DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CIT and cita

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_011536085.1 Gene:CIT / 11113 HGNCID:1985 Length:2084 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_073807858.1 Gene:cita / 100329792 ZFINID:ZDB-GENE-130530-981 Length:2119 Species:Danio rerio


Alignment Length:2128 Identity:1506/2128 - (70%)
Similarity:1794/2128 - (84%) Gaps:53/2128 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MLKFKYGARNPL-DAGAAEPIASRASRLNLFFQGKPPFMTQQQMSPLSREGILDALFVLFEECSQ 64
            |||||||....: |..|.:.|.||.:|||...|||........::.|||||::|||.:||:|||.
Zfish     1 MLKFKYGGHGSVKDLSAVDSITSRCARLNQLLQGKCSMSGFTGVNALSREGLIDALLLLFQECST 65

Human    65 PALMKIKHVSNFVRKYSDTIAELQELQPSAKDFEVRSLVGCGHFAEVQVVREKATGDIYAMKVMK 129
            |.|||||||:|||.|||:.:||:|||.|..||||||.:||.|.|:|||||:|:||||:||||:|.
Zfish    66 PELMKIKHVANFVNKYSEVVAEVQELLPGKKDFEVRGIVGRGQFSEVQVVKERATGDVYAMKIMD 130

Human   130 KKALLAQEQVSFFEEERNILSRSTSPWIPQLQYAFQDKNHLYLVMEYQPGGDLLSLLNRYEDQLD 194
            |.:|.:...|:|||||::||:.::||||||||:||||::|:.|||||.|||||::|:||||||.|
Zfish   131 KNSLRSHHNVAFFEEEKSILALNSSPWIPQLQHAFQDQDHVCLVMEYLPGGDLMALMNRYEDQFD 195

Human   195 ENLIQFYLAELILAVHSVHLMGYVHRDIKPENILVDRTGHIKLVDFGSAAKMNSNKMV-NAKLPI 258
            |::.||||||||.|||::|.||||||||:|||:|:||||||||.|||.||::.:|:.| ::|||:
Zfish   196 ESMAQFYLAELIQAVHTLHQMGYVHRDIRPENVLIDRTGHIKLADFGWAARLTANRTVTSSKLPV 260

Human   259 GTPDYMAPEVLTVMNGDGKGTYGLDCDWWSVGVIAYEMIYGRSPFAEGTSARTFNNIMNFQRFLK 323
            |.||::|||:|:..:|.....:|.:.||||:|||||||||.:|||.:|||.:|.|||:|||||||
Zfish   261 GPPDFLAPEILSAFSGGSACNHGPESDWWSLGVIAYEMIYMKSPFTDGTSTKTINNIINFQRFLK 325

Human   324 FPDDPKVSSDFLDLIQSLLCGQKERLKFEGLCCHPFFSKIDWNNIRNSPPPFVPTLKSDDDTSNF 388
            ||::||.|:.|:||:||||||..|||.:|||..|||||.:||.|:|::.|||||:|:|:||..||
Zfish   326 FPEEPKASAAFMDLLQSLLCGSVERLGYEGLRSHPFFSSVDWTNLRHALPPFVPSLRSEDDACNF 390

Human   389 DEPEKNSWVSSSPCQLSP----SGFSGEELPFVGFSYSKALGILGRSESVVSGLDSPAKTSSMEK 449
            :.||:....:::..|  |    |||.|.:|||||:.:|:||..|.:||||.:||:|||||:||||
Zfish   391 EAPERPPRPATAAAQ--PEHPRSGFHGRDLPFVGWCFSRALTALAKSESVGAGLNSPAKTNSMEK 453

Human   450 KLLIKSKELQDSQDKCHKMEQEMTRLHRRVSEVEAVLSQKEVELKASETQRSLLEQDLATYITEC 514
            ||.:|||||||:||||||||||::|..|:::::|:||.||:|||||||||||:||||||||||||
Zfish   454 KLHLKSKELQDTQDKCHKMEQEISRFQRKMTDLESVLQQKDVELKASETQRSILEQDLATYITEC 518

