DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ATE1 and Ate1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001426290.1 Gene:ATE1 / 11101 HGNCID:782 Length:578 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_063142435.1 Gene:Ate1 / 293526 RGDID:1309335 Length:563 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:534 Identity:449/534 - (84%)
Similarity:481/534 - (90%) Gaps:6/534 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human    49 NRDSGMWAHSMTVQDYQDLIDRGWRRSGKYVYKPVMNQTCCPQYTIRCRPLQFQPSKSHKKVLKK 113
            :|..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
  Rat    32 SRSHGMWAHSMTVQDYQDLIDRGWRRSGKYVYKPVMNQTCCPQYTIRCHPLQFQPSKSHKKVLKK 96

Human   114 MLKFLAKGEVPKGSCEDEPMDSTMDDAVAGDFALINKLDIQCDLKTLSDDIKESLESEGKNS--- 175
            |||||||||:.||:||||||||||:|||.|||||:|||||:|||||||.|:|.|:|||.|..   
  Rat    97 MLKFLAKGEISKGNCEDEPMDSTMEDAVDGDFALMNKLDIKCDLKTLSSDLKVSIESEEKEKEKS 161

Human   176 -KKEEPQELLQSQDFVGEKLGSGEPSHSVKVHTVPKPGKGADLSKPPCRKAKEIRKERKRLKLMQ 239
             |||..::|:..| .:.|||||||||||:|||..|||||||||||||||||||:|||||||||||
  Rat   162 LKKEGSKDLIHPQ-AIEEKLGSGEPSHSIKVHVGPKPGKGADLSKPPCRKAKEMRKERKRLKLMQ 225

Human   240 QNPAGELEGFQAQGHPPSLFPPKAKSNQPKSLEDLIFESLPENASHKLEVRVVRSSPPSSQFKAT 304
            |:.||..|||||||.|.||. |||||||||||||||||||||:||||||||||||||||.|||||
  Rat   226 QSSAGAFEGFQAQGQPVSLL-PKAKSNQPKSLEDLIFESLPEDASHKLEVRVVRSSPPSPQFKAT 289

Human   305 LLESYQVYKRYQMVIHKNPPDTPTESQVRLVPVSFEDPEFKSSFSQSFSLYVKYQVAIHQDPPDE 369
            ..|||||||||||:|||:|||.||.|||||||.|||||||||||:||.|||.|||||||||.||.
  Rat   290 FQESYQVYKRYQMIIHKDPPDKPTVSQVRLVPASFEDPEFKSSFNQSLSLYTKYQVAIHQDEPDI 354

Human   370 CGKTEFTRFLCSSPLEAETPPNGPDCGYGSFHQQYWLDGKIIAVGVIDILPNCVSSVYLYYDPDY 434
            |.|:|||||||:||||||.|.|||:||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
  Rat   355 CDKSEFTRFLCNSPLEAEHPANGPECGYGSFHQQYWLDGKIIAVGVIDILPYCVSSVYLYYDPDY 419

Human   435 SFLSLGVYSALREIAFTRQLHEKTSQLSYYYMGFYIHSCPKMKYKGQYRPSDLLCPETYVWVPIE 499
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||
  Rat   420 SFLSLGVYSALREIAFTRQLHEKTSQLSYYYMGFYIHSCPKMRYKGQYRPSDLLCPETYVWVPIE 484

Human   500 QCLPSLENSKYCRFNQDPEAVDEDRSTEPDRLQVFHKRAIMPYGVYKKQQKDPSEEAAVLQYASL 564
            ||||||:|||||||||||:|.||.||.|.|||:|||:|:.|||||||..|:||||||.||:||:|
  Rat   485 QCLPSLDNSKYCRFNQDPQAEDEGRSKELDRLRVFHRRSAMPYGVYKNHQEDPSEEAVVLEYANL 549

Human   565 VGQKCSERMLLFRN 578
            |||||||.|||||:
  Rat   550 VGQKCSETMLLFRH 563

Return to query results.
Submit another query.