DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CHD3 and Chd3

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_005256484.1 Gene:CHD3 / 1107 HGNCID:1918 Length:2115 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_017169944.1 Gene:Chd3 / 216848 MGIID:1344395 Length:2111 Species:Mus musculus


Alignment Length:2119 Identity:2040/2119 - (96%)
Similarity:2067/2119 - (97%) Gaps:12/2119 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MASPLRDEEEEEEEMVVSEEEEEEEEEGDEEEEEEVEAADEDDEEDDDEGVLGRGPGHDRGRDRH 65
            ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||:|:||||||||||||.||||
Mouse     1 MASPLRDEEEEEEEMVVSEEEEEEEEEGD-EEEEEVEAADEDDEEEDEEGVLGRGPGHDRSRDRH 64

Human    66 SPPGCHLFPPPPPPPPPLPPPPPPPPPDKDDIRLLPSALGVKKRKRGPKKQKENKPGKPRKRKKR 130
            |||.||||||||      ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Mouse    65 SPPSCHLFPPPP------PPLPPPPPPDKDDIRLLPSALGVKKRKRGPKKQKENKPGKPRKRKKL 123

Human   131 DSEEEFGSERDEYREKSESGGSEYGTGPGRKRRRKHREKKEKKTKRRKKGEGDGGQKQVEQKSSA 195
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||.|||||||||
Mouse   124 DSEEEFGSERDEYREKSESGGSEYGTGPGRKRRRKHREKKEKKTKRRKRGEGDGGHKQVEQKSSA 188

Human   196 TLLLTWGLEDVEHVFSEEDYHTLTNYKAFSQFMRPLIAKKNPKIPMSKMMTILGAKWREFSANNP 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   189 TLLLTWGLEDVEHVFSEEDYHTLTNYKAFSQFMRPLIAKKNPKIPMSKMMTILGAKWREFSANNP 253

Human   261 FKGSAAAVAAAAAAAAAAVAEQVSAAVSSATPIAPSG-PPALPPPPAADIQPPPIRRAKTKEGKG 324
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||.:||||||||||||||||
Mouse   254 FKGSAAAVAAAAAAAAAAVAEQVSAAVSSATPIAPSGPPPALPPPPAPEIQPPPIRRAKTKEGKG 318

Human   325 PGHKRRSKSPRVPDGRKKLRGKKMAPLKIKLGLLGGKRKKGGSYVFQSDEGPEPEAEESDLDSGS 389
            ||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||.||..|||:||.|||||||||||||
Mouse   319 PGHKRRNKSPRVPDGRKKLRGKKMAPLKIKLGLLGGKRKKAGSCAFQSEEGHEPEAEESDLDSGS 383

Human   390 VHSASGRPDGPVRTKKLKRGRPGRKKKKVLGCPAVAGEEEVDGYETDHQDYCEVCQQGGEIILCD 454
            ||||||.||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   384 VHSASGWPDGPVRAKKLKRGRPGRKKKKVLGCPAVTGEEEVDGYETDHQDYCEVCQQGGEIILCD 448

Human   455 TCPRAYHLVCLDPELDRAPEGKWSCPHCEKEGVQWEAKEEEEEYEEEGEEEGEKEEEDDHMEYCR 519
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Mouse   449 TCPRAYHLVCLDPELDRAPEGKWSCPHCEKEGVQWEAKEEEEEYEEEG-EEGEKEEEDDHMEYCR 512

Human   520 VCKDGGELLCCDACISSYHIHCLNPPLPDIPNGEWLCPRCTCPVLKGRVQKILHWRWGEPPVAVP 584
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   513 VCKDGGELLCCDACISSYHIHCLNPPLPDIPNGEWLCPRCTCPVLKGRVQKILHWRWGEPPVAVP 577

Human   585 APQQADGNPDVPPPRPLQGRSEREFFVKWVGLSYWHCSWAKELQLEIFHLVMYRNYQRKNDMDEP 649
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   578 APQQADGNPDVPPPRPLQGRSEREFFVKWVGLSYWHCSWAKELQLEIFHLVMYRNYQRKNDMDEP 642

Human   650 PPLDYGSGEDDGKSDKRKVKDPHYAEMEEKYYRFGIKPEWMTVHRIINHSVDKKGNYHYLVKWRD 714
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||:|
Mouse   643 PPLDYGSGEDDGKSDKRKVKDPHYAEMEEKYYRFGIKPEWMTVHRIINHSMDKKGNYHYLVKWKD 707

