHMASSTGDGPV-PVPPEVEQAMKQWEYNEKLAFHMFQEGMLEKHEYLTWILDVL 259
            .|||.||:|:|..|......|. |:|||||.|:||||||||||..|||:|||::||:|||:|:..
 Frog   239 WEQLQKIADYYRPALGGCSSPSGPMPPEVEVALKQWEYNEKLALFMFQDGMLDRHEFLTWVLECF 303

Human   260 EKIRPMDDDLLKLLLPLMLQYSDEFVQSAYLSRRLAYFCARRLSLLLSDSPNLLAAHSPHMMIGP 324
            ||||..:|:||||||||:|:||:..||||||||||||||.|||:.||..|    .:|..|:|...
 Frog   304 EKIRQGEDELLKLLLPLLLRYSNSLVQSAYLSRRLAYFCTRRLAQLLEGS----GSHPGHLMTAQ 364

Human   325 NNSSIGAPSPGPPGPGMSPVQLAFSDFLSCAQHGPLVYGLSCMLQTVTLCCPSALVWNYSTNENK 389
            ..::: .|:|.||.|..|.....|||.|.|.||.|||:|||||||::.|||||||||:||..:|:
 Frog   365 TGTAL-PPAPAPPPPSGSAPSSPFSDLLQCPQHRPLVFGLSCMLQSIVLCCPSALVWHYSLTDNR 428

Human   390 SANPGSPLDLLQVAPSSLPMPGGNTAFNQQVRARIYEVEQQIKQRGRAVEVRWSFDKCQESTAGV 454
             ...|||||.|.:||||||||||::||.||||.::.::|||||:|||:||||||||||||:|||.
 Frog   429 -IKTGSPLDHLPIAPSSLPMPGGSSAFTQQVRRKLRDMEQQIKERGRSVEVRWSFDKCQEATAGF 492

Human   455 TISRVLHTLEVLDRHCFDRTDSSNSMETLYHKIFWANQNKDNQEVAPNDEAVVTLLCEWAVSCKR 519
            .|.||||||||||.|.|:::|.||::::||::||.....||..|::|:|:|||||||||||||||
 Frog   493 PIGRVLHTLEVLDSHSFEKSDFSNNLDSLYNRIFGLGLGKDGHEISPDDDAVVTLLCEWAVSCKR 557

Human   520 SGKHRAMAVAKLLEKRQAEIEAERCGESEVLDEKESISSSSLAG-SSLPVFQNVLLRFLDTQAPS 583
            .|.|||:.||||||||||||||||||:||.:|||.|:||.||:. |:.||||.|||:|||||||.
 Frog   558 YGHHRALVVAKLLEKRQAEIEAERCGDSEAVDEKGSVSSGSLSALSAPPVFQEVLLQFLDTQAPM 622

Human   584 LSDPNSECEKVEFVNLVLLFCEFIRHDVFSHDAYMCTLISRGDLSVTA-STRPRSPVGENADEHY 647
            |:||.:|.|:|||.||||||||.||||||||:.|||||||||||.:.. :.|||||..:.:|:..
 Frog   623 LTDPANESERVEFYNLVLLFCELIRHDVFSHNMYMCTLISRGDLGIDPHAPRPRSPYEDPSDDTD 687

Human   648 SKDHD----VKMEEQSIMAHMGIDSGTTNIFDEVDKSDFKTDFGSEFPIFSP-------MPGESC 701
            .|:.:    :|:|:.::...|.||.|:..:|::::|        ||||:|||       .||.  
 Frog   688 RKEGEANSSIKLEDTTLSETMDIDHGSGALFEDMEK--------SEFPMFSPAMRCEGRSPGP-- 742

Human   702 ENANTSLGRRMSVNCEKLVKREKPRELIFPSNYDLLRHLQYATHFPIPLDESSSHECNQRTILLY 766
            |:.:..:.|.:     |.:..|.|...:    ||..||:|||||||||.:||.|||||||.::||
 Frog   743 EDGDRDIRRTV-----KGLNGEGPLSAL----YDQPRHIQYATHFPIPQEESCSHECNQRLVVLY 798

Human   767 GVGKERDEARHQLKKITKDILKILNKKSTTETG----VG---------------------DEGQK 806
            |||::||:|||.:|:||:||||:||:|||:|||    :|                     ||||:
 Frog   799 GVGRQRDDARHIIKRITRDILKVLNRKSTSETGKVVVMGKVKQIEKQVNVPKLTLSPCGTDEGQR 863

Human   807 ARKNKQETFPTLETVFTKLQLLSYFDQHQVTSQISNNVLEQITSFASGTSYHLPLAHHIQLIFDL 871
            .|:.|.|.|||.|.:|.:.|.||:|||||||:|:|.||||||||||.|.||||||..|||.||||
 Frog   864 RRRAKPEAFPTAEEIFCRFQQLSHFDQHQVTAQVSRNVLEQITSFALGLSYHLPLVQHIQFIFDL 928

