Protein Alignment CFTR and cftr

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_000483.3
• Gene: CFTR / 1080
• HGNCID: 1884
• Length: 1480
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: XP_031754831.1
• Gene: cftr / 100486085
• XenbaseID: XB-GENE-853972
• Length: 1485
• Species: Xenopus tropicalis
• Alignment Length: 1493
• Identity: 1155/1493 - (77%)
• Similarity: 1311/1493 - (87%)
• Gaps: 21/1493 - (1%)

Human     1 MQRSPLEKASVVSKLFFSWTRPILRKGYRQRLELSDIYQIPSVDSADNLSEKLEREWDRELA-SK 64
            ||||||||||:.|::|||||:|||.|||||||||||||||...||||||||:||||||||:| ||
 Frog     1 MQRSPLEKASIFSQIFFSWTKPILWKGYRQRLELSDIYQIHPGDSADNLSERLEREWDREVATSK 65

Human    65 KNPKLINALRRCFFWRFMFYGIFLYLGEVTKAVQPLLLGRIIASYDPDNKEERSIAIYLGIGLCL 129
            |||||||||:|||||:|:||||.|||||||||||||||||||||||.||:.|||||.||.|||||
 Frog    66 KNPKLINALKRCFFWKFLFYGILLYLGEVTKAVQPLLLGRIIASYDRDNEHERSIAYYLAIGLCL 130

Human   130 LFIVRTLLLHPAIFGLHHIGMQMRIAMFSLIYKKTLKLSSRVLDKISIGQLVSLLSNNLNKFDEG 194
            ||:||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
 Frog   131 LFVVRMLLLHPAIFGLHHIGMQMRIAMFSLIYKKTLKLSSRVLDKISTGQLVSLLSNNLNKFDEG 195

Human   195 LALAHFVWIAPLQVALLMGLIWELLQASAFCGLGFLIVLALFQAGLGRMMMKYRDQRAGKISERL 259
            ||||||||||||||.|||||:|:||||||||||||||:||||||.||||||||||:|||||:|||
 Frog   196 LALAHFVWIAPLQVLLLMGLLWDLLQASAFCGLGFLIILALFQAWLGRMMMKYRDKRAGKINERL 260

Human   260 VITSEMIENIQSVKAYCWEEAMEKMIENLRQTELKLTRKAAYVRYFNSSAFFFSGFFVVFLSVLP 324
            |||||:|||||||||||||.||||:||.:|:||||||||||||||||||||||||||||||.::|
 Frog   261 VITSEIIENIQSVKAYCWESAMEKIIETIRETELKLTRKAAYVRYFNSSAFFFSGFFVVFLCIVP 325

Human   325 YALIKGIILRKIFTTISFCIVLRMAVTRQFPWAVQTWYDSLGAINKIQDFLQKQEYKTLEYNLTT 389
            :.|:.||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||:||||:|||:|||||||
 Frog   326 HLLLDGISLRKIFTTISFSIVLRMAVTRQFPWAVQTWYDSLGVINKIQEFLQKEEYKSLEYNLTT 390

Human   390 TEVVMENVTAFWEEGFGELFEKAKQNNNNRKTSNGDDSLFFSNFSLLGTPVLKDINFKIERGQLL 454
            |||.||||:|.|:||.||.||||||..|....||.|.|.|||||||...|||::||||||:||||
 Frog   391 TEVAMENVSASWDEGIGEFFEKAKQEVNGGNISNEDPSPFFSNFSLHVAPVLRNINFKIEKGQLL 455

Human   455 AVAGSTGAGKTSLLMVIMGELEPSEGKIKHSGRISFCSQFSWIMPGTIKENIIFGVSYDEYRYRS 519
            |:|||||||||||||:||||||||.|||||||||||..|.|||||||||||||||||||:|||.|
 Frog   456 AIAGSTGAGKTSLLMMIMGELEPSAGKIKHSGRISFSPQVSWIMPGTIKENIIFGVSYDQYRYLS 520

Human   520 VIKACQLEEDISKFAEKDNIVLGEGGITLSGGQRARISLARAVYKDADLYLLDSPFGYLDVLTEK 584
            ||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||:||||.|||:.|||
 Frog   521 VIKACQLEEDISKFPEKDNTVLGEGGITLSGGQRARISLARAVYKDADLYLMDSPFSYLDLFTEK 585

Human   585 EIFESCVCKLMANKTRILVTSKMEHLKKADKILILHEGSSYFYGTFSELQNLQPDFSSKLMGCDS 649
            ||||||||||||||||||||||:|.||||||:|||||||.||||||||||:.:|:|||.|.|
 Frog   586 EIFESCVCKLMANKTRILVTSKVEQLKKADKVLILHEGSCYFYGTFSELQDQRPEFSSHLTG--- 647

Human   650 FDQFSAERRNSILTETLHRFSLEGDAPVSWTETKKQSFKQTGEFGEKRKNSILNPINSIRKFSIV 714
            ||.|:|||||||:||||.|.|::.|......|.|.:||||..:|.||||||::||..|.|||||:
 Frog   648 FDHFNAERRNSIITETLRRCSIDSDPTAVRNEVKNKSFKQVADFSEKRKNSVINPRKSSRKFSIM 712

Human   715 QKTPLQMNGIEEDSDEPL--ERRLSLVPDSEQGEAILPRISVISTGPTLQARRRQSVLNLMTH-S 776
            ||:..||:||||:...|.  ||:|||||:||||||.|||.:|::||||.|.|||||||||||. |
 Frog   713 QKSQPQMSGIEEEDIPPNQGERKLSLVPESEQGEASLPRSNVLNTGPTFQGRRRQSVLNLMTRTS 777

