DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment APC2 and Apc2

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_054175471.1 Gene:APC2 / 10297 HGNCID:24036 Length:2404 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001359169.1 Gene:Apc2 / 23805 MGIID:1346052 Length:2317 Species:Mus musculus


Alignment Length:2347 Identity:1892/2347 - (80%)
Similarity:1998/2347 - (85%) Gaps:52/2347 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human    71 ISGGA---RGAAQREEAPDPGAPPAQLHTLQELKMASSVAPYEQLVRQVEALKAENSHLRQELRD 132
            :|||.   ||:..|.:.      |.::..||||||.||:|.|||||||||||||||:||||||||
Mouse    10 VSGGMWGHRGSRPRTQT------PGRIVALQELKMTSSMASYEQLVRQVEALKAENTHLRQELRD 68

Human   133 NSSHLSKLETETSGMKEVLKHLQGKLEQEARVLVSSGQTEVLEQLKALQMDITSLYNLKFQPPTL 197
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||:|||||||..|.|
Mouse    69 NSSHLSKLETETSGMKEVLKHLQGKLEQEARVLVSSGQTEVLEQLKALQTDISSLYNLKFHAPAL 133

Human   198 GPEPAARTPEGSPVHGSGPSKDSFGELSRATIRLLEELDRERCFLLNEIEKEEKEKLWYYSQLQG 262
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||:||||||||||||||||||
Mouse   134 GPEPAARTPEGSPVHGSGPSKDSFGELSRATIRLLEELDQERCFLLSEIEKEEKEKLWYYSQLQG 198

Human   263 LSKRLDELPHVETQFSMQMDLIRQQLEFEAQHIRSLMEERFGTSDEMVQRAQIRASRLEQIDKEL 327
            |||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   199 LSKRLDELPHVDTQFSMQMDLIRQQLEFEAQHIRSLMEERFGTSDEMVQRAQIRASRLEQIDKEL 263

Human   328 LEAQDRVQQTEPQALLAVKSVPVDEDPETEVPTHPEDGTPQPGNSKVEVVFWLLSMLATRDQEDT 392
            |||||||||||||||||||.|.|:|:.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   264 LEAQDRVQQTEPQALLAVKPVAVEEEQEAEVPTHPEDGTPQPGNSKVEVVFWLLSMLATRDQEDT 328

Human   393 ARTLLAMSSSPESCVAMRRSGCLPLLLQILHGTEAAAGGRAGAPGAPGAKDARMRANAALHNIVF 457
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.:.||||.||||||||||||||||||||||
Mouse   329 ARTLLAMSSSPESCVAMRRSGCLPLLLQILHGTEAGSVGRAGIPGAPGAKDARMRANAALHNIVF 393

Human   458 SQPDQGLARKEMRVLHVLEQIRAYCETCWDWLQARDGGPEGGGAGSAPIPIEPQICQATCAVMKL 522
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.| .|.|..|:||||||||||||||||
Mouse   394 SQPDQGLARKEMRVLHVLEQIRAYCETCWDWLQARDSGTE-SGTGDTPVPIEPQICQATCAVMKL 457

Human   523 SFDEEYRRAMNELGGLQAVAELLQVDYEMHKMTRDPLNLALRRYAGMTLTNLTFGDVANKATLCA 587
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   458 SFDEEYRRAMNELGGLQAVAELLQVDYEMHKMTRDPLNLALRRYAGMTLTNLTFGDVANKATLCA 522

Human   588 RRGCMEAIVAQLASDSEELHQVVSSILRNLSWRADINSKKVLREAGSVTALVQCVLRATKESTLK 652
            ||||||||||||.|:|||||||||||||||||||||||||||||.||:|||::|||||:||||||
Mouse   523 RRGCMEAIVAQLGSESEELHQVVSSILRNLSWRADINSKKVLREVGSMTALMECVLRASKESTLK 587

Human   653 SVLSALWNLSAHSTENKAAICQVDGALGFLVSTLTYKCQSNSLAIIESGGGILRNVSSLVATRED 717
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||.||||:||||||||||||||:|||||
Mouse   588 SVLSALWNLSAHSTENKAAICQVDGALGFLVSTLTYRCQGNSLAVIESGGGILRNVSSLIATRED 652

Human   718 YRQVLRDHNCLQTLLQHLTSHSLTIVSNACGTLWNLSARSARDQELLWDLGAVGMLRNLVHSKHK 782
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Mouse   653 YRQVLRDHNCLQTLLQHLTSHSLTIVSNACGTLWNLSARSPRDQELLWDLGAVGMLRNLVHSKHK 717

