DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment PRPF8 and Prp8

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_006436.3 Gene:PRPF8 / 10594 HGNCID:17340 Length:2335 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_610735.1 Gene:Prp8 / 36304 FlyBaseID:FBgn0033688 Length:2396 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:2331 Identity:2134/2331 - (91%)
Similarity:2246/2331 - (96%) Gaps:7/2331 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     8 RGPG-NPVPGPLAPLPDYMSEEKLQEKARKWQQLQAKRYAEKRKFGFVDAQKEDMPPEHVRKIIR 71
            :||| ..:|   .|.||.::||||||||.|||.||:||:||||||||||.|||||||||:|||||
  Fly    70 QGPGLGQIP---TPKPDILTEEKLQEKALKWQHLQSKRFAEKRKFGFVDTQKEDMPPEHIRKIIR 131

Human    72 DHGDMTNRKFRHDKRVYLGALKYMPHAVLKLLENMPMPWEQIRDVPVLYHITGAISFVNEIPWVI 136
            ||||||:||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||:|||||||||
  Fly   132 DHGDMTSRKYRHDKRVYLGALKYMPHAVLKLLENMPMPWEQIRDVQVLYHITGAITFVNEIPWVI 196

Human   137 EPVYISQWGSMWIMMRREKRDRRHFKRMRFPPFDDEEPPLDYADNILDVEPLEAIQLELDPEEDA 201
            |||||:|||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||:|||.:||.
  Fly   197 EPVYIAQWGTMWIMMRREKRDRRHFKRMRFPPFDDEEPPLDYADNVLDVEPLEAIQIELDNDEDN 261

Human   202 PVLDWFYDHQPLRDSRKYVNGSTYQRWQFTLPMMSTLYRLANQLLTDLVDDNYFYLFDLKAFFTS 266
            .|..|||||:||.|: ::|||:||::|..:||.::|||||||||||||||:|:|||||.|:|||:
  Fly   262 AVYKWFYDHRPLVDT-QFVNGTTYRKWNLSLPQLATLYRLANQLLTDLVDNNFFYLFDPKSFFTA 325

Human   267 KALNMAIPGGPKFEPLVRDINLQDEDWNEFNDINKIIIRQPIRTEYKIAFPYLYNNLPHHVHLTW 331
            ||||||||||||||||::|.|:.||||||||||||:||||||||||:|||||||||:||.|||:|
  Fly   326 KALNMAIPGGPKFEPLIKDHNVGDEDWNEFNDINKVIIRQPIRTEYRIAFPYLYNNMPHFVHLSW 390

Human   332 YHTPNVVFIKTEDPDLPAFYFDPLINPISHRH-SVKSQEPLPDDDEEFELPEFVEPFLKDTPLYT 395
            |||||||:|||||||||||||||||||||||: :.|.|||||||||:|.||:.|:|||:||||||
  Fly   391 YHTPNVVYIKTEDPDLPAFYFDPLINPISHRNANSKIQEPLPDDDEDFTLPDDVQPFLQDTPLYT 455

Human   396 DNTANGIALLWAPRPFNLRSGRTRRALDIPLVKNWYREHCPAGQPVKVRVSYQKLLKYYVLNALK 460
            |||||||||||||||||:||||:|||:|:||||.||:||||.|.|||||||||||||||||||||
  Fly   456 DNTANGIALLWAPRPFNMRSGRSRRAIDVPLVKCWYKEHCPPGHPVKVRVSYQKLLKYYVLNALK 520

Human   461 HRPPKAQKKRYLFRSFKATKFFQSTKLDWVEVGLQVCRQGYNMLNLLIHRKNLNYLHLDYNFNLK 525
            ||.||.|||||||||||||||||:|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly   521 HRKPKPQKKRYLFRSFKATKFFQTTTLDWVEAGLQVCRQGYNMLNLLIHRKNLNYLHLDYNFNLK 585

Human   526 PVKTLTTKERKKSRFGNAFHLCREVLRLTKLVVDSHVQYRLGNVDAFQLADGLQYIFAHVGQLTG 590
            ||||||||||||||||||||||||:||||||::||||||||.|||||||||||||||||||||||
  Fly   586 PVKTLTTKERKKSRFGNAFHLCREILRLTKLIIDSHVQYRLNNVDAFQLADGLQYIFAHVGQLTG 650

