Protein Alignment CHD2 and Chd2

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001262.3
• Gene: CHD2 / 1106
• HGNCID: 1917
• Length: 1828
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: XP_063118674.1
• Gene: Chd2 / 308738
• RGDID: 1310056
• Length: 1840
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 1808
• Identity: 1747/1808 - (96%)
• Similarity: 1783/1808 - (98%)
• Gaps: 1/1808 - (0%)

Human    21 SHSASEEASGSDSGSQSESEQGSDPGSGHGSESNSSSESSESQSESESESAGSKSQPVLPEAKEK 85
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    34 SHSASEEASASDSGSQSESEQGSDPGSGHGSESNSSSESSESQSESESESAGSKSQPVLPEAKEK 98

Human    86 PASKKERIADVKKMWEEYPDVYGVRRSNRSRQEPSRFNIKEEASSGSESGSPKRRGQRQLKKQEK 150
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    99 PASKKERIADVKKMWEEYPDVYGVRRSNRSRQEPSRFNIKEEASSGSESGSPKRRGQRQLKKQEK 163

Human   151 WKQEPSEDEQEQGTSAESEPEQKKVKARRPVPRRTVPKPRVKKQPKTQRGKRKKQDSSDEDDDDD 215
            |||:||||:||||:|||||.||||||||||:||||||||:||||||.||||||||:|||:|||||
  Rat   164 WKQDPSEDDQEQGSSAESEAEQKKVKARRPIPRRTVPKPQVKKQPKIQRGKRKKQESSDDDDDDD 228

Human   216 EAPKRQTRRRAAKNVSYKEDDDFETDSDDLIEMTGEGVDEQQDNSETIEKVLDSRLGKKGATGAS 280
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   229 EAPKRQTRRRAAKNVSYKEDDDFETDSDDLIEMTGEGVDEQQDNSETIEKVLDSRLGKKGATGAS 293

Human   281 TTVYAIEANGDPSGDFDTEKDEGEIQYLIKWKGWSYIHSTWESEESLQQQKVKGLKKLENFKKKE 345
            |||||:|||||||||||||::||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   294 TTVYAVEANGDPSGDFDTEREEGEIQYLIKWKGWSYIHSTWESEESLQQQKVKGLKKLENFKKKE 358

Human   346 DEIKQWLGKVSPEDVEYFNCQQELASELNKQYQIVERVIAVKTSKSTLGQTDFPAHSRKPAPSNE 410
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
  Rat   359 DEIKQWLGKVSPEDVEYFNCQQELASELNKQYQIVERVIAVKTSKSALGQTDFPAHSRKPAPSNE 423

Human   411 PEYLCKWMGLPYSECSWEDEALIGKKFQNCIDSFHSRNNSKTIPTRECKALKQRPRFVALKKQPA 475
            ||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   424 PEYLCKWMGLPYSECSWEDEALIGKKFQSCIDSFHSRNNSKTIPTRECKALKQRPRFVALKKQPA 488

Human   476 YLGGENLELRDYQLEGLNWLAHSWCKNNSVILADEMGLGKTIQTISFLSYLFHQHQLYGPFLIVV 540
            ||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   489 YLGGENLELRDYQLEGLNWLAHSWCKSNSVILADEMGLGKTIQTISFLSYLFHQHQLYGPFLIVV 553

Human   541 PLSTLTSWQREFEIWAPEINVVVYIGDLMSRNTIREYEWIHSQTKRLKFNALITTYEILLKDKTV 605
            ||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   554 PLSTLTSWQREFEIWAPEVNVVVYIGDLMSRNTIREYEWIHSQTKRLKFNALITTYEILLKDKTV 618

Human   606 LGSINWAFLGVDEAHRLKNDDSLLYKTLIDFKSNHRLLITGTPLQNSLKELWSLLHFIMPEKFEF 670
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   619 LGSINWAFLGVDEAHRLKNDDSLLYKTLIDFKSNHRLLITGTPLQNSLKELWSLLHFIMPEKFEF 683