Human   783 MIAMGSAAALRNLLAHRPAKHQAAATAVSPGSCVPSLYVRKQRALEAELDARHLAQALEHLEKQG 847
            ||||||||||||||||||||:||||.|||||:||||||||||||||||||.|||..||.|||||.
Mouse   718 MIAMGSAAALRNLLAHRPAKYQAAAMAVSPGTCVPSLYVRKQRALEAELDTRHLVHALGHLEKQS 782

Human   848 PPAAEAATKKPLPPLRHLDGLAQDYASDSGCFDDDDAPSSLAAAAATGEPASPAALSLFLGSPFL 912
            .|.||..:|||||||||||||.|||||||||||||||| ||||||.|.||||||.:|:|||.|||
Mouse   783 LPEAETTSKKPLPPLRHLDGLVQDYASDSGCFDDDDAP-SLAAAATTAEPASPAVMSMFLGGPFL 846

Human   913 QGQALARTPPTRRGGKEAEKDTSGEAAVAAKAKAKLALAVARIDQLVEDISALHTSSDDSFSLSS 977
            ||||||||||.|:||.||||:..|||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||
Mouse   847 QGQALARTPPARQGGLEAEKEAGGEAAVAAKAKAKLALAVARIDRLVEDISALHTSSDDSFSLSS 911

Human   978 GDPGQEAPREGRAQSCSPCRGPEGGRREAGSRAHPLLRLKAAHASLSNDSLNSGSASDGYCPREH 1042
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||
Mouse   912 GDPGQEAPREGRAQSCSPCRGTEGGRREAGSRAHPLLRLKAAHTSLSNDSLNSGSTSDGYCTREH 976

Human  1043 MLPCPLAALASRREDPRCGQPRPSRLDLDLPGCQAEPPAREATSADARVRTIKLSPTYQHVPLLE 1107
            |.||||||||..|:||..||.||||||||||. :||.|||:..:.|||||||||||||||||||:
Mouse   977 MTPCPLAALAEHRDDPVRGQTRPSRLDLDLPS-RAELPARDTAATDARVRTIKLSPTYQHVPLLD 1040

Human  1108 GASRAGAEPLAGPGISPGARKQAWLPADHLSKVPEKLAAAPLSVASKALQKLAAQEGPLSLSRCS 1172
            ||:.||..||.|||.|||||||||:|||.||||||||.|:||.:|||.||||.||:||:||||||
Mouse  1041 GAAGAGVRPLVGPGTSPGARKQAWIPADSLSKVPEKLVASPLPIASKVLQKLVAQDGPMSLSRCS 1105

Human  1173 SLSSLSSAGRPGPSEGGDLDDSDSSLEGLEEAGPSEAELDSTWRAPGATSLPVAIPAPRRNRGRG 1237
            |||||||.|...||:..:| ||||||||||||||.||||...|||.|:|||||:||||:|.|.||
Mouse  1106 SLSSLSSTGHAVPSQAENL-DSDSSLEGLEEAGPGEAELGRAWRASGSTSLPVSIPAPQRGRSRG 1169

Human  1238 LGVEDATPSSSSENYVQETPLVLSRCSSVSSLGSFESPSIASSIPSEPCSGQGSGTISPSELPDS 1302
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||:||||.||||:||||||||
Mouse  1170 LGVEDATPSSSSENCVQETPLVLSRCSSVSSLGSFESRSIASSIPSDPCSGLGSGTVSPSELPDS 1234

Human  1303 PGQTMPPSRSKTPPLAPAPQGPPEATQFSLQWESYVKRFLDIADCRERCRLPSELDAGSVRFTVE 1367
            |||||||||||||   |||.|.||.:|||||||||||||||||||||||:.||||||||||||||
Mouse  1235 PGQTMPPSRSKTP---PAPPGQPETSQFSLQWESYVKRFLDIADCRERCQPPSELDAGSVRFTVE 1296

Human  1368 KPDENFSCASSLSALALHEHYVQQDVELRLLPSACPERGGGAGGAGLHFAGHRRREE------GP 1426
            |||||||||||||||||||.||||||||||.|.|||||..|.|       |||||:|      ||
Mouse  1297 KPDENFSCASSLSALALHELYVQQDVELRLRPPACPERAVGGG-------GHRRRDEAASRLDGP 1354

Human  1427 APTGSRPRGAADQELELLRECLGAAVPARLRKVASALVPGRRALPVPVYMLVPAPAPAQEDDSCT 1491
            ||.|||.|.|.|:|||.||||||||:||||||||||||||||:|||||||||  ||||:.|||.|
Mouse  1355 APAGSRARSATDKELEALRECLGAAMPARLRKVASALVPGRRSLPVPVYMLV--PAPARGDDSGT 1417

