DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CIT and Cit

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_011536085.1 Gene:CIT / 11113 HGNCID:1985 Length:2084 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_038945746.1 Gene:Cit / 83620 RGDID:70878 Length:2114 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2115 Identity:2008/2115 - (94%)
Similarity:2046/2115 - (96%) Gaps:32/2115 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MLKFKYGARNPLDAGAAEPIASRASRLNLFFQGKPPFMTQQQMSPLSREGILDALFVLFEECSQP 65
            |||||||.|||.:|.|.|||||||||||||||||||.|||||||.|||||:|||||||.||||||
  Rat     1 MLKFKYGVRNPSEASAPEPIASRASRLNLFFQGKPPLMTQQQMSALSREGVLDALFVLLEECSQP 65

Human    66 ALMKIKHVSNFVRKYSDTIAELQELQPSAKDFEVRSLVGCGHFAEVQVVREKATGDIYAMKVMKK 130
            |||||||||:||||||||||||:|||||.:||||||||||||||||||||||||||:||||:|||
  Rat    66 ALMKIKHVSSFVRKYSDTIAELRELQPSVRDFEVRSLVGCGHFAEVQVVREKATGDVYAMKIMKK 130

Human   131 KALLAQEQVSFFEEERNILSRSTSPWIPQLQYAFQDKNHLYLVMEYQPGGDLLSLLNRYEDQLDE 195
            .||.||||||||||||||||:|||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 AALRAQEQVSFFEEERNILSQSTSPWIPQLQYAFQDKNNLYLVMEYQPGGDLLSLLNRYEDQLDE 195

Human   196 NLIQFYLAELILAVHSVHLMGYVHRDIKPENILVDRTGHIKLVDFGSAAKMNSNKMVNAKLPIGT 260
            |:||||||||||||||||.||||||||||||||:||||||||||||||||||||| |:|||||||
  Rat   196 NMIQFYLAELILAVHSVHQMGYVHRDIKPENILIDRTGHIKLVDFGSAAKMNSNK-VDAKLPIGT 259

Human   261 PDYMAPEVLTVMNGDGKGTYGLDCDWWSVGVIAYEMIYGRSPFAEGTSARTFNNIMNFQRFLKFP 325
            |||||||||||||.|.:||||||||||||||:||||:||::||.|||||||||||||||||||||
  Rat   260 PDYMAPEVLTVMNEDRRGTYGLDCDWWSVGVVAYEMLYGKTPFTEGTSARTFNNIMNFQRFLKFP 324

Human   326 DDPKVSSDFLDLIQSLLCGQKERLKFEGLCCHPFFSKIDWNNIRNSPPPFVPTLKSDDDTSNFDE 390
            |||||||:.|||||||||.||||||||||||||||::.|||||||||||||||||||||||||||
  Rat   325 DDPKVSSELLDLIQSLLCVQKERLKFEGLCCHPFFARTDWNNIRNSPPPFVPTLKSDDDTSNFDE 389

Human   391 PEKNSWVSSSPCQLSPSGFSGEELPFVGFSYSKALGILGRSESVVSGLDSPAKTSSMEKKLLIKS 455
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||
  Rat   390 PEKNSWVSSSPCQLSPSGFSGEELPFVGFSYSKALGYLGRSESVVSGLDSPAKISSMEKKLLIKS 454

Human   456 KELQDSQDKCHKMEQEMTRLHRRVSEVEAVLSQKEVELKASETQRSLLEQDLATYITECSSLKRS 520
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   455 KELQDSQDKCHKMEQEMARLHRRVSEVEAVLSQKEVELKASETQRSLLEQDLATYITECSSLKRS 519

Human   521 LEQARMEVSQEDDKALQLLHDIREQSRKLQEIKEQEYQAQVEEMRLMMNQLEEDLVSARRRSDLY 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   520 LEQARMEVSQEDDKALQLLHDIREQSRKLQEIKEQEYQAQVEEMRLMMNQLEEDLVSARRRSDLY 584

Human   586 ESELRESRLAAEEFKRKATECQHKLLK-----------------------------AKDQGKPEV 621
            ||||||||||||||||||.||||||:|                             |||.|||||
  Rat   585 ESELRESRLAAEEFKRKANECQHKLMKVVSHPPRGDPGGTAPDDLHKTQGHAGLASAKDLGKPEV 649

