DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment LYST and Lyst

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_011542333.1 Gene:LYST / 1130 HGNCID:1968 Length:3855 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_445970.2 Gene:Lyst / 85419 RGDID:621837 Length:3788 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:3855 Identity:3254/3855 - (84%)
Similarity:3507/3855 - (90%) Gaps:67/3855 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MSTDSNSLAREFLTDVNRLCNAVVQRVEAREEEEEETHMATLGQYLVHGRGFLLLTKLNSIIDQA 65
            |||||||||||||.|||:||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MSTDSNSLAREFLIDVNQLCNAVVQRAEAREEEEEETHMATLGQYLVHGRGFLLLTKLNSIIDQA 65

Human    66 LTCREELLTLLLSLLPLVWKIPVQEEKATDFNLPLSADIILTKEKNSSSQRSTQEKLHLEGSALS 130
            |||||||||||||||||||||||||.:|||||||||:||||||||||:.|:|||.||:|||||.:
  Rat    66 LTCREELLTLLLSLLPLVWKIPVQEHQATDFNLPLSSDIILTKEKNSNLQKSTQGKLYLEGSAPA 130

Human   131 SQVSAKVNVFRKSRRQRKITHRYSVRDARKTQLSTSDSEANSDEKGIAMNKHRRPHLLHHFLTSF 195
            ||||||||:|||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||...:.||||.|.|...||..
  Rat   131 SQVSAKVNLFRKIRRQRKSTHRYSVRDARKTQLSTSDSEGNSDEKNTVVRKHRRFHTLPRLLTES 195

Human   196 PKQDHPKAKLDRLATKEQTPPDAMALENSREIIPRQGSNTDILSEPAALSVISNMNNSPFDLCHV 260
            ||:||..||||..|||||...|.|:||||||:|.||.||.||||||||||::|||||||||||||
  Rat   196 PKEDHFVAKLDPSATKEQVLSDTMSLENSREVILRQDSNGDILSEPAALSILSNMNNSPFDLCHV 260

Human   261 LLSLLEKVCKFDVTLNHNSPLAASVVPTLTEFLAGFGDCCSLSDNLESRVVSAGWTEEPVALIQR 325
            ||||||||||||:.|||||.||.|||||||||||||||||:.||.||.::||||||||||||:||
  Rat   261 LLSLLEKVCKFDIALNHNSSLALSVVPTLTEFLAGFGDCCNQSDTLERQLVSAGWTEEPVALVQR 325

Human   326 MLFRTVLHLLSVDVSTAEMMPENLRKNLTELLRAALKIRICLEKQPDPFAPRQKKTLQEVQEDFV 390
            |||||||||:||||||||.|||:||||||||||||||||.|||||||||:|||||||||:||.||
  Rat   326 MLFRTVLHLMSVDVSTAEAMPESLRKNLTELLRAALKIRACLEKQPDPFSPRQKKTLQEIQEGFV 390

Human   391 FSKYRHRALLLPELLEGVLQILICCLQSAASNPFYFSQAMDLVQEFIQHHGFNLFETAVLQMEWL 455
            ||||.|||||||||||||||:||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
  Rat   391 FSKYLHRALLLPELLEGVLQLLISCLQSAASNPFYFSQAMDLVQEFIQHQGFNLFETAVLQMEWL 455

Human   456 VLRDGVPPEASEHLKALINSVMKIMSTVKKVKSEQLHHSMCTRKRHRRCEYSHFMHHHRDLSGLL 520
            :.||.||.||:||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
  Rat   456 LSRDAVPSEAAEHLKALINSVIKIMSTVKKVKSEQLHHSMCTRKRHRRCEYSHFMQHHRDLSGLL 520