Human  1492 DSAEGTPVNFSSAASLSDETLQGPPRDQPGGPAGRQRPTGRPTSARQAMGHRHKAGGAGRSAEQS 1556
            ||||||||||||||||||||||||.||:|.||..||:||||...|||...||.||.|||:|.|.:
Mouse  1418 DSAEGTPVNFSSAASLSDETLQGPSRDKPAGPGDRQKPTGRAAPARQTRSHRPKAAGAGKSTEHT 1482

Human  1557 RGAGKNRAGLELPLGRPPSAPADKDGSKPGRTRGDGALQSLCLTTPTEEAVYCFYGNDSDEEPPA 1621
            ||..:|||||||||.||.||.:::|.|...|||||||||||||||||||||||||  ||||||||
Mouse  1483 RGPCRNRAGLELPLSRPQSARSNRDSSCQTRTRGDGALQSLCLTTPTEEAVYCFY--DSDEEPPA 1545

Human  1622 AAPTPTHRRTSAIPRAFTRERPQGRKEAPAPSKAAPAAPPPARTQPSLIADETPPCYSLSSSASS 1686
            .||.|  ||.||||||..||:|.||||  .||:||..|..|.|.||.||.|||||||||:|||||
Mouse  1546 TAPPP--RRASAIPRALKREKPAGRKE--TPSRAAQPATLPVRAQPRLIVDETPPCYSLTSSASS 1606

Human  1687 LSEPEPSEPPAVHPRGREPAVTKDPGPGGGRDSSPSPRAAEELLQRCISSALPRRRPPVSGLRRR 1751
            |||||..|.||.|.||        |..|..:||||||||.|||||||||.|:||||..|.|.|||
Mouse  1607 LSEPEAPEQPANHARG--------PEQGSKQDSSPSPRAEEELLQRCISLAMPRRRTQVPGSRRR 1663

Human  1752 KPRATRLDERPAEGSRERGEEAAGSDRASDLDSVEWRAIQEGANSIVTWLHQAAA-ATREASSES 1815
            ||||.|.|.||.|.:::..||.||||.|||||||||:|||||||||||||||||| |:.||||||
Mouse  1664 KPRALRSDIRPTEITQKCQEEVAGSDPASDLDSVEWQAIQEGANSIVTWLHQAAAKASLEASSES 1728

Human  1816 DSILSFVSGLSVGSTLQPPKHRKGRQAEGEMGSARRPEKRGAASVKTSGSPRSPAGPEKPRGTQK 1880
            ||:||.|||:|.||||||.|.||||:...|.|.|.||||||..|.|.:||||.|.||||.:||||
Mouse  1729 DSLLSLVSGVSAGSTLQPSKLRKGRKPAAEAGGAWRPEKRGTTSTKINGSPRLPNGPEKAKGTQK 1793

Human  1881 TTPGVPAVLRGRTVIYVPSPAPRAQPKGTPGPRATPRKVAPPCLAQPAAPAKVPSPGQQRSRSLH 1945
            ...|...:||||||||...||.|.|.||..||..||:|.......||....|.|||.||||||||
Mouse  1794 MMAGESTMLRGRTVIYSAGPASRTQSKGISGPCTTPKKTGTSGTTQPETVTKAPSPEQQRSRSLH 1858

Human  1946 RPAKTSELATLSQPPRSATPPARLAKTPSSSSSQTSPASQPLPRKRPPVTQAAGALPGPGASPVP 2010
            ||.|.||||.|..|||||||||||||||||||||||||||||||:.|..|...|.|||||.|.||
Mouse  1859 RPGKISELAALRHPPRSATPPARLAKTPSSSSSQTSPASQPLPRRSPLATPTGGPLPGPGGSLVP 1923

Human  2011 KTPARTLLAKQHKTQRSPVRIPFMQRPARRGPPPLARAVPEPGPRGRAGTEAGPGARGGRLGLVR 2075
            |:|||.|||||||||:||||||||||||||.||||||..||||.|||||.|..|||||.||||||
Mouse  1924 KSPARALLAKQHKTQKSPVRIPFMQRPARRVPPPLARPSPEPGSRGRAGAEGTPGARGSRLGLVR 1988

Human  2076 VASALSSGSESSDRSGFRRQLTFIKESPG-LRRRRSELSSAESAASAPQGASPRRGRPALPAVFL 2139
            :|||.|||||||||||||||||||||||| |||||||||||:|.||..|.|||||||||||||||
Mouse  1989 MASARSSGSESSDRSGFRRQLTFIKESPGLLRRRRSELSSADSTASTSQAASPRRGRPALPAVFL 2053