Human   715 LPYDQSTWEEDEMNIPEYEEHKQSYWRHRELIMGEDPAQPRKYKKKKKELQGDGPPSSPTNDPTV 779
            ||||||||||||||||||::|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   708 LPYDQSTWEEDEMNIPEYDDHKQSYWRHRELIMGEDPAQPRKYKKKKKELQGDGPPSSPTNDPTV 772

Human   780 KYETQPRFITATGGTLHMYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTIQTIVFLYSLYKEGHTK 844
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   773 KYETQPRFITATGGTLHMYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTIQTIVFLYSLYKEGHTK 837

Human   845 GPFLVSAPLSTIINWEREFQMWAPKFYVVTYTGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIKGGKKAFKMKRE 909
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   838 GPFLVSAPLSTIINWEREFQMWAPKFYVVTYTGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIKGGKKAFKMKRE 902

Human   910 AQVKFHVLLTSYELITIDQAALGSIRWACLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYKIDHKLLLTGTPL 974
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   903 AQVKFHVLLTSYELITIDQAALGSIRWACLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYKIDHKLLLTGTPL 967

Human   975 QNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLEEFADISKEDQIKKLHDLLGPHMLRRLKADVFKNMPAKT 1039
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   968 QNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLEEFADISKEDQIKKLHDLLGPHMLRRLKADVFKNMPAKT 1032

Human  1040 ELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNSRGGGNQVSLLNIMMDLKKCCNHPYLFPVAAMESPKL 1104
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1033 ELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNSRGGGNQVSLLNIMMDLKKCCNHPYLFPVAAMESPKL 1097

Human  1105 PSGAYEGGALIKSSGKLMLLQKMLRKLKEQGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLDYEGYKYERIDGGI 1169
            |||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1098 PSGAYEGGALIKSSGKLLLLQKMLRKLKEQGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLDYEGYKYERIDGGI 1162

Human  1170 TGALRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIFDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQ 1234
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1163 TGALRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIFDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQ 1227

Human  1235 ANKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHLVVRPGLGSKAGSMSKQELDDILKFGTEELFKDE 1299
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1228 ANKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHLVVRPGLGSKAGSMSKQELDDILKFGTEELFKDE 1292

Human  1300 NEGENKEEDSSVIHYDNEAIARLLDRNQDATEDTDVQNMNEYLSSFKVAQYVVREEDKIEEIERE 1364
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1293 NEGENKEEDSSVIHYDNEAIARLLDRNQDATEDTDVQNMNEYLSSFKVAQYVVREEDKIEEIERE 1357

Human  1365 IIKQEENVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRVRKQVNYNDAAQEDQDNQSEYSVGSEEE 1429
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1358 IIKQEENVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRVRKQVNYNDAAQEDQDNQSEYSVGSEEE 1422

Human  1430 DEDFDERPEGRRQSKRQLRNEKDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNTRQRKAFLNAVMRWGMPPQDAF 1494
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1423 DEDFDERPEGRRQSKRQLRNEKDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNTRQRKAFLNAVMRWGMPPQDAF 1487

Human  1495 TTQWLVRDLRGKTEKEFKAYVSLFMRHLCEPGADGSETFADGVPREGLSRQQVLTRIGVMSLVKK 1559
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1488 TTQWLVRDLRGKTEKEFKAYVSLFMRHLCEPGADGSETFADGVPREGLSRQQVLTRIGVMSLVKK 1552

Human  1560 KVQEFEHINGRWSMPELMPDPSADSKRSSRASSPTKTSPTTPEASATNSPCTSKPATPAPSEKGE 1624
            |||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||:
Mouse  1553 KVQEFEHINGRWSMPELMPDPSAESKRSSRASSPTKTSPTTPEASTTNSPCTSKPATPAPSEKGD 1617

Human  1625 GIRTPLEKEEAENQEEKPEKNSRIGEKMETEADAPSPAPSLGERLEPRKIPLEDEVPGVPGEMEP 1689
            |:||||:|::.|||||||||||::|||||.|.|:||||||||||||.|||.||||.||||||.||
Mouse  1618 GVRTPLDKDDTENQEEKPEKNSKVGEKMEAEVDSPSPAPSLGERLEHRKILLEDEAPGVPGETEP 1682

