DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment atp8b5a and Atp8b5

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_021332106.1 Gene:atp8b5a / 100330945 ZFINID:ZDB-GENE-060531-48 Length:1205 Species:Danio rerio
Sequence 2:XP_038966915.1 Gene:Atp8b5 / 691125 RGDID:1587460 Length:1191 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1180 Identity:724/1180 - (61%)
Similarity:904/1180 - (76%) Gaps:39/1180 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Zfish     7 DCA------------RKKEKEVERKIRANDREYNSSFKYATNCIKTSKYNPFSFLPLNLFEQFQR 59
            ||:            :::.:|.||.::||:|.:||.|:|..|.||||||:.|:|||:||||||||
  Rat    14 DCSWFCSAMYERENEQRQNEEEERILQANNRRFNSLFEYPDNSIKTSKYSFFNFLPVNLFEQFQR 78

Zfish    60 IANAYFLFLLILQVIPAISSLSWFTTVVPLVLVLSVTAAKDAIDDI------------NRHRSDR 112
            :||||||.||.||:||.||||:|:|||:||::|||:|..||||||:            .||:||:
  Rat    79 LANAYFLILLFLQLIPQISSLAWYTTVIPLIVVLSITGVKDAIDDVVKWLPGLPSLHLKRHQSDQ 143

Zfish   113 QVNNRKVNVLISGKLTSEKWMNVQVGDIIKLENNQFVTADLLLLSSSEPLNLVYIETAELDGETN 177
            |||||.|.:|::|::...||.||||||||||||:..||||:||||||||..|.|||||:||||||
  Rat   144 QVNNRSVLILVNGRIEENKWRNVQVGDIIKLENDHPVTADVLLLSSSEPYGLTYIETADLDGETN 208

Zfish   178 LKVKQSLTVTGDMGHNLEALAAFNGEVCCEPPNNRLDRFTGTLTFDTQKYSLDNERVLLRGCTLR 242
            |||||:::.|.||..|||.|:||||||.||||||:||||:|||::....|.||.||:|||||.:|
  Rat   209 LKVKQAVSATSDMEDNLELLSAFNGEVRCEPPNNKLDRFSGTLSYLGDTYFLDYERLLLRGCIIR 273

Zfish   243 NTDWCFGLVLFAGPETKLMQNCGKSTFKRTSIDRLMNVLVLFIFALLALMCIILAVGHGIWENYT 307
            |||||:|||::.||:||||||.|:||||||.||.|||||||:||.||..||.:|::||||||:..
  Rat   274 NTDWCYGLVVYTGPDTKLMQNSGRSTFKRTHIDHLMNVLVLWIFMLLGGMCFLLSIGHGIWESNR 338

Zfish   308 GSKFNVFLPHEE---NAAFSAFLTFWSYIIILNTVVPISLYVSMEVIRLGNSYYINWDRNMYHTR 369
            |..|..|||.|.   ::|.|:.|.||||.|:|||:||||||||:|:|||||||||||||.|::..
  Rat   339 GYHFQAFLPWERYITSSAASSALAFWSYFIVLNTMVPISLYVSVEIIRLGNSYYINWDRKMFYAP 403

Zfish   370 TDTPAEARTTTLNEELGQIKYIFSDKTGTLTQNIMTFNKCSINGKSYGDVFQHYSGQTLEITEET 434
            .:|||:||||||||||||::|:|||||||||:|:|.|||||||||:||..:.. :||.:. ...:
  Rat   404 KNTPAQARTTTLNEELGQVEYVFSDKTGTLTENVMIFNKCSINGKTYGYSYDE-NGQCVP-KSPS 466

Zfish   435 TPVDFSFNGLADPKFLFYDHSLVEAVKLELPEVHAFFRLLALCHTCMAEEKKEGHLVYQAQSPDE 499
            ..||||:|.||||||.|||.:||||||.|.|.|:.||..|:||||.|:|||.||.||||||||||
  Rat   467 NKVDFSYNHLADPKFSFYDKTLVEAVKSEDPLVYLFFLCLSLCHTVMSEEKVEGELVYQAQSPDE 531

Zfish   500 GALVTAARNFGFVFRSRSPETITIEEMGIQRTYELLAILDFNNVRKRMSVIVRNPEGKLSLYCKG 564
            ||||||:|||||||.||:|||||:.|||..|.|.|||||||:|.||||||||:.||.::.|:|||
  Rat   532 GALVTASRNFGFVFHSRTPETITVIEMGRVRVYRLLAILDFSNERKRMSVIVQTPEDRVMLFCKG 596

