DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CHM and Chm

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_000381.1 Gene:CHM / 1121 HGNCID:1940 Length:653 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_058763.2 Gene:Chm / 24942 RGDID:2340 Length:650 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:656 Identity:548/656 - (83%)
Similarity:585/656 - (89%) Gaps:9/656 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MADTLPSEFDVIVIGTGLPESIIAAACSRSGRRVLHVDSRSYYGGNWASFSFSGLLSWLKEYQEN 65
            |||.|||:|||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MADNLPSDFDVIVIGTGLPESIIAAACSRSGQRVLHVDSRSYYGGNWASFSFSGLLSWLKEYQEN 65

Human    66 SDIVSDSPVWQDQILENEEAIALSRKDKTIQHVEVFCYASQDLHEDVEEAGALQKNHALVTSANS 130
            :|:|:::.:||:|||||||||.||.|||||||||||||||||||:|||||||||||||.||||.|
  Rat    66 NDVVTENSMWQEQILENEEAIPLSSKDKTIQHVEVFCYASQDLHKDVEEAGALQKNHASVTSAQS 130

Human   131 TEAADSA---FLPTEDESLSTMSCEMLTEQTPSSDPENALEVNGAEVTGEKENHCDDKTCVPSTS 192
            .|||::|   .|||..|.||..|||:..||:....||::.|||.||.||:||| .|.|     :|
  Rat   131 AEAAEAAETSCLPTAVEPLSMGSCEIPAEQSQCPGPESSPEVNDAEATGKKEN-SDAK-----SS 189

Human   193 AEDMSENVPIAEDTTEQPKKNRITYSQIIKEGRRFNIDLVSKLLYSRGLLIDLLIKSNVSRYAEF 257
            .|:.|||||..:|.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   190 TEEPSENVPKVQDNTETPKKNRITYSQIIKEGRRFNIDLVSKLLYSRGLLIDLLIKSNVSRYAEF 254

Human   258 KNITRILAFREGRVEQVPCSRADVFNSKQLTMVEKRMLMKFLTFCMEYEKYPDEYKGYEEITFYE 322
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||:|||::||||:.||..||.|
  Rat   255 KNITRILAFREGTVEQVPCSRADVFNSKQLTMVEKRMLMKFLTFCVEYEEHPDEYRAYEGTTFSE 319

Human   323 YLKTQKLTPNLQYIVMHSIAMTSETASSTIDGLKATKNFLHCLGRYGNTPFLFPLYGQGELPQCF 387
            |||||||||||||.|:|||||||||.|.|:|||||||.||.||||||||||||||||||||||||
  Rat   320 YLKTQKLTPNLQYFVLHSIAMTSETTSCTVDGLKATKKFLQCLGRYGNTPFLFPLYGQGELPQCF 384

Human   388 CRMCAVFGGIYCLRHSVQCLVVDKESRKCKAIIDQFGQRIISEHFLVEDSYFPENMCSRVQYRQI 452
            |||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||:||::||||..||.|||||||||
  Rat   385 CRMCAVFGGIYCLRHSVQCLVVDKESRKCKAVIDQFGQRIISKHFIIEDSYLSENTCSRVQYRQI 449

Human   453 SRAVLITDRSVLKTDSDQQISILTVPAEEPGTFAVRVIELCSSTMTCMKGTYLVHLTCTSSKTAR 517
            ||||||||.||||||:|||:|||||||||||:||||||||||||||||||||||||||.||||||
  Rat   450 SRAVLITDGSVLKTDADQQVSILTVPAEEPGSFAVRVIELCSSTMTCMKGTYLVHLTCMSSKTAR 514

Human   518 EDLESVVQKLFVPYTEMEIENEQVEKPRILWALYFNMRDSSDISRSCYNDLPSNVYVCSGPDCGL 582
            ||||.||||||.||||:|.|||||||||:||||||||||||||||.||||||||||||||||.||
  Rat   515 EDLERVVQKLFTPYTEIEAENEQVEKPRLLWALYFNMRDSSDISRDCYNDLPSNVYVCSGPDSGL 579

Human   583 GNDNAVKQAETLFQEICPNEDFCPPPPNPEDIILDGDSLQPEASESSAIPEANSETFKESTNLGN 647
            ||||||||||||||:|||||||||.|||||||:|||||.|.|..|||..||.||||.||||.|||
  Rat   580 GNDNAVKQAETLFQQICPNEDFCPAPPNPEDIVLDGDSSQQEVPESSVTPETNSETPKESTVLGN 644

Human   648 LEESSE 653
            .||.||
  Rat   645 PEEPSE 650

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CHMNP_000381.1 NAD_binding_8 13..>54 CDD:433218 39/40 (98%)
Rossmann-fold NAD(P)(+)-binding proteins 225..542 CDD:473865 284/316 (90%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 606..653 33/46 (72%)
ChmNP_058763.2 Rossmann-fold NAD(P)(+)-binding proteins 6..530 CDD:473865 441/529 (83%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 156..208 26/57 (46%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 603..650 33/46 (72%)

Return to query results.
Submit another query.