Human   671 WEDFEEDHGKGRENGYQSLHKVLEPFLLRRVKKDVEKSLPAKVEQILRVEMSALQKQYYKWILTR 735
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   684 WEDFEEDHGKGRENGYQSLHKVLEPFLLRRVKKDVEKSLPAKVEQILRVEMSALQKQYYKWILTR 748

Human   736 NYKALAKGTRGSTSGFLNIVMELKKCCNHCYLIKPPEENERENGQEILLSLIRSSGKLILLDKLL 800
            |||||||||||||||||||||||||||||||||:.||::|||.|||:|.||||||||||||||||
  Rat   749 NYKALAKGTRGSTSGFLNIVMELKKCCNHCYLIRAPEDSERETGQEVLQSLIRSSGKLILLDKLL 813

Human   801 TRLRERGNRVLIFSQMVRMLDILAEYLTIKHYPFQRLDGSIKGEIRKQALDHFNADGSEDFCFLL 865
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   814 TRLRERGNRVLIFSQMVRMLDILAEYLTIKHYPFQRLDGSIKGEIRKQALDHFNADGSEDFCFLL 878

Human   866 STRAGGLGINLASADTVVIFDSDWNPQNDLQAQARAHRIGQKKQVNIYRLVTKGTVEEEIIERAK 930
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   879 STRAGGLGINLASADTVVIFDSDWNPQNDLQAQARAHRIGQKKQVNIYRLVTKGTVEEEIIERAK 943

Human   931 KKMVLDHLVIQRMDTTGRTILENNSGRSNSNPFNKEELTAILKFGAEDLFKELEGEESEPQEMDI 995
            |||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||
  Rat   944 KKMVLDHLVIQRMDTTGRTVLENNSGRSNSNPFNKEELTAILKFGAEDLFKEIEGEESEPQEMDI 1008

Human   996 DEILRLAETRENEVSTSATDELLSQFKVANFATMEDEEELEERPHKDWDEIIPEEQRKKVEEEER 1060
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1009 DEILRLAETRENEVSTSATDELLSQFKVANFATMEDEEELEERPHKDWDEIIPEEQRKKVEEEER 1073

Human  1061 QKELEEIYMLPRIRSSTKKAQTNDSDSDTESKRQAQRSSASESETEDSDDDKKPKRRGRPRSVRK 1125
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||
  Rat  1074 QKELEEIYMLPRIRSSTKKAQTNDSDSDTESKRQAQRSSASESETDDSDDDKKPKRRGRPRSVRK 1138

Human  1126 DLVEGFTDAEIRRFIKAYKKFGLPLERLECIARDAELVDKSVADLKRLGELIHNSCVSAMQEYEE 1190
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||
  Rat  1139 DLVEGFTDAEIRRFIKAYKKFGLPLERLECIARDAELVDKSVADLKRLGELVHNSCVSAMQEYEE 1203

Human  1191 QLKENASEGKGPGKRRGPTIKISGVQVNVKSIIQHEEEFEMLHKSIPVDPEEKKKYCLTCRVKAA 1255
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1204 QLKENASEGKGPGKRRGPTIKISGVQVNVKSIIQHEEEFEMLHKSIPVDPEEKKKYCLTCRVKAA 1268

Human  1256 HFDVEWGVEDDSRLLLGIYEHGYGNWELIKTDPELKLTDKILPVETDKKPQGKQLQTRADYLLKL 1320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
  Rat  1269 HFDVEWGVEDDSRLLLGIYEHGYGNWELIKTDPELKLTDKILPVETDKKPQGKQLQTRVDYLLKL 1333

Human  1321 LRKGLEKKGAVTGGEEAKLKKRKPRVKKENKVPRLKEEHGIELSSPRHSDNPSEEGEVKDDGLEK 1385
            |||||||||.||.||||||||||||||||||.||||:|||:||||||||||||||||||||||||
  Rat  1334 LRKGLEKKGTVTSGEEAKLKKRKPRVKKENKAPRLKDEHGLELSSPRHSDNPSEEGEVKDDGLEK 1398