Human   515 SSLKRSLEQARMEVSQEDDKALQLLHDIREQSRKLQEIKEQEYQAQVEEMRLMMNQLEEDLVSAR 579
            |||||||||||:||||||||||||||||||||.||||||||||.||:|||::.:.||||||.:||
Zfish   519 SSLKRSLEQARVEVSQEDDKALQLLHDIREQSNKLQEIKEQEYHAQLEEMQVTIRQLEEDLSAAR 583

Human   580 RRSDLYESELRESRLAAEEFKRKATECQHKLLKAKDQGKPEVGE-YAKLEKINAEQQLKIQELQE 643
            |||||||:||||||..:||.||||.|.|.::.|||:|||.||.| .:||||.||||||||||||:
Zfish   584 RRSDLYETELRESRQTSEELKRKAAEYQQRIQKAKEQGKAEVEELLSKLEKTNAEQQLKIQELQD 648

Human   644 KLEKAVKASTEATELLQNIRQAKERAERELEKLQNREDSSEGIRKKLVEAEERRHSLENKVKRLE 708
            ||.||||||||||||||||||||||.|||||:|:|:.|.|:.:|::|.|.|:.|.:|||:|||||
Zfish   649 KLSKAVKASTEATELLQNIRQAKERLERELERLRNKSDPSDTLRRRLRETEDGRKTLENQVKRLE 713

Human   709 TMERRENRLKDDIQTKSQQIQQMADKILELEEKHREAQVSAQHLEVHLKQKEQHYEEKIKVLDNQ 773
            .:|||||:||||||||||||||||:|||||||..||.|.:||.:|.||.|||:.||:|||:|:.|
Zfish   714 MVERRENKLKDDIQTKSQQIQQMAEKILELEENLRETQATAQRMEAHLVQKERLYEDKIKILEAQ 778

Human   774 IKKDLADKETLENMMQRHEEEAHEKGKILSEQKAMINAMDSKIRSLEQRIVELSEANKLAANSSL 838
            :|.|:|||::||....:.||||.||.|::|||||.|||||:|::||||||.|||||||||||||:
Zfish   779 MKSDMADKDSLEQKRAQQEEEAREKCKLISEQKATINAMDNKMKSLEQRIAELSEANKLAANSSI 843

Human   839 FTQRNMKAQEEMISELRQQKFYLETQAGKLEAQNRKLEEQLEKISHQDHSDKNRLLELETRLREV 903
            :||:||||||||||||||||||||:|||||||||.||||.|||:|.|:.:.|:|::||||||||:
Zfish   844 YTQKNMKAQEEMISELRQQKFYLESQAGKLEAQNAKLEEHLEKMSQQEQTRKSRIMELETRLREM 908

Human   904 SLEHEEQKLELKRQLTELQLSLQERESQLTALQAARAALESQLRQAKTELEETTAEAEEEIQALT 968
            .|||||||||:|||:|||.|||||||||::.|||||.|||:||:|||||||||||||||||.||.
Zfish   909 GLEHEEQKLEIKRQVTELTLSLQERESQISNLQAARHALENQLQQAKTELEETTAEAEEEITALR 973

Human   969 AHRDEIQRKFDALRNSCTVITDLEEQLNQLTEDNAELNNQNFYLSKQLDEASGANDEIVQLRSEV 1033
            ||||||||||||||:||:|||||||||.|||::|||||.|||||||||||.:..::|.:||..:|
Zfish   974 AHRDEIQRKFDALRDSCSVITDLEEQLTQLTQENAELNRQNFYLSKQLDELTLESEERLQLTQDV 1038

Human  1034 DHLRREITEREMQLTSQKQTMEALKTTCTMLEEQVMDLEALNDELLEKERQWEAWRSVLGDEKSQ 1098
            |.||||:.:|||.|.:|||.:|.|||||:||||||::||:|||||||||||||.|||.|.|||||
Zfish  1039 DRLRREVADREMHLNNQKQNIETLKTTCSMLEEQVVELESLNDELLEKERQWENWRSALEDEKSQ 1103