Human   622 GEYAKLEKINAEQQLKIQELQEKLEKAVKASTEATELLQNIRQAKERAERELEKLQNREDSSEGI 686
            ||.::||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
  Rat   650 GECSRLEKINAEQQLKIQELQEKLEKAVKASTEATELLQNIRQAKERAERELEKLHNREDSSEGI 714

Human   687 RKKLVEAEERRHSLENKVKRLETMERRENRLKDDIQTKSQQIQQMADKILELEEKHREAQVSAQH 751
            :||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||
  Rat   715 KKKLVEAEERRHSLENKVKRLETMERRENRLKDDIQTKSEQIQQMADKILELEEKHREAQVSAQH 779

Human   752 LEVHLKQKEQHYEEKIKVLDNQIKKDLADKETLENMMQRHEEEAHEKGKILSEQKAMINAMDSKI 816
            |||||||||||||||||||||||||||||||:||.||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   780 LEVHLKQKEQHYEEKIKVLDNQIKKDLADKESLETMMQRHEEEAHEKGKILSEQKAMINAMDSKI 844

Human   817 RSLEQRIVELSEANKLAANSSLFTQRNMKAQEEMISELRQQKFYLETQAGKLEAQNRKLEEQLEK 881
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   845 RSLEQRIVELSEANKLAANSSLFTQRNMKAQEEMISELRQQKFYLETQAGKLEAQNRKLEEQLEK 909

Human   882 ISHQDHSDKNRLLELETRLREVSLEHEEQKLELKRQLTELQLSLQERESQLTALQAARAALESQL 946
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   910 ISHQDHSDKNRLLELETRLREVSLEHEEQKLELKRQLTELQLSLQERESQLTALQAARAALESQL 974

Human   947 RQAKTELEETTAEAEEEIQALTAHRDEIQRKFDALRNSCTVITDLEEQLNQLTEDNAELNNQNFY 1011
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   975 RQAKTELEETTAEAEEEIQALTAHRDEIQRKFDALRNSCTVITDLEEQLNQLTEDNAELNNQNFY 1039

Human  1012 LSKQLDEASGANDEIVQLRSEVDHLRREITEREMQLTSQKQTMEALKTTCTMLEEQVMDLEALND 1076
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1040 LSKQLDEASGANDEIVQLRSEVDHLRREITEREMQLTSQKQTMEALKTTCTMLEEQVMDLEALND 1104

Human  1077 ELLEKERQWEAWRSVLGDEKSQFECRVRELQRMLDTEKQSRARADQRITESRQVVELAVKEHKAE 1141
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1105 ELLEKERQWEAWRSVLGDEKSQFECRVRELQRMLDTEKQSRARADQRITESRQVVELAVKEHKAE 1169

Human  1142 ILALQQALKEQKLKAESLSDKLNDLEKKHAMLEMNARSLQQKLETERELKQRLLEEQAKLQQQMD 1206
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1170 ILALQQALKEQKLKAESLSDKLNDLEKKHAMLEMNARSLQQKLETERELKQRLLEEQAKLQQQMD 1234

Human  1207 LQKNHIFRLTQGLQEALDRADLLKTERSDLEYQLENIQVLYSHEKVKMEGTISQQTKLIDFLQAK 1271
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1235 LQKNHIFRLTQGLQEALDRADLLKTERSDLEYQLENIQVLYSHEKVKMEGTISQQTKLIDFLQAK 1299

Human  1272 MDQPAKKKKGLFSRRKEDPALPTQVPLQYNELKLALEKEKARCAELEEALQKTRIELRSAREEAA 1336
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1300 MDQPAKKKKGLFSRRKEDPALPTQVPLQYNELKLALEKEKARCAELEEALQKTRIELRSAREEAA 1364

Human  1337 HRKATDHPHPSTPATARQQIAMSAIVRSPEHQPSAMSLLAPPSSRRKESSTPEEFSRRLKERMHH 1401
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||
  Rat  1365 HRKATDHPHPSTPATARQQIAMSAIVRSPEHQPSAMSLLAPPSSRRKEASTPEEFSRRLKERMHH 1429

Human  1402 NIPHRFNVGLNMRATKCAVCLDTVHFGRQASKCLECQVMCHPKCSTCLPATCGLPAEYATHFTEA 1466
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1430 NIPHRFNVGLNMRATKCAVCLDTVHFGRQASKCLECQVMCHPKCSTCLPATCGLPAEYATHFTEA 1494

