DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment KIF1C and Kif1c

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_006603.2 Gene:KIF1C / 10749 HGNCID:6317 Length:1103 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_665884.2 Gene:Kif1c / 113886 RGDID:70928 Length:1100 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1103 Identity:1043/1103 - (94%)
Similarity:1056/1103 - (95%) Gaps:3/1103 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MAGASVKVAVRVRPFNARETSQDAKCVVSMQGNTTSIINPKQSKDAPKSFTFDYSYWSHTSTEDP 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
  Rat     1 MAGASVKVAVRVRPFNARETSQDAKCVVSMQGNTTSIINPKQSKDAPKSFTFDYSYWSHTSVEDP 65

Human    66 QFASQQQVYRDIGEEMLLHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGRQEPGQQGIVPQLCEDLFSRV 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 QFASQQQVYRDIGEEMLLHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGRQEPGQQGIVPQLCEDLFSRV 130

Human   131 SENQSAQLSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKSRGSLRVREHPILGPYVQDLSKLAVTSYADIADL 195
            :.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 NVNQSAQLSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKSRGSLRVREHPILGPYVQDLSKLAVTSYADIADL 195

Human   196 MDCGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQRCHDQLTGLDSEKVSKISLVDLAGSERADSSGA 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 MDCGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQRSHDQLTGLDSEKVSKISLVDLAGSERADSSGA 260

Human   261 RGMRLKEGANINKSLTTLGKVISALADMQSKKRKSDFIPYRDSVLTWLLKENLGGNSRTAMIAAL 325
            |||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 RGMRLKEGANINKSLTTLGKVISALADLQSKKRKSDFIPYRDSVLTWLLKENLGGNSRTAMIAAL 325

Human   326 SPADINYEETLSTLRYADRTKQIRCNAIINEDPNARLIRELQEEVARLRELLMAQGLSASALEGL 390
            |||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
  Rat   326 SPADINYEETLSTLRYADRTKQIRCNAVINEDPNARLIRELQEEVARLRELLMAQGLSASALGGL 390

Human   391 KTEEGSVRGALPAVSSPPAPVSPSSPTTHNGELEPSFSPNTESQIGPEEAMERLQETEKIIAELN 455
            |.||||..|.|||.||||||.|||||..|||||||||||:.|.||||||||||||||||||||||
  Rat   391 KVEEGSPGGVLPAASSPPAPASPSSPPPHNGELEPSFSPSAEPQIGPEEAMERLQETEKIIAELN 455

Human   456 ETWEEKLRKTEALRMEREALLAEMGVAVREDGGTVGVFSPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYHIKD 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 ETWEEKLRKTEALRMEREALLAEMGVAVREDGGTVGVFSPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYHIKD 520

Human   521 GVTRVGQVDMDIKLTGQFIREQHCLFRSIPQPDGEVVVTLEPCEGAETYVNGKLVTEPLVLKSGN 585
            |||||||||:||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   521 GVTRVGQVDVDIKLTGQFIREQHCLFRSIPQPDGEVMVTLEPCEGAETYVNGKLVTEPLVLKSGN 585

Human   586 RIVMGKNHVFRFNHPEQARLERERGVPPPPGPPSEPVDWNFAQKELLEQQGIDIKLEMEKRLQDL 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   586 RIVMGKNHVFRFNHPEQARLERERGVPPPPGPPSEPVDWNFAQKELLEQQGIDIKLEMEKRLQDL 650

Human   651 ENQYRKEKEEADLLLEQQRLYADSDSGDDSDKRSCEESWRLISSLREQLPPTTVQTIVKRCGLPS 715
            |||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
  Rat   651 ENQYRKEKEEADLLLEQQRLYADSDSGEDSDKRSCEESWRLISSLREQLPPNTVQTIVKRCGLPS 715

Human   716 SGKRRAPRRVYQIPQRRRLQGKDPRWATMADLKMQAVKEICYEVALADFRHGRAEIEALAALKMR 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   716 SGKRRAPRRVYQIPQRRRLQGKDPRWATMADLKMQAVKEICYEVALADFRHGRAEIEALAALKMR 780

Human   781 ELCRTYGKPDGPGDAWRAVARDVWDTVGEEEGGGAGSGGGSEEGARGAEVEDLRAHIDKLTGILQ 845
            |||||||||:||||||||||||||||||||||.| |.|||.||||||||||||||||||||||||
  Rat   781 ELCRTYGKPEGPGDAWRAVARDVWDTVGEEEGCG-GGGGGGEEGARGAEVEDLRAHIDKLTGILQ 844

Human   846 EVKLQNSSKDRELQALRDRMLRMERVIPLAQDHEDENEEGGEVPWAPPEGSEAAEEAAPSDRMPS 910
            |||||||||||||||||||||||||||||.||.||:|||.|.|.|||||||||.|||..:|..|:
  Rat   845 EVKLQNSSKDRELQALRDRMLRMERVIPLTQDLEDDNEESGLVTWAPPEGSEAVEEAVSNDHSPA 909

Human   911 ARPPSPPLSSWERVSRLMEEDPAFRRGRLRWLKQEQLRLQGLQGSGGRGGGLRRPPARFVPPHDC 975
            .||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   910 VRPSSPPQSSWERVSRLMEEDPAFRRGRLRWLKQEQLRLQGLQGSGGRGGGLRRPPARFVPPHDC 974

Human   976 KLRFPFKSNPQHRESWPGMGSGEAPTPLQPPEEVTPHPATPARRPPSPRRSHHPRRNSLDGGGRS 1040
            |||||||||||||||||||||||||.| |||||||..|..|.||||||||.|.|||||||||.||
  Rat   975 KLRFPFKSNPQHRESWPGMGSGEAPGP-QPPEEVTAPPPPPNRRPPSPRRPHRPRRNSLDGGSRS 1038

Human  1041 RGAGSAQPEPQHFQPKKHNSYPQPPQPYPAQRPPGPRYPPYTTPPRMRRQRSAPDLKESGAAV 1103
            ||.||.||||||.:|:|||||||.|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1039 RGGGSTQPEPQHLRPQKHNSYPQQPQPYPAQR-PGPRYPPYTTPPRMRRQRSAPDLKESGAAV 1100

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
KIF1CNP_006603.2 KISc_KIF1A_KIF1B 4..355 CDD:276816 344/350 (98%)
Kinesin_assoc 352..522 CDD:465047 156/169 (92%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 400..438 29/37 (78%)
FHA_KIF1C 498..599 CDD:438780 98/100 (98%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 808..828 15/19 (79%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 874..924 33/49 (67%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 950..1103 135/152 (89%)
Kif1cNP_665884.2 KISc_KIF1A_KIF1B 4..355 CDD:276816 344/350 (98%)
Kinesin_assoc 352..522 CDD:465047 156/169 (92%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 398..435 27/36 (75%)
FHA_KIF1C 498..599 CDD:438780 98/100 (98%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 900..924 14/23 (61%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 949..1100 135/152 (89%)

Return to query results.
Submit another query.