Human   521 VSAFKNQVSKNPFEETADGDVYYPERCCCIAVCAHQCLRLLQQASLSSTCVQILSGVHNIGICCC 585
            |||||||:|::||||||:|||.|||||||||||||||||||||.||.:||:|||||||::|||||
  Rat   521 VSAFKNQLSESPFEETAEGDVQYPERCCCIAVCAHQCLRLLQQVSLQTTCIQILSGVHSVGICCC 585

Human   586 MDPKSVIIPLLHAFKLPALKNFQQHILNILNKLILDQLGGAEISPKIKKAACNICTVDSDQLAQL 650
            |||||||:||||||||||||||||||||:|:||:||||||||||.:|||||||||||||||||:|
  Rat   586 MDPKSVIVPLLHAFKLPALKNFQQHILNVLSKLLLDQLGGAEISQQIKKAACNICTVDSDQLAKL 650

Human   651 EETLQGNLCDAELSSSLSSPSYRFQGILPSSGSEDLLWKWDALKAYQNFVFEEDRLHSIQIANHI 715
            .|||||.||.|..|..|.|||||||||||||||||.|||||||:|||||:|:|||||:.|||:||
  Rat   651 GETLQGTLCGAGPSCGLPSPSYRFQGILPSSGSEDFLWKWDALEAYQNFIFQEDRLHNTQIASHI 715

Human   716 CNLIQKGNIVVQWKLYNYIFNPVLQRGVELAHHCQHLSVTSAQSHVCSHHNQCLPQDVLQIYVKT 780
            ||||||||::||||||||||||||||||||.||||.||:||||:|:.|...|.|||:|||||:||
  Rat   716 CNLIQKGNVIVQWKLYNYIFNPVLQRGVELVHHCQQLSITSAQTHMSSQLKQYLPQEVLQIYLKT 780

Human   781 LPILLKSRVIRDLFLSCNGVSQIIELNCLNGIRSHSLKAFETLIISLGEQQKDASVPDIDGIDIE 845
            ||||||||||||||||||||:||||||.|:||||||||||||||:|||||||.|:||.:||:||:
  Rat   781 LPILLKSRVIRDLFLSCNGVNQIIELNYLDGIRSHSLKAFETLIVSLGEQQKRAAVPGVDGLDIQ 845

Human   846 QKELSSVHVGTSFHHQQAYSDSPQSLSKFYAGLKEAYPKRRKTVNQDVHINTINLFLCVAFLCVS 910
            | ||||:.||.|.|.|||.:|||.||.||||.|::..||:||||:||.|||||||||||||||||
  Rat   846 Q-ELSSLSVGPSLHKQQASTDSPCSLRKFYASLRDTDPKKRKTVHQDAHINTINLFLCVAFLCVS 909

Human   911 KEAESDRESANDSEDTSGYDSTASEPLSHMLPCISLESLVLPSPEHMHQAADIWSMCRWIYMLSS 975
            |||:|||||||:||||||||||||||||||||.:|||::||||||.:|.||||||||||||||:|
  Rat   910 KEADSDRESANESEDTSGYDSTASEPLSHMLPRLSLENVVLPSPECLHHAADIWSMCRWIYMLNS 974

Human   976 VFQKQFYRLGGFRVCHKLIFMIIQKLFRSHKEEQGKKEGDTSVNENQDLNRISQPKRTMKEDLLS 1040
            ||||||:|||||:|||:|||||||||||||.|:||:::|:.|||:||.|.|||||:..:|||   
  Rat   975 VFQKQFHRLGGFQVCHELIFMIIQKLFRSHTEDQGRRQGEMSVNKNQGLMRISQPEMILKED--- 1036

Human  1041 LAIKSDPIPSELGSLKKSADSLGKLELQHISSINVEEVSATEAAPEEAKLFTSQESETSLQSIRL 1105
              :.|...| |.|.||||||.:.:||.||:...:.|::.||::.|.|||.|.:|||||.||||||
  Rat  1037 --VSSSTAP-EPGFLKKSADRVSELESQHMLPTSAEQILATKSIPGEAKTFMNQESETCLQSIRL 1098