Human   591 MYRYKYKLMRQIRMCKDLKHLIYYRFNTGPVGKGPGCGFWAAGWRVWLFFMRGITPLLERWLGNL 655
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
  Fly   651 MYRYKYKLMRQIRMCKDLKHLIYYRFNTGPVGKGPGCGFWAPGWRVWLFFMRGITPLLERWLGNL 715

Human   656 LARQFEGRHSKGVAKTVTKQRVESHFDLELRAAVMHDILDMMPEGIKQNKARTILQHLSEAWRCW 720
            |:||||||||||||||||||||||||||||||:|||||:||||||||||||||||||||||||||
  Fly   716 LSRQFEGRHSKGVAKTVTKQRVESHFDLELRASVMHDIVDMMPEGIKQNKARTILQHLSEAWRCW 780

Human   721 KANIPWKVPGLPTPIENMILRYVKAKADWWTNTAHYNRERIRRGATVDKTVCKKNLGRLTRLYLK 785
            ||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly   781 KANIPWKVPGLPIPIENMILRYVKMKADWWTNTAHYNRERIRRGATVDKTVCKKNLGRLTRLYLK 845

Human   786 AEQERQHNYLKDGPYITAEEAVAVYTTTVHWLESRRFSPIPFPPLSYKHDTKLLILALERLKEAY 850
            ||||||||||||||||:.|||||:|||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||
  Fly   846 AEQERQHNYLKDGPYISPEEAVAIYTTTVHWLESRRFAPIPFPPLSYKHDTKLLILALERLKEAY 910

Human   851 SVKSRLNQSQREELGLIEQAYDNPHEALSRIKRHLLTQRAFKEVGIEFMDLYSHLVPVYDVEPLE 915
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||:|||||
  Fly   911 SVKSRLNQSQREELGLIEQAYDNPHEALSRIKRHLLTQRAFKEVGIEFMDLYSHLIPVYEVEPLE 975

Human   916 KITDAYLDQYLWYEADKRRLFPPWIKPADTEPPPLLVYKWCQGINNLQDVWETSEGECNVMLESR 980
            |||||||||||||||||||||||||||:||||||||.||||||||||||||:..||||||:||||
  Fly   976 KITDAYLDQYLWYEADKRRLFPPWIKPSDTEPPPLLAYKWCQGINNLQDVWDVGEGECNVLLESR 1040

Human   981 FEKMYEKIDLTLLNRLLRLIVDHNIADYMTAKNNVVINYKDMNHTNSYGIIRGLQFASFIVQYYG 1045
            |||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||.||||
  Fly  1041 FEKLYEKIDLTLLNRLLRLIVDHNIADYMTAKNNVVINYKDMNHTNSYGIIRGLQFSSFITQYYG 1105

Human  1046 LVMDLLVLGLHRASEMAGPPQMPNDFLSFQDIATEAAHPIRLFCRYIDRIHIFFRFTADEARDLI 1110
            ||:|||||||||:||||||||||||||:|||..||.||||||:|||:||||:||||:|:||||||
  Fly  1106 LVLDLLVLGLHRSSEMAGPPQMPNDFLTFQDTVTETAHPIRLYCRYVDRIHLFFRFSAEEARDLI 1170

Human  1111 QRYLTEHPDPNNENIVGYNNKKCWPRDARMRLMKHDVNLGRAVFWDIKNRLPRSVTTVQWENSFV 1175
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:.||::||
  Fly  1171 QRYLTEHPDPNNENIVGYNNKKCWPRDARMRLMKHDVNLGRAVFWDIKNRLPRSVTTIGWESTFV 1235

Human  1176 SVYSKDNPNLLFNMCGFECRILPKCRTSYEEFTHKDGVWNLQNEVTKERTAQCFLRVDDESMQRF 1240
            ||||||||||||||.||||||||||||..|||||:|||||||||:||||||||||||||||:.||
  Fly  1236 SVYSKDNPNLLFNMSGFECRILPKCRTQNEEFTHRDGVWNLQNEITKERTAQCFLRVDDESLGRF 1300

Human  1241 HNRVRQILMASGSTTFTKIVNKWNTALIGLMTYFREAVVNTQELLDLLVKCENKIQTRIKIGLNS 1305
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly  1301 HNRVRQILMASGSTTFTKIVNKWNTALIGLMTYFREAVVNTQELLDLLVKCENKIQTRIKIGLNS 1365

