DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment PPARGC1A and Ppargc1a

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001317680.1 Gene:PPARGC1A / 10891 HGNCID:9237 Length:803 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_036020787.1 Gene:Ppargc1a / 19017 MGIID:1342774 Length:819 Species:Mus musculus


Alignment Length:790 Identity:741/790 - (93%)
Similarity:765/790 - (96%) Gaps:4/790 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human    18 REAGW---QCAALVGEDQPLCPDLPELDLSELDVNDLDTDSFLGGLKWCSDQSEIISNQYNNEPS 79
            :::.|   :|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:
Mouse     8 QDSVWSDIECAALVGEDQPLCPDLPELDLSELDVNDLDTDSFLGGLKWCSDQSEIISNQYNNEPA 72

Human    80 NIFEKIDEENEANLLAVLTETLDSLPVDEDGLPSFDALTDGDVTTDNEASPSSMPDGTPPPQEAE 144
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Mouse    73 NIFEKIDEENEANLLAVLTETLDSLPVDEDGLPSFDALTDGAVTTDNEASPSSMPDGTPPPQEAE 137

Human   145 EPSLLKKLLLAPANTQLSYNECSGLSTQNH-ANHNHRIRTNPAIVKTENSWSNKAKSICQQQKPQ 208
            |||||||||||||||||||||||||||||| |||.||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   138 EPSLLKKLLLAPANTQLSYNECSGLSTQNHAANHTHRIRTNPAIVKTENSWSNKAKSICQQQKPQ 202

Human   209 RRPCSELLKYLTTNDDPPHTKPTENRNSSRDKCTSKKKSHTQSQSQHLQAKPTTLSLPLTPESPN 273
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||.|||||||||||||||||
Mouse   203 RRPCSELLKYLTTNDDPPHTKPTENRNSSRDKCASKKKSHTQPQSQHAQAKPTTLSLPLTPESPN 267

Human   274 DPKGSPFENKTIERTLSVELSGTAGLTPPTTPPHKANQDNPFRASPKLKSSCKTVVPPPSKKPRY 338
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||.|||||||||:|:.||
Mouse   268 DPKGSPFENKTIERTLSVELSGTAGLTPPTTPPHKANQDNPFKASPKLKPSCKTVVPPPTKRARY 332

Human   339 SESSGTQGNNSTKKGPEQSELYAQLSKSSVLTGGHEERKTKRPSLRLFGDHDYCQSINSKTEILI 403
            ||.|||||::|||||||||||||||||||.|:.|||||||||||||||||||||||:||||:|||
Mouse   333 SECSGTQGSHSTKKGPEQSELYAQLSKSSGLSRGHEERKTKRPSLRLFGDHDYCQSLNSKTDILI 397

Human   404 NISQELQDSRQLENKDVSSDWQGQICSSTDSDQCYLRETLEASKQVSPCSTRKQLQDQEIRAELN 468
            ||||||||||||:.||.|.||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   398 NISQELQDSRQLDFKDASCDWQGHICSSTDSGQCYLRETLEASKQVSPCSTRKQLQDQEIRAELN 462

Human   469 KHFGHPSQAVFDDEADKTGELRDSDFSNEQFSKLPMFINSGLAMDGLFDDSEDESDKLSYPWDGT 533
            ||||||.||||||::|||.||||.|||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   463 KHFGHPCQAVFDDKSDKTSELRDGDFSNEQFSKLPVFINSGLAMDGLFDDSEDESDKLSYPWDGT 527

Human   534 QSYSLFNVSPSCSSFNSPCRDSVSPPKSLFSQRPQRMRSRSRSFSRHRSCSRSPYSRSRSRSPGS 598
            |.||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   528 QPYSLFDVSPSCSSFNSPCRDSVSPPKSLFSQRPQRMRSRSRSFSRHRSCSRSPYSRSRSRSPGS 592

Human   599 RSSSRSCYYYESSHYRHRTHRNSPLYVRSRSRSPYSRRPRYDSYEEYQHERLKREEYRREYEKRE 663
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|:||||||:|||:|:||||
Mouse   593 RSSSRSCYYYESSHYRHRTHRNSPLYVRSRSRSPYSRRPRYDSYEAYEHERLKRDEYRKEHEKRE 657

Human   664 SERAKQRERQRQKAIEERRVIYVGKIRPDTTRTELRDRFEVFGEIEECTVNLRDDGDSYGFITYR 728
            ||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   658 SERAKQRERQKQKAIEERRVIYVGKIRPDTTRTELRDRFEVFGEIEECTVNLRDDGDSYGFITYR 722

Human   729 YTCDAFAALENGYTLRRSNETDFELYFCGRKQFFKSNYADLDSNSDDFDPASTKSKYDSLDFDSL 793
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||
Mouse   723 YTCDAFAALENGYTLRRSNETDFELYFCGRKQFFKSNYADLDTNSDDFDPASTKSKYDSLDFDSL 787

Human   794 LKEAQRSLRR 803
            ||||||||||
Mouse   788 LKEAQRSLRR 797

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
PPARGC1ANP_001317680.1 Complexin_NTD 641..676 CDD:459253 28/34 (82%)
RRM_PPARGC1A 680..770 CDD:410034 89/89 (100%)
Ppargc1aXP_036020787.1 RRM_PPARGC1A 674..764 CDD:410034 89/89 (100%)

Return to query results.
Submit another query.