Human  1106 LEALLAICLHGARTSQQKMELELPNQNLSVESILFEMRDHLSQSKVIETQLAKPLFDALLRVALG 1170
            ||:|||||||.||.||||||||||:|:||:|:||.|:|||||||||.||:|||||||||||||||
  Rat  1099 LESLLAICLHSARASQQKMELELPSQSLSLENILCELRDHLSQSKVAETELAKPLFDALLRVALG 1163

Human  1171 NYSADFEHNDAMTEKSHQSAEELSSQPGDFSEEAEDSQCCSFKLLVEEEGYEADSESNPEDGETQ 1235
            |:|||.:..|.:|||||.| |||.|||||||||.||||||:.|||.|||||||||||||||||||
  Rat  1164 NHSADLDPGDTVTEKSHPS-EELLSQPGDFSEETEDSQCCNLKLLGEEEGYEADSESNPEDGETQ 1227

Human  1236 DDGVDLKSETEGFSASSSPNDLLENLTQGEIIYPEICMLELNLLSASKAKLDVLAHVFESFLKII 1300
            ||||:| .|.||||.|..||:|||:||.|||||||||:|.|||||.||||||||||||||||||.
  Rat  1228 DDGVEL-PEAEGFSGSIVPNNLLESLTHGEIIYPEICILGLNLLSGSKAKLDVLAHVFESFLKIA 1291

Human  1301 RQKEKNVFLLMQQGTVKNLLGGFLSILTQDDSDFQACQRVLVDLLVSLMSSRTCSEELTLLLRIF 1365
            ||||||:.|||||||||.||||||::|||.:|||||||||||||||||||||..||:||||||||
  Rat  1292 RQKEKNISLLMQQGTVKILLGGFLNVLTQTNSDFQACQRVLVDLLVSLMSSRMSSEDLTLLLRIF 1356

Human  1366 LEKSPCTKILLLGILKIIESDTTMSPSQYLTFPLLHAPNLSNGVSSQKYPGILNSKAMGLLRRAR 1430
            |||||||:|||.||.||:|||.||||||||||||||.|:|||||||||.||||||||:|||||||
  Rat  1357 LEKSPCTEILLHGIQKIVESDFTMSPSQYLTFPLLHTPSLSNGVSSQKPPGILNSKALGLLRRAR 1421

Human  1431 VSRSKKEADRESFPHRLLSSWHIAPVHLPLLGQNCWPHLSEGFSVSLWFNVECIHEAESTTEKGK 1495
            :||.||||||||||:||||||:|||:||||||||||||||||||||||||||.|||:||..|:||
  Rat  1422 ISRGKKEADRESFPYRLLSSWYIAPIHLPLLGQNCWPHLSEGFSVSLWFNVEYIHESESAAERGK 1486

Human  1496 KIKKRNKSLILPDSSFDGTESDRPEGAEYINPGERLIEEGCIHIISLGSKALMIQVWADPHNATL 1560
            |:|||||..:|.||||:..|.||||..|.|:|.:||||:||||:|||||||||||||||||:.|.
  Rat  1487 KVKKRNKPSVLEDSSFERAEGDRPEVTESISPSDRLIEDGCIHLISLGSKALMIQVWADPHSGTF 1551

Human  1561 IFRVCMDSNDDMKAVLLAQVESQENIFLPSKWQHLVLTYLQQPQGKRRIHGKISIWVSGQRKPDV 1625
            |||||:|||||||||.|||||||||||.||.||||:|||:|.||||:.:||:||||||||||.||
  Rat  1552 IFRVCVDSNDDMKAVTLAQVESQENIFFPSSWQHLILTYIQHPQGKKNVHGEISIWVSGQRKTDV 1616

