DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment PRPF8 and PRP8

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_006436.3 Gene:PRPF8 / 10594 HGNCID:17340 Length:2335 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_012035.1 Gene:PRP8 / 856570 SGDID:S000001208 Length:2413 Species:Saccharomyces cerevisiae


Alignment Length:2375 Identity:1460/2375 - (61%)
Similarity:1818/2375 - (76%) Gaps:65/2375 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human    13 PVPGP--------------LAPLPDYMSEEKLQEKARKWQQLQAKRYAEKRKFGFVDAQ------ 57
            |.|.|              |.|.|.....::|:.||.|..:|..||..:..|..||..:      
Yeast    52 PPPPPSNFEINAEEIVDFTLPPPPPPPGLDELETKAEKKVELHGKRKLDIGKDTFVTRKSRKRAK 116

Human    58 --------------KEDMPPEHVRKIIRDHGDMTNRKFRHDKRVYLGALKYMPHAVLKLLENMPM 108
                          |.:|||||:||||..|.||.::.:..||:.:||||||:|||:||||||||.
Yeast   117 KMTKKAKRSNLYTPKAEMPPEHLRKIINTHSDMASKMYNTDKKAFLGALKYLPHAILKLLENMPH 181

Human   109 PWEQIRDVPVLYHITGAISFVNEIPWVIEPVYISQWGSMWIMMRREKRDRRHFKRMRFPPFDDEE 173
            ||||.::|.||||.:|||:||||.|.||||||.:||.:.||.||||||||.||||||||||||:|
Yeast   182 PWEQAKEVKVLYHTSGAITFVNETPRVIEPVYTAQWSATWIAMRREKRDRTHFKRMRFPPFDDDE 246

Human   174 PPLDYADNILDVEPLEAIQLELDPEEDAPVLDWFYDHQPLRDSRKYVNGSTYQRWQFTLPMMSTL 238
            |||.|..:|.::|||:.|.|.||.::|..|.||.||.:||.:..|.|||::|::|.|.||.||.|
Yeast   247 PPLSYEQHIENIEPLDPINLPLDSQDDEYVKDWLYDSRPLEEDSKKVNGTSYKKWSFDLPEMSNL 311

Human   239 YRLANQLLTDLVDDNYFYLFDLKAFFTSKALNMAIPGGPKFEPLV-RDINLQDEDWNEFNDINKI 302
            |||:..|..::.|.||:||||.|:||..||||.|||||||||||. |:   ::||:||||.|:::
Yeast   312 YRLSTPLRDEVTDKNYYYLFDKKSFFNGKALNNAIPGGPKFEPLYPRE---EEEDYNEFNSIDRV 373

Human   303 IIRQPIRTEYKIAFPYLYNNLPHHVHLTWYHTP-NVVFIKTEDPDLPAFYFDPLINPISHRHSVK 366
            |.|.|||:|||:|||:|||:.|..|.:.||:.| :.:....|:.|.||.:|||.:|||.|.....
Yeast   374 IFRVPIRSEYKVAFPHLYNSRPRSVRIPWYNNPVSCIIQNDEEYDTPALFFDPSLNPIPHFIDNN 438

Human   367 SQEPLPDDDE--EFELPEFVEPFL-KDTPLYTDNTANGIALLWAPRPFNLRSGRTRRALDIPLVK 428
            |...:.:..|  :|.|||...|.| ::..|...||.:.::|..:|.|||...|:..||.|:.|.|
Yeast   439 SSLNVSNTKENGDFTLPEDFAPLLAEEEELILPNTKDAMSLYHSPFPFNRTKGKMVRAQDVALAK 503

Human   429 NWYREHCPAGQPVKVRVSYQKLLKYYVLNALKHRPPKAQKKRYLFRSFKATKFFQSTKLDWVEVG 493
            .|:.:|.....||||:||||||||.||||.|....|....|..|.:|.|.||:||.|.:||||.|
Yeast   504 KWFLQHPDEEYPVKVKVSYQKLLKNYVLNELHPTLPTNHNKTKLLKSLKNTKYFQQTTIDWVEAG 568

Human   494 LQVCRQGYNMLNLLIHRKNLNYLHLDYNFNLKPVKTLTTKERKKSRFGNAFHLCREVLRLTKLVV 558
            ||:||||:||||||||||.|.||||||||||||.||||||||||||.||:|||.||:|::.||:|
Yeast   569 LQLCRQGHNMLNLLIHRKGLTYLHLDYNFNLKPTKTLTTKERKKSRLGNSFHLMRELLKMMKLIV 633