Human  2140 CSSRCEELRAAPRQGPAP-ARQRPPAARPSPGERPARRTTSESPSRLPVRAPAARPETVKRYASL 2203
            |||||:|||.:|||   | |.||.|.|:|....|..|||:|||||||||||...|||||||||||
Mouse  2054 CSSRCDELRVSPRQ---PLAAQRSPQAKPGLAPRAPRRTSSESPSRLPVRASPGRPETVKRYASL 2115

Human  2204 PHISVARRPDGAVPAAPASADAARRSSDGEPRPLPRVAAPGTTWRRIRDEDVPHILRSTLPATAL 2268
            |||||:||.|.||......|:|.||.||||.|||||||.||||||||:|||||||||||||||||
Mouse  2116 PHISVSRRSDSAVSVPTTQANATRRGSDGEARPLPRVAPPGTTWRRIKDEDVPHILRSTLPATAL 2180

Human  2269 PLRGSTPEDAPAGPPPRKTSDAVVQTEEVAAPKTNSSTSPSLETREPPGAPAGGQLSLLGSDVDG 2333
            |||.|:|||:|||.|.|||||||||||:||..|||||||||||:|:||.|||.|.::..||||||
Mouse  2181 PLRVSSPEDSPAGTPQRKTSDAVVQTEDVATSKTNSSTSPSLESRDPPQAPASGPVAPQGSDVDG 2245

Human  2334 PSLAKAPISAPFVHEGLGVAVGGFPASRHGSPSRSARVPPFNYVPSPMVVAA-TTDSAAEKAPAT 2397
            |.|.|.|.||||.||||...:.|||.||||||||:|||||||||||||..|. .:|||.||||.:
Mouse  2246 PVLTKPPASAPFPHEGLSAVIAGFPTSRHGSPSRAARVPPFNYVPSPMAAATMASDSAVEKAPVS 2310

Human  2398 ASATLLE 2404
            :.|:|||
Mouse  2311 SPASLLE 2317

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
APC2XP_054175471.1 APC_N_CC 107..158 CDD:435517 48/50 (96%)
Suppressor_APC 225..306 CDD:463275 77/80 (96%)
APC_rep 458..532 CDD:465870 65/73 (89%)
armadillo repeat 531..574 CDD:293788 42/42 (100%)
armadillo repeat 582..619 CDD:293788 34/36 (94%)
armadillo repeat 628..661 CDD:293788 27/32 (84%)
armadillo repeat 669..710 CDD:293788 37/40 (93%)
Arm 716..755 CDD:425727 38/38 (100%)
armadillo repeat 719..753 CDD:293788 33/33 (100%)
armadillo repeat 761..797 CDD:293788 35/35 (100%)
Arm_APC_u3 798..1045 CDD:435476 214/246 (87%)
APC_r 1361..1382 CDD:461781 20/20 (100%)
PHA03247 <1436..2012 CDD:223021 402/576 (70%)
APC_basic 1887..2214 CDD:428690 245/328 (75%)
PHA03247 2103..>2328 CDD:223021 168/226 (74%)
Apc2NP_001359169.1 APC_N_CC 43..94 CDD:435517 48/50 (96%)
Suppressor_APC 161..242 CDD:463275 77/80 (96%)
APC_rep 394..467 CDD:465870 65/73 (89%)
armadillo repeat 466..509 CDD:293788 42/42 (100%)
armadillo repeat 517..554 CDD:293788 34/36 (94%)
armadillo repeat 563..596 CDD:293788 27/32 (84%)
armadillo repeat 604..645 CDD:293788 37/40 (93%)
Arm 651..690 CDD:425727 38/38 (100%)
armadillo repeat 654..688 CDD:293788 33/33 (100%)
Arm 692..732 CDD:425727 38/39 (97%)
armadillo repeat 696..732 CDD:293788 35/35 (100%)
Arm_APC_u3 733..979 CDD:435476 214/246 (87%)
APC_r 1178..1201 CDD:461781 21/22 (95%)
APC_r 1290..1311 CDD:461781 20/20 (100%)
PHA03247 <1328..1665 CDD:223021 248/359 (69%)
APC_r 1413..1435 CDD:461781 20/21 (95%)
PHA03247 <1548..1987 CDD:223021 309/450 (69%)
APC_basic 1800..2132 CDD:428690 248/334 (74%)
PTZ00449 <2042..2239 CDD:185628 148/199 (74%)

Return to query results.
Submit another query.