Human  1626 TLDFMLPRKTSLSSDSNKTFCMIGHCLSSQEEFLQLAGKWDLGNLLLFNGAKVGSQEAFYLYACG 1690
            .|||:||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||:||||||||||||
  Rat  1617 ILDFVLPRKTSLSSDSNKTFCMIGHCLTSQEEFLQLAGKWDLGNLLLFNGAKIGSQEAFYLYACG 1681

Human  1691 PNHTSVMPCKYGKPVNDYSKYINKEILRCEQIRELFMTKKDVDIGLLIESLSVVYTTYCPAQYTI 1755
            ||:||:|||||||||.|||||||||||||::||:|||||||||:|||||||||||||||||||||
  Rat  1682 PNYTSIMPCKYGKPVVDYSKYINKEILRCDEIRDLFMTKKDVDVGLLIESLSVVYTTYCPAQYTI 1746

Human  1756 YEPVIRLKGQMKTQLSQRPFSSKEVQSILLEPHHLKNLQPTEYKTIQGILHEIGGTGIFVFLFAR 1820
            ||||||||||:|||||||||||||.|||||||..||:|||||.||||||||||||.|||||||||
  Rat  1747 YEPVIRLKGQVKTQLSQRPFSSKEAQSILLEPSQLKSLQPTECKTIQGILHEIGGAGIFVFLFAR 1811

Human  1821 VVELSSCEETQALALRVILSLIKYNQQRVHELENCNGLSMIHQVLIKQKCIVGFYILKTLLEGCC 1885
            ||||||||||||||||:|||||||:|||.||||||||||||||||:||||:|||:||||||||||
  Rat  1812 VVELSSCEETQALALRIILSLIKYSQQRTHELENCNGLSMIHQVLVKQKCVVGFHILKTLLEGCC 1876

Human  1886 GEDIIYMNENGEFKLDVDSNAIIQDVKLLEELLLDWKIWSKAEQGVWETLLAALEVLIRADHHQQ 1950
            ||::|::||:|||||||:|:|||||||||:|||||||||:|||||||||||||||||||.:|.||
  Rat  1877 GEEVIFVNEHGEFKLDVESHAIIQDVKLLQELLLDWKIWNKAEQGVWETLLAALEVLIRVEHQQQ 1941

Human  1951 MFNIKQLLKAQVVHHFLLTCQVLQEYKEGQLTPMPREVCRSFVKIIAEVLGSPPDLELLTIIFNF 2015
            .|||.|||.|:||||||||||||||::|||||.||||||||||||||||||||||||||::||||
  Rat  1942 QFNITQLLNARVVHHFLLTCQVLQEHREGQLTSMPREVCRSFVKIIAEVLGSPPDLELLSVIFNF 2006

Human  2016 LLAVHPPTNTYVCHNPTNFYFSLHIDGKIFQEKVRSIMYLRHSSSGGRSLMSPGFMVISPSGFTA 2080
            ||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||:|..||||||||||.|||
  Rat  2007 LLAVHPPTNTYVCHNPANFYFSLHIDGKIFHEKVRSIMYLRHSSSGGQSFPSPGFMVISPSAFTA 2071

Human  2081 SPYEGENSSNIIPQQMAAHMLRSRSLPAFPTSSLLTQSQKLTGSLGCSIDRLQNIADTYVATQSK 2145
            ||.||.:||||:||:|||.|:||||||||||.|.|.|:|||.|||..|:|:||||||    ...:
  Rat  2072 SPPEGTSSSNIVPQRMAAQMVRSRSLPAFPTYSPLMQAQKLAGSLVFSVDKLQNIAD----ASPE 2132

Human  2146 KQNSLGSSDTLKKGKEDAFISSCESAKTVCEMEAVLSAQVSVSDVPKGVLGFPVVKADHKQLGAE 2210
            |:|.|||..||||.||:|||||||||||||||||.|:||.|.:.|.:|.|.||:.:.|||.||.|
  Rat  2133 KRNPLGSPYTLKKSKEEAFISSCESAKTVCEMEAFLAAQASANGVSRGSLRFPMARIDHKDLGTE 2197