Human   559 DSHVQYRLGNVDAFQLADGLQYIFAHVGQLTGMYRYKYKLMRQIRMCKDLKHLIYYRFNTGPVGK 623
            |:|||:|||||||||||||:.||..|:|||||:||||||:|.|||.||||||:|||:||.. :||
Yeast   634 DTHVQFRLGNVDAFQLADGIHYILNHIGQLTGIYRYKYKVMHQIRACKDLKHIIYYKFNKN-LGK 697

Human   624 GPGCGFWAAGWRVWLFFMRGITPLLERWLGNLLARQFEGRHSKGVAKTVTKQRVESHFDLELRAA 688
            |||||||...|||||.|:||..|||||::|||:.|||||| |..:.||.||||:::::|||||.:
Yeast   698 GPGCGFWQPAWRVWLNFLRGTIPLLERYIGNLITRQFEGR-SNEIVKTTTKQRLDAYYDLELRNS 761

Human   689 VMHDILDMMPEGIKQNKARTILQHLSEAWRCWKANIPWKVPGLPTPIENMILRYVKAKADWWTNT 753
            ||.|||:||||.|:|.||||||||||||||||||||||.|||:|.||:.:|.||:|:|||.|.:.
Yeast   762 VMDDILEMMPESIRQKKARTILQHLSEAWRCWKANIPWDVPGMPAPIKKIIERYIKSKADAWVSA 826

Human   754 AHYNRERIRRGATVDKTVCKKNLGRLTRLYLKAEQERQHNYLKDGPYITAEEAVAVYTTTVHWLE 818
            ||||||||:|||.|:||:.||||||||||::|.|||||....|:||.||.|||..:::..|.|||
Yeast   827 AHYNRERIKRGAHVEKTMVKKNLGRLTRLWIKNEQERQRQIQKNGPEITPEEATTIFSVMVEWLE 891

Human   819 SRRFSPIPFPPLSYKHDTKLLILALERLKEAYSVKSRLNQSQREELGLIEQAYDNPHEALSRIKR 883
            ||.|||||||||:||:|||:|:||||.||:.|:.|.|||.|:||||.|||:||||||:.|:|||:
Yeast   892 SRSFSPIPFPPLTYKNDTKILVLALEDLKDVYASKVRLNASEREELALIEEAYDNPHDTLNRIKK 956

Human   884 HLLTQRAFKEVGIEFMDLYSHLVPVYDVEPLEKITDAYLDQYLWYEADKRRLFPPWIKPADTEPP 948
            :|||||.||.|.|..|:.|.::.|||.|:|||||||||||||||||||:|:|||.||||:|:|.|
Yeast   957 YLLTQRVFKPVDITMMENYQNISPVYSVDPLEKITDAYLDQYLWYEADQRKLFPNWIKPSDSEIP 1021

Human   949 PLLVYKWCQGINNLQDVWETSEGECNVMLESRFEKMYEKIDLTLLNRLLRLIVDHNIADYMTAKN 1013
            |||||||.||||||.::|:.|.|:..|:||:...:|.||||.||||||||||||.|||||:||||
Yeast  1022 PLLVYKWTQGINNLSEIWDVSRGQSAVLLETTLGEMAEKIDFTLLNRLLRLIVDPNIADYITAKN 1086

Human  1014 NVVINYKDMNHTNSYGIIRGLQFASFIVQYYGLVMDLLVLGLHRASEMAGPPQMPNDFLSFQDIA 1078
            |||||:|||:|.|.||:||||:|||||.||||||:|||:||..||:::|||...||:|:.|:...
Yeast  1087 NVVINFKDMSHVNKYGLIRGLKFASFIFQYYGLVIDLLLLGQERATDLAGPANNPNEFMQFKSKE 1151

Human  1079 TEAAHPIRLFCRYIDRIHIFFRFTADEARDLIQRYLTEHPDPNNENIVGYNNKKCWPRDARMRLM 1143
            .|.||||||:.||:|||::.|.|..||..:|...||.|:||||.||.:||||:||||:|:||||:
Yeast  1152 VEKAHPIRLYTRYLDRIYMLFHFEEDEGEELTDEYLAENPDPNFENSIGYNNRKCWPKDSRMRLI 1216

Human  1144 KHDVNLGRAVFWDIKNRLPRSVTTVQWENSFVSVYSKDNPNLLFNMCGFECRILPKCRTSYEEFT 1208
            :.||||||||||:|::|:|.|:|:::|||:|||||||:||||||:|||||.||||:.|.. |..:
Yeast  1217 RQDVNLGRAVFWEIQSRVPTSLTSIKWENAFVSVYSKNNPNLLFSMCGFEVRILPRQRME-EVVS 1280