Human  1467 FCRDKMNSPGLQTKEPSSSLHLEGWMKVPRNNKRGQQGWDRKYIVLEGSKVLIYDNEAREAGQRP 1531
            |||||::|||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1495 FCRDKVSSPGLQSKEPSSSLHLEGWMKVPRNNKRGQQGWDRKYIVLEGSKVLIYDNEAREAGQRP 1559

Human  1532 VEEFELCLPDGDVSIHGAVGASELANTAKADVPYILKMESHPHTTCWPGRTLYLLAPSFPDKQRW 1596
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1560 VEEFELCLPDGDVSIHGAVGASELANTAKADVPYILKMESHPHTTCWPGRTLYLLAPSFPDKQRW 1624

Human  1597 VTALESVVAGGRVSREKAEADAARDCVSYELLPAWVQKLLGNSLLKLEGDDRLDMNCTLPFSDQV 1661
            |||||||||||||||||||||||.||.|.|.||.||:||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1625 VTALESVVAGGRVSREKAEADAAWDCTSCERLPVWVEKLLGNSLLKLEGDDRLDMNCTLPFSDQV 1689

Human  1662 VLVGTEEGLYALNVLKNSLTHVPGIGAVFQIYIIKDLEKLLMIAGEERALCLVDVKKVKQSLAQS 1726
            |||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1690 VLVGTEEGLYALNVLKNSLTHIPGIGAVFQIYIIKDLEKLLMIAGEERALCLVDVKKVKQSLAQS 1754

Human  1727 HLPAQPDISPNIFEAVKGCHLFGAGKIENGLCICAAMPSKVVILRYNENLSKYCIRKEIETSEPC 1791
            |||||||:||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||:||||:||||||||||||
  Rat  1755 HLPAQPDVSPNIFEAVKGCHLFAAGKIENSLCICAAMPSKVVILRYNDNLSKFCIRKEIETSEPC 1819

Human  1792 SCIHFTNYSILIGTNKFYEIDMKQYTLEEFLDKNDHSLAPAVFAASSNSFPVSIVQVNSAGQREE 1856
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|:|||||||||.||.|||||
  Rat  1820 SCIHFTNYSILIGTNKFYEIDMKQYTLEEFLDKNDHSLAPAVFASSTNSFPVSIVQANSTGQREE 1884

Human  1857 YLLCFHEFGVFVDSYGRRSRTDDLKWSRLPLAFAYREPYLFVTHFNSLEVIEIQARSSAGTPARA 1921
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
  Rat  1885 YLLCFHEFGVFVDSYGRRSRTDDLKWSRLPLAFAYREPYLFVTHFNSLEVIEIQARSSLGTPARA 1949

Human  1922 YLDIPNPRYLGPAISSGAIYLASSYQDKLRVICCKGNLVKESGTEHHRGPSTSRSSPNKRGPPTY 1986
            ||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||
  Rat  1950 YLEIPNPRYLGPAISSGAIYLASSYQDKLRVICCKGNLVKESGTEQHRVPSTSRSSPNKRGPPTY 2014

Human  1987 NEHITKRVASSPAPPEGPSHPREPSTPHRY--REGRTELRRDKSPGRPLEREKSPGRMLSTRRER 2049
            ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2015 NEHITKRVASSPAPPEGPSHPREPSTPHRYRDREGRTELRRDKSPGRPLEREKSPGRMLSTRRER 2079

Human  2050 SPGRLFEDSSRGRLPAGAVRTPLSQVNKVWDQSSV 2084
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2080 SPGRLFEDSSRGRLPAGAVRTPLSQVNKVWDQSSV 2114

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CITXP_011536085.1 STKc_CRIK 95..422 CDD:270752 300/326 (92%)
CwlO1 442..>598 CDD:443091 153/155 (99%)
SMC_prok_B 531..1343 CDD:274008 800/840 (95%)
CRIK 1401..1456 CDD:410364 54/54 (100%)
PH 1486..1605 CDD:459697 118/118 (100%)
CNH 1650..1946 CDD:214481 283/295 (96%)
CitXP_038945746.1 STKc_CRIK 96..421 CDD:270752 300/325 (92%)
SMC_prok_B 530..1264 CDD:274008 693/733 (95%)
Smc <1177..>1368 CDD:440809 190/190 (100%)
CRIK 1429..1484 CDD:410364 54/54 (100%)
PH 1514..1633 CDD:459697 118/118 (100%)
CNH 1678..1974 CDD:214481 283/295 (96%)

Return to query results.
Submit another query.