Human  2211 PRSEDDSPGDESCPRRPDYLKGLASFQRSHSTIASLGLAFPSQNGSAAVGRWPSLVDRNTDDWEN 2275
            .||:||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||...|||||||||.|||||
  Rat  2198 HRSDDDSPGDESYPRRPDNLKGLASFQRSHSTIASLGLAFPSQNGSAVASRWPSLVDRNADDWEN 2262

Human  2276 FAYSLGYEPNYNRTASAHSVTEDCLVPICCGLYELLSGVLLILPDVLLEDVMDKLIQADTLLVLV 2340
            |.:|..||.||||..|.||..||||:|||||.|||||||||:|||.:||||||::||||.|||||
  Rat  2263 FTFSPAYEANYNRATSTHSAIEDCLIPICCGFYELLSGVLLVLPDAMLEDVMDRIIQADILLVLV 2327

Human  2341 NHPSPAIQQGVIKLLDAYFARASKEQKDKFLKNRGFSLLANQLYLHRGTQELLECFIEMFFGRHI 2405
            |||||||||||||||.||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..
  Rat  2328 NHPSPAIQQGVIKLLQAYINRASKEQKDKFLKNRGFSLLANQLYLHRGTQELLECFIEMFFGRPF 2392

Human  2406 GLDEEFDLEDVRNMGLFQKWSVIPILGLIETSLYDNILLHNALLLLLQILNSCSKVADMLLDNGL 2470
            ||||||||:::::|.||||||||||||||||||||||||||:||||||:||||||||||||||||
  Rat  2393 GLDEEFDLDEMKHMELFQKWSVIPILGLIETSLYDNILLHNSLLLLLQVLNSCSKVADMLLDNGL 2457

Human  2471 LYVLCNTVAALNGLEKNIPMSEYKLLACDIQQLFIAVTIHACSSSGSQYFRVIEDLIVMLGYLQN 2535
            |||||||||||||||||||::|::||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||.|
  Rat  2458 LYVLCNTVAALNGLEKNIPLNEFRLLACDIQQLFIAVTIHACSSSGSQYFRVIEDLIVLLGYLHN 2522

Human  2536 SKNKRTQNMAVALQLRVLQAAMEFIRTTANHDSENLTDSLQSPSAPHHAVVQKRKSIAGSIPMKG 2600
            ||||||||||:||||:|||||:||||:|||||||:..|::|||||.||:|.|||:||        
  Rat  2523 SKNKRTQNMALALQLKVLQAALEFIRSTANHDSESPLDAVQSPSAYHHSVPQKRRSI-------- 2579

Human  2601 SIIPHLPRHHFGSYGQLPMPFSFGPLNQDSSPQFSPGCTTCVVPPGAGPRKFPLAQTESLLMKMR 2665
                                                          |||||||||||||||||||
  Rat  2580 ----------------------------------------------AGPRKFPLAQTESLLMKMR 2598

Human  2666 SVANDELHVMMQRRMSQENPSQATETELAQRLQRLTVLAVNRIIYQEFNSDIIDILRTPENVTQS 2730
            |||:||||.|||||||||:||||:|.|||||||||.:||||||||||.|||||||||||||.:||
  Rat  2599 SVASDELHSMMQRRMSQEHPSQASEAELAQRLQRLIILAVNRIIYQELNSDIIDILRTPENTSQS 2663

Human  2731 KTSVFQTEISEENIHHEQSSVFNPFQKEIFTYLVEGFKVSIGSSKASGSKQQWTKILWSCKETFR 2795
            ||||.|||.|||::|:||.||.||||||:||||::|||:||||||...|||||||||.|.|||.|
  Rat  2664 KTSVSQTETSEEDVHYEQPSVSNPFQKEMFTYLLDGFKISIGSSKTGTSKQQWTKILGSSKETLR 2728