Human   777 VNQGQNIHRKTTASTRKVSLAPQANLT-ELDIYSRRLSQETGLEISEEINEEDLKECFFDDMESI 840
            |:||.|.......|.||:|:...:|.: |:|||:|||||::.||:|||||||||||||.||.:|.
 Frog   778 VSQGSNAFATRNTSVRKMSVGSFSNSSFEVDIYNRRLSQDSILEVSEEINEEDLKECFLDDTDSP 842

Human   841 PAVTTWNTYLRYITVHKSLIFVLIWCLVIFLAEVAASLVVLWLL-GNTPLQDKGNSTHSRNNSYA 904
            ...||||||:|::|.||:.||:|::|:|||||||.||...||:: .|.|:   .|.|.:.|.|.|
 Frog   843 SPTTTWNTYIRFLTAHKNFIFILVFCIVIFLAEVIASSAGLWIIKRNAPV---SNMTSNENISEA 904

Human   905 -----VIITSTSSYYVFYIYVGVADTLLAMGFFRGLPLVHTLITVSKILHHKMLHSVLQAPMSTL 964
                 ||:|.||.||||||||||||:|||:|.||||||||:||:||::||.|||||:|.|||||.
 Frog   905 SDILSVIVTHTSFYYVFYIYVGVADSLLALGIFRGLPLVHSLISVSRVLHKKMLHSILHAPMSTF 969

Human   965 NTLKAGGILNRFSKDIAILDDLLPLTIFDFIQLLLIVIGAIAVVAVLQPYIFVATVPVIVAFIML 1029
            ||::||.||||||||.|||||:|||:||||.||:|||||||.||::|:||||:||||||.|||:|
 Frog   970 NTMRAGRILNRFSKDTAILDDILPLSIFDFTQLVLIVIGAITVVSLLEPYIFLATVPVIAAFILL 1034

Human  1030 RAYFLQTSQQLKQLESEGRSPIFTHLVTSLKGLWTLRAFGRQPYFETLFHKALNLHTANWFLYLS 1094
            |:|||.|||||||||||.|||||.||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  1035 RSYFLHTSQQLKQLESEARSPIFAHLITSLKGLWTLRAFGRQPYFETLFHKALNLHTANWFLYLS 1099

Human  1095 TLRWFQMRIEMIFVIFFIAVTFISILTTGEGEGRVGIILTLAMNIMSTLQWAVNSSIDVDSLMRS 1159
            |||||||.||||||||||||:||||.|:|.||.:|||:||||||||:|||||||:||||||||||
 Frog  1100 TLRWFQMTIEMIFVIFFIAVSFISIATSGAGEEKVGIVLTLAMNIMNTLQWAVNASIDVDSLMRS 1164

Human  1160 VSRVFKFIDMPTEGKPTKSTKPYKNGQLSKVMIIENSHVKKDDIWPSGGQMTVKDLTAKYTEGGN 1224
            |||:|:|||||.|  .......:|:.|||:|:|.||.::||:.:||||||||||:|:|||.:||:
 Frog  1165 VSRIFRFIDMPRE--ELIHDNNHKDDQLSEVLIYENDYIKKNQVWPSGGQMTVKNLSAKYKDGGH 1227

Human  1225 AILENISFSISPGQRVGLLGRTGSGKSTLLSAFLRLLNTEGEIQIDGVSWDSITLQQWRKAFGVI 1289
            .:|||||||::||||||||||||||||||||||||||:|:|:||||||||.:|.||:|||||||:
 Frog  1228 TVLENISFSLNPGQRVGLLGRTGSGKSTLLSAFLRLLSTQGDIQIDGVSWQTIPLQKWRKAFGVV 1292

Human  1290 PQKVFIFSGTFRKNLDPYEQWSDQEIWKVADEVGLRSVIEQFPGKLDFVLVDGGCVLSHGHKQLM 1354
            ||||||||||.|||||||.:|||:|:.||.:||||:|:|:||||:|||||:|||||||||||||:
 Frog  1293 PQKVFIFSGTIRKNLDPYGKWSDEELLKVTEEVGLKSIIDQFPGQLDFVLLDGGCVLSHGHKQLV 1357

Human  1355 CLARSVLSKAKILLLDEPSAHLDPVTYQIIRRTLKQAFADCTVILCEHRIEAMLECQQFLVIEEN 1419
            ||||||||||||||||||||||||:|:||||:|||.|||:|||||.|||:|||||||.|||||:|
 Frog  1358 CLARSVLSKAKILLLDEPSAHLDPITFQIIRKTLKHAFANCTVILSEHRLEAMLECQHFLVIEDN 1422

Human  1420 KVRQYDSIQKLLNERSLFRQAISPSDRVKLFP--HRNSSKCKSKPQIAALKEETEEEVQDTRL 1480
            .||||||||||:||:|.|:||||.|||:||||  .|||||.||:|:|:||:||||||||:|||
 Frog  1423 TVRQYDSIQKLMNEKSFFKQAISQSDRLKLFPLHRRNSSKRKSRPKISALQEETEEEVQETRL 1485

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CFTR	NP_000483.3	CFTR_protein	1..1480	CDD:273530	1153/1491 (77%)
		Disordered R region. /evidence=ECO:0000269|PubMed:10792060	654..831		107/180 (59%)
		Interaction with GORASP2. /evidence=ECO:0000269|PubMed:21884936	1386..1480		72/95 (76%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1452..1480		20/27 (74%)
		PDZ-binding. /evidence=ECO:0000269|PubMed:11707463, ECO:0000269|PubMed:16331976	1478..1480		1/1 (100%)
cftr	XP_031754831.1	CFTR_protein	1..1472	CDD:273530	1142/1478 (77%)