Human  1306 KMPSRFPPVVFYTPKELGGLGMLSMGHVLIPQSDLRWSKQTDVGITHFRSGMSHEEDQLIPNLYR 1370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||
  Fly  1366 KMPSRFPPVVFYTPKELGGLGMLSMGHVLIPQSDLRWSKQTDVGITHFRSGMSHDEDQLIPNLYR 1430

Human  1371 YIQPWESEFIDSQRVWAEYALKRQEAIAQNRRLTLEDLEDSWDRGIPRINTLFQKDRHTLAYDKG 1435
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly  1431 YIQPWESEFIDSQRVWAEYALKRQEANAQNRRLTLEDLEDSWDRGIPRINTLFQKDRHTLAYDKG 1495

Human  1436 WRVRTDFKQYQVLKQNPFWWTHQRHDGKLWNLNNYRTDMIQALGGVEGILEHTLFKGTYFPTWEG 1500
            ||:||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly  1496 WRIRTEFKQYQVLKQNPFWWTHQRHDGKLWNLNNYRTDMIQALGGVEGILEHTLFKGTYFPTWEG 1560

Human  1501 LFWEKASGFEESMKWKKLTNAQRSGLNQIPNRRFTLWWSPTINRANVYVGFQVQLDLTGIFMHGK 1565
            ||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly  1561 LFWEKASGFEESMKYKKLTNAQRSGLNQIPNRRFTLWWSPTINRANVYVGFQVQLDLTGIFMHGK 1625

Human  1566 IPTLKISLIQIFRAHLWQKIHESIVMDLCQVFDQELDALEIETVQKETIHPRKSYKMNSSCADIL 1630
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly  1626 IPTLKISLIQIFRAHLWQKIHESIVMDLCQVFDQELDALEIETVQKETIHPRKSYKMNSSCADIL 1690

Human  1631 LFASYKWNVSRPSLLADSKDVMDSTTTQKYWIDIQLRWGDYDSHDIERYARAKFLDYTTDNMSIY 1695
            ||.:|||||||||||||:||.||:|||||||:|||||||||||||:|||||||||||||||||||
  Fly  1691 LFPAYKWNVSRPSLLADTKDTMDNTTTQKYWLDIQLRWGDYDSHDVERYARAKFLDYTTDNMSIY 1755

Human  1696 PSPTGVLIAIDLAYNLHSAYGNWFPGSKPLIQQAMAKIMKANPALYVLRERIRKGLQLYSSEPTE 1760
            ||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||
  Fly  1756 PSPTGVLIAIDLAYNLHSAYGNWFPGCKTLIQQAMAKIMKANPALYVLRERIRKALQLYSSEPTE 1820

Human  1761 PYLSSQNYGELFSNQIIWFVDDTNVYRVTIHKTFEGNLTTKPINGAIFIFNPRTGQLFLKIIHTS 1825
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly  1821 PYLSSQNYGELFSNQIIWFVDDTNVYRVTIHKTFEGNLTTKPINGAIFIFNPRTGQLFLKIIHTS 1885

Human  1826 VWAGQKRLGQLAKWKTAEEVAALIRSLPVEEQPKQIIVTRKGMLDPLEVHLLDFPNIVIKGSELQ 1890
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly  1886 VWAGQKRLGQLAKWKTAEEVAALIRSLPVEEQPKQIIVTRKGMLDPLEVHLLDFPNIVIKGSELQ 1950

Human  1891 LPFQACLKVEKFGDLILKATEPQMVLFNLYDDWLKTISSYTAFSRLILILRALHVNNDRAKVILK 1955
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.:|.|:|||
  Fly  1951 LPFQACLKVEKFGDLILKATEPQMVLFNLYDDWLKTISSYTAFSRLILILRALHVNTERTKIILK 2015

Human  1956 PDKTTITEPHHIWPTLTDEEWIKVEVQLKDLILADYGKKNNVNVASLTQSEIRDIILGMEISAPS 2020
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly  2016 PDKTTITEAHHIWPTLTDEEWIKVEVQLKDLILADYGKKNNVNVASLTQSEIRDIILGMEISAPS 2080

