DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment SUPT16H and Supt16h

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_009123.1 Gene:SUPT16H / 11198 HGNCID:11465 Length:1047 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001100731.1 Gene:Supt16h / 305851 RGDID:1310032 Length:1047 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1047 Identity:1037/1047 - (99%)
Similarity:1047/1047 - (100%) Gaps:0/1047 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MAVTLDKDAYYRRVKRLYSNWRKGEDEYANVDAIVVSVGVDEEIVYAKSTALQTWLFGYELTDTI 65
            |||||||||||||||||||||||||||||::||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MAVTLDKDAYYRRVKRLYSNWRKGEDEYASIDAIVVSVGVDEEIVYAKSTALQTWLFGYELTDTI 65

Human    66 MVFCDDKIIFMASKKKVEFLKQIANTKGNENANGAPAITLLIREKNESNKSSFDKMIEAIKESKN 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||
  Rat    66 MVFCDDKIIFMASKKKVEFLKQIANTKGNENANGAPAITLLVREKNESNKSSFDKMIEAIKESKN 130

Human   131 GKKIGVFSKDKFPGEFMKSWNDCLNKEGFDKIDISAVVAYTIAVKEDGELNLMKKAASITSEVFN 195
            ||||||||||||||||||||:||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 GKKIGVFSKDKFPGEFMKSWSDCLNKEGFDKVDISAVVAYTIAVKEDGELNLMKKAASITSEVFN 195

Human   196 KFFKERVMEIVDADEKVRHSKLAESVEKAIEEKKYLAGADPSTVEMCYPPIIQSGGNYNLKFSVV 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 KFFKERVMEIVDADEKVRHSKLAESVEKAIEEKKYLAGADPSTVEMCYPPIIQSGGNYNLKFSVV 260

Human   261 SDKNHMHFGAITCAMGIRFKSYCSNLVRTLMVDPSQEVQENYNFLLQLQEELLKELRHGVKICDV 325
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 SDKNHMHFGAITCAMGIRFKSYCSNLVRTLMVDPTQEVQENYNFLLQLQEELLKELRHGVKICDV 325

Human   326 YNAVMDVVKKQKPELLNKITKNLGFGMGIEFREGSLVINSKNQYKLKKGMVFSINLGFSDLTNKE 390
            ||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 YNSVMDVVKKQKPELLNKITKNLGFGMGIEFREGSLVINSKNQYKLKKGMVFSINLGFSDLTNKE 390

Human   391 GKKPEEKTYALFIGDTVLVDEDGPATVLTSVKKKVKNVGIFLKNEDEEEEEEEKDEAEDLLGRGS 455
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||
  Rat   391 GKKPEEKTYALFIGDTVLVDEDGPATVLTSVKKKVKNVGIFLKNEDDEEEEEEKDEAEDLLGRGS 455

Human   456 RAALLTERTRNEMTAEEKRRAHQKELAAQLNEEAKRRLTEQKGEQQIQKARKSNVSYKNPSLMPK 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 RAALLTERTRNEMTAEEKRRAHQKELAAQLNEEAKRRLTEQKGEQQIQKARKSNVSYKNPSLMPK 520

Human   521 EPHIREMKIYIDKKYETVIMPVFGIATPFHIATIKNISMSVEGDYTYLRINFYCPGSALGRNEGN 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   521 EPHIREMKIYIDKKYETVIMPVFGIATPFHIATIKNISMSVEGDYTYLRINFYCPGSALGRNEGN 585

Human   586 IFPNPEATFVKEITYRASNIKAPGEQTVPALNLQNAFRIIKEVQKRYKTREAEEKEKEGIVKQDS 650
            |||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   586 IFPNPEATFVKEITYRASNMKAPGEQTVPALNLQNAFRIIKEVQKRYKTREAEEKEKEGIVKQDS 650

Human   651 LVINLNRSNPKLKDLYIRPNIAQKRMQGSLEAHVNGFRFTSVRGDKVDILYNNIKHALFQPCDGE 715
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   651 LVINLNRSNPKLKDLYIRPNIAQKRMQGSLEAHVNGFRFTSVRGDKVDILYNNIKHALFQPCDGE 715

Human   716 MIIVLHFHLKNAIMFGKKRHTDVQFYTEVGEITTDLGKHQHMHDRDDLYAEQMEREMRHKLKTAF 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   716 MIIVLHFHLKNAIMFGKKRHTDVQFYTEVGEITTDLGKHQHMHDRDDLYAEQMEREMRHKLKTAF 780

Human   781 KNFIEKVEALTKEELEFEVPFRDLGFNGAPYRSTCLLQPTSSALVNATEWPPFVVTLDEVELIHF 845
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   781 KNFIEKVEALTKEELEFEVPFRDLGFNGAPYRSTCLLQPTSSALVNATEWPPFVVTLDEVELIHF 845

Human   846 ERVQFHLKNFDMVIVYKDYSKKVTMINAIPVASLDPIKEWLNSCDLKYTEGVQSLNWTKIMKTIV 910
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   846 ERVQFHLKNFDMVIVYKDYSKKVTMINAIPVASLDPIKEWLNSCDLKYTEGVQSLNWTKIMKTIV 910

Human   911 DDPEGFFEQGGWSFLEPEGEGSDAEEGDSESEIEDETFNPSEDDYEEEEEDSDEDYSSEAEESDY 975
            |||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   911 DDPEGFFEQGGWSFLEPEGEGSDAEDGDSESEIEDETFNPSEDDYEEEEEDSDEDYSSEAEESDY 975

Human   976 SKESLGSEEESGKDWDELEEEARKADRESRYEEEEEQSRSMSRKRKASVHSSGRGSNRGSRHSSA 1040
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   976 SKESLGSEEESGKDWDELEEEARKADRESRYEEEEEQSRSMSRKRKASVHSSGRGSNRGSRHSSA 1040

Human  1041 PPKKKRK 1047
            |||||||
  Rat  1041 PPKKKRK 1047

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
SUPT16HNP_009123.1 COG5406 5..1001 CDD:227693 985/995 (99%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 492..518 25/25 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 918..1047 127/128 (99%)
Supt16hNP_001100731.1 COG5406 5..1001 CDD:227693 985/995 (99%)

Return to query results.
Submit another query.