Human  1690 EPGYRGDREKSATESTPGERGEEKPLDGQEHRERPEGETGDLGKRAEDVKGDRELRPG-PRDEPR 1753
            ||||||||||||:|.||||||||||||.||||||.|||||||||||||||.|||||.| ||||||
Mouse  1683 EPGYRGDREKSASEPTPGERGEEKPLDVQEHRERTEGETGDLGKRAEDVKADRELRLGPPRDEPR 1747

Human  1754 SNGRREEKTEKPRFMFNIADGGFTELHTLWQNEERAAISSGKLNEIWHRRHDYWLLAGIVLHGYA 1818
            .|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1748 PNGRREEKVEKPRFMFNIADGGFTELHTLWQNEERAAISSGKLNEIWHRRHDYWLLAGIVLHGYA 1812

Human  1819 RWQDIQNDAQFAIINEPFKTEANKGNFLEMKNKFLARRFKLLEQALVIEEQLRRAAYLNLSQEPA 1883
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1813 RWQDIQNDAQFAIINEPFKTEANKGNFLEMKNKFLARRFKLLEQALVIEEQLRRAAYLNLSQEPA 1877

Human  1884 HPAMALHARFAEAECLAESHQHLSKESLAGNKPANAVLHKGKGRGGPARGRAHNAASEPAGGVAE 1948
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||
Mouse  1878 HPAMALHARFAEAECLAESHQHLSKESLAGNKPANAVLHKGKGRGGPARGRAHNAASEPAGGIAE 1942

Human  1949 RHEGGRDPPASHAVPNTPHRSPPSDVRAQHPQPAGQQGHGASPHTGLPAGSLRYTSGVRGGLQRR 2013
            ||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||:||||||.||||
Mouse  1943 RHEGRCDPPASHAVPNTPHRSPPSDVRAQHPQPAGQQGHGASPHTGLSPGSLRHTSGVRGSLQRR 2007

Human  2014 TRRGPGRRRRQLQPDACRVLHHSRHQRPSSACEEGEGNGGGIGVRR--AGSEGAPSRGGDLYRRL 2076
            |||||||||||||||||||||||.|||||||.||.||||||:|:||  |||||||||||||||||
Mouse  2008 TRRGPGRRRRQLQPDACRVLHHSHHQRPSSAGEEREGNGGGVGIRRAGAGSEGAPSRGGDLYRRL 2072

Human  2077 TGSQACPSPRPRPRGRPPAQALGPAASPPPSPPLGPSLG 2115
            ||||||||||||||.||.:|||||.|:|||||||||.||
Mouse  2073 TGSQACPSPRPRPRSRPTSQALGPVANPPPSPPLGPPLG 2111

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CHD3XP_005256484.1 CHDNT 207..260 CDD:462357 52/52 (100%)
PHD1_CHD_II 440..482 CDD:277006 41/41 (100%)
PHD2_CHD_II 517..559 CDD:277007 41/41 (100%)
CD1_tandem_CHD3-4_like 564..642 CDD:349314 77/77 (100%)
CD2_tandem_CHD3-4_like 687..741 CDD:349309 49/53 (92%)
PLN03142 778..>1332 CDD:215601 552/553 (100%)
DEXHc_CHD3 795..1026 CDD:350813 230/230 (100%)
DUF1087 <1373..1416 CDD:461922 42/42 (100%)
CHDII_SANT-like 1437..1576 CDD:461920 138/138 (100%)
PHA03418 1578..>1727 CDD:177646 127/148 (86%)
CHDCT2 1797..1923 CDD:462358 125/125 (100%)
Chd3XP_017169944.1 CHDNT 200..253 CDD:462357 52/52 (100%)
PHD1_CHD_II 434..476 CDD:277006 41/41 (100%)
PHD2_CHD_II 510..552 CDD:277007 41/41 (100%)
CD1_tandem_CHD3-4_like 557..635 CDD:349314 77/77 (100%)
CD2_tandem_CHD3-4_like 680..734 CDD:349309 49/53 (92%)
PLN03142 771..>1325 CDD:215601 552/553 (100%)
DEXHc_CHD3 788..1019 CDD:350813 230/230 (100%)
DUF1087 <1366..1409 CDD:461922 42/42 (100%)
CHDII_SANT-like 1430..1569 CDD:461920 138/138 (100%)
PHA03169 1589..>1759 CDD:223003 144/169 (85%)
CHDCT2 1791..1917 CDD:462358 125/125 (100%)

Return to query results.
Submit another query.