Human  1099 FECRVRELQRMLDTEKQSRARADQRITESRQVVELAVKEHKAEILALQQALKEQKLKAESLSDKL 1163
            .|.|.|::||:||.|||:|.|||||.|||||.|||||:||||||:|||||||||:||||||||.|
Zfish  1104 AERRTRDMQRLLDNEKQNRLRADQRSTESRQAVELAVREHKAEIVALQQALKEQRLKAESLSDTL 1168

Human  1164 NDLEKKHAMLEMNARSLQQKLETERELKQRLLEEQAKLQQQMDLQKNHIFRLTQGLQEALDRADL 1228
            |||||||||||||||||||||||||||||||:|||.||||||||||.||||||||||:|||:.||
Zfish  1169 NDLEKKHAMLEMNARSLQQKLETERELKQRLMEEQGKLQQQMDLQKTHIFRLTQGLQDALDQTDL 1233

Human  1229 LKTERSDLEYQLENIQVLYSHEKVKMEGTISQQTKLIDFLQAKMDQPAKKKKGLFSRRKED---- 1289
            |||||:||||||||||.:|||||||||||||||||||||||||||||:|||||:|.||..:    
Zfish  1234 LKTERTDLEYQLENIQAVYSHEKVKMEGTISQQTKLIDFLQAKMDQPSKKKKGIFGRRGREEVGV 1298

Human  1290 -----PALPTQ--VPLQYNELKLALEKEKARCAELEEALQKTRIELRSAREEAAHRKATDHPHPS 1347
                 .|:.||  |||||:::|.|||||::||:||||||||.||||||.||||||.||.:|..||
Zfish  1299 TANGATAMSTQPVVPLQYSDMKAALEKERSRCSELEEALQKMRIELRSLREEAAHFKAQEHVAPS 1363

Human  1348 TPATARQQIAMSAIVRSPEHQPSAMSLLAPPSS-RRKESSTPEE--------FSRRLKERMHHNI 1403
            |||:|||||.|||||:|||.||:..|||.|.|| ||||:|||||        :.||:||||||||
Zfish  1364 TPASARQQILMSAIVKSPERQPNPSSLLNPSSSARRKENSTPEEKRRVTFEKYGRRVKERMHHNI 1428

Human  1404 PHRFNVGLNMRATKCAVCLDTVHFGRQASKCLECQVMCHPKCSTCLPATCGLPAEYATHFTEAFC 1468
            ||||.|||||||.||.||||||||||||:.||||..:||||||.|||||||||||:||||:||.|
Zfish  1429 PHRFTVGLNMRAAKCTVCLDTVHFGRQAATCLECHTLCHPKCSPCLPATCGLPAEFATHFSEALC 1493

Human  1469 RDKMNSPGLQTKEPSSSLHLEGWMKVPRNNKRGQQGWDRKYIVLEGSKVLIYDNEAREAGQRPVE 1533
            |||.:||.||.||.|..:.||||||.|||.|||||||:|||::|:|:||.||::|..|...:|:|
Zfish  1494 RDKTSSPALQVKEASGHVRLEGWMKQPRNGKRGQQGWERKYVILDGTKVSIYESEPTEDSVKPLE 1558

Human  1534 EFELCLPDGDVSIHGAVGASELANTAKADVPYILKMESHPHTTCWPGRTLYLLAPSFPDKQRWVT 1598
            |||||||||:|::|||||||||.||||:|:||:||:|||||||||||::||.:|||||||||||.
Zfish  1559 EFELCLPDGEVTVHGAVGASELINTAKSDIPYVLKLESHPHTTCWPGQSLYFMAPSFPDKQRWVA 1623