Human  1209 HKDGVWNLQNEVTKERTAQCFLRVDDESMQRFHNRVRQILMASGSTTFTKIVNKWNTALIGLMTY 1273
            :.:|||:|.:|.||:|||:.:|:|.:|.:::|.:|:|.||||||||||||:..||||:||.|.||
Yeast  1281 NDEGVWDLVDERTKQRTAKAYLKVSEEEIKKFDSRIRGILMASGSTTFTKVAAKWNTSLISLFTY 1345

Human  1274 FREAVVNTQELLDLLVKCENKIQTRIKIGLNSKMPSRFPPVVFYTPKELGGLGMLSMGHVLIPQS 1338
            ||||:|.|:.|||:|||.|.:||.|:|:|||||||:||||.|||||||||||||:|..|:|||.|
Yeast  1346 FREAIVATEPLLDILVKGETRIQNRVKLGLNSKMPTRFPPAVFYTPKELGGLGMISASHILIPAS 1410

Human  1339 DLRWSKQTDVGITHFRSGMSHEEDQLIPNLYRYIQPWESEFIDSQRVWAEYALKRQEAIAQNRRL 1403
            ||.||||||.||||||:||:||:::|||.::|||..||:||:||||||||||.||||||.|||||
Yeast  1411 DLSWSKQTDTGITHFRAGMTHEDEKLIPTIFRYITTWENEFLDSQRVWAEYATKRQEAIQQNRRL 1475

Human  1404 TLEDLEDSWDRGIPRINTLFQKDRHTLAYDKGWRVRTDFKQYQVLKQNPFWWTHQRHDGKLWNLN 1468
            ..|:||.|||||||||:||||:||||||||:|.|:|.:||||.:.:.:|||||:..|||||||||
Yeast  1476 AFEELEGSWDRGIPRISTLFQRDRHTLAYDRGHRIRREFKQYSLERNSPFWWTNSHHDGKLWNLN 1540

Human  1469 NYRTDMIQALGGVEGILEHTLFKGTYFPTWEGLFWEKASGFEESMKWKKLTNAQRSGLNQIPNRR 1533
            .||||:||||||:|.||||||||||.|.:|||||||||||||:||::||||:|||:||:||||||
Yeast  1541 AYRTDVIQALGGIETILEHTLFKGTGFNSWEGLFWEKASGFEDSMQFKKLTHAQRTGLSQIPNRR 1605

Human  1534 FTLWWSPTINRANVYVGFQVQLDLTGIFMHGKIPTLKISLIQIFRAHLWQKIHESIVMDLCQVFD 1598
            ||||||||||||||||||.|||||||||:||||||||||||||||||||||||||||.|:||:.|
Yeast  1606 FTLWWSPTINRANVYVGFLVQLDLTGIFLHGKIPTLKISLIQIFRAHLWQKIHESIVFDICQILD 1670

Human  1599 QELDALEIETVQKETIHPRKSYKMNSSCADILLFASYKWNVSRPSLLADSKDVMDSTTTQKYWID 1663
            .|||.|:||:|.|||:|||||||||||.|||.:.:.::|.||:||||.::.|......|.|.|.|
Yeast  1671 GELDVLQIESVTKETVHPRKSYKMNSSAADITMESVHEWEVSKPSLLHETNDSFKGLITNKMWFD 1735

Human  1664 IQLRWGDYDSHDIERYARAKFLDYTTDNMSIYPSPTGVLIAIDLAYNLHSAYGNWFPGSKPLIQQ 1728
            :|||:||||||||.||.|||||||||||:|:|||||||:|.||||||::.||||||.|.|||||.
Yeast  1736 VQLRYGDYDSHDISRYVRAKFLDYTTDNVSMYPSPTGVMIGIDLAYNMYDAYGNWFNGLKPLIQN 1800

Human  1729 AMAKIMKANPALYVLRERIRKGLQLYSSEPTEPYLSSQNYGELFSNQIIWFVDDTNVYRVTIHKT 1793
            :|..||||||||||||||||||||:|.|...||:|:|.||.|||:|.|..|||||||||||:|||
Yeast  1801 SMRTIMKANPALYVLRERIRKGLQIYQSSVQEPFLNSSNYAELFNNDIKLFVDDTNVYRVTVHKT 1865

Human  1794 FEGNLTTKPINGAIFIFNPRTGQLFLKIIHTSVWAGQKRLGQLAKWKTAEEVAALIRSLPVEEQP 1858
            ||||:.||.|||.||..||:||.|||||||||||||||||.|||||||||||:||:||||.||||
Yeast  1866 FEGNVATKAINGCIFTLNPKTGHLFLKIIHTSVWAGQKRLSQLAKWKTAEEVSALVRSLPKEEQP 1930