Human  1386 SPMKKKQKKKENKENKEKQMSSRKDKEGDKERKKSKDKKEKPKSGDAKSSSKSKRSQGPVHITAG 1450
            ||.|||||||||||||||.:|||||:|||||:|||||||||.|.|||||||||||||||||||||
  Rat  1399 SPTKKKQKKKENKENKEKPVSSRKDREGDKEKKKSKDKKEKVKGGDAKSSSKSKRSQGPVHITAG 1463

Human  1451 SEPVPIGEDEDDDLDQETFSICKERMRPVKKALKQLDKPDKGLNVQEQLEHTRNCLLKIGDRIAE 1515
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||
  Rat  1464 SEPVPIGEDEDDDLDQETFSICKERMRPVKKALKQLDKPDKGLNVQEQLEHTRSCLLKIGDRIAE 1528

Human  1516 CLKAYSDQEHIKLWRRNLWIFVSKFTEFDARKLHKLYKMAHKKRSQEEEEQKKKDDVTGGKKPFR 1580
            ||:|||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||
  Rat  1529 CLRAYSEQEHIKLWRRNLWIFVSKFTEFDARKLHKLYKMAHKKRSQEEEEQKKKDDTLGGKKPFR 1593

Human  1581 PEASGSSRDSLISQSHTSHNLHPQKPHLPASHGPQMHGHPRDNYNHPNKRHFSNADRGDWQRERK 1645
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|:||||||||||||||||||||
  Rat  1594 PEASGSSRDSLISQSHASHNLHPQKPHLPASHGPQMHGHPRDTYSHPNKRHFSNADRGDWQRERK 1658

Human  1646 FNYGGGNNNPPWGSDRHHQYEQHWYKDHHYGDRRHMDAHRSGSYRPNNMSRKRPYDQYSSDRDHR 1710
            |||||| ||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||:||||||
  Rat  1659 FNYGGG-NNAPWGGDRHHQYEQHWYKDHHYGDRRHMDAHRSGSYRPNNMSRKRPYEQYNSDRDHR 1722

Human  1711 GHRDYYDRHHHDSKRRRSDEFRPQNYHQQDFRRMSDHRPAMGYHGQGPSDHYRSFHTDKLGEYKQ 1775
            |||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
  Rat  1723 GHRDYYDRHHHDSKRRRSDDFRPQNYHQQDFRRMSDHRPTMGYHGQGPSDHYRSFHTDKLGEYKQ 1787

Human  1776 PLPPLHPAVSDPRSPPSQKSPHDSKSPLDHRSPLERSLEQKNNPDYNWNVRKT 1828
            |:|.||.|:|||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1788 PMPTLHTALSDPRSPPAQKSPHDSKSPLDHRSPLERSLEQKNNPDYNWNVRKT 1840

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CHD2	NP_001262.3	Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1..243		211/221 (95%)
		CD1_tandem_CHD1-2_like	259..343	CDD:349313	80/83 (96%)
		CD2_tandem_CHD1-2_like	376..447	CDD:349308	68/70 (97%)
		DEXHc_CHD2	464..700	CDD:350812	233/235 (99%)
		PLN03142	468..>1021	CDD:215601	541/552 (98%)
		DEAH box	617..620		2/2 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1030..1124		92/93 (99%)
		CDH1_2_SANT_HL1	1130..1218	CDD:465731	86/87 (99%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1331..1462		119/130 (92%)
		CHD1 helical C-terminal domain (CHCT). /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:O14646	1464..1566		98/101 (97%)
		DUF4208	1471..1553	CDD:464035	78/81 (96%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1556..1638		76/81 (94%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1680..1828		138/147 (94%)
Chd2	XP_063118674.1	None