Human   872 MEPALNINGLIDFAIQLLNELSVVEAELLLKSSSLAGSYTTGLCVCIVAVLRRYHSCLILNPDQT 936
            ||.:|||:|||||||||||||||||||||||||||.||||.|||:|||||||.||:|||||.:||
 Frog   929 MEYSLNISGLIDFAIQLLNELSVVEAELLLKSSSLVGSYTMGLCLCIVAVLRHYHTCLILNQEQT 993

Human   937 AQVFEGLCGVVKHVVNPSECSSPERCILAYLYDLYVSCSHLRSKFGDLFSSACSKVKQTIYNNVM 1001
            |||||||||||||.:|.|:.||.||||||||||||.|||||:||||:|||..|||||.|||.||.
 Frog   994 AQVFEGLCGVVKHGMNRSDGSSAERCILAYLYDLYTSCSHLKSKFGELFSDFCSKVKNTIYCNVE 1058

Human  1002 PANSNLRWDPDFMMDFIENPSARSINYSMLGKILSDNAANRYSFVCNTLMNVCMGHQDAGRINDI 1066
            |::||:.|:.:||:|.|.|||..|:|..||||:|||:..||||||||.|::||.|..|..|:|||
 Frog  1059 PSDSNMLWEQEFMLDTIINPSGHSVNCGMLGKLLSDSPTNRYSFVCNALVHVCAGDHDTDRVNDI 1123

Human  1067 ANFSSELTACCTVLSSEWLGVLKALCCSSNH-VWGFNDVLCTVDVSDLSFHDSLATFIAILIARQ 1130
            |...:|||..|..|||||||||||||||||: ..||||:||.|||||||||||||||:|||:|||
 Frog  1124 AILCAELTGSCKALSSEWLGVLKALCCSSNNGTCGFNDLLCNVDVSDLSFHDSLATFVAILVARQ 1188

Human  1131 CFSLEDVVQHVALPSLLAAACGDADAEPGARMTCRLLLHLFRAPQACFLPQATGKPFPGIRSSCD 1195
            |..|||:::..|:||||.|||.:.|:|.|||:|||:|||||:.||.........||..|||||||
 Frog  1189 CLLLEDLIRCAAIPSLLNAACSEQDSEAGARLTCRILLHLFKTPQLNPCEPDGSKPTVGIRSSCD 1253

Human  1196 RHLLAAAHNSIEVGAVFAVLKAIMMLGDAKIGNNSVSSLKNDDFTMRGLRCDGNADDIWTASQNP 1260
            ||||||:.|.|..|||||||||:.:||||::..:..|.....|        :.:.:||.|.    
 Frog  1254 RHLLAASQNRIVDGAVFAVLKAVFVLGDAELRGSGFSHPTGTD--------NASEEDIATR---- 1306

Human  1261 KSCGKSISIETANLREYARYVLRTICQQEWVGEHCLKEPERLCTDKELILDPVLSNMQAQKLLQL 1325
            ::.|:.:|||||:|.|||:||||:|||||||||.|::.   ||.|...:.|||||:.|||:|:||
 Frog  1307 RAGGRPVSIETASLDEYAKYVLRSICQQEWVGERCVRS---LCEDSNDLQDPVLSSAQAQRLMQL 1368

Human  1326 ICYPHGIKECTEGDNLQRQHIKRILQNLEQWTLRQSWLELQLMIKQCLKDPGSGSVAEMNNLLDN 1390
            |||||.:.:..:|||.|||.||.|||||:|||:|||.|||||||||   .|.:    |||:||:|
 Frog  1369 ICYPHRLNDTEQGDNPQRQRIKHILQNLDQWTMRQSALELQLMIKQ---TPSN----EMNSLLEN 1426

Human  1391 IAKATIEVFQQSADLNNSSNSGMSLFNPNSIGSADTSSTRQNG-IKTFLSSSERRGVWLVAPLIA 1454
            |||||||||||||:     |:..:..|..::.:|.:|:...|. .|..|||.||.|.||||||||
 Frog  1427 IAKATIEVFQQSAE-----NACAAPANSAALSNATSSNAPPNSKTKPVLSSLERSGAWLVAPLIA 1486

Human  1455 RLPTSVQGRVLKAAGEELEKGQHLGSSSKKERDRQKQKSMSLLSQQPFLSLVLTCLKGQDEQREG 1519
            :|||||||.|||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  1487 KLPTSVQGHVLKAAGEELEKGQHLGSSSRKERDRQKQKSMSLLSQQPFLSLVLTCLKGQDEQREG 1551

Human  1520 LLTSLQNQVNQILSNWREERYQDDIKARQMMHEALQLRLNLVGGMFDTVQRSTQWTTDWALLLLQ 1584
            |||||..||.||:|||||::||||.|..|::|:.|:||||||||||||||||||.||:||:|||.
 Frog  1552 LLTSLYGQVQQIVSNWREDQYQDDCKTPQLLHDVLKLRLNLVGGMFDTVQRSTQQTTEWAVLLLD 1616