Human  2021 QQRQQIAEIEKQTKEQSQLTATQTRTVNKHGDEIITSTTSNYETQTFSSKTEWRVRAISAANLHL 2085
            .|||||||||||||||:|||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
  Fly  2081 AQRQQIAEIEKQTKEQNQLTATTTRTTNKHGDEIITSTTSNYETQTFSSKTEWRVRAISATNLHL 2145

Human  2086 RTNHIYVSSDDIKETGYTYILPKNVLKKFICISDLRAQIAGYLYGVSPPDNPQVKEIRCIVMVPQ 2150
            ||||||||||||||||||||||||:||||:.|||||||||||||||||||||||||||||||.||
  Fly  2146 RTNHIYVSSDDIKETGYTYILPKNILKKFVTISDLRAQIAGYLYGVSPPDNPQVKEIRCIVMPPQ 2210

Human  2151 WGTHQTVHLPGQLPQHEYLKEMEPLGWIHTQPNESPQLSPQDVTTHAKIMADNPSWDGEKTIIIT 2215
            ||||||::||..||.|:|||:|||||||||||||.|||||||:|||||||.:|.:|||||||:||
  Fly  2211 WGTHQTINLPNTLPTHQYLKDMEPLGWIHTQPNELPQLSPQDITTHAKIMQENSNWDGEKTIVIT 2275

Human  2216 CSFTPGSCTLTAYKLTPSGYEWGRQNTDKGNNPKGYLPSHYERVQMLLSDRFLGFFMVPAQSSWN 2280
            ||||||||:||||||||||:|||.:||||||||||||||||||||||||::||||||||||||||
  Fly  2276 CSFTPGSCSLTAYKLTPSGFEWGSKNTDKGNNPKGYLPSHYERVQMLLSNKFLGFFMVPAQSSWN 2340

Human  2281 YNFMGVRHDPNMKYELQLANPKEFYHEVHRPSHFLNFALLQE-GEVYSADREDLYA 2335
            |||||||||||||||||||||||||||:||.||||.|:.|:: |:...|||||:||
  Fly  2341 YNFMGVRHDPNMKYELQLANPKEFYHELHRTSHFLLFSNLEDGGDGAGADREDVYA 2396

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
PRPF8NP_006436.3 PRP8 1..2335 CDD:227505 2132/2329 (92%)
Reverse transcriptase homology domain 812..1303 456/490 (93%)
Linker 1304..1577 267/272 (98%)
Important for branch point selection. /evidence=ECO:0000250 1513..1526 11/12 (92%)
Restriction endonuclease homology domain 1581..1752 160/170 (94%)
Involved in interaction with pre-mRNA 5' splice site 1669..2034 354/364 (97%)
RNase H homology domain 1767..2020 247/252 (98%)
Required for interaction with EFTUD2 and SNRNP200. /evidence=ECO:0000269|PubMed:17317632 2301..2335 21/34 (62%)
Prp8NP_610735.1 PRP8 64..2396 CDD:227505 2132/2329 (92%)
PRO8NT 118..268 CDD:285342 134/149 (90%)
PROCN 456..856 CDD:285343 376/399 (94%)
RRM_4 1046..1137 CDD:287556 85/90 (94%)
U5_2-snRNA_bdg 1270..1402 CDD:287555 127/131 (97%)
U6-snRNA_bdg 1502..1660 CDD:287554 156/157 (99%)
RNase_H_like_Prp8_IV 1826..2076 CDD:260013 244/249 (98%)
MPN_PRP8 2127..2377 CDD:163687 222/249 (89%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C165151436
Domainoid 1 1.000 815 1.000 Domainoid score I66
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H4706
Inparanoid 1 1.050 4456 1.000 Inparanoid score I4
Isobase 1 0.950 - 0 Normalized mean entropy S96
OMA 1 1.010 - - QHG53611
OrthoDB 1 1.010 - - D156083at2759
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0004087
OrthoInspector 1 1.000 - - oto90010
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_101765
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR11140
Phylome 1 0.910 - -
RoundUp 1 1.030 - avgDist Average_Evolutionary_Distance R1384
SonicParanoid 1 1.000 - - X2835
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 1 0.960 - -
User_Submission 00.000 Not matched by this tool.
1716.850

Return to query results.
Submit another query.