Human  2796 MQLGRLLVHILSPAHAAQERKQIFEIVHEPNHQEILRDCLSPSLQHGAKLVLYLSELIHNHQGEL 2860
            :||||||.|||||.|..||||||.||||||.||:|||||||||.||||||||||||||||||.||
  Rat  2729 VQLGRLLAHILSPTHTVQERKQILEIVHEPAHQDILRDCLSPSPQHGAKLVLYLSELIHNHQDEL 2793

Human  2861 TEEELGTAELLMNALKLCGHKCIPPSASTKADLIKMIKEEQKKYETEEGVNKAAWQKTVNNNQQS 2925
            .|||:.|||||||||||||||||||||.:|.:|||:||||||||::||.|:|.||||||:|||||
  Rat  2794 NEEEMDTAELLMNALKLCGHKCIPPSAPSKPELIKIIKEEQKKYDSEESVSKVAWQKTVSNNQQS 2858

Human  2926 LFQRLDSKSKDISKIAADITQAVSLSQGNERKKVIQHIRGMYKVDLSASRHWQELIQQLTHDRAV 2990
            ||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2859 LFQRLDLKSKDISKIAADITQAVSLSQGLERKKVIQHIRGMYKVDLSASRHWQELIQQLTHDRAV 2923

Human  2991 WYDPIYYPTSWQLDPTEGPNRERRRLQRCYLTIPNKYLLRDRQKSEDVVKPPLSYLFEDKTHSSF 3055
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|:||||||||||||||||
  Rat  2924 WYDPIYYPTSWQLDPTEGPNRERRRLQRCYLTIPNKYLLRDRQKSEGVLKPPLSYLFEDKTHSSF 2988

Human  3056 SSTVKDKAASESIRVNRRCISVAPSRETAGELLLGKCGMYFVEDNASDTVESSSLQGELEPASFS 3120
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2989 SSTVKDKAASESIRVNRRCISVAPSRETAGELLLGKCGMYFVEDNASDTVESSSLQGELEPASFS 3053

Human  3121 WTYEEIKEVHKRWWQLRDNAVEIFLTNGRTLLLAFDNTKVRDDVYHNILTNNLPNLLEYGNITAL 3185
            ||||||||:|:||||||||||||||||||||||||||||||||||.:|||||||:||||||||||
  Rat  3054 WTYEEIKEIHRRWWQLRDNAVEIFLTNGRTLLLAFDNTKVRDDVYQSILTNNLPSLLEYGNITAL 3118

Human  3186 TNLWYTGQITNFEYLTHLNKHAGRSFNDLMQYPVFPFILADYVSETLDLNDLLIYRNLSKPIAVQ 3250
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||..||||||||||||
  Rat  3119 TNLWYTGQITNFEYLTHLNKHAGRSFNDLMQYPVFPFILSDYVSETLDLNDPSIYRNLSKPIAVQ 3183

Human  3251 YKEKEDRYVDTYKYLEEEYRKGAREDDPMPPVQPYHYGSHYSNSGTVLHFLVRMPPFTKMFLAYQ 3315
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  3184 YKEKEDRYVDTYKYLEEEYRKGAREDDPMPPVQPYHYGSHYSNSGTVLHFLVRMPPFTKMFLAYQ 3248

Human  3316 DQSFDIPDRTFHSTNTTWRLSSFESMTDVKELIPEFFYLPEFLVNREGFDFGVRQNGERVNHVNL 3380
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  3249 DQSFDIPDRTFHSTNTTWRLSSFESMTDVKELIPEFFYLPEFLVNREGFDFGVRQNGERVNHVNL 3313

Human  3381 PPWARNDPRLFILIHRQALESDYVSQNICQWIDLVFGYKQKGKASVQAINVFHPATYFGMDVSAV 3445
            ||||||||||||||||||||||:||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  3314 PPWARNDPRLFILIHRQALESDHVSQNICHWIDLVFGYKQKGKASVQAINVFHPATYFGMDVSAV 3378