Human  1859 KQIIVTRKGMLDPLEVHLLDFPNIVIKGSELQLPFQACLKVEKFGDLILKATEPQMVLFNLYDDW 1923
            ||||||||.||||||||:||||||.|:.:||:|||.|.:.::|..|:::|||||||||||:||||
Yeast  1931 KQIIVTRKAMLDPLEVHMLDFPNIAIRPTELRLPFSAAMSIDKLSDVVMKATEPQMVLFNIYDDW 1995

Human  1924 LKTISSYTAFSRLILILRALHVNNDRAKVILKPDKTTITEPHHIWPTLTDEEWIKVEVQLKDLIL 1988
            |..||||||||||.|:||||..|.:.||:||..|.|...:.:|:||:.|||:||.:|.|::||||
Yeast  1996 LDRISSYTAFSRLTLLLRALKTNEESAKMILLSDPTITIKSYHLWPSFTDEQWITIESQMRDLIL 2060

Human  1989 ADYGKKNNVNVASLTQSEIRDIILGMEISAPSQQRQQIAEI-----EKQTKEQS--QLTATQTRT 2046
            .:||:|.|||:::|||:||:|||||..|.|||.:||::||:     |||..|::  ..|..:|:|
Yeast  2061 TEYGRKYNVNISALTQTEIKDIILGQNIKAPSVKRQKMAELEAARSEKQNDEEAAGASTVMKTKT 2125

Human  2047 VNKHGDEIITSTTSNYETQTFSSKTEWRVRAISAANLHLRTNHIYVSSDDIKETGYTYILPKNVL 2111
            :|..|:||:...:::||:||||||.|||..||:...|:||..:||||:||..|....|:||||:|
Yeast  2126 INAQGEEIVVVASADYESQTFSSKNEWRKSAIANTLLYLRLKNIYVSADDFVEEQNVYVLPKNLL 2190

Human  2112 KKFICISDLRAQIAGYLYGVSPPDNPQVKEIRCIVMVPQW---GTHQTVHLP--GQLPQHEYLKE 2171
            ||||.|||::.|:|.::||:|..|:|:||||:.:|:|||.   |:.|..::|  |.||..|.|  
Yeast  2191 KKFIEISDVKIQVAAFIYGMSAKDHPKVKEIKTVVLVPQLGHVGSVQISNIPDIGDLPDTEGL-- 2253

Human  2172 MEPLGWIHTQPNESPQLSPQDVTTHAKIMADNPSWDGEKTIIITCSFTPGSCTLTAYKLTPSGYE 2236
             |.|||||||..|...::..:|.||:|:.||..    ...|.|:...||||.:|:||.||..||:
Yeast  2254 -ELLGWIHTQTEELKFMAASEVATHSKLFADKK----RDCIDISIFSTPGSVSLSAYNLTDEGYQ 2313

Human  2237 WGRQNTDKGN-NPKGYLPSHYERVQMLLSDRFLGFFMVPAQSSWNYNFMGVRHDPNMKYELQLAN 2300
            ||.:|.|..| ..:|:.|:.....|:|||||..|.|::|:.:.|||.|||...:....|..:...
Yeast  2314 WGEENKDIMNVLSEGFEPTFSTHAQLLLSDRITGNFIIPSGNVWNYTFMGTAFNQEGDYNFKYGI 2378

Human  2301 PKEFYHEVHRPSHFLNFALLQEGEVYSADREDLYA 2335
            |.|||:|:|||.|||.|:.|...|...|::.|:::
Yeast  2379 PLEFYNEMHRPVHFLQFSELAGDEELEAEQIDVFS 2413

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
PRPF8NP_006436.3 PRP8 1..2335 CDD:227505 1460/2373 (62%)
Reverse transcriptase homology domain 812..1303 316/490 (64%)
Linker 1304..1577 214/272 (79%)
Important for branch point selection. /evidence=ECO:0000250 1513..1526 8/12 (67%)
Restriction endonuclease homology domain 1581..1752 120/170 (71%)
Involved in interaction with pre-mRNA 5' splice site 1669..2034 259/369 (70%)
RNase H homology domain 1767..2020 175/252 (69%)
Required for interaction with EFTUD2 and SNRNP200. /evidence=ECO:0000269|PubMed:17317632 2301..2335 16/33 (48%)
PRP8NP_012035.1 PRP8 82..2413 CDD:227505 1454/2343 (62%)

Return to query results.
Submit another query.