DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment SUPT16H and supt16h

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_009123.1 Gene:SUPT16H / 11198 HGNCID:11465 Length:1047 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001362206.1 Gene:supt16h / 549984 XenbaseID:XB-GENE-979305 Length:1035 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:1050 Identity:921/1050 - (87%)
Similarity:985/1050 - (93%) Gaps:19/1050 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MAVTLDKDAYYRRVKRLYSNWRKGEDEYANVDAIVVSVGVDEEIVYAKSTALQTWLFGYELTDTI 65
            |||||||:|||||:||.|.||:|||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog     1 MAVTLDKEAYYRRIKRFYGNWKKGEDEFANVDAIVVSVGVDEEIVYAKSTALQTWLFGYELTDTI 65

Human    66 MVFCDDKIIFMASKKKVEFLKQIANTKGNENANGAPAITLLIREK-NESNKSSFDKMIEAIKESK 129
            ||||::||||||||||||||||||||||||||||.||||||:||| ||:||::|:|:|||||.||
 Frog    66 MVFCEEKIIFMASKKKVEFLKQIANTKGNENANGTPAITLLVREKQNEANKANFEKVIEAIKGSK 130

Human   130 NGKKIGVFSKDKFPGEFMKSWNDCLNKEGFDKIDISAVVAYTIAVKEDGELNLMKKAASITSEVF 194
            .||.||||.||||||::||||.|.||||||||:||||.:|||||||||||||||||||:|||:||
 Frog   131 KGKYIGVFIKDKFPGDYMKSWYDTLNKEGFDKVDISASLAYTIAVKEDGELNLMKKAATITSDVF 195

Human   195 NKFFKERVMEIVDADEKVRHSKLAESVEKAIEEKKYLAGADPSTVEMCYPPIIQSGGNYNLKFSV 259
            :||||:||||||||||||||||||||||||||:||||.|.||||:||||||||||||||||||||
 Frog   196 SKFFKDRVMEIVDADEKVRHSKLAESVEKAIEDKKYLGGTDPSTIEMCYPPIIQSGGNYNLKFSV 260

Human   260 VSDKNHMHFGAITCAMGIRFKSYCSNLVRTLMVDPSQEVQENYNFLLQLQEELLKELRHGVKICD 324
            |||||||||||||||||||:|||||||||||||||:||:|:||||||||||||||||:||.||||
 Frog   261 VSDKNHMHFGAITCAMGIRYKSYCSNLVRTLMVDPTQEMQDNYNFLLQLQEELLKELKHGAKICD 325

Human   325 VYNAVMDVVKKQKPELLNKITKNLGFGMGIEFREGSLVINSKNQYKLKKGMVFSINLGFSDLTNK 389
            .|:.:||.||||||:||:||||||||.|||||||||||||:|||||||||||||::||.|:|.||
 Frog   326 AYHIIMDQVKKQKPDLLSKITKNLGFAMGIEFREGSLVINNKNQYKLKKGMVFSVHLGLSELNNK 390

Human   390 EGKKPEEKTYALFIGDTVLVDEDGPATVLTSVKKKVKNVGIFLKNEDEEEEEEEKDEAEDLLGRG 454
            .||||||||||||:||||||:|:|.|||||.|||||||||||||.||:|||||:||||:|:||||
 Frog   391 AGKKPEEKTYALFVGDTVLVNEEGAATVLTHVKKKVKNVGIFLKKEDDEEEEEDKDEAQDILGRG 455

Human   455 SR-AALLTERTRNEMTAEEKRRAHQKELAAQLNEEAKRRLTEQKGEQQIQKARKSNVSYKNPSLM 518
            :| |||||||||||||||||||.||||||.|||:||||||||||||||..|||||||||||.|.|
 Frog   456 ARSAALLTERTRNEMTAEEKRRTHQKELATQLNDEAKRRLTEQKGEQQTLKARKSNVSYKNASQM 520

Human   519 PKEPHIREMKIYIDKKYETVIMPVFGIATPFHIATIKNISMSVEGDYTYLRINFYCPGSALGRNE 583
            |||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||
 Frog   521 PKESEIREMKIYIDKKYETVIMPVFGIATPFHIATIKNISMSVEGDYTYLRINFFCPGSALGRNE 585

Human   584 GNIFPNPEATFVKEITYRASNIKAPGEQTVPALNLQNAFRIIKEVQKRYKTREAEEKEKEGIVKQ 648
            |||||||||||||||||||||:|.||:.:||:|||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   586 GNIFPNPEATFVKEITYRASNVKTPGDPSVPSLNLQNAFRIIKEVQKRYKTREAEEKEKEGIVKQ 650

Human   649 DSLVINLNRSNPKLKDLYIRPNIAQKRMQGSLEAHVNGFRFTSVRGDKVDILYNNIKHALFQPCD 713
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||
 Frog   651 DSLVINLNRSNPKLKDLYIRPNIAQKRMQGSLEAHVNGFRFTSVRGDKVDILYNNIKHAIFQPCD 715

Human   714 GEMIIVLHFHLKNAIMFGKKRHTDVQFYTEVGEITTDLGKHQHMHDRDDLYAEQMEREMRHKLKT 778
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||
 Frog   716 GEMIIVLHFHLKNAIMFGKKRHTDVQFYTEVGEITTDLGKHQHMHDRDDLYAEQLEREMRHKLKT 780

Human   779 AFKNFIEKVEALTKEELEFEVPFRDLGFNGAPYRSTCLLQPTSSALVNATEWPPFVVTLDEVELI 843
            ||||||||||:||||:||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||:
 Frog   781 AFKNFIEKVESLTKEDLEFEVPFRDLGFNGAPYRSTCLLQPTSSALVNTTEWPPFVVTLDEVELV 845

Human   844 HFERVQFHLKNFDMVIVYKDYSKKVTMINAIPVASLDPIKEWLNSCDLKYTEGVQSLNWTKIMKT 908
            |||||||||||||||||||:|.|||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||
 Frog   846 HFERVQFHLKNFDMVIVYKEYGKKVTMINAIPVASLDPIKEWLNSCDIKYTEGVQSLNWTKIMKT 910

Human   909 IVDDPEGFFEQGGWSFLEPEGEGSDAEEGDSESEIEDETFNPSEDDYEEEEEDSDEDYSSEAEES 973
            ||||||||||||||||||||||||.||||:||||:||||||||||:|||||||||||||.|.|||
 Frog   911 IVDDPEGFFEQGGWSFLEPEGEGSGAEEGESESEMEDETFNPSEDEYEEEEEDSDEDYSDETEES 975

Human   974 DYSKESLGSEEESGKDWDELEEEARKADRESRYEEEEEQSRSMSRKRKASVHSSGRGSNRGSRHS 1038
            ..|:||||::|||||||||||||||||||||||||||||..  .:|||.              |:
 Frog   976 VGSEESLGTDEESGKDWDELEEEARKADRESRYEEEEEQKG--GKKRKV--------------HA 1024

Human  1039 SAP-PKKKRK 1047
            .|| |.||||
 Frog  1025 PAPNPSKKRK 1034

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
SUPT16HNP_009123.1 COG5406 5..1001 CDD:227693 893/997 (90%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 492..518 22/25 (88%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 918..1047 93/129 (72%)
supt16hNP_001362206.1 COG5406 5..1021 CDD:227693 907/1017 (89%)

Return to query results.
Submit another query.