Human  1599 ALESVVAGGRVSREKAEADAARDCVSYELLPAWVQKLLGNSLLKLEGDDRLDMNCTLPFSDQVVL 1663
            .|||||||.|.||||.|:||| .....:.|...|||||||||||||||||||:|||||.:||:||
Zfish  1624 VLESVVAGSRGSREKTESDAA-GVKRQKTLSPLVQKLLGNSLLKLEGDDRLDINCTLPLTDQIVL 1687

Human  1664 VGTEEGLYALNVLKNSLTHVPGIGAVFQIYIIKDLEKLLMIAGEERALCLVDVKKVKQSLAQSHL 1728
            ||:|||||||||:||||||:||:.:||||.|:|:|:|||||.|:|||||||::|:||||||||||
Zfish  1688 VGSEEGLYALNVIKNSLTHIPGLDSVFQIQILKELDKLLMITGKERALCLVEIKRVKQSLAQSHL 1752

Human  1729 PAQPDISPNIFEAVKGCHLFGAGKIENGLCICAAMPSKVVILRYNENLSKYCIRKEIETSEPCSC 1793
            |||||:||.|||||||||||.:|||:.|:|||||||:|:.|||:|:.|:|:||||||||||||||
Zfish  1753 PAQPDLSPYIFEAVKGCHLFASGKIDTGMCICAAMPNKITILRFNDTLNKFCIRKEIETSEPCSC 1817

Human  1794 IHFTNYSILIGTNKFYEIDMKQYTLEEFLDKNDHSLAPAVFAASSNSFPVSIVQVNSAGQREEYL 1858
            ||||.|||:|||||||||:||||.|||||||||.:||.|||||||:|||:||:||:||.|:.|||
Zfish  1818 IHFTGYSIIIGTNKFYEIEMKQYVLEEFLDKNDVTLASAVFAASSHSFPISIIQVSSAPQKVEYL 1882

Human  1859 LCFHEFGVFVDSYGRRSRTDDLKWSRLPLAFAYREPYLFVTHFNSLEVIEIQARSSAGTPARAYL 1923
            |||||||||||:|||||||||:|||||||:|||||||||||:||||:|||:|:.|:.|..|.|:|
Zfish  1883 LCFHEFGVFVDAYGRRSRTDDIKWSRLPLSFAYREPYLFVTYFNSLDVIEVQSHSALGPHAYAHL 1947

Human  1924 DIPNPRYLGPAISSGAIYLASSYQDKLRVICCKGNLVKESGT-EHHRGPSTSRSSPNKRGPPTYN 1987
            ||||||||||||||||:|||||||:|||||||||||.:|:.: |..|..||  .||||||||:||
Zfish  1948 DIPNPRYLGPAISSGAVYLASSYQNKLRVICCKGNLSQEAASAEMQRNGST--RSPNKRGPPSYN 2010

Human  1988 EHITKRVASSPAPPEGPSHPREPSTPHRYREGRTELRRDKSPGRPLEREKSPGRM---------- 2042
            |||:||:|:.||..||   .::|.|||||||.|||.||||||.||||||||||||          
Zfish  2011 EHISKRLAAMPAVQEG---LQQPGTPHRYREARTEFRRDKSPARPLEREKSPGRMERSPGRMMER 2072

Human  2043 -----LSTRRERSPGRLFEDSSRGRLPAGAVRTPLSQVNK-VWDQSSV 2084
                 :..||||||||.||: .|.||..|:.|||::.||| |||||||
Zfish  2073 SPGRVMELRRERSPGRAFEE-PRQRLHTGSARTPINTVNKQVWDQSSV 2119

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CITXP_011536085.1 STKc_CRIK 95..422 CDD:270752 201/331 (61%)
CwlO1 442..>598 CDD:443091 123/155 (79%)
SMC_prok_B 531..1343 CDD:274008 619/823 (75%)
CRIK 1401..1456 CDD:410364 45/54 (83%)
PH 1486..1605 CDD:459697 85/118 (72%)
CNH 1650..1946 CDD:214481 232/295 (79%)
citaXP_073807858.1 None

Return to query results.
Submit another query.