Human  3446 EDPVQRRALETMIKTYGQTPRQLFHMAHVSRPGAKLNIEGELPAAVGLLVQFAFRETREQVKEIT 3510
            |||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||.:||||
  Rat  3379 EDPVQRRALETMIKTYGQTPRQLFHTAHASRPGAKLNIEGELPAAVGLLVQFAFRETREPIKEIT 3443

Human  3511 YPSPLSWIKGLKWGEYVGSPSAPVPVVCFSQPHGERFGSLQALPTRAICGLSRNFCLLMTYSKEQ 3575
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||
  Rat  3444 YPSPLSWIKGLKWGEYVGSPSAPVPVVCFSQPHGERFGSLQALPTRAICGLSQNFCLLMTYSKEQ 3508

Human  3576 GVRSMNSTDIQWSAILSWGYADNILRLKSKQSEPPVNFIQSSQQYQVTSCAWVPDSCQLFTGSKC 3640
            ||||||:||||||||||||||||||||||||||||:||||||||:||||||||||||||||||||
  Rat  3509 GVRSMNNTDIQWSAILSWGYADNILRLKSKQSEPPINFIQSSQQHQVTSCAWVPDSCQLFTGSKC 3573

Human  3641 GVITAYTNRFTSSTPSEIEMETQIHLYGHTEEITSLFVCKPYSILISVSRDGTCIIWDLNRLCYV 3705
            ||||||||||||.||||||||:|:||||||||||||.||||||::||||||||||:|||||||||
  Rat  3574 GVITAYTNRFTSGTPSEIEMESQMHLYGHTEEITSLCVCKPYSVMISVSRDGTCIVWDLNRLCYV 3638

Human  3706 QSLAGHKSPVTAVSASETSGDIATVCDSAGGGSDLRLWTVNGDLVGHVHCREIICSVAFSNQPEG 3770
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  3639 QSLAGHKSPVTAVSASETSGDIATVCDSAGGGSDLRLWTVNGDLVGHVHCREIICSVAFSNQPEG 3703

Human  3771 VSINVIAGGLENGIVRLWSTWDLKPVREITFPKSNKPIISLTFSCDGHHLYTANSDGTVIAWCRK 3835
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  3704 VSINVIAGGLENGIVRLWSTWDLKPVREITFPKSNKPIISLTFSCDGHHLYTANSDGTVIAWCRK 3768

Human  3836 DQQRLKQPMFYSFLSSYAAG 3855
            ||||:|||||||||||||||
  Rat  3769 DQQRVKQPMFYSFLSSYAAG 3788

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
LYSTXP_011542333.1 PH_BEACH 3066..3171 CDD:275391 100/104 (96%)
Beach 3186..3476 CDD:214982 282/289 (98%)
WD40 repeat 3582..3619 CDD:293791 34/36 (94%)
WD40 3583..3832 CDD:475233 239/248 (96%)
WD40 repeat 3623..3668 CDD:293791 41/44 (93%)
WD40 repeat 3673..3709 CDD:293791 31/35 (89%)
WD40 repeat 3716..3749 CDD:293791 32/32 (100%)
WD40 repeat 3759..3800 CDD:293791 40/40 (100%)
LystNP_445970.2 PH_BEACH 3007..3102 CDD:434260 90/94 (96%)
Beach 3119..3409 CDD:214982 282/289 (98%)
WD40 3516..3765 CDD:475233 239/248 (96%)
WD40 repeat 3516..3552 CDD:293791 34/35 (97%)
WD40 repeat 3556..3601 CDD:293791 41/44 (93%)
WD40 repeat 3606..3642 CDD:293791 31/35 (89%)
WD40 repeat 3649..3682 CDD:293791 32/32 (100%)
WD40 repeat 3692..3733 CDD:293791 40/40 (100%)

Return to query results.
Submit another query.