DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment AFG3L2 and Afg3l2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_006787.2 Gene:AFG3L2 / 10939 HGNCID:315 Length:797 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001128336.1 Gene:Afg3l2 / 307350 RGDID:1305259 Length:802 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:804 Identity:745/804 - (92%)
Similarity:764/804 - (95%) Gaps:9/804 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MAHRCLRLWGRGGCWPRGLQQLLVPGG-VGPGEQPCLRTLYRFVTTQARASRNSLLTDIIAAYQR 64
            ||||||.||||||| .|||..||||.| :|||.:|||||||::.|.|...||:|||.|:||||||
  Rat     1 MAHRCLLLWGRGGC-RRGLPPLLVPSGCLGPGRRPCLRTLYQYATVQTANSRSSLLRDVIAAYQR 64

Human    65 FCSRPPKGFEKYFPNGKNGKKASEPKEVMGEKKESKPAATTRSSGGGGGGGGKRGGKKDDSHWWS 129
            ||||||||||||||||||||||||.||.:||||||: .:..:||||..||||||.|||:||||||
  Rat    65 FCSRPPKGFEKYFPNGKNGKKASESKEAVGEKKESQ-LSGPQSSGGASGGGGKRRGKKEDSHWWS 128

Human   130 RFQKGDIPWDDKDFRMFFLWTALFWGGVMFYLLLKRSGREITWKDFVNNYLSKGVVDRLEVVNKR 194
            ||||||.|||||||||:||||||||.|||.|.|.|.|||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   129 RFQKGDFPWDDKDFRMYFLWTALFWSGVMIYFLFKSSGREITWKDFVNNYLSKGVVDRLEVVNKR 193

Human   195 FVRVTFTPGKTPVDGQYVWFNIGSVDTFERNLETLQQELGIEGENRVPVVYIAESDGSFLLSMLP 259
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   194 FVRVTFTPGKTPVDGQYVWFNIGSVDTFERNLETLQQELGIEGENRVPVVYIAESDGSFLLSMLP 258

Human   260 TVLIIAFLLYTIRRGPAGIGRTGRGMGGLFSVGETTAKVLKDEIDVKFKDVAGCEEAKLEIMEFV 324
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   259 TVLIIAFLLYTIRRGPAGIGRTGRGMGGLFSVGETTAKVLKDEIDVKFKDVAGCEEAKLEIMEFV 323

Human   325 NFLKNPKQYQDLGAKIPKGAILTGPPGTGKTLLAKATAGEANVPFITVSGSEFLEMFVGVGPARV 389
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   324 NFLKNPKQYQDLGAKIPKGAILTGPPGTGKTLLAKATAGEANVPFITVSGSEFLEMFVGVGPARV 388

Human   390 RDLFALARKNAPCILFIDEIDAVGRKRGRGNFGGQSEQENTLNQLLVEMDGFNTTTNVVILAGTN 454
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   389 RDLFALARKNAPCILFIDEIDAVGRKRGRGNFGGQSEQENTLNQLLVEMDGFNTTTNVVILAGTN 453

Human   455 RPDILDPALLRPGRFDRQIFIGPPDIKGRASIFKVHLRPLKLDSTLEKDKLARKLASLTPGFSGA 519
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
  Rat   454 RPDILDPALLRPGRFDRQIFIGPPDIKGRASIFKVHLRPLKLDSALEKDKLARKLASLTPGFSGA 518

Human   520 DVANVCNEAALIAARHLSDSINQKHFEQAIERVIGGLEKKTQVLQPEEKKTVAYHEAGHAVAGWY 584
            |||||||||||||||||||:||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   519 DVANVCNEAALIAARHLSDAINEKHFEQAIERVIGGLEKKTQVLQPEEKKTVAYHEAGHAVAGWY 583

Human   585 LEHADPLLKVSIIPRGKGLGYAQYLPKEQYLYTKEQLLDRMCMTLGGRVSEEIFFGRITTGAQDD 649
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   584 LEHADPLLKVSIIPRGKGLGYAQYLPKEQYLYTKEQLLDRMCMTLGGRVSEEIFFGRITTGAQDD 648

Human   650 LRKVTQSAYAQIVQFGMNEKVGQISFDLPRQGDMVLEKPYSEATARLIDDEVRILINDAYKRTVA 714
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||::|||||||
  Rat   649 LRKVTQSAYAQIVQFGMNEKVGQISFDLPRQGDMVLEKPYSEATARMIDDEVRILISEAYKRTVA 713

Human   715 LLTEKKADVEKVALLLLEKEVLDKNDMVELLGPRPFAEKSTYEEFVEGTGSLDEDTSLPEGLKDW 779
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||:||
  Rat   714 LLTEKKADVEKVALLLLEKEVLDKNDMVELLGPRPFTEKSTYEEFVEGTGSLDEDTSLPEGLQDW 778

Human   780 NKERE------KEKEEPPGEKVAN 797
            |||||      ||||||..|||.:
  Rat   779 NKEREKEKKEKKEKEEPVNEKVVS 802

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
AFG3L2NP_006787.2 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 76..126 35/49 (71%)
HflB 151..747 CDD:440233 584/595 (98%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 759..797 34/43 (79%)
Afg3l2NP_001128336.1 HflB 156..746 CDD:440233 579/589 (98%)

Return to query results.
Submit another query.