Zfish   565 ADTIIYERLHPSCSKLMEVTTEHLNEFAGEGLRTLVLAYKDLDEDYFAEWKQRHHESSVAMEDRE 629
            |||||||.|||||:.|.:||.:.|::||.||||||::||::||:.:|..|.::|.|:.:.:|:||
  Rat   597 ADTIIYELLHPSCAALSDVTMDQLDDFASEGLRTLMVAYRELDKAFFQTWIKKHGEAWLTLENRE 661

Zfish   630 EKLDKVYEEIEKDMMLIGATAIEDKLQDGVALTIELLAKAEIKIWVLTGDKQETAENIGYSCNLL 694
            :||..||||||:|::|:||||||||||.||..||..|.||:||||||||||||||.||.|||.:.
  Rat   662 KKLALVYEEIERDLVLLGATAIEDKLQSGVPETIVTLNKAKIKIWVLTGDKQETAVNIAYSCRIF 726

Zfish   695 REEMNDVFIVAAHSPEEVRQELRDARLKMQPST--EQDKFLIPEVILGNTPKVVQDEHVNGEYGL 757
            ::||:.||:|.....|.|.:|||.||.||:|.:  |.|...|........|....||..||.|||
  Rat   727 KDEMDAVFMVEGTDRETVLEELRTARKKMKPESLLESDPINIYLARKSKMPFKAVDEVPNGSYGL 791

Zfish   758 VINGHSLAFALESSMELEFLRTACMCKTVICCRVTPLQKAQVVELVKRYKKAVTLAIGDGANDVS 822
            ||:|.|||:||||:.|.|.||||||||.|:|||:|||||||||:|||||||.|||||||||||:.
  Rat   792 VISGCSLAYALESNTEFELLRTACMCKGVVCCRMTPLQKAQVVDLVKRYKKVVTLAIGDGANDIG 856

Zfish   823 MIKAAHIGVGISGQEGMQAVLSSDFSFAQFRFLQRLLLVHGRWSYLRMCKFLRYFFYKNFTFTFV 887
            |||||||||||||||||||.|||||||.|||:|||||||||||||.||||||.|||||||.||.|
  Rat   857 MIKAAHIGVGISGQEGMQATLSSDFSFCQFRYLQRLLLVHGRWSYNRMCKFLSYFFYKNFAFTLV 921

Zfish   888 HFWYAFFCGFSAQTVYDEGFITLYNLVYTALPVLGMSLFDQDVNANWSLEFPQLYVPGQLSQYFS 952
            |||||||.|||||||||..|||.|||:||:||:||:|||::|||..|||.:|:||.|||.:.||:
  Rat   922 HFWYAFFNGFSAQTVYDIWFITFYNLIYTSLPILGLSLFEKDVNETWSLCYPELYEPGQHNLYFN 986

Zfish   953 KRAFMMCALHSCYSSLVLFFVPYATTYDTARADGRDGADYQSFALITQTCLTVTVCVQLGLDLSY 1017
            |:.|:.|.||..|||.||||||..|.:::.|:||:|.:|:|||:|:.||.|...:.:|:.|..:|
  Rat   987 KKEFIKCLLHGIYSSFVLFFVPMGTVFNSERSDGKDISDFQSFSLLVQTTLIWVMTMQIALSTTY 1051

Zfish  1018 WTVVNHLFVWGSLGMFFFLTFTMYTDGLFKLRPASFAFIGTARNCLNQPNVWLTVALTALLCVLP 1082
            ||::||.|.|||||::|.:.|.:.:|||..:.|:.|.|:|.|||.||||.:||.:.|:::||::|
  Rat  1052 WTMINHAFTWGSLGLYFCILFLLCSDGLCLMFPSVFNFLGVARNGLNQPQMWLCLVLSSVLCLIP 1116

Zfish  1083 VVAYRFIYCQIYPTINDKVRYKMR-QMKEPAPRP-RPRLTRRSTRRSGYAFSHAQGYGDLVT--- 1142
            ::.|.|:...::|...|||..::. .:|.|.|.| :.::.....|||.|||||.||:|.|:|   
  Rat  1117 LMGYNFLKPILWPINVDKVLNRIHFCLKHPLPPPVQIKVKHPGLRRSAYAFSHKQGFGALITSGK 1181

Zfish  1143 ---SRRFLRR 1149
               ||.|.||
  Rat  1182 TLKSRAFTRR 1191

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
atp8b5aXP_021332106.1 P-type_ATPase_APLT_Dnf-like 36..974 CDD:319770 634/954 (66%)
Atp8b5XP_038966915.1 P-type_ATPase_APLT_Dnf-like 54..1008 CDD:319770 634/955 (66%)

Return to query results.
Submit another query.