Human  1585 IITSGTVDMHTNNELFTTVLDMLGVLINGTLASDLSNASPGGSEENKRAYMNLVKKLKKELGDKR 1649
            ||:||||||.:||||||||||||.||||||||:|:|:.|.|..||||||||||||||:|||||::
 Frog  1617 IISSGTVDMQSNNELFTTVLDMLSVLINGTLAADMSSISQGSMEENKRAYMNLVKKLRKELGDRQ 1681

Human  1650 SESIDKVRQLLPLPKQTCDVITCEPMGSLIDTKGNKIAGFDSIDKKQGLQVSTKQKVSPWDLFEG 1714
            |||::||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||.||:|||||||||:||||||||
 Frog  1682 SESLEKVRQLLPLPKQTRDVITCEPQGSLIDTKGNKIAGFDSIFKKEGLQVSTKQKISPWDLFEG 1746

Human  1715 QKNPAPLSWAWFGTVRVDRRVIKYEEQHHLLLYHTHPMPKPRSYYLQPLPLPPEEEEEEPTSPVS 1779
            .|..|||||.|||||||||||.:.|||..|||||||..||||||||:.|||||  |:|||.:|.|
 Frog  1747 IKQSAPLSWGWFGTVRVDRRVSRMEEQQRLLLYHTHLKPKPRSYYLENLPLPP--EDEEPPTPTS 1809

Human  1780 QEPERKSAEL--SDQ----GKTTTDEEK---KTKGRKRKTKSSSRVDEYPQSNIYRVPPNYSPIS 1835
            .||::|.:|.  .|:    |.|.||:.|   |.|..|::..:.|:|:|:|...  ..|..|..:.
 Frog  1810 TEPDKKLSEALKVDKSGVGGTTNTDDRKKPSKPKREKKRNMAPSKVEEFPLGP--GRPGPYGMVP 1872

Human  1836 SQMMHHPQSTLWGYNLVGQPQQP----GFFLQNQSLTPGGSRLDPAGSFVPTNTKQAL------- 1889
            :.::|        ....|..:.|    ..:.|||.|.|||.|||  .|:.|  |:.|:       
 Frog  1873 TDLLH--------TQAAGMSRLPYATQNMYAQNQPLPPGGPRLD--NSYRP--TRMAMVKVPARP 1925

Human  1890 --------SNMLQRRSGAMMQPPSLHAITSQQQLIQMKLLQQQQQQRLLRQAQTRPFQQDFCNSA 1946
                    :.|:......|.:|        |..:.|.:||:||.|.:|.:               
 Frog  1926 QYVSGVPQAGMMDSYKPVMYRP--------QPPIPQGQLLRQQLQAKLAQ--------------- 1967

Human  1947 VSLLEDFDNIMGQPGDQAALFAAQARPSPQLPQYPGLQQAQTMPQGYTMYGTQMPLQQ-TSQQQA 2010
                    .:|.||          .|...|.|.|..:|     |||||.||:.|.||| ....||
 Frog  1968 --------GMMPQP----------VRQMSQTPSYGSMQ-----PQGYTSYGSHMTLQQHPPPSQA 2009

Human  2011 GSVVLSPSYNSRAYPAA--HSNPVLMERLRQIQQQPSGYVQQQASPYLQPLTGSQRLNHQALQQS 2073
            |::| .|.|:::.||.:  .|...|::.:||:||:|||||.||||.:....:..||..||.:.|:
 Frog  2010 GALV-PPPYSTQQYPGSLPPSGGALLDPVRQMQQRPSGYVHQQASGFSHSASAGQRFPHQQITQT 2073

Human  2074 ---PLVGGGIDAVLTSA-HPNLPSVPLPQDPMRPRQPQVRQQQRLLQMQQPQQPQ---------- 2124
               |.:|......:|.| .|.|    ||:...:.:|.|..:||::|:.||.||.|          
 Frog  2074 GMMPSMGHLTTQPVTGAIRPQL----LPEQQQQQQQQQYLRQQQILRQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 2134

Human  2125 -----------------PQQPPQ-----PQQSSQSQSQTLGLQAMQPQQPLFPRQGLQQTQQQQQ 2167
                             ||.|||     ||..:|.|...||:|.:|     |.||||||||||||
 Frog  2135 QQQQQQQNQAPPQQQAPPQPPPQQVPTVPQPQTQGQPPGLGMQTLQ-----FQRQGLQQTQQQQQ 2194

Human  2168 TAALVRQLQKQLSSNQPQQGVTPYG 2192
            |||||||||:||||.||||...|:|
 Frog  2195 TAALVRQLQQQLSSTQPQQNSNPFG 2219

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MED12LXP_016861165.1 Med12 106..161 CDD:462818 36/54 (67%)
Med12-LCEWAV 283..765 CDD:463472 276/494 (56%)
Med12-PQL 1837..2071 CDD:463471 74/255 (29%)
med12XP_012824460.1 Med12 148..204 CDD:462818 37/55 (67%)
Med12-LCEWAV 329..797 CDD:463472 276/492 (56%)
Med12-PQL 1874..2070 CDD:463471 74/254 (29%)

Return to query results.
Submit another query.